ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
宿主細胞因子1（HCFC1、HCF1、またはHCF-1 ）は、 VP16アクセサリタンパク質としても知られ、[5] 、ヒトではHCFC1遺伝子によってコードされるタンパク質です。[6] [7]
構造
HCF1 は、高度に保存された宿主細胞因子ファミリーのメンバーであり、5 つのケルチ反復配列、フィブロネクチン様モチーフ、および 6 つの HCF 反復配列を持つタンパク質をコードします。各反復配列には、高度に特異的な切断シグナルが含まれています。この核転写コレギュレーターは、 6 つの可能な部位のうちの 1 つ以上でタンパク質分解により切断され、 N 末端鎖と対応するC 末端鎖が生成されます。このタンパク質の最終形態は、非共有結合した N 末端鎖と C 末端鎖で構成され、静電気力によって相互作用します。
関数
HCF1は細胞周期の制御に関与しているほか、転写に関連する多数のプロセスにおいて調節的役割を果たしている。さらに、モデル生物における研究では、HCF1が寿命の決定因子である可能性が指摘されている。[8]異なるタンパク質アイソフォームをコードする選択的スプライシング変異体が記載されているが、すべての変異体が完全に特徴付けられているわけではない。[7]
この遺伝子の変異はコバラミン代謝障害と関連している。[9]
インタラクション
宿主細胞因子 C1 は、以下と相互作用することが示されています。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000172534 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000031386 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ HCFC1 の GeneCards エントリ、http://genecards.org 2013-10-14 にWayback Machineでアーカイブ
- ^ Wilson AC、LaMarco K、Peterson MG、Herr W (1993 年 7 月)。「VP16 アクセサリ タンパク質 HCF は、大きな前駆体タンパク質から処理されたポリペプチドのファミリーです」。Cell . 74 (1): 115– 25. doi :10.1016/0092-8674 ( 93)90299-6. PMID 8392914. S2CID 43569318.
- ^ ab 「Entrez Gene: HCFC1 宿主細胞因子 C1 (VP16 アクセサリ タンパク質)」。
- ^ Li J、江端 A、Dong Y、Rizki G、岩田 T、Lee SS (2008 年 9 月)。 「Caenorhabditis elegans HCF-1 は DAF-16 調節因子として寿命維持に機能します。」PLOS 生物学。6 (9): e233。土井：10.1371/journal.pbio.0060233。PMC 2553839。PMID 18828672。
- ^ Yu HC、Sloan JL、Scharer G、Brebner A、Quintana AM、Achilly NP、Manoli I、Coughlin CR、Geiger EA、Schneck U、Watkins D、Suormala T、Van Hove JL、Fowler B、Baumgartner MR、Rosenblatt DS、Venditti CP、Shaikh TH (2013 年 9 月)。「転写コレギュレーター HCFC1 の変異によって引き起こされる X 連鎖コバラミン障害」。American Journal of Human Genetics。93 ( 3): 506– 14。doi : 10.1016/j.ajhg.2013.07.022。PMC 3769968。PMID 24011988。
- ^ Machida YJ, Machida Y, Vashisht AA, Wohlschlegel JA, Dutta A (2009年12月). 「脱ユビキチン化酵素BAP1はHCF-1との相互作用を介して細胞増殖を制御する」. The Journal of Biological Chemistry . 284 (49): 34179– 88. doi : 10.1074/jbc.M109.046755 . PMC 2797188. PMID 19815555 .
- ^ Lu R、Yang P、Padmakumar S、Misra V (1998 年 8 月)。「ヘルペスウイルストランスアクチベーター VP16 は、HCF との相互作用において、ヒト基本ドメインロイシンジッパータンパク質 luman を模倣する」。Journal of Virology。72 ( 8 ) : 6291– 7。doi : 10.1128 /JVI.72.8.6291-6297.1998。PMC 109766。PMID 9658067 。
- ^ Freiman RN、Herr W (1997 年12 月)。「ウイルスの模倣: VP16 と細胞タンパク質 LZIP による HCF との共通の関連性」。遺伝子 と発達。11 (23): 3122–7。doi : 10.1101/gad.11.23.3122。PMC 316754。PMID 9389645。
- ^ Vogel JL、Kristie TM (2000 年 2 月)。「新規コアクチベーター C1 (HCF) は多タンパク質エンハンサー形成を調整し、GABP による転写活性化を仲介する」。EMBOジャーナル 。19 ( 4 ) : 683– 90。doi :10.1093/ emboj /19.4.683。PMC 305606。PMID 10675337。
- ^ abcdefg Wysocka J、Myers MP、Laherty CD、Eisenman RN、Herr W (2003 年 4 月)。「ヒト Sin3 脱アセチル化酵素とトリソラックス関連 Set1/Ash2 ヒストン H3-K4 メチルトランスフェラーゼは、細胞増殖因子 HCF-1 によって選択的に結合される」。遺伝子と 発達。17 ( 7 ): 896– 911。doi :10.1101/gad.252103。PMC 196026。PMID 12670868。
- ^ abc Yokoyama A, Wang Z, Wysocka J, Sanyal M, Aufiero DJ, Kitabayashi I, Herr W, Cleary ML (2004 年 7 月). 「白血病プロトオンコプロテイン MLL はメニンと SET1 様ヒストンメチルトランスフェラーゼ複合体を形成し、Hox 遺伝子発現を制御する」. 分子細胞生物学. 24 (13): 5639– 49. doi : 10.1128 /MCB.24.13.5639-5649.2004. PMC 480881. PMID 15199122.
