エアロピルム・ペルニクス

エアロピルム・ペルニクス
科学的分類
ドメイン：	古細菌
王国：	プロテオアーキオータ
上門:	TACKグループ
門:	サーモプロテオタ
クラス：	熱タンパク質
注文：	デスルフォロコッカス
家族：	デスルフォロコッカス科
属:	エアロピルム
種：	A. ペルニクス
二名法名
	エアロピルム・ペルニクス; 佐古ら 1996

Aeropyrum pernix は、古細菌門Thermoproteotaに属する極限好熱性古細菌の一種です。絶対好熱性種です。最初の標本は日本沿岸の海底堆積物から分離されました。

発見

エアロピルム・ペルニクスは、最初に発見された好気性超好熱古細菌である。この細菌はもともと、1996年に日本の九州にある小宝島の硫酸塩噴出孔から採取された加熱された海洋堆積物と噴出水から分離された。^[1]

ゲノム構造

1999年にその完全なゲノム配列が決定され、そのサイズは1,669キロベースで、2,694個の遺伝子が検出されました。^[2]α-ケトグルタル酸脱水素酵素を除くTCA回路の遺伝子がすべて見つかりました。その代わりに、2-オキソ酸：フェレドキシン酸化還元酵素の2つのサブユニットをコードする遺伝子が特定されました。

プロパティ

Aeropyrum pernixの細胞は球形で、直径は約 1 μmです。Aeropyrum の細胞を包むエンベロープの幅は約 25 nm です。この菌は、温度 70 ～ 100 °C (最適温度 90 ～ 95 °C)、pH 5 ～ 9 (最適温度 pH 7)、塩分濃度 1.8 ～ 7% (最適温度 3.5% 塩分) で増殖します。68 °C または 102 °C では菌の増殖は検出されません。塩分濃度が 1.5% 未満の場合、細胞は低浸透圧ショックで溶解します。この菌の細胞はクロラムフェニコールに敏感ですが、アンピシリン、バンコマイシン、サイクロセリンには鈍感です。タンパク質性物質上でよく増殖し、これらの条件下での倍加時間は約 200 分です。^{[1]この種は}プリンヌクレオチド生合成遺伝子を欠いており、プリンの必要量を満たすために環境源に依存しています。^[3]

参考文献

^ ab Sako Y, Nomura N, Uchida A, et al. (1996). 「Aeropyrum pernix gen. nov., sp. nov.、100 度 C までの温度で成長する新規好気性超好熱性古細菌」Int. J. Syst. Bacteriol . 46 (4): 1070– 7. doi : 10.1099/00207713-46-4-1070 . PMID 8863437.
^ カワラバヤシ Y、日野 Y、堀川裕、他。（1999年）。「好気性超好熱性クレナーキオン、Aeropyrum pernix K1 の完全なゲノム配列」。DNA研究所6 (2): 83–101、145–52 .土井: 10.1093 / dnares/6.2.83。PMID 10382966。
^ Brown, Anne M; Hoopes, Samantha L; White, Robert H; Sarisky, Catherine A (2011-12-14). 「古細菌におけるプリン生合成：テーマのバリエーション」. Biology Direct . 6:63 . doi : 10.1186/1745-6150-6-63 . ISSN 1745-6150. PMC 3261824. PMID 22168471 .

さらに読む

ブイヤ、モハマド・ワドゥッド。スリヤディ、ジミー。周、周利。ブラウン、バーナード・アンドリュー2世（2013年8月5日）。「Aeropyrum pernix L7Ae 多機能タンパク質の構造とその極度の熱安定性についての洞察」。Acta Crystallographica セクション F。69 (Pt 9): 979–988。土井:10.1107/S1744309113021799。PMC 3758144。PMID 23989144。
大福、隆。吉田隆司；北村隆之；河市聡；井上貴博野村圭吾吉田唯；久野宗太郎。迫良彦 (2013 年 7 月 19 日) 「超好熱性古細菌 Aeropyrum のシンテニーゲノム内のウイルス関連要素の変異」。応用環境。微生物。79 (19): 5891– 8. Bibcode :2013ApEnM..79.5891D。土井：10.1128/AEM.01089-13。PMC 3811351。PMID 23872576。
Lee, Pyung Cheon; Mijts, Benjamin N.; Petri, Ralf; Watts, Kevin T.; Schmidt-Dannert, Claudia (2004 年 6 月 16 日)。「指向性進化による Aeropyrum pernix ファルネシルゲラニル二リン酸合成酵素 (Fgs) の生成物特異性の変更」。タンパク質工学設計と選択。17 (11): 771– 777。doi : 10.1093/ protein / gzh089。PMID 15548566 。
Ota, Ajda; Gmajner, Dejan; Sentijurc, Marjeta; Ulrih, Natasa Poklar (2012年4 月 13 日)。「Aeropyrum peering の成長培地 pH がアーキオソームの構造特性と流動性に与える影響」。Archaea . 2012 : 9. doi : 10.1155/2012/285152 . PMC 3384975 . PMID 22778670。
桜庭晴彦; 佐藤武則; 川上龍志; キムクワン; 唐雄介; 米田一成; 大島俊久 (2012 年 4 月 16 日). 「超好熱性古細菌 Aeropyrum Pernix 由来の新規色素結合型 L-プロリン脱水素酵素の結晶構造」. The Journal of Biological Chemistry . 287 (24): 20070– 20080. doi : 10.1074/jbc.M111.319038 . PMC 3370190. PMID 22511758 .

外部リンク

BacDive の Aeropyrum pernix の標準株 - 細菌多様性メタデータ
KEGG ゲノム : Aeropyrum pernix

[Sako-1] Sako Y, Nomura N, Uchida A, et al. (1996). 「Aeropyrum pernix gen. nov., sp. nov.、100 度 C までの温度で成長する新規好気性超好熱性古細菌」Int. J. Syst. Bacteriol . 46 (4): 1070– 7. doi : 10.1099/00207713-46-4-1070 . PMID 8863437.

[2] カワラバヤシ Y、日野 Y、堀川裕、他。（1999年）。「好気性超好熱性クレナーキオン、Aeropyrum pernix K1 の完全なゲノム配列」。DNA研究所6 (2): 83–101、145–52 .土井: 10.1093 / dnares/6.2.83。PMID 10382966。

[3] Brown, Anne M; Hoopes, Samantha L; White, Robert H; Sarisky, Catherine A (2011-12-14). 「古細菌におけるプリン生合成：テーマのバリエーション」. Biology Direct . 6:63 . doi : 10.1186/1745-6150-6-63 . ISSN 1745-6150. PMC 3261824. PMID 22168471 .