南軍秘密情報部

南軍は、ローズ・オニール・グリーンハウやアーロン・ヴァン・キャンプといった「伝統的な」スパイたちの働きから恩恵を受けた。彼らは南軍政府形成期にスパイ集団の一員だったようだ。グリーンハウはワシントンD.C.の旧国会議事堂刑務所に収監されていたが、トーマス・ジョーダンが彼女を勧誘し、暗号を提供した。

他に知られているスパイとしては、ベル・ボイドやキャサリン・バージニア・バクスリーなどがいる。ジョン・スラットは、運び屋とスパイの両方の役割を担っていた。

ジョン・H・ソソロンは、メリーランド州セントメアリーズ郡で南軍の地下組織を指揮していたようだ。ソソロン大佐はシャーロット・ホール陸軍士官学校の近くに住んでいた。彼の息子ウェブスターはこの学校に通っており、スパイだったと噂されていた。リチャード・トーマス（ザルヴォナ）とデイビッド・ヘロルドも生徒だったが、ヘロルドの在籍については異論がある。

メリーランド州チャールズ郡のサミュエル・マッドは、諜報員を匿い、ジョン・ウィルクス・ブースをかくまっていたようだが、マッドの役割については議論がある。

南軍初の秘密諜報員はジェームズ・D・ブロッチだったかもしれない。1861年、サムター要塞攻撃の直後、ブロッチは作戦拠点を築くためイギリスのリバプールへ渡った。イギリスは南北戦争において公式には中立の立場をとっていたが、世論も国民感情も南軍を支持していた。また、イギリスは北軍の海上封鎖を突破して密輸できる綿花を購入する意思があり、それが南軍にとって唯一の実質的な外貨源となっていた。ブロッチは海運会社フレイザー・トレンホルム社と提携し、南軍の綿花を売買することで、この外貨を使って武器弾薬、軍服、その他の戦争物資を購入した。フレイザー・トレンホルム社は事実上、南軍の国際銀行となったのである。ブロッチはまた、通商破壊艦CSSアラバマ号の建造と秘密裏の購入を手配したほか、南軍の商業上の生命線として機能した多くの封鎖突破船の手配も行った。

ジェイコブ・トンプソンはカナダにおける南軍の代表であった。彼は資金を分配し、工作員を統括し、秘密作戦を計画した可能性もある。彼は、政治犯も収容されていた北軍の施設であるジョンソン島で、南軍捕虜を解放しようとする試みに関与していた。

トンプソンはオハイオ州の政治家クレメント・レアード・ヴァランディガムと会談した。リンカーンに対抗する大統領候補として有力視されていたヴァランディガムは、北軍のアンブローズ・バーンサイド将軍に逮捕され、南軍に追放された。ヴァランディガムはその後カナダへ渡った。

南軍通信隊は1862年に設立された。約1,200人の男性が秘密諜報機関に所属しており、そのほとんどは裕福で複数の言語を話せた。例：エドマンド・ウィンチェスター・ラッカー大佐の弟であるアレクサンダー・キャンベル・ラッカーは、南軍秘密諜報機関に所属していた。^{[ 2 ]}ウィリアム・ノリス 少佐が彼らの指揮官だった。ノリスはブラクストン・ブラッグの下で働いていた可能性がある。1865年4月26日、ノリスはロバート・オールド捕虜交換委員の職に就いた。オールドは通信隊への民間連絡員で、ブラッグは軍事連絡員であり、両者ともジェファーソン・デイビスまたはジュダ・ベンジャミンに報告していた可能性がある。

トーマス・ネルソン・コンラッドは、ノリスと共に活動した斥候兼スパイだった。

1862年10月31日に設立が認可され、ガブリエル・レインズ准将が指揮を執った魚雷局は、地雷、機雷、そして「石炭魚雷」（ボイラーを破壊するために石炭の塊に偽装した爆弾）など、様々な爆発物の製造を任務としていた。

魚雷局と同時に設立された潜水艦砲兵隊は、南軍海軍の魚雷専門部隊であった。同部隊は主に電気起爆式魚雷を用いて南部の水路を防衛した。当初は「海の開拓者」として知られるマシュー・フォンテーヌ・モーリー司令官が指揮を執っていたが、モーリーが電気魚雷に関する実験をさらに進め、必要な物資や艦船を調達するために海外に派遣された際、彼の後継者としてハンター・デイビッドソン中尉が指揮を執った。同部隊はバージニア州リッチモンドとハンプトン・ローズ間のジェームズ川沿い、ノースカロライナ州ウィルミントン、サウスカロライナ州チャールストン、ジョージア州サバンナなど、各地で活動した。

