ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| CBFA2T2 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | CBFA2T2、EHT、MTGR1、ZMYND3、p85、CBFA2/RUNX1 転座パートナー 2、CBFA2/RUNX1 パートナー転写コリプレッサー 2 |
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| 外部ID | オミム:603672; MGI : 1333833;ホモロジーン: 3733;ジーンカード:CBFA2T2; OMA :CBFA2T2 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体2(マウス)[2] |
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| | バンド | 2|2 H1 | 始める | 154,278,401 bp [2] |
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| 終わり | 154,381,276 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 頬粘膜細胞
- 神経節隆起
- 中側頭回
- 腓骨神経
- 視床の外側核群
- 網状部
- 外淡蒼球
- 上腕二頭筋の腱
- 前立腺
- 視床下核
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| | トップの表現 | - 黒質
- パネートセル
- 心室帯
- 窩
- バレル皮質
- 神経節隆起
- 帯状回
- 顆頭
- 水晶体上皮
- 胎児の尾
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- DNA結合転写因子活性
- タンパク質結合
- 転写コリプレッサー活性
- 金属イオン結合
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- ニューロン投射発達の負の調節
- 転写の負の調節、DNAテンプレート
- 転写の調節、DNAテンプレート
- 上皮細胞の分化
- 転写、DNAテンプレート
- ニューロン投射発達の正の調節
- RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御
- Notchシグナル伝達経路の負の制御
- 腸管上皮細胞の分化
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001032999 NM_001039709 NM_005093 NM_175864 |
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NM_001285446 NM_009823 NM_172860 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001028171 NP_001034798 NP_005084 |
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NP_001272375 NP_033953 NP_766448 |
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| 場所 (UCSC) | 20 章: 33.49 – 33.65 Mb | 2 章: 154.28 – 154.38 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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タンパク質CBFA2T2は、ヒトではCBFA2T2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
関数
急性骨髄性白血病、特にM2サブタイプでは、t(8;21)(q22;q22)転座は最も頻繁にみられる核型異常の1つです。転座により、RUNX1 (AML1)遺伝子の5'領域とCBFA2T1 (MTG8)遺伝子の3'領域が融合したキメラ遺伝子が生成されます。キメラタンパク質は、核コリプレッサー/ヒストン脱アセチル化酵素複合体と結合して造血分化を阻害すると考えられています。この遺伝子によってコードされるタンパク質はAML1-MTG8複合体に結合し、白血病形成を促進する上で重要である可能性があります。この遺伝子にはいくつかの転写バリアントが存在すると考えられていますが、全長の性質が記述されているのは3つだけです。[6]
インタラクション
CBFA2T2はRUNX1T1と相互作用することが示されている。[7] [8] [9]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000078699 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000038533 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Calabi F, Cilli V (1998年12月). 「ヒト白血病で再配列した遺伝子CBFA2T1は、多遺伝子ファミリーのメンバーである」. Genomics . 52 (3): 332–41. doi :10.1006/geno.1998.5429. PMID 9790752.
- ^ ab "Entrez 遺伝子: CBFA2T2 コア結合因子、ラントドメイン、アルファサブユニット 2; 転座先、2".
