タイプ（生物学）

生物学において、タイプとは、その生物の学名が正式に関連付けられている特定の標本（または場合によっては標本のグループ）のことである。言い換えれば、タイプとは、その特定の分類群の定義的特徴を固定または集中化するのに役立つ例である。古い用法（1900年以前の植物学）では、タイプは標本ではなく分類群であった。^[1]

分類群とは、公開された詳細な説明（例えば種の説明）と、通常、主要な博物館の研究コレクションや同様の機関で科学者が調査するために利用できるタイプ資料の提供に基づいて、一部の生物を含み他の生物を除外する生物の集合を科学的に命名したものです。^{[1] [2]}

国際動物命名規約（ICZN）と国際藻類菌類植物命名規約（ICN）に定められた厳密な規則によれば、あらゆる分類群の学名は、ほぼ常に特定の標本、場合によっては標本に基づいています。タイプは生物学者、特に分類学者にとって非常に重要です。タイプは通常、博物館や植物標本館の研究コレクションに保管されている物理的な標本ですが、それがない場合は、その分類群の個体の画像がタイプとして指定されることもあります。^{[3]種の記述とタイプ標本の指定は、}科学的命名法とアルファ分類法の一部です。

材料を同定する際、科学者は、関連する分類群に関する理解に基づいて、標本または標本群に分類群名を適用しようとします。^{[要説明] [要出典]}少なくともタイプ記述を読んだことに基づいて、^[要出典]できれば関連する分類群すべてのタイプ材料の調査にも基づきます。命名されたタイプが複数あり、すべて同じ分類群であると思われる場合は、最も古い名前が優先され、手元にある材料の正しい名前と見なされます。一方、分類群がまったく命名されていないと思われる場合は、科学者または他の資格のある専門家がタイプ標本を選択し、新しい名前と公式の説明を公開します。^[要出典]

問題の生物に適用される命名コードに応じて、タイプは標本、培養物、図、または（細菌学コードの下では）説明になることがあります。一部のコードでは、従属分類群をタイプと見なしますが、植物学コードの下では、タイプは常に標本または図です。^{[引用が必要]}

たとえば、ロンドン自然史博物館の研究コレクションには、1886.6.24.20 という番号が付けられた鳥の標本があります。これは、現在Circus assimilisという学名を持つ、一般にはクロチュウヒとして知られている鳥の一種の標本です。この特定の標本はその種のホロタイプです。Circus assimilisという名前は、定義上、その特定の標本の種を指します。その種は 1828 年にジャーディンとセルビーによって命名され、記載され、ホロタイプは他の科学者が必要に応じて参照できるように博物館のコレクションに収められました。^{[出典が必要]}

少なくともタイプ標本の場合、「典型的な」個体を使用する必要はない。属や科、特に初期の分類学者によって確立されたものは、その属や科にとってより「典型的な」種にちなんで命名される傾向があるが、この場合も常にそうであるとは限らず、系統学の変化によりそうすることが できなくなった。したがって、生物学的タイプは「典型的な」個体や分類群を定義するのではなく、特定の操作的分類単位に学名を固定するという事実を示すために、名を冠したタイプまたは擬音語という用語が時々使用される。タイプ標本は理論的には異常な個体や奇形の個体、または色のバリエーションであっても許容されるが、個体がどの集団に属していたかを判断するのが難しくなるため、そのように選択されることはめったにない。^{[1] [2] [4]}

タイプという用語の使用法は、植物学と動物学で若干異なる用法があるため、やや複雑です。PhyloCode では、タイプに基づく定義は系統学的定義に置き換えられています。^[要出典]

古い分類学の著作では、「タイプ」という言葉が別の意味で使われることがある。最初の植物命名法では意味は同様であったが、^{[5] [6] 、他の著作では}「分類群」という用語に近い意味を持つ。^[7]

セクションの種類を区別するための特性を確認してください。 ... さまざまな形式の研究を行った後、具体的なタイプを検討してください。

翻訳: この単一の特徴により、このタイプをセクションの他のすべての種と区別することができます...さまざまな形態を研究した後、私はそれらが1つの同じ特定のタイプに属すると考えるに至りました。

植物命名法では、タイプ（typus、命名法タイプ）は「分類群の名前が恒久的に付けられる要素である」（第7.2条）^[8]。植物学では、タイプは標本または図解のいずれかである。標本とは、実際の植物（または植物の1つ以上の部分、または小さな植物の束）であり、死んで植物標本室（または菌類の同等物）で安全に保管され、「精選」されている。図解がタイプとして機能する例としては、次のものがある。

