ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| アポック2 |
|---|
 |
| 利用可能な構造 |
|---|
| ＰＤＢ | オルソログ検索: PDBe RCSB |
|---|
| PDB IDコードのリスト |
|---|
1SOH、1BY6、1I5J、1O8T |
|
|
| 識別子 |
|---|
| エイリアス | APOC2、APO-CII、APOC-II、アポリポタンパク質 C2 |
|---|
| 外部ID | オミム：608083; MGI : 88054;ホモロジーン: 47928;ジーンカード：APOC2; OMA :APOC2 - オルソログ |
|---|
|
| 遺伝子の位置（マウス） |
|---|
 | | クロ。 | 染色体7（マウス）[2] |
|---|
| | バンド | 7 A3|7 9.94 cM | 始める | 19,405,504 bp [2] |
|---|
| 終わり | 19,411,866 bp [2] |
|---|
|
| RNA発現パターン |
|---|
| ブギー | | 人間 | マウス（相同遺伝子） |
|---|
| トップの表現 | - 肝臓の右葉
- 黒質
- C1セグメント
- 十二指腸
- 尾状核
- 被殻
- 扁桃体
- 睾丸
- 側坐核
- 視床下部
|
| | トップの表現 | - 卵黄嚢
- 十二指腸
- 肝臓
- 小腸
- 回腸
- 精母細胞
- 結腸
- 顆粒球
- 肺胞
- 肺胞の壁
|
| | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
| バイオGPS | |
|---|
|
| 遺伝子オントロジー |
|---|
| 分子機能 |
- リパーゼ阻害活性
- ホスホリパーゼ結合
- タンパク質ホモ二量体化活性
- リポタンパク質リパーゼ活性化因子活性
- ホスホリパーゼ活性化活性
- 酵素活性化活性
- 脂質結合
| | 細胞成分 |
- カイロミクロン
- 超低密度リポタンパク質粒子
- 球状高密度リポタンパク質粒子
- 細胞外領域
- 初期エンドソーム
- 低密度リポタンパク質粒子
- 高密度リポタンパク質粒子
- 中密度リポタンパク質粒子
- 細胞外空間
| | 生物学的プロセス |
- 高密度リポタンパク質粒子クリアランス
- 脂質輸送
- トリグリセリド分解過程の正の調節
- カイロミクロン残渣除去
- 脂質代謝
- リン脂質の流出
- リポタンパク質リパーゼ活性の正の調節
- 脂肪酸生合成過程の正の調節
- 超低密度リポタンパク質粒子のクリアランスの負の調節
- レチノイド代謝プロセス
- 受容体を介したエンドサイトーシスの負の制御
- 脂質分解プロセス
- ホスホリパーゼ活性の正の調節
- リン脂質分解過程の正の調節
- コレステロールの流出
- 超低密度リポタンパク質粒子のリモデリング
- コレステロール輸送の負の調節
- コレステロール恒常性
- 超低密度リポタンパク質粒子のリモデリングの正の調節
- トリグリセリドを多く含むリポタンパク質粒子のリモデリング
- トリグリセリド恒常性
- 脂質代謝過程の負の調節
- コレステロール逆輸送
- 触媒活性の負の調節
- リポタンパク質輸送
- カイロミクロンのリモデリング
- 高密度リポタンパク質粒子のリモデリング
- カイロミクロンアセンブリ
- 触媒活性の正の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
|
| オルソログ |
|---|
| 種 | 人間 | ねずみ |
|---|
| エントレズ | | |
|---|
| アンサンブル | | |
|---|
| ユニプロット | | |
|---|
| RefSeq (mRNA) | | |
|---|
NM_001277944
NM_001309795 |
|
|---|
| RefSeq (タンパク質) | | |
|---|
NP_001296728
NP_001264873
NP_001296724 |
|
|---|
| 場所 (UCSC) | 19章: 44.95 – 44.95 Mb | 7 章: 19.41 – 19.41 Mb |
|---|
| PubMed検索 | [3] | [4] |
|---|
|
| ウィキデータ |
|
| アポCII |
|---|
 SDS 存在下でのヒトアポリポタンパク質 C-II の NMR 構造 |
|
| シンボル | アポCII |
|---|
| パム | PF05355 |
|---|
| インタープロ | 著作権 |
|---|
| SCOP2 | 1by6 / スコープ / SUPFAM |
|---|
|
アポリポタンパク質 C-II ( Apo-CII、または Apoc-II )、またはアポリポタンパク質 C2は、ヒトではAPOC2遺伝子によってコードされるタンパク質です。
この遺伝子によってコードされるタンパク質は血漿中に分泌され、超低密度リポタンパク質とカイロミクロンの成分となる。このタンパク質は毛細血管内の酵素リポタンパク質リパーゼを活性化し[5] 、トリグリセリドを加水分解して細胞に遊離脂肪酸とグリセロールを供給する。この遺伝子の変異は、黄色腫、膵炎、肝脾腫を特徴とする高リポタンパク質血症IB型を引き起こすが、動脈硬化のリスクは増加しない。臨床検査では、トリグリセリド、コレステロール、カイロミクロンの血中濃度の上昇が示される[6] 。
