ヒトのタンパク質コード遺伝子
| CLEC1B |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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2C6U、3WSR、3WWK |
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| 識別子 |
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| エイリアス | CLEC1B、1810061I13Rik、CLEC2、CLEC2B、PRO1384、QDED721、C 型レクチンドメインファミリー 1 メンバー B |
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| 外部ID | オミム:606783; MGI : 1913287;ホモロジーン: 49468;ジーンカード:CLEC1B; OMA :CLEC1B - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体6(マウス)[2] |
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| | バンド | 6|6 F3 | 始める | 129,374,260 bp [2] |
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| 終わり | 129,386,298 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 単球
- 睾丸
- 肝臓
- 肝臓の右葉
- 顆粒球
- 海綿骨
- 血
- 骨髄
- 頬粘膜細胞
- 骨髄細胞
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| | トップの表現 | - 血
- 脛骨大腿関節
- 脾臓
- 腸間膜リンパ節
- 顆粒球
- 肝胆道系
- 肝臓
- 胚
- 右肺
- 右肺葉
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- タンパク質結合
- 炭水化物結合
- 膜貫通シグナル受容体活性
| | 細胞成分 |
- 膜の不可欠な構成要素
- 細胞膜
- 細胞膜の不可欠な構成要素
- 膜
| | 生物学的プロセス |
- 血小板活性化
- 防御反応
- 細胞表面受容体シグナル伝達経路
- 血小板形成
- シグナル伝達
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001099431 NM_016509 NM_001393342 |
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NM_001204239 NM_001204253 NM_019985 |
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| RefSeq (タンパク質) | | |
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NP_001191168 NP_001191182 NP_064369 |
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| 場所 (UCSC) | 12 章: 9.99 – 10.01 Mb | 6 章: 129.37 – 129.39 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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C型レクチンドメインファミリー1メンバーBは、ヒトではCLEC1B遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
ナチュラルキラー(NK)細胞は、CD94(KLRD1; MIM 602894)やNKG2D(KLRC4; MIM 602893)などの複数のカルシウム依存性(C型)レクチン様受容体を発現しており、主要組織適合性複合体クラスI分子と相互作用して細胞毒性やサイトカイン分泌を阻害または活性化します。CLEC2は、骨髄細胞とNK細胞で発現するC型レクチン様受容体です。[OMIM提供] [7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000165682 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000030159 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Colonna M、Samaridis J、Angman L (2000 年 3 月)。「2 つ の新規 C 型レクチン様受容体の分子特性、そのうちの 1 つはヒト樹状細胞で選択的に発現している」。Eur J Immunol。30 ( 2): 697–704。doi : 10.1002/1521-4141(200002)30:2<697::AID-IMMU697>3.0.CO;2- M。PMID 10671229 。
- ^ Sobanov Y, Bernreiter A, Derdak S, Mechtcheriakova D, Schweighofer B, Duchler M, Kalthoff F, Hofer E (2001 年 12 月). 「単球、樹状細胞、内皮細胞で発現するレクチン様受容体遺伝子の新規クラスターは、ヒト NK 遺伝子複合体の NK 受容体遺伝子の近くに位置している」Eur J Immunol . 31 (12): 3493–503. doi :10.1002/1521-4141(200112)31:12<3493::AID-IMMU3493>3.0.CO;2-9. PMID 11745369. S2CID 42415487.
- ^ ab "Entrez Gene: CLEC1B C 型レクチンドメインファミリー 1、メンバー B"。
外部リンク
さらに読む
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Clark HF、Gurney AL、Abaya E、他 (2003)。「分泌タンパク質発見イニシアチブ (SPDI)、新規ヒト分泌タンパク質および膜貫通タンパク質を同定するための大規模な取り組み: バイオインフォマティクス評価」。Genome Res . 13 (10): 2265–70. doi :10.1101/gr.1293003. PMC 403697. PMID 12975309 。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Suzuki-Inoue K, Fuller GL, García A, et al. (2006). 「C 型レクチン受容体 CLEC-2 による血小板活性化の新たな Syk 依存性メカニズム」Blood . 107 (2): 542–9. doi :10.1182/blood-2005-05-1994. PMID 16174766. S2CID 168505.
- Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173–8。Bibcode :2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038 /nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。
- Watson AA、O'Callaghan CA (2006) 。「ヒトCLEC-2の結晶化とX線回折分析」。Acta Crystallographica Section F 。61 ( Pt 12): 1094–6。doi : 10.1107 /S1744309105037991。PMC 1978148。PMID 16511244。
- Scherer SE、 Muzny DM、 Buhay CJ、他 (2006)。「ヒト染色体 12 の完成した DNA 配列」。Nature . 440 ( 7082 ): 346–51。Bibcode :2006Natur.440..346S。doi : 10.1038/nature04569。PMID 16541075。
- Chaipan C、Soilleux EJ、Simpson P、et al. (2006)。「DC-SIGN と CLEC-2 は血小板によるヒト免疫不全ウイルス 1 型の捕捉を仲介する」。J . Virol . 80 (18): 8951–60. doi :10.1128/JVI.00136-06. PMC 1563896. PMID 16940507 。
- Watson AA、Brown J、Harlos K、et al. (2007)。「血小板活性化受容体CLEC-2の細胞外ドメインの結晶構造と変異結合分析」。J . Biol. Chem . 282 (5): 3165–72. doi : 10.1074/jbc.M610383200 . PMID 17132623。
- Suzuki-Inoue K, Kato Y, Inoue O, et al. (2007). 「癌細胞によるポドプラニン媒介血小板活性化におけるヘビ毒受容体 CLEC-2 の関与」J. Biol. Chem . 282 (36): 25993–6001. doi : 10.1074/jbc.M702327200 . PMID 17616532.
- Watson AA、 Eble JA、O'Callaghan CA (2008)。「血小板活性化受容体CLEC-2のリガンドであるロドサイチンの結晶構造」。タンパク質科学。17 (9 ) : 1611–6。doi : 10.1110/ps.035568.108。PMC 2525532。PMID 18583525。