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| タック | |
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| サルフォロバス | |
科学的分類 
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| ドメイン： | 古細菌 |
| 王国： | プロテオアーキオータ |
| 上門: | TACK グループ ガイ & エテマ 2011 |
| 門[1] | |
| 同義語 | |
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TACKは古細菌のグループであり、その名前は最初に発見されたグループであるThaumarchaeota（現在のNitrososphaerota）、Aigarchaeota、Crenarchaeota（現在のThermoproteota）、およびKoarchaeotaの頭文字をとったものです。これらは好酸性好 熱菌から中温菌や好冷菌までさまざまな環境に生息し、主に嫌気性および化学合成のさまざまなタイプの代謝を行います。[ 4 ] TACKは真核生物を生み出したアスガルドの分岐の姉妹群です。TACK群をCrenarchaeotaに分類し、従来の「Crenarchaeota」（Thermoproteota）を他の門とともに「Sulfolobia」という綱に分類することが提案されています。[5] ICNPに界カテゴリーを含めた後、このグループの提案名はThermoproteati界である（Guy and Ettema 2024）。[6]
分類
- サーモプロテオータ（旧称クレンアーキオータ）。海洋生態系で最もよく知られた最古の古細菌であり、最も豊富に存在します。硫黄に依存することから以前は硫酸細菌と呼ばれていましたが、炭素固定菌として重要です。熱水噴出孔には超好熱菌が存在し、他のグループは水深 100 m 未満で最も豊富に存在します。
- 「アイガルカオータ」。日本の金鉱山の奥深くで発見された候補種Caldiarchaeum subterraneumのゲノムから提案された門です。このグループのゲノム配列は、陸上と海洋の両方の地熱環境でも発見されています。
- 「地質古細菌門」。酸性環境で鉄(III)を還元する好熱性生物が含まれます。あるいは、このグループと以前のグループは実際には Nitrososphaerota 門に属すると提案されています。
- Nitrososphaerota（旧称 Thaumarchaeota）。この分類群には、中温または好冷性（中温および低温）の生物が含まれ、アンモニア酸化化学合成独立栄養代謝（硝化）を行い、窒素循環や炭素循環などの生化学循環で重要な役割を果たすことができます。
- 「深海古細菌門」。栄養分の乏しい海底の堆積物に豊富に生息しています。少なくとも一部の系統は、これまで細菌に特有であると考えられていた代謝の一種であるホモ酢酸生成によって発達します。
- 「コラキオータ」。コラキオータは熱水環境でのみ発見されており、生息数も少ない。温度、塩分濃度（淡水または海水）、地理に応じて、異なる系統レベルで多様化しているようだ。
系統発生
関係はおおよそ次のようになります。
エオサイト仮説
1980年代にジェームズ・レイクによって提唱されたエオサイト仮説は、真核生物が原核生物のエオサイトから出現したことを示唆している。[15]
TACKと真核生物との密接な関係を裏付ける証拠の一つは、RNAポリメラーゼサブユニットRbp-8の相同体が熱原生類には存在するが、真核生物には存在しないことである。[16]
参照
参考文献
- ^ Castelle, CJ; Banfield, JF (2018). 「主要な新しい微生物群が多様性を拡大し、生命の樹に対する理解を変える」Cell . 172 (6): 1181–1197. doi : 10.1016/j.cell.2018.02.016 . PMID 29522741.
- ^ Lake, JA; Henderson, E.; Oakes, M. (Clark, MW) (1984). 「エオサイト: 新しいリボソーム構造は真核生物と密接な関係にある王国を示唆している」. PNAS . 81 (12): 3786–3790. Bibcode :1984PNAS...81.3786L. doi : 10.1073/pnas.81.12.3786 . PMC 345305. PMID 6587394 .
{{cite journal}}: CS1 maint: 複数の名前: 著者リスト (リンク) - ^ Lake, JA (2015). 「真核生物の起源」. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci . 370 (1678): 20140321. doi :10.1098/rstb.2014.0321. PMC 4571561 . PMID 26323753.
- ^ Guy, Lionel; Ettema, Thijs JG (2011). 「古細菌「TACK」上門と真核生物の起源」。Trends in Microbiology . 19 (12): 580–587. doi :10.1016/j.tim.2011.09.002. PMID 22018741.
- ^ Cavalier-Smith, Thomas ; Chao, Ema E-Yung (2020). 「マルチドメインリボソームタンパク質ツリーとネオムラ（真核生物、古細菌）のプランクトンバクテリア起源」。 プロトプラズマ。257 ( 3): 621–753。doi : 10.1007 / s00709-019-01442-7。PMC 7203096。PMID 31900730。
- ^ Göker, Markus; Oren, Aharon (2024年1月22日). 「原核生物の2つのドメインと7つの界の名前の有効な公表」. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 74 (1). doi :10.1099/ijsem.0.006242. ISSN 1466-5026. PMID 38252124.
- ^ McKay, LJ, Dlakić, M., Fields, MW et al. コラキオタ類で発見された嫌気性メタン代謝と異化硫黄代謝の共存ゲノム能力。Nat Microbiol 4, 614–622 (2019) doi:10.1038/s41564-019-0362-4
- ^ 「The LTP」。All -Species Living Tree Project 。 2023年5月10日閲覧。
- ^ 「LTP_all tree in newick format」。All -Species Living Tree Project 。 2023年5月10日閲覧。
- ^ 「LTP_06_2022 リリースノート」(PDF)。All -Species Living Tree Project 。 2023年5月10日閲覧。
- ^ 「GTDBリリース08-RS214」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。
- ^ "ar53_r214.sp_label".ゲノム分類データベース. 2023年5月10日閲覧。
- ^ 「分類の歴史」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。
- ^ Cox, CJ; Foster, PG; Hirt, RP; Harris, SR; Embley, TM (2008). 「真核生物の古細菌起源」Proc Natl Acad Sci USA . 105 (51): 20356–61. Bibcode :2008PNAS..10520356C. doi : 10.1073/pnas.0810647105 . PMC 2629343 . PMID 19073919.
- ^ (UCLA) 核の起源と生命の樹 アーカイブ 2003-02-07 at archive.today
- ^ Kwapisz, M.; Beckouët, F.; Thuriaux, P. (2008). 「真核生物の DNA 依存性 RNA ポリメラーゼの初期進化」. Trends Genet . 24 (5): 211–5. doi :10.1016/j.tig.2008.02.002. PMID 18384908.