ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
トリム21 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス TRIM21 、RNF81、RO52、Ro/SSA、SSA、SSA1、三者モチーフ含有21、三者モチーフ含有タンパク質21 外部ID オミム ：109092; MGI : 106657; ホモロジーン : 2365; ジーンカード ：TRIM21; OMA :TRIM21 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体7（マウス） [2] バンド 7|7 E3 始める 102,207,128 bp [2] 終わり 102,214,693 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 顆粒球 単球 血 横行結腸粘膜 脾臓 直腸 結腸上皮 心の頂点 胸部大動脈下行 回腸粘膜
トップの表現 回腸上皮 パネートセル 腸間膜リンパ節 腰椎神経節 胸腺 血 顆粒球 頸動脈小体 脾臓 脈絡叢上皮
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
DNA結合 亜鉛イオン結合 金属イオン結合 タンパク質結合 RNA結合 同一のタンパク質結合 ユビキチンタンパク質転移酵素活性 トランスフェラーゼ活性 細胞成分
細胞質 細胞質 SCFユビキチンリガーゼ複合体 Pボディ 細胞内解剖構造 オートファゴソーム 細胞質小胞 核 核質 リボ核タンパク質複合体 生物学的プロセス
タンパク質脱ユビキチン化の負の制御 インターフェロンガンマに対する反応 オートファジーの正の制御 インターフェロン-γを介したシグナル伝達経路 タンパク質三量体化 宿主細胞へのウイルス侵入の正の調節 DNA結合転写因子活性の正の調節 タンパク質モノユビキチン化 I型インターフェロン産生の調節 細胞周期の正の調節 タンパク質の不安定化 タンパク質のユビキチン化 細胞周期 NF-κB転写因子活性の負の制御 タンパク質の自己ユビキチン化 先天性免疫反応 タンパク質ポリユビキチン化 ウイルス転写の負の調節 出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
三分節モチーフ含有タンパク質21は、 E3ユビキチンタンパク質リガーゼTRIM21 としても知られ 、 ヒトでは TRIM21 遺伝子によってコードされる タンパク質 である。 [5] [6] この遺伝子の選択的スプライシング転写バリアントが記述されているが、全長の性質が決定されているのは1つだけである。ほとんどのヒト組織で発現している。 [7]
構造 TRIM21は、三者モチーフ （TRIM）ファミリーのメンバーです 。TRIMモチーフには、3つの亜鉛結合ドメイン、 RINGフィンガードメイン 、Bボックスタイプ1とBボックスタイプ2の 亜鉛フィンガー 、および コイルドコイル 領域が含まれています。 [6]
関数 TRIM21は、細胞内抗体媒介タンパク質分解 経路 における細胞内抗体エフェクターである。Fc ドメイン [8] を認識し、細胞に感染した抗体標識非エンベロープウイルス粒子上の 免疫グロブリンG 、 免疫グロブリンA [9] 、 免疫グロブリンM に結合する。自己 ユビキチン化または補因子のユビキチン化によって、ウイルス粒子を プロテアソーム に誘導する役割を果たす 。ウイルスカプシドおよび結合抗体とは異なり、TRIM21自体はプロテアソームで分解されない。 [7]
TRIM21は、単一のポリペプチドと4つの小さなRNA分子のうちの1つを含むRoSSAリボ核タンパク質の一部です。RoSSA粒子は細胞質と核の両方に局在します。 [6]
臨床的意義 RoSSAはシェーグレン症候群 および 全身性エリテマトーデス の患者の自己抗原と相互作用する 。 [6] さらに、ループス傾向のあるマクロファージはリソソーム内の免疫複合体を分解できないため、TRIM21に結合してNF-κBシグナル伝達を増強する自己抗体が細胞質に漏れ出す。 [10]
TRIM21は、対応する抗体を使用して特定のタンパク質をノックアウトするために使用することができ、この方法はTrim-Awayとして知られています。このアッセイでは、TRIM21と抗体が 電気穿孔法 によって細胞に送達され、標的タンパク質は数分以内に分解されます。 [11]
参考文献
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さらに読む
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