• 植物分類学の初期のころに植物を描いた詳細な絵や絵画など。乾燥した植物は輸送が難しく、将来のために安全に保管するのも困難でした。植物学の初期のころの標本の多くは、その後紛失したり損傷したりしました。忠実で詳細なイラストを描くために、植物学者は熟練した植物画家を雇ったことがありました。そのようなイラストの中には、最良の記録となり、分類群のタイプとして選ばれているものもあります。
• 顕微鏡でのみ見ることができるものの詳細な写真。顕微鏡のスライド上の小さな「植物」は、タイプとしては不適切です。顕微鏡のスライドが紛失または破損している可能性があり、顕微鏡のスライド上の他のものの中から問題の「植物」を見つけるのが非常に難しい場合があります。イラストは、はるかに信頼性の高いタイプになります ( 2006 年ウィーン法典第 37.5 条)。

タイプは、分類群の限定を決定するものではありません。たとえば、タンポポは議論の多い分類群です。タンポポは 100 種以上から成ると考える植物学者もいれば、1 種とみなす植物学者もいます。Taraxacum officinaleという名前の種類は、種の限定にすべての小さな種が含まれる場合 ( Taraxacum officinaleは「大きな」種) でも、限定が他の 100 種のうちの 1 つの小さな種に限定されている場合 ( Taraxacum officinaleは「小さな」種) でも同じです。Taraxacum officinaleという名前は同じで、名前の種類も同じですが、実際に名前が適用される範囲は大きく異なります。分類群の限定の設定は、分類学者が出版物で行います。

雑記：

1. 種または種内分類群のみが独自のタイプを持つことができます。これらのランクのほとんどの新しい分類群(2007 年 1 月 1 日以降に公開、記事 37) では、タイプは図解であってはなりません。
2. 属は、その属に属する種のうちの一つと同一のタイプを有する（第10条）。
3. 科はその属のうちの一つと同じ型を持つ（第10条）。

ICNはさまざまな種類のタイプ（第9条および用語集）のリストを提供しており、^[8]その中で最も重要なのはホロタイプである。これらは

• ホロタイプ – 著者が名前の命名上のタイプであると明確に示した単一の標本またはイラスト
• レクトタイプ – ホロタイプが指定されていない場合、またはホロタイプが紛失または破壊された場合に、元の資料から命名上のタイプとして指定された標本または図解
• アイソタイプ – ホロタイプの複製
• シンタイプ - ホロタイプがない場合に元の記述で引用された標本（または図）、または同時にタイプとして指定された2つ以上の標本のうちの1つ
• パラタイプ – ホロタイプでもアイソタイプでもシンタイプでもない、元の記述で引用された標本（または図）
• ネオタイプ – 元の記述から資料が入手できない場合に命名上のタイプとして使用するために選択された標本またはイラスト
• エピタイプ – 通常は別の種類のタイプが識別に必要な重要な特徴を示さない場合に、解釈タイプとして使用するために選択された標本またはイラスト

「タイプ」という単語は、 ICNではステータスを持たないいくつかの古い用語の一部として植物学文献に登場します。たとえば、クロノタイプなどです。

動物学の命名法では、種または亜種のタイプは標本または標本のシリーズです。属または亜属のタイプは種です。属を超える分類群 (科など) のタイプは属です。上科より上位の分類群の名前にはタイプはありません。「名を冠するタイプ」とは、「名目上の分類群の名前の適用を決定できる客観的な基準を提供する」標本または画像のことです。^{[引用が必要]}

• タイプ標本は、種の様々な名前を持つタイプのいずれかである個体または化石に対して通常使用される俗語（正式に定義された用語ではない）です。たとえば、ホモネアンデルターレンシス 種のタイプ標本は、1856年にドイツのネアンデル渓谷のフェルトホーファーでヨハン・カール・フールロットによって発見された標本「ネアンデルタール人1」であり、頭蓋骨、大腿骨、骨盤の一部、肋骨の一部、腕と肩の骨の一部で構成されていました。タイプ標本は複数存在する場合がありますが、ホロタイプは（少なくとも現代では）1つだけです。
• タイプ種とは、名目属または名目亜属の命名基準となる名目種である。
• タイプ属は、名目上の科グループ分類群の命名タイプである名目上の属です。
• タイプシリーズとは、著者が明示的または暗黙的にシリーズの一部として除外しない限り、著者が分類群の正式な説明に含めるすべての標本です。

実際には、生物学者は、公式に公表された種の説明を書く前に、新しい分類群の多くの標本（入手可能な場合）を調べることがありますが、種の命名に関する正式な規則（国際動物命名規約）では、公表された説明の一部として単一のタイプを指定する必要があります。^{[引用が必要]}

タイプ標本の説明には、診断（通常は近縁種との類似点と相違点についての議論）と、タイプ標本が検査のために保管されている場所の記載が含まれなければならない。タイプ標本が最初に発見された地理的場所は、その標本が属する場所として知られている。タイプ地域。寄生虫の場合、タイプ宿主（または共生型）は、タイプ標本が得られた宿主生物を示すために使用されます。^[9]

