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| アシディロバス・サッカロボランス | |
|---|---|
科学的分類 
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| ドメイン： | 古細菌 |
| 王国： | プロテオアーキオータ |
| 上門: | TACKグループ |
| 門: | サーモプロテオタ |
| クラス： | 熱タンパク質 |
| 注文： | デスルフォロコッカス |
| 家族： | アシジロバ科 |
| 属: | アキディロブス |
| 種： | A.サッカロボランス
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| 二名法名 | |
| アシディロバス・サッカロボランス Prokofeva 他、2009 [1] [2]
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アシディロバス・サッカロボランスは好熱好酸性（好熱性と好酸性の両方の性質を持つ）嫌気性古細菌の一種である。この種は2009年にカムチャッカ半島の温泉から分離され、初めて記載された。 [2] [3]
説明
Acidilobus saccharovorans は、直径1～2 μmの球状形態で、比較的厚いS層と鞭毛の束を持つ。最適生育温度は80～85° C （超好熱菌に分類される）、最適pHは3.5～4.0である。発酵代謝を行う偏性嫌気性菌である。成長は元素硫黄の存在によって促進され、硫化水素に還元されるが、硫黄は成長に必須ではない。抗生物質のクロラムフェニコール、ペニシリン、ストレプトマイシンには耐性がある。[2] A. saccharovorans は、この属で唯一認められている他の種であるA. aceticusとは2つの大きな点で異なる。A. aceticusは非運動性であるのに対し、A. saccharovoransは鞭毛を持つ。また、多くの糖や多糖類を含む幅広い基質上で増殖することができます。[4] [3]その名前は、その代謝のこの特性に由来しています。[2]
ゲノムと代謝
A. saccharovoransの ゲノム配列は、好熱好酸性かつ絶対嫌気性である古細菌の最初の完全なゲノムとして2010年に報告されました。[5]ゲノムには、Embden-MeyerhofおよびEntner-Doudoroff代謝経路と一致する遺伝子が含まれています。意外にも、酸化的トリカルボン酸回路酵素をコードする遺伝子も含まれていることがわかりましたが、経路を還元的に機能させる重要な酵素であるATPクエン酸リアーゼは含まれていませんでした。古細菌としては珍しく、 β酸化経路をコードしており、これによりトリアシルグリセリドと脂肪酸上で増殖できると予想されました。[5]ただし、これらの代謝能力はまだ実験的に実証されていません。[6]予測されたプロテオームには、細胞外の高濃度のプロトンを利用して酸性条件での成長に適応していると解釈される多くの特徴も含まれています。[5]
系統学
配列が決定されている他のゲノムと比較すると、A. saccharovoransはAeropyrum pernixに最も近いことが示唆されている。ゲノムには、同じ温泉によく見られる好気性好熱酸性菌の目であるAcidilobales とSulfolobalesの間での水平遺伝子伝播の証拠も含まれている。A . saccharovorans のゲノム配列は当初、 Acidilobaceae科とCaldisphaeraceae科を含む新しい目Acidilobalesの確立を支持するものとして報告され、[5]現在ではそれが受け入れられている。[1]しかし、2015 年に行われた保存された古細菌タンパク質配列の系統ゲノム研究によると、この 2 つの科はAeropyrum pernixも含まれるDesulfurococcales目に位置づけられる方が適切であることが示唆された。[7]
エコロジー
アキディロバルス属の種は酸性環境の温泉に広く分布しており、そこでは有機物の完全酸化に役割を果たしていると考えられる。A. saccharovoransゲノムから予測される代謝能力に基づくと、アキディロバルス属はサーモプロテアレス属と代謝的に類似しており、この2つの目はそれぞれ酸性温泉と中性温泉で同様の生態学的役割を果たしている可能性がある。[2] [6]
参考文献
- ^ ab "Acidilobus aceticus".統合分類情報システム. 2016年6月10日閲覧。
- ^ abcde プロコフェバ、ミシガン州;コストリキナ、NA;コルガノバ、テレビ。トゥロバ、TP;ルイセンコ、午前。レベディンスキー、AV; EA、ボンチ・オスモロフスカヤ（2009 年 12 月）。 「嫌気性・好熱性好酸性クレナーカオテ Acidilobus saccharovorans sp. nov. の単離と、Acidilobaceae fam. nov. および Caldisphaeraceae fam. nov. を含む Acidilobales ord. nov. の提案」。系統的および進化的微生物学の国際ジャーナル。59 (Pt 12): 3116–22。土井：10.1099/ijs.0.010355-0。PMID 19643887。
- ^ ab プロコフェヴァ、マリア; メルケル、アレクサンダー; レベディンスキー、アレクサンダー; ボンチ・オスモロフスカヤ、エリザヴェータ (2014)。「アシジロバセア科」。原核生物：細菌と古細菌のその他の主要系統：9–14。doi : 10.1007 / 978-3-642-38954-2_332。ISBN 978-3-642-38953-5。
- ^ Prokofeva, MI; Miroshnichenko, ML; Kostrikina, NA; Chernyh, NA; Kuznetsov, BB; Tourova, TP; Bonch-Osmolovskaya, EA (2000 年 11 月)。「カムチャッカ半島の大陸性熱噴出孔から発見された、嫌気性好熱酸性古細菌の新属新種 Acidilobus aceticus」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology。50 (6): 2001–8。doi : 10.1099 /00207713-50-6-2001。PMID 11155973 。
- ^ abcd Mardanov, AV; Svetlitchnyi, VA; Beletsky, AV; Prokofeva, MI; Bonch-Osmolovskaya, EA; Ravin, NV; Skryabin, KG (2010 年 8 月)。「クレンアーキア Acidilobus saccharovorans のゲノム配列は、新しい目である Acidilobales を支持し、陸上の酸性温泉における重要な生態学的役割を示唆しています」。応用環境 微生物学。76 ( 16 ): 5652–7。Bibcode :2010ApEnM..76.5652M。doi : 10.1128/aem.00599-10。PMC 2918975。PMID 20581186。
- ^ ab Bonch-Osmolovskaya, Elisaveta (2012). 「好熱性原核生物の代謝多様性 - 最新情報」.極限環境生物: 微生物学とバイオテクノロジー. ノーフォーク: Caister Academic Press . pp. 109–31. ISBN 9781904455981。
- ^ Petitjean, C; Deschamps, P; López-García, P; Moreira, D; Brochier-Armanet, C (2015 年 5 月). 「古細菌の保存された系統学的コアの拡張により、生命の第 3 ドメインの進化が解明される」. Molecular Biology and Evolution . 32 (5): 1242–54. doi : 10.1093/molbev/msv015 . PMID 25660375.
外部リンク
- BacDive - 細菌多様性メタデータベースにおける Acidilobus saccharovorans の標準株