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| デフビー4B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | DEFB4B、DEFB4P、デフェンシンベータ4B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | HomoloGene : 122147; GeneCards : DEFB4B; OMA :DEFB4B - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ベータデフェンシン2 （BD-2）は皮膚抗菌ペプチド1（SAP1）としても知られ、ヒトではDEFB4（デフェンシン、ベータ4）遺伝子によってコードされるペプチドです。[3]
ヒトベータデフェンシン-2 (hBD-2) は、病変皮膚で発見されたシステインを豊富に含むカチオン性低分子量抗菌ペプチドです。
構造
hBD-2 は、64 個のアミノ酸で一次構造が作られるタンパク質です。濃度 ≤2.4 mM では、hBD-2 は単量体です。[4]この構造は両親媒性で、正電荷の表面分布は不均一で、3 本鎖の反平行ベータシート(ストランド 2 と 3 がベータヘアピン構造) など、いくつかの重要な構造要素が含まれています。他の構造要素の決定は、使用する技術によって異なります。X 線結晶構造解析を使用すると、タンパク質のN 末端にアルファヘリックスが観察されます(PDB コード: 1fd3 、1fd4 、および6cs9 )。NMR を使用すると、このアルファヘリックスは表示されません (PDB コード: 1e4q )。ただし、この構造は、最初の 4 つのアミノ酸が欠落している hBD-2 の短縮バージョンを使用して決定されたため、不一致の原因となっている可能性があります。
関数
ディフェンシンは好中球によって作られる殺菌性および細胞毒性ペプチドのファミリーを形成します。ディフェンシンファミリーのメンバーはタンパク質配列が非常に類似しています。ベータディフェンシン2は炎症によって局所的に制御される抗生物質ペプチドです。[5]
ヒトβ-ディフェンシン2は多くの上皮細胞によって産生され、グラム陰性菌やカンジダに対して強力な抗菌活性を示すが、グラム陽性菌である黄色ブドウ球菌に対しては活性を示さない。β-ディフェンシン2は、皮膚や肺組織におけるグラム陰性菌感染の頻度の低さに寄与しているのではないかと推測されている。[6]
hBD-2 は、緑膿菌などの微生物や、TNF-α、IL-1 βなどのサイトカインとの接触によって上皮細胞が刺激された後に生成される最初のヒトディフェンシンです。HBD-2 遺伝子とタンパク質は、炎症性皮膚病変に関連するケラチノサイトで局所的に発現しています。HBD-2 が、表面を感染から保護する役割を持つ皮膚と呼吸器の局所上皮防御システムの動的構成要素であると推測するのは興味深いことです。これは、グラム陰性菌による皮膚や肺の感染がかなりまれである理由の 1 つです。[6]
このタンパク質はグラム陽性菌に対して抗菌活性はないが、hBD-2と他のタンパク質の間に相乗効果があることを示す研究がある。[7]この相乗効果の一例は、 S. epidermidisのいくつかの株によって分離されたタンパク質であるepiPである。hBD2はepiPと協力し、ヒトの病気の原因となるグラム陽性菌である S. aureusを殺すことができる。
参考文献
- ^ abc ENSG00000275444, ENSG00000285433 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000177257, ENSG00000275444, ENSG00000285433 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Harder J、Bartels J、 Christophers E、 Schröder JM (1997 年 6 月) 。「ヒト皮膚由来のペプチド抗生物質」。Nature。387 ( 6636): 861。doi : 10.1038 /43088。PMID 9202117。S2CID 4354862 。
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- ^ 「Entrez Gene: DEFB4 デフェンシン、ベータ 4」。
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- ^ 岩瀬 哲、上原 裕、真治 裕、田島 亜、瀬尾 裕、高田 和、縣 哲、水之江 裕 (2010 年 5 月)。 「表皮ブドウ球菌 Esp は、黄色ブドウ球菌のバイオフィルム形成と鼻腔内定着を阻害します。」自然。465 (7296): 346–349。Bibcode :2010Natur.465..346I。土井：10.1038/nature09074. PMID 20485435。S2CID 4392908 。
外部リンク
- UCSC ゲノム ブラウザのヒト DEFB4A ゲノムの位置と DEFB4A 遺伝子の詳細ページ。
さらに読む
- Weinberg A、Krisanaprakornkit S、Dale BA (1999)。「上皮抗菌ペプチド：経口投与におけるレビューと意義」。 口腔生物学および医学の批評的レビュー。9 (4): 399–414。doi : 10.1177 /10454411980090040201。PMID 9825219。
- Schröder JM、Harder J (1999 年 6 月)。「ヒト β-デフェンシン-2」。国際生化学・細胞生物学誌。31 (6): 645–651。doi : 10.1016 /S1357-2725(99)00013-8。PMID 10404637 。
- Bals R、Wang X、Wu Z、Freeman T、Bafna V、Zasloff M、Wilson JM (1998 年 9 月)。「ヒト β-デフェンシン 2 は、ヒトの肺で発現する塩感受性ペプチド抗生物質である」。The Journal of Clinical Investigation。102 ( 5 ): 874–880。doi :10.1172/JCI2410。PMC 508952。PMID 9727055 。
- Liu L、Wang L、Jia HP、Zhao C、Heng HH、Schutte BC、McCray PB、Ganz T (1998 年 11 月)。「ヒト β-デフェンシン HBD-2 遺伝子の構造とマッピング、および炎症部位での発現」。Gene . 222 (2): 237–244. doi : 10.1016 / S0378-1119 (98)00480-6. PMID 9831658。
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- Jia HP、Mills JN、Barahmand-Pour F、Nishimura D、Mallampali RK、Wang G、Wiles K、Tack BF、Bevins CL、McCray PB (1999 年 9 月)。「ヒト β-ディフェンシンの相同遺伝子をコードするラット遺伝子の分子クローニングと特性評価」。感染と免疫。67 (9): 4827–4833。doi : 10.1128 / IAI.67.9.4827-4833.1999。PMC 96815。PMID 10456937。
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