バークホルデリア

バークホルデリア
	血液寒天培地上のB. pseudomalleiコロニー。
科学的分類
ドメイン：	細菌
門:	シュードモナドタ
クラス：	ベータプロテオバクテリア
注文：	バークホルデリア目
家族：	ブルクホルデリア科
属:	バークホルデリア薮内他1993年;
タイプ種
	バークホルデリア・セパシア; (Palleroni と Holmes 1981) 薮内ら。 1993年
種
	テキストを参照

BurkholderiaはPseudomonadota属の一種でその病原性メンバーには、ヒトを攻撃するBurkholderia cepacia複合体、主に馬や関連動物に発生する疾患である鼻疽の原因となるBurkholderia mallei 、類鼻疽の原因となるBurkholderia pseudomallei、嚢胞性線維症(CF)患者の肺感染症の重要な病原体であるBurkholderia cepacia^{が含まれます。 [3]}Burkholderia属の種は海洋環境にも見られます。SI Paul ら (2021)^{[4] は}、バングラデシュのベンガル湾にあるセントマーチン島の海綿動物からBurkholderia cepacia を分離し、特徴付けました。^[4]

Burkholderia （以前はPseudomonasの一部）属名は、実質的に遍在するグラム陰性、偏性好気性、桿菌の一群を指し、単一または複数の極性鞭毛によって運動しますが、 Burkholderia malleiは非運動性です。^{[4]この属に属するメンバーは鞘や}プロステッカを生成せず、成長のためにポリ-β-ヒドロキシ酪酸（PHB）を利用できます。この属には、動物病原体と植物病原体の両方と、環境的に重要な種が含まれます。特に、B. xenovorans （以前はPseudomonas cepacia 、その後B. cepaciaおよびB. fungorumと命名されました）は、カタラーゼ陽性（慢性肉芽腫性疾患の患者に影響）であり、塩素系殺虫剤とポリ塩化ビフェニルを分解する能力があることで知られています。保存されたRNA構造である抗hemB RNAモチーフは、この属の既知の細菌すべてに見られる。^[5]

B. malleiとB. pseudomallei は、抗生物質耐性と関連疾患による高い死亡率のため、家畜や人間を標的とした潜在的な生物兵器であると考えられています。

歴史

この属はコーネル大学の植物病理学者ウォルター・H・バークホルダーにちなんで命名された。この属に最初に分類された種は、様々な生化学検査に基づいてシュードモナス属^{から移入されたものである。 [1]}^[2]

最近まで、バークホルデリア属にはパラバークホルデリア属の全ての種が含まれていました。^{[6]しかし、}パラバークホルデリア属は系統学的に異なり、各属に固有の分子シグネチャに基づいてバークホルデリア属の全ての種と区別することができます。 ^[7]

分類

Burkholderia属の種は、ベータプロテオバクテリアのBurkholderiales目内の単系統群を形成している。^[4]現在、48の有効な命名種は、さまざまなタンパク質の保存された特徴的なインデルによって、関連属（つまりParaburkholderia）および他のすべての細菌と区別することができる。 ^{[7]これらのインデルは、すべての}Burkholderia属種に共通する排他的な祖先を表している。

この属には3つの異なる単系統群がある。1つのグループはBurkholderia cepacia複合体に属するすべての種から成り、もう1つの系統群はB. pseudomalleiと近縁種から成り、最後の系統群はB. glumaeやB. gladioliを含む属内の植物原性の種のほとんどを包含する。^[7]保存されたシグネチャーインデルは属内のこれらのサブグループに特有のものであり、この極めて大きく多様な属のメンバーを区別するのに役立つ。^[7]^[8]

研究

最近、ブルクホルデリア属菌の研究では、抗生物質に対する代謝反応、細菌群集間の接触依存的相互作用、有益な産物を生み出すゲノムの可能性など、さまざまなトピックと特性が調査されています。^[9]^[10]^[11]

Burkholderia属細菌では、トリメトプリムなどの特定の抗生物質が大量のメタボロームを誘導・アップレギュレーションし、Burkholderia thailandensisで 100 を超えるサイレント二次代謝産物遺伝子クラスターを誘導することが示されています。^[9]これらのグローバル活性化因子は、病原性細菌種のメタボロームが抗生物質ストレスにどのように反応するか、細菌種がそれに応じてどのように変化するかを調査するための情報源として使用できます。^[9]嚢胞性線維症に関連するBurkholderia属細菌は、トリメトプリムに対してさまざまな二次代謝産物の発現レベルが異なることが示されており、関連細菌株におけるメタボロミクスの個別化特性が強調されています。^[12]

Burkholderiaを用いた細菌間シグナル伝達に焦点を当てた研究では、接触依存性増殖抑制が、特にB. thailandensisにおいて細胞間コミュニケーションの媒介に重要な役割を果たしていることが示されています。^[10]この相互作用では、細胞がタンパク質毒素を周囲の環境に放出し、対応する保護タンパク質を持つ細胞 (通常は同じ株の細菌) のみが増殖抑制されず、死滅します。さらに、対応するタンパク質を持つ受容細胞は、遺伝子発現と表現型が変化し、バイオフィルムの形でコミュニティ形成を促進します。これは、受容細胞が同じ細菌株でなくても発生するため、このシステムの重要性が強調されます。^{[10]タンパク質毒素をコードする遺伝子と接触依存性抑制システムの残りの部分は、細胞間を移動できる}トランスポゾンの形で移動可能になり、システムのコミュニティの側面に重要です。^[13]このように、接触依存性シグナル伝達は、細菌の自己認識とコミュニティ形成に重要な役割を果たします。^[10]^[13]

Burkholderia属は抗菌剤やバイオサーファクタントなどの有益な製品の潜在的な供給源であることが示されています。^[11]^[14]Burkholderiaは、関連属であるPseudomonas属とともに、ラムノリピドと呼ばれる特定のクラスのバイオサーファクタントを合成できます。Burkholderiaによって合成されたラムノリピドは、（ Pseudomonasによって合成されたものと比較して）異なる化学的特性を持っているため、新しい用途の可能性を秘めています。^[14]^[15]

種

種の一覧: ^[16]

参照

MAEB RNAモチーフ

参考文献

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外部リンク

NIAID が資金提供しているバイオインフォマティクスリソースセンター PATRIC の Burkholderia ゲノムと関連情報
パテマ・バークホルデリアリソース
バークホルデリアゲノムデータベース

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[LPSN-16] 「命名法上認められている原核生物の名前の一覧」。 2016年10月21日閲覧。

歴史

分類

研究

種

参照

参考文献

外部リンク

関連するトピック

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科学的分類

細菌

シュードモナドタ