動物学のコレクションは、大学や博物館によって管理されています。タイプが良好な状態に保たれ、分類学者による調査に利用できるようにすることが、このようなコレクションの 2 つの重要な機能です。ホロタイプは 1 つしか指定されませんが、他にも「タイプ」標本が存在する可能性があり、正式に定義されているのは次の通りです。

単一の標本が元の記述で明確に指定されている場合、この標本はその種のホロタイプとして知られています。 ^[10]ホロタイプは通常、大規模な博物館や同様のよく知られた公共のコレクションに保管され、後で他の生物学者が自由に調査できるようにします。

元の記述でホロタイプが指定されていた場合、著者が同じ種の追加の代表として指定する追加の標本が存在する可能性があり、これをパラタイプと呼びます。これらは名前の付いたタイプではありません。^{[引用が必要]}

アロタイプとは、ホロタイプとは反対の性別の標本で、パラタイプの中から指定される。この言葉は、化石のホロタイプには見られない特徴を示す標本に対してもかつて使われていた。^{[11]この用語は}ICZNによ​​って規制されていない。^[要出典]

ネオタイプとは、オリジナルのホロタイプが紛失または破壊された場合、あるいはオリジナルの著者が標本を引用しなかった場合に、唯一のタイプ標本として後から選択された標本です。

シンタイプとは、ホロタイプが指定されていない種の説明に記載されている 2 つ以上の標本のうちの 1 つです。歴史的には、シンタイプは明示的にそのように指定されることがよくあり、現在の ICZN でもこれは必須ですが、シンタイプに基づいて種の説明を公開する現代の試みは、実践的な分類学者から一般的に嫌われており、ほとんどが徐々にレクトタイプに置き換えられています。現在も存在するものは、依然として名前を持つタイプと見なされています。^{[引用が必要]}

レクトタイプは、もともとシンタイプセットから記述された種の単一のタイプ標本として後に選択された標本です。動物学では、レクトタイプは一種の担名タイプです。種がもともと複数の標本からなる担名タイプに基づいて記述された場合、そのうちの 1 つがレクトタイプとして指定されることがあります。特に、一連のシンタイプに複数の種の標本が含まれることは珍しくないことを考えると、単一の担名タイプを持つことで混乱の可能性が減ります。

正式には、カール・リンネが1959年にホモ・サピエンスのレクトタイプに指定された^{。[12] [ 13]}彼は分類学上の命名法の一部と見なされる最初の本、Systema Naturaeの第10版を出版した。これにはホモ・サピエンスの最初の記述が含まれており、この種の有効なシンタイプがすべて決定されている。^[12]重要なことに、1959年にウィリアム・ステアーン教授はリンネの貢献についての一言で「リンネ自身が彼のホモ・サピエンスのタイプとして立つ必要がある」と書いた。 ^{[12] [14]}彼は、5回も自伝を書いたリンネが最も研究した標本はおそらく彼自身であったと指摘して、自分の選択を正当化した。^{[15]これにより、リンネが}ホモ・サピエンスのレクトタイプとして十分かつ正しく指定された。^[12]

1994年にルイ・プシホヨスがボブ・バッカーの未発表の提案を報告したことに基づき、エドワード・コープがホモ・サピエンスのレクトタイプであるとも示唆されている。 ^[12]しかし、この指定は、エドワード・コープがSystema Naturae 10th Ed.に記載されている標本の一つではなかったためシンタイプではないことが不適格であり、また1959年のステアンの指定が先順位であり将来の指定を無効にするため無効である。^[12]

パラレクトタイプとは、レクトタイプが指定された後にシンタイプのセットから追加された標本です。これらは名前を持つタイプではありません。^[16]

原生生物における特殊なケースで、血液塗抹標本などの標本媒体に含まれる「直接関連のある個体」の2つ以上の標本からタイプ標本が構成される。パラハパントタイプおよびレクトハパントタイプという用語は、ハパントタイプに加えて記述著者によって指定されたタイプ標本を指す。^[17]他のタイプ指定と同様に、Neohapantotypeなどの接頭辞「Neo-」の使用は、元のハパントタイプの代わりを指定する場合、または元の記述に指定されたタイプ標本が含まれていない場合に使用される。^[18]

新種または亜種の元となったイラスト。例えば、ビルマニシキヘビ（Python bivittatus）は、アルベルトゥス・セバ（1734年）のイラストに基づいた多くの種の1つです。 ^{[19] [20]}

エルガトタイプとは、多形性階級を持つ膜翅目昆虫の働きアリを代表するために選ばれた標本である。 ^[11]

ヒポタイプとは、その種の詳細が以前に公表されており、補足図や説明に使用される標本である。^[21]

