ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| DCTN1 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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1TXQ、2COY、2HKN、2HKQ、2HL3、2HL5、2HQH、3E2U、3TQ7 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | DCTN1、DAP-150、DP-150、P135、ダイナクチンサブユニット1 |
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| 外部ID | オミム:601143; MGI : 107745;ホモロジーン: 3011;ジーンカード:DCTN1; OMA :DCTN1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体6(マウス)[2] |
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| | バンド | 6 C3|6 35.94 cM | 始める | 83,142,902 bp [2] |
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| 終わり | 83,177,099 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 右前頭葉
- 前頭前皮質
- 小脳の右半球
- 心の頂点
- 前帯状皮質
- 側坐核
- 扁桃体
- 被殻
- 尾状核
- 下垂体前葉
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| | トップの表現 | - 網膜の神経層
- 嗅内皮質
- 嗅周囲皮質
- CA3フィールド
- 上前頭回
- 一次視覚野
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 小脳皮質
- 太ももの筋肉
- 中脳の中心灰白質
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- タンパク質結合
- 細胞骨格の運動活動
- 微小管結合
- チューブリン結合
- ダイニン複合体結合
- タンパク質キナーゼ結合
- タウタンパク質結合
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- 中心体
- 膜
- ダイナクチン複合体
- レトロマー複合体
- セル先端
- ダイニン複合体
- 微小管
- 細胞骨格
- 動原体
- 微小管形成中心
- 核
- 核膜
- 中心小体
- スピンドル
- 細胞質
- アクチン細胞骨格
- 微小管プラス端
- スピンドルポール
- 細胞皮質領域
- 細胞皮質
- 微小管関連複合体
- 軸索
- ニューロン投影
- ソーマ
- 中間径フィラメント細胞骨格
- 中心小体下遠位付属器
| | 生物学的プロセス |
- MHCクラスIIを介した外因性ペプチド抗原の抗原処理と提示
- 神経系の発達
- 小胞体からゴルジ小胞を介した輸送
- 微小管に沿った輸送
- IRE1を介した未折り畳みタンパク質応答
- 逆行輸送、エンドソームからゴルジ体へ
- 有糸分裂細胞周期のG2/M移行
- メラノソーム輸送
- 中心小体間の凝集
- 微小管重合の正の制御
- 中心体における微小管の固定
- 核膜の分解
- 微小管核形成の正の調節
- 毛様体基底小体と細胞膜のドッキング
- 非運動性繊毛集合体
- 有糸分裂細胞周期
- 有糸分裂紡錘体の方向の確立
- 有糸分裂紡錘体の組織化の調節
- 細胞周期
- 細胞分裂
- 有糸分裂細胞周期のG2/M移行の調節
- 輸送
- 神経筋接合部の発達
- 脊髄の腹側発達
- 神経筋プロセス
- 運動行動
- ニューロン細胞の恒常性
- 軸索輸送
- シナプス構造の維持
- 神経筋接合部発達の正の調節
- ニューロン投射維持
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | NM_001135040 NM_001135041 NM_001190836 NM_001190837 NM_004082
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NM_023019 NM_001378991 NM_001378992 |
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NM_001198866 NM_001198867 NM_007835 NM_001347310 |
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| RefSeq (タンパク質) | NP_001128512 NP_001128513 NP_001177765 NP_001177766 NP_004073
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NP_075408 NP_001365920 NP_001365921 |
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NP_001185795 NP_001185796 NP_001334239 NP_031861 |
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| 場所 (UCSC) | 2 章: 74.36 – 74.39 Mb | 6 章: 83.14 – 83.18 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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ダイナクチンサブユニット1は、ヒトではDCTN1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5]
関数
この遺伝子は、23のサブユニット(サイズが22~150 kDの11個の個別タンパク質)からなる高分子複合体であるダイナクチンの最大のサブユニットをコードしています。 [6]ダイナクチンは、細胞質ダイニン、ダイニンカーゴアダプター、および微小管に結合します。[7] ERからゴルジへの輸送、リソソームとエンドソームの求心運動、紡錘体形成、染色体運動、核の位置決定、および軸索形成など、多様な細胞機能に関与しています。
このサブユニットは、一般的にp150接着サブユニットと呼ばれます。[5] これは、ダイナクチン複合体あたり2つのコピーで存在し、ダイナクチン本体から伸びる約75nmの長さの柔軟なアームを形成します。[6] p150接着アームには、微小管の結合部位、[8]微小管プラス先端結合タンパク質EB1、[9]およびダイニン中間鎖のN末端が含まれています。[10] [11]
この遺伝子の選択的スプライシングにより、少なくとも2つの機能的に異なるアイソフォーム(普遍的に発現するものと脳特異的なもの)が生じる。細胞遺伝学的位置に基づいて、この遺伝子は肢帯型筋ジストロフィーの候補遺伝子であると考えられている。[12]
インタラクション
DCTN1 は以下と相互作用することが示されています:
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000204843 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000031865 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ab Holzbaur EL, Hammarback JA, Paschal BM, Kravit NG, Pfister KK, Vallee RB (1991 年 6 月). 「150K 細胞質ダイニン関連ポリペプチドとショウジョウバエ遺伝子 Glued との相同性」. Nature . 351 (6327): 579–83. Bibcode :1991Natur.351..579H. doi :10.1038/351579a0. PMID 1828535. S2CID 4263574.