1864年11月、連合国下院は秘密会期で「特別秘密情報局の設立」法案を軍事委員会に付託した。同局には「ポリテクニック部隊」が設置される予定だった。既存の「魚雷部隊」は同局に統合されることになっていた。新たな発明が奨励されることになっていた。^{[ 3 ]}

南軍の工作員はハリファックス、ケベックシティ、ナイアガラ、トロント、そして（特に）モントリオール周辺で活動していた。^{[ 4 ]}カナダで活動していた南軍の工作員は相当数に上り、広く容認されていた。^{[ 5 ]}例えばトロントでは、

南部の工作員は、イギリス領北アメリカの公式な中立政策によって統治されていた地元当局からほとんど、あるいは全く懸念されることなく、自由かつ公然と活動していた。実際、南部の工作員はトロントの政治、社会、ビジネス界のエリートのほとんどから同情を得ていたが、ジョージ・テイラー・デニソン3世ほど熱心に南軍を支持した者はほとんどいなかった。^{[ 6 ]}

カナダの銀行は彼らの活動に資金を提供し、トロント、モントリオール、セントキャサリンズ、ハリファックスは、これらの都市の南軍の工作員や同調者による資金豊富な南軍ネットワークの拠点であった。^{[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]}トロントのクイーンズホテルやケベックシティのセントルイスホテルなど、領土内のいくつかのカナダのホテルは、南軍秘密情報機関の活動の非公式本部として機能した。^{[ 6 ] [ 10 ] [ 5 ]}

南軍は開戦当初から、独自の海軍を持たないことが問題だと認識していた。民間所有で軍事用に転用できる数少ない艦船は、北軍海軍には到底敵わなかった。1861年5月21日、南軍議会は1861年5月6日の宣戦布告に修正条項を制定し、次のように規定した。

連合国政府は、当該法律に基づいて任命された民間の武装船舶の巡洋艦に対し、当該民間の武装船舶によって撃沈または破壊された敵の軍艦1隻あたりの価値の20パーセントを、見積りに含まれる武装の価値として支払うものとする。

1862年、おそらく誰かの提案を受けて、連合国議会は、新しい発明によって破壊された船舶の価値の50パーセントを報奨金として支払うという法律を制定した。

アメリカ連合国議会は、上記法律の第1条を改正し、いかなる者または複数の者も、敵の武装船舶を破壊するための新たな機械またはエンジンを発明または製造した場合、あるいは新たな方法を考案した場合、その発明または考案によって沈没または破壊された船舶1隻あたりの価値の50パーセントを受け取るものとする、と制定する。

このことが起業家たちの注目を集めた。ホレス・ローソン・ハンリーは、報奨金で利益を得ようと、自身の名を冠した潜水艦HLハンリー号の資金調達のために投資家グループを組織した。ECシンガー、C・ウィリアムズ、ゼール・マクダニエルといった工学経験を持つ個人は、新しい魚雷や信管を開発し、特許を取得した。

南軍秘密情報部のトーマス・コートニーによって開発された石炭魚雷は、石炭の塊に似た中空の金属鋳物だった。この鋳物に火薬を詰め、敵艦の石炭庫に隠した。石炭の模造品を船のボイラーの火室に投げ込むと、爆発が起こり、船に損傷を与えたり沈没させたりする。火薬を詰めた中空の木片は、河川蒸気船に対して使用された。これらは、川岸に積み上げられた薪の燃料の中に隠すことができた。

ダールグレン事件は、北軍騎兵隊が南軍の首都バージニア州リッチモンドを襲撃し、そこに拘束されていた北軍捕虜を解放しようとした事件である。計画では、北軍兵士を使って市を焼き払い、南軍大統領ジェファーソン・デイヴィスを暗殺することになっていた。襲撃は失敗に終わったが、デイヴィスと南軍指導部を激怒させた。この事件と、南軍の戦場での惨敗を鑑みて、1864年に秘密情報機関が再活性化された。同機関は、1864年10月19日にカナダ人職員によって行われたバーモント州セントオールバンズ襲撃、北部都市での放火計画、そして後にケンタッキー州知事となるルーク・P・ブラックバーンの生物兵器計画に関与した。