インタラクティブな経路マップ
下記の遺伝子、タンパク質、代謝物をクリックすると、それぞれの記事にリンクします。 [§ 1]
- ^ インタラクティブなパスウェイマップは、WikiPathways: "Statin_Pathway_WP430" で編集できます。
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000234906 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000002992 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Kim SY、Park SM、Lee ST (2006)。「アポリポタンパク質C-IIはマトリックスメタロプロテアーゼの新規基質である」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 339 (1): 47–54. doi :10.1016/j.bbrc.2005.10.182. PMID 16314153。
- ^ 「Entrez Gene: APOC2 アポリポタンパク質 C-II」。
- Jackson RL、Baker HN、Gilliam EB、Gotto AM (1977)。「ヒト血漿の超低密度アポリポタンパク質C-IIの一次構造」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 74 ( 5): 1942–5。Bibcode : 1977PNAS ...74.1942J。doi : 10.1073 / pnas.74.5.1942。PMC 431048。PMID 194244。
- Lycksell PO、Ohman A、Bengtsson-Olivecrona G、他 (1992)。「アポリポタンパク質 CII のカルボキシ末端機能フラグメントの配列特異的 1H-NMR 割り当てと二次構造」。Eur . J. Biochem . 205 (1): 223–31。doi : 10.1111/ j.1432-1033.1992.tb16772.x。PMID 1555583。
- Hegele RA、Connelly PW、Maguire GF、他 (1992)。「高脂血症患者で確認されたアポリポタンパク質 CII 変異、CIILys19----Thr」。Dis . マーカー. 9 (2): 73–80. PMID 1782747。
- Crecchio C, Capurso A, Pepe G (1990). 「血漿アポリポタンパク質 CII 欠乏症 (Apo CII-Bari) の原因となる変異の特定」. Biochem. Biophys. Res. Commun . 168 (3): 1118–27. doi :10.1016/0006-291X(90)91145-I. PMID 1971748.
- Bengtsson-Olivecrona G、Sletten K (1990)。「ヒトアポリポタンパク質 CII および CIII のウシ類似体の一次構造。アイソフォームの研究とタンパク質分解処理の証拠」。Eur . J. Biochem . 192 (2): 515–21. doi : 10.1111/j.1432-1033.1990.tb19255.x . PMID 2209608。
- Wei CF、Tsao YK、Robberson DL、他 (1986)。「ヒトアポリポタンパク質 C-II 遺伝子の構造。RNA:DNA ハイブリッドの電子顕微鏡分析、完全なヌクレオチド配列、およびアポリポタンパク質遺伝子間の 5' 相同配列の同定」。J . Biol. Chem . 260 (28): 15211–21。doi : 10.1016 /S0021-9258(18) 95724-8。PMID 2415514。
- Fojo SS、Lohse P、Parrott C、et al. (1989)。「アポリポタンパク質 C-II 欠乏症患者におけるアポリポタンパク質 C-IIPadova 遺伝子のナンセンス変異」。J . Clin. Invest . 84 (4): 1215–9. doi :10.1172/JCI114287. PMC 329780. PMID 2477392 。
- Jackson CL、Bruns GA、Breslow JL (1986)。「アポリポタンパク質 C-II の cDNA およびゲノムクローンの分離」。Segrest JP、Albers JA (編)。血漿リポタンパク質パート A: 調製、構造、および分子生物学。Methods in Enzymology。Vol. 128。Elsevier。pp. 788–800。doi :10.1016/0076-6879(86) 28106-9。ISBN 9780121820282. PMID 3014272。
- Fojo SS、Law SW 、Brewer HB (1987)。「ヒトプレプロアポリポタンパク質C-II遺伝子。完全な核酸配列とゲノム構成」。FEBS Lett。213 ( 1): 221–6。doi : 10.1016/0014-5793(87) 81495-3。PMID 3030808。S2CID 42223577 。
