人間の体内に存在するタンパク質
| NR2F1 |
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| 利用可能な構造 |
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| 電子データ | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | NR2F1、BBOAS、BBSOAS、COUP-TFI、EAR-3、EAR3、ERBAL3、NR2F2、SVP44、TCFCOUP1、TFCOUP1、核受容体サブファミリー2グループFメンバー1、COUPTF1 |
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| 外部ID | オミム:132890; MGI : 1352451;ホモロジーン: 21158;ジーンカード:NR2F1; OMA :NR2F1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 13番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 13 C1|13 41.38 cM | 始める | 78,337,092 bp [2] |
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| 終わり | 78,347,876 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 心室帯
- 視神経
- 精嚢
- 三叉神経節
- 左子宮管
- 胚上皮
- 神経節隆起
- 壁側胸膜
- 肺の下葉
- 一次視覚野
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| | トップの表現 | - 蝸牛管の前庭膜
- 外側膝状体
- 前扁桃体領域
- バレル皮質
- 内側背核
- 心室帯
- 精管
- 球形嚢
- 毛様体
- 鉤状部
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- DNA結合転写因子活性
- ステロイドホルモン受容体活性
- 配列特異的DNA結合
- 転写活性化因子活性
- DNA結合
- 核受容体活性
- 亜鉛イオン結合
- タンパク質結合
- 金属イオン結合
- RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合
- DNA結合転写抑制活性、RNAポリメラーゼII特異的
- DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
- レチノイン酸応答要素結合
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写開始
- 転写の調節、DNAテンプレート
- RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御
- 転写、DNAテンプレート
- シグナル伝達
- ステロイドホルモンを介したシグナル伝達経路
- 細胞内受容体シグナル伝達経路
- 核酸テンプレート転写の正の制御
- 神経系の発達
- ニューロン投射発達の負の調節
- RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | | |
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NM_010151 NM_001347538 NM_001347539 |
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| RefSeq (タンパク質) | | NP_001334467 NP_001334468 NP_034281 NP_001390702 NP_001390704
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NP_001390706 |
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| 場所 (UCSC) | 5 章: 93.58 – 93.59 Mb | 13 章: 78.34 – 78.35 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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COUP-TF1(COUP 転写因子1 )はNR2F1(核受容体サブファミリー2、グループF 、メンバー1)としても知られ、ヒトではNR2F1遺伝子によってコードされるタンパク質です。[5] [6]このタンパク質はステロイドホルモン受容体 の核ホルモン受容体ファミリーのメンバーです。
関数
Coup(ニワトリ卵白アルブミン上流プロモーター)転写因子は卵白アルブミンプロモーターに結合し、別のタンパク質(S300-II)と組み合わせて転写の開始を刺激します。[7] [8] COUP-TF1は5'-AGGTCA-3'モチーフの直接反復配列と回文配列の両方に結合します。 [9]
インタラクション
COUP-TFI は以下と相互作用することが示されています:
臨床
この遺伝子の変異はボッシュ・ブーンストラ・シャーフ視神経萎縮症候群と関連している。[13]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000175745 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000069171 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「Entrez 遺伝子: NR2F1 核受容体サブファミリー 2、グループ F、メンバー 1」。
- ^ Qiu Y、Krishnan V、Zeng Z、Gilbert DJ、Copeland NG、Gibson L、Yang-Feng T、Jenkins NA、Tsai MJ、Tsai SY (1995 年 9 月)。「マウスおよびヒトの COUP-TF I および II 遺伝子の単離、特徴付け、および染色体局在」。Genomics . 29 ( 1): 240–6. doi : 10.1006/geno.1995.1237 . PMID 8530078。
- ^ Sagami I, Tsai SY, Wang H, Tsai MJ, O'Malley BW (1986年12月). 「オボアルブミン遺伝子の転写に必要な2つの因子の同定」.分子細胞生物学. 6 (12): 4259–67. doi :10.1128/MCB.6.12.4259. PMC 367207. PMID 3796602 .
- ^ Tsai SY、Sagami I、Wang H、Tsai MJ、O'Malley BW (1987年8月)。「DNA結合転写因子(COUP)と非DNA結合因子(S300-II)の相互作用」。Cell . 50 (5):701–9. doi :10.1016/0092-8674(87)90328-X. PMID 3040258. S2CID 25136877.
