エーリッヒ・ボルンベルグ・バウアー

エーリッヒ・ボルンベルク＝バウアー（1963年ウィーン生まれ）は、オーストリアの 生化学者、理論生物学者、バイオインフォマティクス学者である。

ボルンベルグ＝バウアーは、ウィーン大学で生化学、物理学、数学（1981～1991年）を学び、生化学の学位（1992年）を取得した。ウィーン大学理論化学研究所のピーター・シュスターのグループで RNAとタンパク質の進化適応度ランドスケープに関する博士研究を行い、1995年に博士号を取得した。 ^[2]ウィーン大学（数学研究所）で大学助手（助教授に相当、1994～1996年）として研究生活を続けた。その後、ハイデルベルクのドイツ化学研究センターでマルティン・ヴィンロンのグループに博士研究員として勤務し、配列分析アルゴリズムを研究（1996～1998年）、その後EML（欧州メディア研究所）有限会社でプロジェクトリーダーを務めた（1998～2000年。この部門は現在ハイデルベルク理論研究所の一部となっている）。2000年以降、ボルンベルク＝バウアーは独立した学術研究者として活動しており、最初はマンチェスター大学でバイオインフォマティクスの上級講師（2000～2003年）、その後ミュンスター大学進化・生物多様性研究所で分子進化・バイオインフォマティクスの教授（2003年～現在）を務めている。^{[2] 2018年より、}テュービンゲンのマックス・プランク生物学研究所の客員研究員である。^[3]彼はクロード・ベルナール大学リヨン第1校の客員教授であり、欧州バイオインフォマティクス研究所の客員研究員でもあった。

ボーンバーグ＝バウアーの以前の研究は、RNAとタンパク質の進化の側面、特に中立進化、進化可能性、堅牢性という現象に焦点を当てていた。トロント大学のヒュー・スン・チャンと共同で^[4]、彼は中立ネットワーク上のスーパーファンネルの概念を開発した。これは、機能性ポリマー（タンパク質など）の集団が配列空間をランダムに探索して、新しいネットワークへの遷移配列（スイッチ）を見つける方法を説明するものである。 ^{[5] [6] [7]彼の研究はまた、}翻訳中に生じるタンパク質配列のエラー（表現型変異）が、配列空間をより迅速に探索するのに役立つことを示した。先読み効果と呼ばれるこの現象は、遺伝子が有益な二重変異を獲得する確率を劇的に高める。^[8]ミュンスター大学の彼の研究グループは、3つの主要な研究テーマに取り組んでいる。1つ目は（2005年以来）タンパク質のモジュール進化であり、これはタンパク質ドメインが再シャッフルされて、機能の異なる新しいタンパク質が作成される仕組みを理解することを含む。^{[2] [9] [10] [11] [12]} 2番目のトピックは、de novo遺伝子誕生と呼ばれる現象に関するもので、生物のゲノム内の遺伝子を含まないDNAセグメントから新しいタンパク質コード遺伝子が出現するものです。 ^{[13] [14] [15] [16] [17] [18] [19] [20] [21] 3番目のトピックは、昆虫の}真社会性の進化に関するゲノム解析です。^{[22] [23] [24] [25] [26] [27]}ボルンバーグ・バウアーは、ユーカリ・グランディス、^[28]ナソニア・ヴィトリペニス、^[29]ナソニア・ギラルティ、 ^[29]、ナソニア・ロンギコルニス、^[29]ゾステラ・マリーナ、^[30]ボンバスの初期ゲノム配列決定と注釈付けに関与している。ハマビシ、^[31]セイヨウオオマルハナバチ、^[31]アッタ セファロテス、^[32]ブラテラ ゲルマニカ^[33]およびCryptotermes secundus ^[33]

彼の初期の研究と彼のグループのほとんどの研究プロジェクトは、主にバイオインフォマティクスと計算生物学に関連しています。彼のグループの最近のプロジェクトは、理論的な発見と実験を組み合わせて、無差別（多機能）酵素の分子進化、^[34]と新たに出現するタンパク質の特性を理解することです。^{[35]ボーンバーグ＝バウアーの研究は、}ドイツ研究振興財団、フォルクスワーゲン財団、欧州委員会、および2006年、2013年、2018年、2023年のヒューマンフロンティアサイエンスプログラムからの4つの研究助成金などによってサポートされています。^{[2] [36] 2021年以来、ボルンベルク＝バウアーは}ドイツ研究振興財団の研究優先プログラム「進化的イノベーションのゲノム基盤（GEvol）」を主導している。^{[37] [38] [39]彼は2009年から}バイオインフォマティクスと生物学の洞察^[40]の編集長を務めており、 Journal of the Royal Society Interface、^[41]、 BMC Evolutionary Biology ^[42]、Journal of Experimental Zoology ^[43]の編集委員でもある。