- ^ Scarr RB、Sharp PA (2002年8月)。「PDCD2はHCF-1 ( C1)の負の調節因子である」。Oncogene . 21 (34): 5245–54 . doi : 10.1038/sj.onc.1205647 . PMID 12149646。
- ^ La Boissière S、Hughes T、O'Hare P (1999年1月)。「VP16のHCF依存性核内輸入」。The EMBO Journal。18 ( 2): 480– 9。doi : 10.1093 /emboj/18.2.480。PMC 1171141。PMID 9889203。
- ^ Kristie TM、Sharp PA (1993年3月)。「単純ヘルペスウイルスα-トランス誘導因子(VP16)によるOct-1ホメオドメインの安定した認識に必要な細胞C1因子の精製」。The Journal of Biological Chemistry。268(9):6525–34。doi : 10.1016 / S0021-9258 ( 18 ) 53282-8。PMID 8454622 。
- ^ Ajuh PM、Browne GJ、Hawkes NA、Cohen PT、Roberts SG、Lamond AI (2000 年 2 月)。「タンパク質ホスファターゼ 1 活性とヒト因子 C1 (HCF) 複合体との関連」。 核酸研究。28 ( 3 ): 678– 86。doi :10.1093/ nar /28.3.678。PMC 102561。PMID 10637318。
- ^ Gunther M、Laithier M、 Brison O (2000 年 7 月)。「2 ハイブリッド スクリーニングで特定された転写因子 Sp1 と相互作用するタンパク質のセット」。分子細胞生化学。210 ( 1–2 ): 131–42。doi : 10.1023 / A:1007177623283。PMID 10976766。S2CID 1339642 。
- ^ Piluso D、 Bilan P、Capone JP (2002 年 11 月)。「宿主細胞因子 1 は細胞周期調節因子 Miz-1 と相互作用し、トランス活性化に拮抗する」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 48): 46799– 808。doi : 10.1074/ jbc.M206226200。PMID 12244100。
さらに読む
- Oehler T、Angel P (1992 年 12 月)。「Jun タンパク質による転写活性化には、「酸性ブロブ」型ドメインを認識する共通中間因子 (p52/54) が必要である」。分子細胞 生物学。12 (12): 5508– 15。doi :10.1128/ mcb.12.12.5508。PMC 360488。PMID 1448082。
- Wilson AC、 Peterson MG 、Herr W (1995 年 10 月)。「 HCFリピートは珍しいタンパク質分解切断シグナルである」。遺伝子と発達。9 (20): 2445–58。doi : 10.1101/ gad.9.20.2445。PMID 7590226 。
- Klemm RD、Goodrich JA、Zhou S、Tjian R (1995 年 6 月)。「ヒト TFIID の 32 kDa サブユニットの分子クローニングと発現により、転写活性化を媒介する VP16 および TFIIB との相互作用が明らかになった」。米国科学 アカデミー紀要。92 (13): 5788– 92。Bibcode : 1995PNAS ... 92.5788K。doi : 10.1073/ pnas.92.13.5788。PMC 41586。PMID 7597030。
- フラッティーニ A、ファランダ S、レドルフィ E、ズッキ I、ヴィラ A、パトロッソ MC、ストリーナ D、スザーニ L、ヴェッツォーニ P (1994 年 9 月)。 「ヒト VP16 アクセサリー タンパク質、Xq28 にマッピングされるハウスキーピング遺伝子 (HCFC1) のゲノム構成」。ゲノミクス。23 (1): 30–5 .土井:10.1006/geno.1994.1455。PMID 7829097。
- Kristie TM、Pomerantz JL、Twomey TC、Parent SA、Sharp PA (1995 年 3 月)。「単純ヘルペスウイルスエンハンサー複合体の細胞 C1 因子はポリペプチドファミリーです」。The Journal of Biological Chemistry。270 ( 9): 4387– 94。doi : 10.1074/ jbc.270.9.4387。PMID 7876203 。
- Kristie TM、Sharp PA (1993 年 3 月)。「単純ヘルペスウイルス α-トランス誘導因子 (VP16) による Oct-1 ホメオドメインの安定した認識に必要な細胞 C1 因子の精製」。The Journal of Biological Chemistry。268 ( 9): 6525– 34。doi : 10.1016/S0021-9258(18) 53282-8。PMID 8454622。
