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| YRNA | |
|---|---|
 | |
| 識別子 | |
| シンボル | ワイRNA |
| 代替記号 | Y1; Y3; Y4; Y5 |
| Rfam | RF00019 |
| その他のデータ | |
| RNAタイプ | 遺伝子 |
| ドメイン | 真核生物 |
| それで | 0000405 ... |
| PDB構造 | PDBe |
Y RNAは小さな非コードRNAです。全身性エリテマトーデス患者の自己免疫抗体の標的であるRo60リボ核タンパク質粒子[1]の構成要素です。[2]また、クロマチンや開始タンパク質との相互作用を通じてDNA複製に必要であるとも報告されています。[3] [4]しかし、Y RNAを欠くマウス胚性幹細胞は生存可能であり、正常な細胞周期を示します。[5]
構造
これらの小さなRNAは、RNAの3'末端と5'末端によって形成される保存されたステムに折り畳まれると予測され、 Ro結合に必要な単一の膨らんだシトシンを特徴とします。 [6] [7] [8]
関数
文献では、Y RNAの2つの機能について説明されています。Ro60のリプレッサーとして、およびDNA複製の開始因子としてです。Ro60タンパク質の保存された結合部位を欠く変異ヒトY RNAは、依然としてDNA複製をサポートしており、[3] Roタンパク質への結合とDNA複製の促進は、Y RNAの2つの分離可能な機能であることを示しています。Y RNA由来の小さなRNAはマイクロRNAとサイズが似ていますが、これらのY RNAフラグメントはマイクロRNA経路に関与していないことが示されています。[9]
Ro60阻害
遊離状態のRoは、ミスフォールドした5S rRNAを含む様々なミスフォールドRNAに結合し、ある種の品質管理機構として機能すると考えられています。[10] Y RNAまたは他のRNAと複合したRoの 結晶構造は、RoがRNAの一本鎖3'末端に比較的非特異的に結合するのに対し、Y RNAは他のRNAのアクセスを制御する第2の部位に特異的に結合することを示しまし。[6]デイノコッカスでは、遊離Roは23S rRNAの成熟にも機能することが示されています。[11]デイノコッカスでは、 Y RNAを欠く変異体が生存可能であり、Y RNAはRoと複合している場合を除いて不安定であるようです。[11]
DNA複製の開始
ヒトY RNAはDNA複製に機能的に必要である。[3]生化学的分画および再構成実験により、 in vitroでの単離脊椎動物細胞核における染色体DNA複製にヒトY RNAの機能的要件があることが立証されている。 [3]また、 in vitroではヒトY RNAの特異的分解がDNA複製を阻害し、in vivoでは無傷細胞で阻害する。[3] Y RNAの機能は、クロマチンおよび開始タンパク質（起点認識複合体を含む）との相互作用を介して媒介されると考えられている。 [4]
人間の病理学において
Y RNAは一部のヒト腫瘍で過剰発現しており、細胞増殖に必要であり[12]、マイクロRNAサイズの小さな分解産物は自己免疫やその他の病状に関与している可能性がある。[13]最近の研究では、Y RNAは3'末端が非標準的なポリ(A)ポリメラーゼPAPD5によって修飾され、PAPD5によって付加された短いオリゴ(A)テールは、リボヌクレアーゼPARN/EXOSC10による3'末端処理またはエキソヌクレアーゼDIS3Lによる分解のマーカーであることが実証されている。[14] PARN欠損は、先天性角化異常症という骨髄疾患の重篤な形態や肺線維症を引き起こすため[15] [16]、 Y RNA処理の欠陥がこれらの患者に観察される重篤な病状に寄与している可能性がある。
種の分布
推定Y RNAとRoタンパク質の相同体は真核生物と細菌で発見されている。[7] [17]
人間
ヒトにはhY1、hY3、hY4、hY5と呼ばれる4つのY RNA [17]と多数の擬似遺伝子が存在するようです。
線虫
Caenorhabditis elegansにはCeY RNAと呼ばれる1つのsbRNAと、 Y RNAの相同体であると仮定される多数のsbRNAが存在する。 [18] [19]
D.ラジオデュランス
放射線耐性細菌デイノコッカス・ラジオデュランスは、 Roの相同遺伝子であるrsr（「Ro 60関連」）をコードしており、 rsr発現が誘導される条件下（紫外線照射）では、少なくとも4つの小さなRNAがデイノコッカスに蓄積する。これらのRNAの1つはY RNA相同遺伝子であると思われる。 [20]デイノコッカス・ラジオデュランスでは、 RsrはY RNAを介してエキソリボヌクレアーゼPNPaseに連結され、一本鎖RNAをPNPaseキャビティに導く。RsrとY RNAは、PNPaseによる構造化RNAの分解を促進する。この役割は保存されている可能性があり、RsrとYrlAおよびYrlB（Y RNA類似）と呼ばれるncRNAは、進化的に遠い細菌サルモネラチフス菌でもPNPaseと関連している。[21]
参考文献
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外部リンク
- Rfamの Y RNA のページ