エーリッヒ・ボーンバーグ・バウアーは、150 本を超える科学論文と本の章を出版しています。

科学論文

• エーリッヒ・ボルンベルク・バウアー 出版物リスト（ミュンスター大学：ボルンベルクラボ）

主な出版物

• Eicholt, LA, Aubel, M, Berk, K, Bornberg - Bauer, E, Lange, A. シャペロンを用いた自然に進化した推定 de novo タンパク質の異種発現。タンパク質科学。2022; 31( 8):e4371。doi :10.1002/pro.4371
• Lange, A., Patel, PH, Heames, B. et al. ショウジョウバエにおける推定 de novo 遺伝子の構造と機能の特徴付け。Nature Communications 12, 1667 (2021). doi :10.1038/s41467-021-21667-6
• N. Terrapon、C. Li、HM Robertson、L. Ji、X. Meng、W. Booth、Z. Chen、CP Childers、KM Glastad、K. Gokhale、J. Gowin、W. Gronenberg、RA Hermansen、H. Hu、BG Hunt、AK Huylmans、SM Khalil、RD Mitchell、MC Munoz-Torres、JA Mustard、H. Pan、JT Reese、ME Scharf、F. Sun、H. Vogel、J. Xiao、W. Yang、Z. Yang、Z. Yang、J. Zhou、J. Zhu、CS Brent、CG Elsik、MA Goodisman、DA Liberles、RM Roe、EL Vargo、A. Vilcinskas、J. Wang、E. Bornberg-Bauer、J. Korb、G. Zhang、J. Liebig:代替社会組織の分子的痕跡シロアリゲノム。Nature Communications誌第5号、2014年5月、S. 3636、doi :10.1038/ncomms4636、PMID 24845553。
• MC ハリソン、E. ジョンピア、HM ロバートソン、N. アーニング、T. ビタード フィールド、H. チャオ、CP チルダース、H. ディン、H. ドッダパネニ、S. ドゥガン、J. ゴーウィン、C. グライナー、Y. ハン、H. フー、DS ヒューズ、AK ハイルマンス、C. ケメナ、LP クレーマー、SL リー、A. Lopez-Ezquerra、L. Mallet、JM Monroy-Kuhn、A. Moser、SC Murali、DM Muzny、S. Otani、MD Piulachs、M. Poelchau、J. Qu、F. Schaub、A. Wada-Katsumata、KC Worley 、Q. Xie、G. Ylla、M. Poulsen、RA Gibbs、C. Schal、S. Richards、X.ベルズ、J. コルブ、 E. ボーンバーグ・バウアー:半変態ゲノムがシロアリの真社会性の分子基盤を明らかにする。Nature Ecology and Evolution 誌第2 号、第 3 号、2018 年 3 月、S. 557–566、doi :10.1038/s41559-017-0459-1、PMID 29403074.
• T. Sikosek、HS Chan、E. Bornberg-Bauer：「適応的葛藤からの脱出は、弱い機能的トレードオフと突然変異の堅牢性から生じる」。米国科学アカデミー紀要。バンド109、番号 37、2012 年 9 月、S. 14888–14893、doi :10.1073/pnas.1115620109、PMID 22927372、PMC  3443171。
• E. Bornberg-Bauer、HS Chan:進化ランドスケープのモデリング: シーケンス空間における突然変異の安定性、トポロジー、スーパーファンネル。米国科学アカデミー紀要。バンド96、番号 19、1999 年 9 月、S. 10689–10694、PMID 10485887、PMC  17944。
• AD Moore、E. Bornberg-Bauer:ドメインの喪失と出現のダイナミクスと進化の可能性。分子生物学と進化誌。第29巻、第2号、2012年2月、S. 787–796、doi :10.1093/molbev/msr250、PMID 22016574、PMC  3258042。
• J. Weiner、F. Beaussart、E. Bornberg-Bauer:モジュールタンパク質の進化におけるドメインの削除と置換。In : The FEBS journal。Band 273、Nummer 9、Mai 2006、S. 2037–2047、doi :10.1111/j.1742-4658.2006.05220.x、PMID 16640566。
• DJ Whitehead、CO Wilke、D. Vernazobres、E. Bornberg-Bauer:表現型変異の先読み効果。Biology direct。Band 3 、2008年5月、S. 18、doi :10.1186/1745-6150-3-18、PMID 18479505、PMC  2423361。
• L. Wissler、J. Gadau、DF Simola、M. Helmkampf、E. Bornberg-Bauer:昆虫ゲノムにおける孤児遺伝子出現のメカニズムとダイナミクス。ゲノム生物学と進化。バンド5、番号2、2013、S. 439–455、doi :10.1093/gbe/evt009、PMID 23348040、PMC  3590893。
• Olsen, J., Rouzé, P., Verhelst, B. et al. 海草 Zostera marina のゲノムは被子植物の海への適応を明らかにする。Nature 530 , 331–335 (2016). doi :10.1038/nature16548
• Sadd, BM, Barribeau, SM, Bloch, G. et al. 原始的な真社会組織を持つ 2 つの主要なマルハナバチ種のゲノム。ゲノム生物学16, 76 (2015). doi :10.1186/s13059-015-0623-3
• Myburg, A.、Grattapaglia, D.、Tuskan, G.他。ユーカリ グランディスのゲノム。Nature 510、356–362 (2014)。土井：10.1038/nature13308

• エーリッヒ・ボーンベルグ・バウアーのウェブサイト
• Google Scholar プロフィール
• オルクイド
• Bakterium v​​erändert Spermien von Insekten (シュピーゲル オンライン)
• 生命のコードの意外な源 (サイエンティフィック・アメリカン)
• 陸上植物が海洋の重要種に(サイエンスデイリー)
• 昆虫の利他行動の謎の計算 (サイエンティフィック・アメリカン)
• ゴキブリについて考えてみよう（Inside Science）
• シロアリの社会的進化 (サイエンスデイリー)