- Zoppè M、Frattini A、Faranda S、Vezzoni P (1996 年 5 月)。「宿主細胞因子 1 (HCFC1) 遺伝子とそのプロモーターの完全な配列: その発現の調節における YY1 転写因子の役割」。Genomics。34 ( 1 ) : 85– 91。doi :10.1006/geno.1996.0244。PMID 8661027 。
- Wilson AC、Freiman RN、Goto H、Nishimoto T、Herr W (1997 年 10 月)。「VP16 は細胞周期の進行に関与 するHCF のアミノ末端ドメインを標的とする」。分子細胞生物学。17 (10): 6139– 46。doi : 10.1128/ mcb.17.10.6139。PMC 232464。PMID 9315674。
- Freiman RN、Herr W (1997年12 月)。「ウイルスの模倣: VP16と細胞タンパク質 LZIP による HCF との共通の関連性」。遺伝子 と発達。11 (23): 3122–7。doi : 10.1101/gad.11.23.3122。PMC 316754。PMID 9389645。
- Lu R、Yang P、Padmakumar S、Misra V (1998 年 8 月)。「ヘルペスウイルストランスアクチベーター VP16 は、HCF との相互作用において、ヒト基本ドメインロイシンジッパータンパク質 luman を模倣する」。Journal of Virology。72 ( 8 ) : 6291– 7。doi : 10.1128 /JVI.72.8.6291-6297.1998。PMC 109766。PMID 9658067 。
- Ge H、Si Y、Roeder RG (1998 年 11 月)。「新規転写コアクチベーター p52 および p75 をコードする cDNA の分離により、転写活性化の代替制御メカニズムが明らかになった」。EMBOジャーナル。17 ( 22 ) : 6723–9。doi :10.1093 / emboj /17.22.6723。PMC 1171017。PMID 9822615 。
- La Boissière S 、 Hughes T、O'Hare P (1999 年 1 月)。「VP16 の HCF 依存性核内輸入」。EMBO ジャーナル。18 ( 2): 480–9。doi : 10.1093/emboj/18.2.480。PMC 1171141。PMID 9889203。
- ルー R、ミスラ V (2000 年 1 月)。 「ヘルペスウイルスの潜伏期間における、単純ヘルペスウイルスVP16（アルファ遺伝子トランス誘導因子）の細胞ホモログであるルーマンの潜在的な役割」。ウイルス学ジャーナル。74 (2): 934–43 .土井:10.1128/JVI.74.2.934-943.2000。PMC 111614。PMID 10623756。
- Mahajan SS、Wilson AC (2000 年 2 月)。「宿主細胞因子 1 の変異により、細胞増殖におけるその役割が VP16 および LZIP の補充から切り離される」。分子細胞生物学。20 (3): 919– 28。doi : 10.1128/MCB.20.3.919-928.2000。PMC 85209。PMID 10629049。
- Ajuh PM、Browne GJ、Hawkes NA 、 Cohen PT、Roberts SG、Lamond AI (2000 年 2 月)。「タンパク質ホスファターゼ 1 活性とヒト因子 C1 (HCF) 複合体との関連」。核酸 研究。28 ( 3): 678– 86。doi :10.1093/nar/ 28.3.678。PMC 102561。PMID 10637318。
- Vogel JL、Kristie TM (2000 年 2 月)。「新規コアクチベーター C1 (HCF) は、多タンパク質エンハンサー形成を調整し、GABP による転写活性化を媒介します」。EMBOジャーナル。19 ( 4 ) : 683– 90。doi :10.1093/ emboj /19.4.683。PMC 305606。PMID 10675337。
- Scarr RB、Smith MR、 Beddall M、Sharp PA (2000 年 5 月)。「G(0) 細胞における宿主細胞因子 1 (C1) の新規 50 キロダルトン断片」。分子細胞生物学。20 (10): 3568– 75。doi : 10.1128 /MCB.20.10.3568-3575.2000。PMC 85649。PMID 10779346。
- Choi Y, Asada S, Uesugi M (2000 年 5 月). 「活性化ドメインに隠された異なる hTAFII31 結合モチーフ」. The Journal of Biological Chemistry . 275 (21): 15912–6 . doi : 10.1074/jbc.275.21.15912 . PMID 10821850.
- Lu R、Misra V (2000 年 6 月)。「Zhangfei: 2 番目の細胞タンパク質は、Luman および VP16 と同様の方法で単純ヘルペスウイルス補助因子 HCF と相互作用します」。核酸研究。28 ( 12): 2446–54。doi :10.1093 / nar /28.12.2446。PMC 102720。PMID 10871379。