- ^ ab Urnavicius L, Zhang K, Diamant AG, Motz C, Schlager MA, Yu M, Patel NA, Robinson CV, Carter AP (2015 年 3 月). 「ダイナクチン複合体の構造とダイニンとの相互作用」. Science . 347 (6229): 1441–1446. Bibcode :2015Sci...347.1441U. doi :10.1126/science.aaa4080. PMC 4413427. PMID 25814576 .
- ^ Cianfrocco MA、DeSantis ME、Leschziner AE、Reck-Peterson SL (2015)。「細胞質ダイニンのメカニズムと制御」。Annual Review of Cell and Developmental Biology。31 : 83–108。doi : 10.1146 / annurev - cellbio -100814-125438。PMC 4644480。PMID 26436706。
- ^ Waterman-Storer CM、Karki S、Holzbaur EL (1995 年 2 月)。「ダイナクチン複合体の p150Glued 成分は微小管とアクチン関連タンパク質セントラクチン (Arp-1) の両方に結合する」。米国科学アカデミー紀要。92 ( 5): 1634–8。Bibcode : 1995PNAS ...92.1634W。doi : 10.1073 / pnas.92.5.1634。PMC 42574。PMID 7878030。
- ^ Berrueta L、Tirnauer JS、 Schuyler SC 、 Pellman D、Bierer BE (1999 年 4 月)。「APC 関連タンパク質 EB1 は、ダイナクチン複合体および細胞質ダイニン中間鎖の構成要素と関連している」。Current Biology。9 ( 8 ): 425–8。Bibcode : 1999CBio ....9..425B。doi : 10.1016/S0960-9822(99) 80190-0。PMID 10226031。S2CID 14191776 。
- ^ Karki S, Holzbaur EL (1995 年 12 月). 「アフィニティークロマトグラフィーにより細胞質ダイニンとダイナクチン複合体の直接結合が実証される」. The Journal of Biological Chemistry . 270 (48): 28806–11. doi : 10.1074/jbc.270.48.28806 . PMID 7499404.
