サーモプロテオータ

サーモプロテオータは、古細菌ドメインの門として分類されている古細菌です。^{[ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]}当初、サーモプロテオータは硫黄依存性の極限環境微生物と考えられていましたが、最近の研究では、サーモプロテオータ特有の環境rRNAが特定され、これらの生物が海洋環境で最も豊富な古細菌である可能性が示されています。^{[ 5 ]}当初、rRNA配列に基づいて他の古細菌から分離されました。ヒストンの欠如などの他の生理学的特徴もこの分類を支持していますが、一部のクレナルカエウムにはヒストンがあることがわかりました。^{[ 6 ]} 2005年まで、培養されたすべてのサーモプロテオータは好熱性または超好熱性の生物であり、その中には113 ℃まで生育できるものもありました。 ^{[ 7 ]}これらの生物はグラム陰性染色され、形態的に多様で、桿菌、球菌、糸状菌、奇形細胞などがある。^{[ 8 ]}最近の証拠によると、サーモプロテオータの一部のメンバーはメタン生成菌である。 

Thermoproteotaは1984年にEocytaの領域 の一部として分類されたが^{[ 9 ]}、この分類は破棄された。「eocyte」という用語は現在、TACK（旧Crenarchaeota）またはThermoproteotaのいずれかに適用される。

クレナルカエオータの中で最もよく特徴づけられているメンバーの 1 つはSulfolobus solfataricusです。この生物はもともとイタリアの地熱で加熱された硫黄泉から分離され、80  °C と pH 2〜4 で生育します。^{[ 10 ]}好熱菌と古細菌の研究の先駆者である Wolfram Zillig による最初の特徴づけ以来、同じ属の類似種が世界中で発見されています。培養された好熱菌の大部分とは異なり、Sulfolobus は好気性で化学有機栄養的に生育します(糖などの有機源からエネルギーを得ます)。これらの要因により、嫌気性生物よりも実験室条件下での生育がはるかに容易になり、Sulfolobus は超好熱菌と、それらの内部で複製する多様なウイルスの大きなグループの研究のモデル生物となっています。

S. solfataricus細胞に紫外線を照射すると、 IV 型線毛の形成が強く誘導され、細胞凝集が促進される。^{[ 17 ] Ajon ら[ 18 ]} は、紫外線誘導による細胞凝集が、細胞間染色体マーカーの高頻度交換を媒介することを示した。紫外線誘導培養では、組換え率が誘導されていない培養の組換え率を最大 3 桁上回った。S . solfataricus細胞は、同種の他のメンバーとのみ凝集することができる。^{[ 18 ]} Frols ら^{[ 17 ] [ 19 ]}および Ajon ら^{[ 18 ]}は、紫外線誘導による DNA 転移プロセスと、それに続く損傷した DNAの相同組換え修復が、染色体の完全性を促進する重要なメカニズムであると考えている。

このDNA伝達プロセスは、原始的な形態の性的相互作用とみなすことができる。

1992年から、海洋環境におけるサーモプロテオータに属する遺伝子の配列を報告するデータが発表された。^{[ 20 ] [ 21 ]}それ以来、外洋から採取されたサーモプロテオータの膜から豊富な脂質の分析が、これらの「低温クレナルカエウム」の濃度を決定するために使用されてきた（ TEX-86を参照）。これらの特徴的な脂質の測定に基づくと、サーモプロテオータは非常に豊富であり、炭素固定の主要な貢献者の1つであると考えられている。^{[ 22 ]}サーモプロテオータのDNA配列は土壌や淡水環境でも発見されており、この門がほとんどの環境に遍在していることを示唆している。^{[ 23 ]}

2005年に、初めて培養された「低温クレナルカエウム」の証拠が発表された。ニトロソプミルス・マリチムスと名付けられたこの生物は、海水水槽から分離され、28 ℃で培養されたアンモニア酸化生物である。 ^{[ 24 ]} 

2ドメイン分類システムに関する研究は、クレナルカエウムと真核生物の間のつながりの可能性を切り開いた。^{[ 25 ]}

2008年（および後の2017年）のDNA解析により、真核生物はサーモプロテオータに似た生物から進化したことが示された。真核生物の祖先の候補としては、近縁のアスガルドも挙げられる。これは、真核生物が原核生物から進化した可能性を示唆している。

これらの結果は、1984 年にJames A. Lakeによって提唱されたエオサイト仮説と類似している。^{[ 9 ]} Lake による分類では、クレナルカエウムとアスガルドの両方がエオキタ界に属するとされている。これは科学者によって否定されているが、主要な概念は残っている。「エオキタ」という用語は現在、TACK グループまたはサーモプロテオタ門自体を指す。

しかし、このテーマは激しい議論の的となっており、研究は現在も続けられている。

• ユーリ古細菌
• 古細菌の属一覧
• 2ドメインシステム
• アスガルド（古細菌）

• 「クレナルカエオータ」 .バーチャル微生物学 (bact.wisc.edu) .ウィスコンシン大学.
• 「クレナーカエウムゲノムの比較解析」。統合微生物ゲノムシステム。米国エネルギー省。 2010年9月1日にオリジナルからアーカイブ済み。