- Fojo SS、Stalenhoef AF、Marr K、et al. (1989)。「アポリポタンパク質C-II欠乏症患者のApoC-II遺伝子（ApoC-II Nijmegen）の欠失変異」。J . Biol. Chem . 263 (34): 17913–6. doi : 10.1016/S0021-9258(19)81302-9 . PMID 3192518。
- Fojo SS、Beisiegel U、Beil U 他（1988年）。 「アポ C-II 欠損症患者のアポリポタンパク質 (Apo) C-II 遺伝子 (アポ C-II ハンブルク) におけるドナー スプライス部位変異」。Ｊ．クリン．投資する。82 (5): 1489–94。土井：10.1172/JCI113756。PMC 442713。PMID 3263393。
- Connelly PW、Maguire GF、Hofmann T、Little JA (1987)。「非機能性ヒトアポリポタンパク質、アポリポタンパク質 C-IIToronto の構造」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 84 ( 1 ): 270–3。Bibcode : 1987PNAS ...84..270C。doi : 10.1073/ pnas.84.1.270。PMC 304185。PMID 3467353。
- Fairwell T、Hospattankar AV、Brewer HB、Khan SA (1987)。「ヒト血漿アポリポタンパク質 C-II :全固相合成と化学的および生物学的特性評価」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 84 ( 14 ): 4796–800。Bibcode : 1987PNAS ...84.4796F。doi : 10.1073/ pnas.84.14.4796。PMC 305192。PMID 3474626。
- Fojo SS, Taam L, Fairwell T, et al. (1986). 「ヒトプレプロアポリポタンパク質 C-II. 主要血漿アイソフォームの分析」J. Biol. Chem . 261 (21): 9591–4. doi : 10.1016/S0021-9258(18)67554-4 . PMID 3525527.
- Das HK、Jackson CL、Miller DA、et al. (1987)。「ヒトアポリポタンパク質C-II遺伝子配列には、3番目のイントロンに新しい染色体19特異的ミニサテライトが含まれています」。J . Biol. Chem . 262 (10): 4787–93. doi : 10.1016/S0021-9258(18)61264-5 . PMID 3558370。
- Connelly PW、Maguire GF、Little JA (1988)。「アポリポタンパク質 CIISt. Michael. 家族性アポリポタンパク質 CII 欠損症は早期血管疾患と関連している」。J . Clin. Invest . 80 (6): 1597–606. doi :10.1172/JCI113246. PMC 442428. PMID 3680515 。
- Baggio G、Manzato E、Gabelli C、他 (1986)。「アポリポタンパク質 C-II 欠乏症候群。罹患患者 2 名におけるアポリポタンパク質 C-II 投与後の臨床的特徴、リポタンパク質特性、リパーゼ活性、および高トリグリセリド血症の是正」。J . Clin. Invest . 77 (2): 520–7. doi :10.1172/JCI112332. PMC 423374. PMID 3944267 。
- Menzel HJ、Kane JP、Malloy MJ、 Havel RJ (1986)。「アフリカ系の人々におけるアポリポタンパク質C-IIの変異一次構造」。J . Clin . Invest。77 ( 2): 595–601。doi : 10.1172/JCI112342。PMC 423392。PMID 3944271。
- Sharpe CR、Sidoli A、 Shelley CS、他 (1984)。「ヒトアポリポタンパク質 AI、AII、CII、CIII。cDNA 配列と mRNA 存在量」。Nucleic Acids Res 12 ( 9): 3917–32。doi :10.1093/ nar /12.9.3917。PMC 318799。PMID 6328445。
- Jackson CL、Bruns GA、Breslow JL (1984)。「ヒトアポリポタンパク質 CII cDNA クローンの単離と配列、およびそれを用いたアポリポタンパク質 CII 遺伝子の単離とヒト染色体 19 へのマッピング」。Proc . Natl . Acad. Sci . USA . 81 (10): 2945–9。Bibcode :1984PNAS...81.2945J。doi : 10.1073 / pnas.81.10.2945。PMC 345197。PMID 6328478。
外部リンク