- ^ Vaughan KT、Vallee RB (1995 年 12 月)。「細胞質ダイニンは中間鎖と p150Glued との直接的な相互作用を通じてダイナクチンに結合する」。The Journal of Cell Biology。131 ( 6 Pt 1): 1507–16。doi :10.1083/jcb.131.6.1507。PMC 2120689。PMID 8522607。
- ^ 「Entrez Gene: DCTN1 ダイナクチン 1 (p150、接着ホモログ、ショウジョウバエ)」。
- ^ Kim JC、Badano JL、Sibold S、Esmail MA、Hill J、Hoskins BE、Leitch CC、Venner K、Ansley SJ、Ross AJ、Leroux MR、Katsanis N、Beales PL (2004 年 5 月)。「Bardet-Biedl タンパク質 BBS4 は、中心小体周囲領域に貨物を輸送し、微小管の固定と細胞周期の進行に必要である」。Nature Genetics。36 ( 5 ) : 462–70。doi : 10.1038/ng1352。PMID 15107855。
- ^ Liu JJ、Ding J、Kowal AS、Nardine T、Allen E、Delcroix JD、Wu C、Mobley W、Fuchs E、Yang Y (2003 年 10 月)。「BPAG1n4 は感覚ニューロンの逆行性軸索輸送に必須である」。The Journal of Cell Biology。163 ( 2 ): 223–9。doi :10.1083/jcb.200306075。PMC 2173519。PMID 14581450。
- ^ Sahni M、Zhou XM、Bakiri L、Schlessinger J、Baron R、Levy JB (1996 年 12 月)。「破骨細胞における新規 135 kDa Grb2 結合タンパク質の同定」。The Journal of Biological Chemistry。271 ( 51): 33141–7。doi : 10.1074/jbc.271.51.33141。PMID 8955163 。
- ^ Short B、Preisinger C、Schaletzky J、Kopajtich R 、 Barr FA (2002 年 10 月)。「Rab6 GTPase はダイナクチン複合体のゴルジ膜へのリクルートメントを制御する」。Current Biology。12 ( 20 ): 1792–5。Bibcode :2002CBio...12.1792S。doi : 10.1016 /s0960-9822(02 ) 01221-6。PMID 12401177。S2CID 14031165 。
さらに読む
- Waterman-Storer CM、Karki S、Holzbaur EL (1995 年 2 月)。「ダイナクチン複合体の p150Glued 成分は微小管とアクチン関連タンパク質セントラクチン (Arp-1) の両方に結合する」。米国科学アカデミー紀要。92 ( 5 ) : 1634–8。Bibcode : 1995PNAS ... 92.1634W。doi : 10.1073/ pnas.92.5.1634。PMC 42574。PMID 7878030 。
- Paschal BM、Holzbaur EL、Pfister KK、Clark S、Meyer DI、Vallee RB (1993 年 7 月)。「細胞質ダイニン標本中の 50 kDa ポリペプチドの特性評価により、p150GLUED および新規アクチンとの複合体が明らかになった」。The Journal of Biological Chemistry。268 ( 20): 15318–23。doi : 10.1016/S0021-9258(18)82472-3。PMID 8325901。
- Vaughan KT、Vallee RB (1995 年 12 月)。「細胞質ダイニンは、中間鎖と p150Glued との直接的な相互作用を通じてダイナクチンに結合する」。The Journal of Cell Biology。131 ( 6 Pt 1): 1507–16。doi :10.1083/jcb.131.6.1507。PMC 2120689。PMID 8522607。
- Holzbaur EL、 Tokito MK (1996 年 2 月)。「蛍光 in situ ハイブリダイゼーションによるヒト染色体 2p13 への p150Glued をコードする DCTN1 遺伝子の局在」。Genomics。31 ( 3): 398–9。doi : 10.1006/geno.1996.0068。PMID 8838327。
- Tokito MK、Howland DS、Lee VM 、Holzbaur EL (1996 年 8 月)。「機能的に異なるダイナクチンのアイソフォームがヒトニューロンで発現している」。 細胞の分子生物学。7 (8): 1167–80。doi :10.1091/ mbc.7.8.1167。PMC 275970。PMID 8856662。
- Sahni M、Zhou XM、Bakiri L、Schlessinger J、Baron R、Levy JB (1996 年 12 月)。「破骨細胞における新規 135 kDa Grb2 結合タンパク質の同定」。The Journal of Biological Chemistry。271 ( 51): 33141–7。doi : 10.1074/ jbc.271.51.33141。PMID 8955163。
- Blangy A、Arnaud L、 Nigg EA (1997 年 8 月)。「p34cdc2 タンパク質キナーゼによるリン酸化は、キネシン関連モーター HsEg5 とダイナクチンサブユニット p150 の結合を制御する」。The Journal of Biological Chemistry。272 ( 31): 19418–24。doi : 10.1074 /jbc.272.31.19418。PMID 9235942。