- ^ ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實・岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ・グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルシュタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサク S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M ( 2005 年 10 月)。 「ヒトのタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールのマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- ^
- ^ ホーヘフェーン AT、ロセッティ S、ストヤノヴァ V、シェーンケレン J、フェナローリ A、スキアフォナーティ L、ファン ウネン L、サッキ N (2002 年 9 月)。 「転写コリプレッサーMTG16aには、t(16;21)陽性骨髄性悪性腫瘍において乱れた新規の核小体標的配列が含まれている。」がん遺伝子。21 (43): 6703–12。土井:10.1038/sj.onc.1205882。PMID 12242670。
さらに読む
- 北林 郁、井田 健、諸星 文、横山 明、三橋 暢、清水 健、野村 暢、林 勇、大木 正 (1998)。「AML1-MTG8 白血病融合タンパク質は、MTG8(ETO/CDR) ファミリーの新規メンバーである MTGR1 と複合体を形成する」。Mol . Cell. Biol . 18 (2): 846–58. doi :10.1128/MCB.18.2.846. PMC 108796. PMID 9447981 。
- Fracchiolla NS、Colombo G、Finelli P、Maiolo AT、Neri A (1998)。「MTG8/ETO 遺伝子ファミリーの新しいメンバーである EHT は、20q11 領域にマップされ、急性骨髄性白血病で欠失しています」。Blood . 92 ( 9): 3481–4. doi :10.1182/blood.V92.9.3481. PMID 9787195。
- 諸星F、三谷俊、三橋直、北林一、高橋英、鈴木正、宗像直、大木正 (2000) 「ヒトMTG8/ETOファミリー遺伝子MTGR1の構造と発現パターン」。遺伝子。241 (2): 287–95。土井:10.1016/S0378-1119(99)00481-3。PMID 10675041。
- ホーヘフェーン AT、ロセッティ S、ストヤノヴァ V、シェーンケレン J、フェナローリ A、スキアフォナーティ L、ファン ウネン L、サッキ N (2002)。 「転写コリプレッサーMTG16aには、t(16;21)陽性骨髄性悪性腫瘍において乱れた新規の核小体標的配列が含まれている。」がん遺伝子。21 (43): 6703–12。土井:10.1038/sj.onc.1205882。PMID 12242670。
- Brandenberger R、Wei H、Zhang S、Lei S、Murage J、Fisk GJ、Li Y、Xu C、Fang R、Guegler K、Rao MS、Mandalam R、Lebkowski J、Stanton LW (2005)。「トランスクリプトーム特性評価により、ヒト ES 細胞の成長と分化を制御するシグナル伝達ネットワークが解明」。Nat . Biotechnol . 22 (6): 707–16. doi :10.1038/nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
- Beausoleil SA、Jedrychowski M、Schwartz D、Elias JE、Villén J、Li J、Cohn MA、Cantley LC、Gygi SP (2004)。「HeLa 細胞核リン酸化タンパク質の大規模特性評価」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 101 ( 33 ): 12130–5。Bibcode : 2004PNAS..10112130B。doi : 10.1073/ pnas.0404720101。PMC 514446。PMID 15302935。
- Zhang J、Kalkum M、Yamamura S、Chait BT、Roeder RG (2004)。「白血病誘発性AML1-ETO融合タンパク質によるEタンパク質サイレンシング」。Science。305 ( 5688 ) : 1286–9。Bibcode : 2004Sci ... 305.1286Z。doi :10.1126/science.1097937。PMID 15333839。S2CID 850967 。
- ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實=岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ=グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグDS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M ( 2005)。 「ヒトのタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールのマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Lim J、Hao T、Shaw C、Patel AJ、Szabó G、Rual JF、Fisk CJ、Li N、Smolyar A、Hill DE、Barabási AL、Vidal M、Zoghbi HY (2006)。「ヒト遺伝性運動失調症およびプルキンエ細胞変性症のタンパク質間相互作用ネットワーク」。Cell . 125 ( 4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569. S2CID 13709685。
- Kumar R、Manning J、Spendlove HE、Kremmidiotis G、McKirdy R、Lee J、Millband DN、Cheney KM、Stampfer MR、Dwivedi PP、Morris HA、Callen DF (2006)。「新規ジンクフィンガータンパク質ZNF652は、推定乳がん抑制因子CBFA2T3と相互作用して転写を抑制する」。Mol . Cancer Res . 4 (9): 655–65. doi : 10.1158/1541-7786.MCR-05-0249 . PMID 16966434。
外部リンク
- CBFA2T2+タンパク質、+ヒト、米国国立医学図書館医学件名表(MeSH)
- UCSC ゲノム ブラウザのヒト CBFA2T2 ゲノムの位置と CBFA2T2 遺伝子の詳細ページ。
この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。