- ^ Tsai SY、Tsai MJ (1997年4月)。「ニワトリ卵白アルブミン上流プロモーター転写因子(COUP-TF):成熟期」。内分泌レビュー。18 (2):229–40。doi :10.1210/ edrv.18.2.0294。PMID 9101138。
- ^ ab Avram D、Fields A、Pretty On Top K、Nevrivy DJ、Ishmael JE、Leid M (2000 年 4 月)。「ニワトリ卵白アルブミン上流プロモーター転写因子 (COUP-TF) オーファン核受容体による転写抑制に関与する C(2)H(2) ジンクフィンガータンパク質の新規ファミリーの単離」。The Journal of Biological Chemistry。275 ( 14): 10315–22。doi : 10.1074 / jbc.275.14.10315。PMC 2819356。PMID 10744719。
- ^ Dressel U、Thormeyer D、Altincicek B、Paululat A、Eggert M、Schneider S、Tenbaum SP、Renkawitz R、Baniahmad A (1999 年 5 月)。「Alien は、核ホルモン受容体スーパーファミリーのメンバーのコリプレッサーの特性を持つ高度に保存されたタンパク質です」。分子細胞生物学。19 (5): 3383–94。doi : 10.1128/ mcb.19.5.3383。PMC 84131。PMID 10207062。
- ^ Métivier R, Gay FA, Hübner MR, Flouriot G, Salbert G, Gannon F, Kah O, Pakdel F (2002 年 7 月). 「hER α-COUP-TFI 複合体の形成は、MAPK による Ser118 リン酸化を介して hER α AF-1 を増強する」. The EMBO Journal . 21 (13): 3443–53. doi :10.1093/emboj/cdf344. PMC 126093. PMID 12093745 .
- ^ Hobbs MM、Wolters WC、Rayapati AO (2020) 32歳男性における新規発症精神病として現れたボッシュ・ブーンストラ・シャーフ視神経萎縮症候群:症例報告と文献レビュー。J Psychiatr Pract 26(1):58-62
外部リンク
さらに読む
- Kliewer SA、Umesono K、Heyman RA、Mangelsdorf DJ、Dyck JA、Evans RM (1992 年 2 月)。「レチノイド X 受容体と COUP-TF の相互作用がレチノイン酸シグナル伝達を調節する」。米国科学アカデミー紀要。89 (4): 1448–52。Bibcode : 1992PNAS ...89.1448K。doi : 10.1073 / pnas.89.4.1448。PMC 48468。PMID 1311101。
- Berrodin TJ、Marks MS、Ozato K、Linney E、Lazar MA (1992 年 9 月)。「甲状腺ホルモン受容体、レチノイン酸受容体、レチノイド X 受容体、ニワトリ卵白アルブミン上流プロモーター転写因子、および内因性肝臓タンパク質間のヘテロ二量体形成」。分子内分泌学。6 ( 9): 1468–78。doi : 10.1210/ mend.6.9.1331778。PMID 1331778。S2CID 24291055 。
- Ing NH、Beekman JM、Tsai SY、Tsai MJ、O'Malley BW (1992 年 9 月)。「ステロイドホルモン受容体スーパーファミリーのメンバーは TFIIB (S300-II) と相互作用する」。The Journal of Biological Chemistry。267 ( 25): 17617–23。doi : 10.1016/ S0021-9258 (19)37087-5。PMID 1517211。
- Wang LH、Tsai SY、 Cook RG、Beattie WG、Tsai MJ、O'Malley BW (1989 年 7 月)。「COUP 転写因子はステロイド受容体スーパーファミリーのメンバーです」。Nature . 340 ( 6229 ): 163–6。Bibcode : 1989Natur.340..163W。doi : 10.1038/340163a0。PMID 2739739。S2CID 4364164。
- Miyajima N, Kadowaki Y, Fukushige S, Shimizu S, Semba K, Yamanashi Y, Matsubara K, Toyoshima K, Yamamoto T (1988 年 12 月)。「分子クローニングによる erbA スーパーファミリーの 2 つの新規メンバーの同定: 2 つの遺伝子産物は互いに高度に関連している」。核酸研究。16 ( 23 ): 11057–74。doi :10.1093/ nar /16.23.11057。PMC 338996。PMID 2905047 。
- Sawaya BE、Rohr O、Aunis D 、 Schaeffer E (1996 年 9 月)。「ニワトリ卵白アルブミン上流プロモーター転写因子、ヒト脳細胞における HIV-1 遺伝子発現の転写活性化因子」。The Journal of Biological Chemistry。271 ( 38): 23572–6。doi : 10.1074/ jbc.271.38.23572。PMID 8798567 。