- Korthaus D、Wedemeyer N、Lengeling A、Ronsiek M、Jockusch H、Schmitt- John T (1997 年 7 月)。「ヒト染色体 2p13 の統合放射線ハイブリッド マップ: 神経筋疾患におけるダイナクチンの関与の可能性」。Genomics。43 ( 2 ): 242–4。doi : 10.1006 /geno.1997.4789。PMID 9244444 。
- Waterman-Storer CM、Karki SB、Kuznetsov SA、Tabb JS、Weiss DG、Langford GM、Holzbaur EL (1997 年 10 月)。「細胞質ダイニンとダイナクチンの相互作用は、軸索の高速輸送に必要である」。米国 科学アカデミー紀要。94 (22): 12180–5。Bibcode : 1997PNAS ...9412180W。doi : 10.1073 / pnas.94.22.12180。PMC 23743。PMID 9342383。
- Engelender S、Sharp AH、Colomer V、Tokito MK、Lanahan A、Worley P、Holzbaur EL、Ross CA (1997 年 12 月)。「ハンチンチン関連タンパク質 1 (HAP1) はダイナクチンの p150Glued サブユニットと相互作用する」。ヒト分子 遺伝学。6 (13): 2205–12。doi : 10.1093/hmg/6.13.2205。PMID 9361024。
- Li SH、Gutekunst CA、Hersch SM、Li XJ (1998 年 2 月) 。 「ハンチンチン関連タンパク質 とダイナクチン P150Glued の相互作用」。The Journal of Neuroscience。18 ( 4): 1261–9。doi : 10.1523 /JNEUROSCI.18-04-01261.1998。PMC 6792727。PMID 9454836。
- Karki S、LaMonte B、Holzbaur EL (1998 年 8 月)。「ダイナクチンの p22 サブユニットの特性解析により、細胞質ダイニンとダイナクチンが分裂細胞の中央部に局在することが明らかになりました」。The Journal of Cell Biology。142 ( 4): 1023–34。doi :10.1083/ jcb.142.4.1023。PMC 2132867。PMID 9722614 。
- Collin GB、Nishina PM、Marshall JD、 Naggert JK (1998年11 月)。「ヒト DCTN1: ゲノム構造とアルストローム症候群の候補としての評価」。ゲノミクス。53 (3): 359–64。doi :10.1006/geno.1998.5542。PMID 9799602 。
- Tokito MK、Holzbaur EL (1998 年 11 月)。「肢帯型筋ジストロフィー (LGMD2B) の候補遺伝子 DCTN1 のゲノム構造」。Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - 遺伝子構造と発現。1442 (2–3): 432–6。doi : 10.1016/S0167-4781(98)00195 - X。PMID 9805007 。
- Bingham JB、Schroer TA (1999 年 2 月)。「アクチン関連タンパク質 Arp1 の自己制御重合」。Current Biology。9 ( 4 ): 223–6。Bibcode : 1999CBio ....9..223B。doi : 10.1016/S0960-9822 ( 99) 80095-5。PMID 10074429。S2CID 208851。
- Heimann K、Percival JM、Weinberger R、Gunning P 、 Stow JL (1999 年 4 月)。「ゴルジ体由来小胞の異なる集団におけるアクチン結合タンパク質の特定のアイソフォーム」。The Journal of Biological Chemistry。274 ( 16): 10743–50。doi : 10.1074/ jbc.274.16.10743。PMID 10196146。
- Eckley DM、Gill SR、Melkonian KA、Bingham JB、Goodson HV、Heuser JE、Schroer TA (1999 年 10 月)。「ダイナクチンサブコンプレックスの分析により、arp1 ミニフィラメントの先端に関連する新しいアクチン関連タンパク質が明らかになりました」。The Journal of Cell Biology。147 ( 2 ): 307–20。doi :10.1083/jcb.147.2.307。PMC 2174220。PMID 10525537。
- Karki S、Tokito MK、 Holzbaur EL (2000 年 2 月)。「高度に保存されたシステインに富むモチーフを持つダイナクチンサブユニットは Arp1 と直接相互作用する」。The Journal of Biological Chemistry。275 ( 7): 4834–9。doi : 10.1074/ jbc.275.7.4834。PMID 10671518。
- Vancoillie G、Lambert J、Haeghen YV、Westbroek W、Mulder A、Koerten HK、Mommaas AM、Van Oostveldt P、Naeyaert JM (2000 年 12 月)。 「正常なヒトメラノサイトにおけるダイナクチンサブユニットP150GluedおよびP50とメラノソームとの共局在」。色素細胞の研究。13 (6): 449–57。土井: 10.1034/j.1600-0749.2000.130607.x。PMID 11153697。
外部リンク
- GeneReviews/NIH/NCBI/UW ペリー症候群に関するエントリー