「クレプトタイプ」という用語は、非公式には盗まれた、または不適切に移転されたタイプ標本またはその一部を指します。^{[22] [23] [24] [25]}

動物学者はタイプ図も使用しており、例えばレユニオンオウムは歴史的な図や説明からしか知られていない。^{[26] : 24}

最近、タイプ標本が生きたまま野生に戻された種がいくつか記載されている。例えば、Bulo Burti boubou (ヤブモズ) はLaniarius liberatusと記載されており、その種の記載には血液と羽毛のサンプルから得た DNA 配列が含まれている。この種の地位について将来疑問が生じないと仮定すると、タイプ標本がなくてもその名前は無効にならないが、将来疑問が生じた場合に備えて、そのような分類群に新タイプを指定する必要があるかもしれない。しかし、ヤブモズの場合、鳥類学者は、入手可能な血液と羽毛のサンプルのみを使用して、標本は古くから知られている種の珍しい、これまで知られていなかった色彩変異であると主張した。実際に殺された個体をタイプ標本として保管する必要性についてはまだ議論があるが、適切な証拠と保管があれば、種の妥当性について論争が起こった場合に組織標本も同様に価値があることが観察される。^[要出典]

上に挙げたさまざまなタイプが必要なの^{は、多くの種が 1 世紀か 2 世紀前に記述}されたためであり、当時は単一のタイプ標本、つまりホロタイプが指定されていなかったことが多かった。また、タイプ標本は常に注意深く保存されていたわけではなく、戦争や火災などの介在する出来事により、元のタイプ標本が破壊されたこともある。種名の妥当性は、元のタイプ標本の存在にかかっていることが多い。タイプ標本が見つからない、または存在したことがない場合は、記述の明確さにかかっている。

ICZN は、規約の初版が発行された 1961 年以降にのみ存在しています。ICZN は、種の歴史的妥当性を証明するために必ずしもタイプ標本を要求しているわけではなく、多くの「タイプのない」種が存在します。規約の現在の版、第 75.3 条では、種の「分類学的地位を明確にする」ための「例外的な必要性」がない限り、ネオタイプの指定を禁止しています(第 75.2 条)。

接尾辞「-type」を使用する用語には、他にも多くの順列やバリエーションがある（例：アロタイプ、コタイプ、トポタイプ、ジェネリタイプ、アイソタイプ、アイソネオタイプ、アイソレクトタイプなど）が、これらは規約で正式に規制されておらず、その多くが廃止されたり特異なものとなっている。しかし、これらのカテゴリのいくつかは、ネオタイプなどの本物のタイプ標本に潜在的に当てはまる可能性がある。例えば、アイソタイプ/トポタイプ標本は、ネオタイプが選択された時点で入手可能な場合（元のタイプと同じ時期や場所からのものであるため）、他の標本よりも好まれる。^[要出典] トポタイプは、元のタイプ標本と同じ場所から得られた標本である。^[27]

固定という用語は、当初の指定かその後の指定かを問わず、名称を冠したタイプの宣言に対してコードで使用されています。^{[引用が必要]}

各属には、指定されたタイプ種が必要です (「遺伝子型」という用語は、かつてはこれに使用されていましたが、遺伝学の別の概念を表す用語としてよりよく知られるようになったため、使用されていません)。属の説明は通常、主にタイプ種に基づいて行われ、属に含まれる他の種の特徴によって修正および拡張されます。属名は、そのタイプ種の属名を持つタイプと永久に関連付けられます。^{[引用が必要]}

理想的には、タイプ種は属する属の本質的な特徴を最もよく表しているが、これは主観的であり、最終的には、規約の要件ではないため、技術的には無関係である。タイプ種が、より詳細な調査により、既存の属に属することが判明した場合（よくあること）、構成種はすべて、既存の属に移動されるか、元のタイプ種から切り離されて新しい属名が与えられる必要がある。例外を設ける緊急の必要性がない限り（国際動物命名委員会への請願を通じて個別に決定される）、古い属名は同義語となり、放棄される。^[要出典]

タイプ属は、科または亜科の名前の元となる属です。タイプ種と同様に、タイプ属は必ずしも最も代表的な属ではありませんが、通常は最も早く記載された属、最も大きい属、または最もよく知られている属です。科の名前が、シノニムとなったタイプ属の名前に基づいていることは珍しくありません。そのような状況では、科名を変更する必要はありません。^[要出典]

• 原型
• 科学的な命名の用語集
• 疑問名（動物学）
• 裸の名前
• 遺伝子型– タイプ標本からの遺伝子配列データ
• 病原型– 病原細菌の亜種内分類群の一種
• 類型化の原則

• ICZNコード：国際動物命名規約、公式ウェブサイト
• Fishbase 用語集セクション (アーカイブ)
• 用語集（アーカイブ）
• 動物の種類の命名法 (Evenhuis) (PDF)