- Rohr O、Aunis D、Schaeffer E (1997 年 12 月)。「COUP-TF と Sp1 は、ヒトミクログリア細胞におけるヒト免疫不全ウイルス 1 型長末端反復配列の転写活性化において相互作用し、協力する」。The Journal of Biological Chemistry。272 ( 49): 31149–55。doi : 10.1074/ jbc.272.49.31149。PMID 9388268。
- Dressel U、Thormeyer D、Altincicek B、Paululat A、Eggert M、Schneider S、Tenbaum SP、Renkawitz R、Baniahmad A (1999 年 5 月)。「Alien は、核ホルモン受容体スーパーファミリーのメンバーに対するコリプレッサーの特性を持つ高度に保存されたタンパク質です」。分子細胞生物学。19 (5): 3383–94。doi :10.1128 / mcb.19.5.3383。PMC 84131。PMID 10207062。
- Klinge CM、Kaur K、Swanson HI (2000 年 1 月)。「アリール炭化水素受容体はエストロゲン受容体アルファおよびオーファン受容体 COUP-TFI および ERRalpha1 と相互作用する」。生化学および生物物理学のアーカイブ。373 (1): 163–74。doi :10.1006 / abbi.1999.1552。PMID 10620335 。
- Rohr O、Schwartz C、Hery C、Aunis D、Tardieu M、Schaeffer E (2000 年 1 月)。「核受容体ニワトリオボアルブミン上流プロモーター転写因子は HIV-1 Tat と相互作用し、ヒトミクログリア細胞におけるウイルス複製を刺激する」。The Journal of Biological Chemistry。275 ( 4): 2654–60。doi : 10.1074/jbc.275.4.2654。PMID 10644726。
- Sugiyama T、Wang JC、Scott DK、Granner DK (2000 年 2 月)。「オーファン核受容体、ニワトリ卵白アルブミン上流プロモーター転写因子 I (COUP-TFI) による転写活性化。ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ遺伝子のグルココルチコイド応答に関与するドメインの定義」。The Journal of Biological Chemistry。275 ( 5): 3446–54。doi : 10.1074/jbc.275.5.3446。PMID 10652338。
- Vlahou A、Flytzanis CN (2000 年 2 月)。「初期胚細胞周期における核受容体 COUP-TF の細胞内輸送」。発達生物学。218 ( 2 ) : 284–98。doi : 10.1006 /dbio.1999.9456。PMID 10656770。
- Avram D、Fields A、Pretty On Top K、Nevrivy DJ、Ishmael JE、Leid M (2000 年 4 月)。「ニワトリ卵白アルブミン上流プロモーター転写因子 (COUP-TF) の孤児核受容体による転写抑制に関与する C(2)H(2) ジンクフィンガータンパク質の新規ファミリーの分離」。The Journal of Biological Chemistry。275 ( 14 ): 10315–22。doi : 10.1074 / jbc.275.14.10315。PMC 2819356。PMID 10744719。
- Gay F、Anglade I、Gong Z 、 Salbert G (2000 年 10 月)。「LIM/ホメオドメインタンパク質 islet-1 はエストロゲン受容体の機能を調節する」。 分子内分泌学。14 (10): 1627–48。doi : 10.1210 / me.14.10.1627。PMID 11043578。
- You M、Fischer M、Cho WK、Crabb D (2002 年 2 月)。「肝細胞核因子 4 によるヒトアルデヒド脱水素酵素 2 プロモーターの転写制御: 環状 AMP および COUP 転写因子による阻害」。生化学および生物物理学のアーカイブ。398 ( 1 ) : 79–86。doi : 10.1006/ abbi.2001.2713。PMID 11811951。
- Lin F、Kolluri SK、Chen GQ 、 Zhang XK (2002 年 6 月)。「レチノイン酸誘導による AP-1 活性阻害の、オーファン受容体ニワトリオボアルブミン上流プロモーター転写因子による制御」。The Journal of Biological Chemistry。277 (24): 21414–22。doi : 10.1074/ jbc.M201885200。PMID 11934895。
- Métivier R、Gay FA、Hübner MR、Flouriot G、Salbert G、Gannon F、Kah O、Pakdel F (2002 年 7 月)。「hER α-COUP-TFI 複合体の形成は、MAPK による Ser118 リン酸化を介して hER α AF-1 を増強する」。EMBOジャーナル。21 ( 13 ) : 3443–53。doi :10.1093/ emboj /cdf344。PMC 126093。PMID 12093745 。
- Yu X、Mertz JE (2003 年 2 月)。「核受容体 HNF4alpha および COUP-TF1 による B 型肝炎ウイルスの転写制御の異なるモード」。Journal of Virology。77 ( 4 ) : 2489–99。doi : 10.1128 /JVI.77.4.2489-2499.2003。PMC 141100。PMID 12551987 。
この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。