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植物分類の APG II システム (被子植物系統分類グループ II システム) は、被子植物系統分類グループによって 2003 年 4 月に発表された、現代の主に分子ベースの植物分類システムの 2 番目のバージョンであり、現在は廃止されています。 [ 1 ]これは1998年に発表された最初のAPG システムの改訂版であり、2009 年にさらに改訂されたAPG III システムによって置き換えられました。
APG IIは以下のように出版されました。
APGの各分類体系は、APGに加盟し、世界中の複数の研究機関で活動する多数の系統植物学者の幅広い合意を反映している。
APG II システムでは 45目が認識され、これは APG システムより 5 つ多い。新しい目はAustrobaileyales、Canellales、Gunnerales、Celastrales、Crossosomatalesであり、これらはすべて APG システムでは目に分類されていないが、上位目クレードに含まれている科である。APG II では 457科が認識され、これは APG システムより 5 つ少ない。APG II の科のうち 39 科はどの目にも分類されなかったが、そのうち 36 科は被子植物内の上位目クレードに分類された。55 科は「括弧付き科」として知られるようになった。これらは、より広い意味で範囲を限定できる科のオプションの分離である。
APG IIシステムは影響力があり、多くの文献で全体または一部（場合によっては修正を加えて）採用された。それから6年半後、 2009年10月に発行されたAPG IIIシステムに取って代わられた。
システム内の主要グループ（綱と目のランク間のすべてのランク付けされていない クレード）：
以下に、APG II で分類が未定であった 15 属と 3 科を除き、分類の詳細を示します。分類が未定であった分類群は、付録の末尾にある「分類上の位置が不明確な分類群」というセクションに記載されています。いくつかのクレードの下には、そのクレード内で分類上の位置が不明確な科がリストされています。このように分類された科は 36 科あります。これは、それらの科とクレード内の他のメンバーとの関係が不明であることを意味します。
注：「+ ...」は、前のファミリーから分離できる、オプションの別のファミリーを意味します。