XRN1（遺伝子）

ＸＲＮ１
識別子
エイリアス	XRN1、SEP1、5'-3' エキソリボヌクレアーゼ 1、Xrn1
外部ID	オミム：607994; MGI : 891964;ホモロジーン: 5894;ジーンカード：XRN1; OMA :XRN1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体3（ヒト）
終わり	142,448,062 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	9番染色体（マウス）
終わり	95,939,856 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	膵臓上皮細胞; ; アキレス腱; ; 胚上皮; ; 臓側胸膜; ; 壁側胸膜; ; 脛骨; ; 骨髄細胞; ; 歯肉上皮; ; 内皮細胞; ; 眼瞼結膜;
	トップの表現
	胎児の尾; ; 積雲細胞; ; 吻側回遊流; ; 胸腺; ; 性器結節; ; 受精卵; ; 松果体; ; 二次卵母細胞; ; 精管; ; 顆粒球;
	参照表現データの詳細
	該当なし
遺伝子オントロジー
分子機能	DNA結合; タンパク質結合; 核酸結合; ヌクレアーゼ活性; エキソヌクレアーゼ活性; 加水分解酵素活性; RNA結合; G-四重鎖RNA結合; G四重鎖DNA結合; 5'-3'エキソリボヌクレアーゼ活性; テロメラーゼRNA結合; 5'-3'エキソヌクレアーゼ活性;
細胞成分	膜; 細胞膜; 核; 細胞質; 細胞質; 樹状突起; ソーマ; シナプス; Pボディ;
生物学的プロセス	mRNAの安定性の調節; rRNA分解プロセス; 核mRNA監視; ヒストンmRNA分解プロセス; 翻訳の否定的規制; テストステロンへの反応; シクロヘキシミドに対する細胞反応; RNAホスホジエステル結合加水分解、エキソヌクレアーゼ; ピューロマイシンに対する細胞反応; テロメラーゼによるテロメア維持の負の制御; 核転写されたmRNAの分解プロセス;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	54464
	24127
	ENSG00000114127
	ENSMUSG00000032410
	翻訳
	P97789
	NM_001042604 ; NM_001282857 ; NM_001282859 ; NM_019001
	NM_011916 ; NM_001311130
	NP_001269786 ; NP_001269788 ; NP_061874
	該当なし
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

5′-3′エキソリボヌクレアーゼ1（Xrn1）は、ヒトではXRN1遺伝子によってコードされるタンパク質である。Xrn1はRNAを5′から3′方向に加水分解する。^[5]^[6]

関数

この遺伝子は、5'-3'エキソヌクレアーゼファミリーのメンバーをコードします。コードされたタンパク質は、複製依存性ヒストン mRNA分解に関与している可能性があり、 mRNA デキャッピングタンパク質 4のエンハンサーと直接相互作用します。mRNA 代謝に加えて、酵母の同様のタンパク質は、転写、翻訳、相同組換え、減数分裂、テロメア維持、および微小管組み立てなど、さまざまな核および細胞質機能に関与しています。この遺伝子の変異は骨肉腫と関連しており、コードされたタンパク質が骨形成にも役割を果たしている可能性があることを示唆しています。選択的スプライシングにより、複数の転写バリアントが生成されます。

参照

エクスターン2

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000114127 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000032410 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Mullen TE、Marzluff WF (2008年1月)。「ヒストンmRNAの分解にはオリゴウリジル化とそれに続く脱キャップ化、および5'から3'および3'から5'へのmRNAの同時分解が必要」。遺伝子と発達。22 ( 1): 50–65。doi : 10.1101/gad.1622708。PMC 2151014。PMID 18172165。
^ 「Entrez 遺伝子: 5'-3' エキソリボヌクレアーゼ 1」。

さらに読む

Bashkirov VI、Scherthan H、Solinger JA、Buerstedde JM、Heyer WD (1997 年 2 月)。「G4 テトラプレックス基質を好むマウス細胞質エキソリボヌクレアーゼ (mXRN1p)」。The Journal of Cell Biology。136 ( 4): 761–73。doi : 10.1083 /jcb.136.4.761。PMC 2132493。PMID 9049243。
Ingelfinger D、Arndt-Jovin DJ、 Lührmann R 、Achsel T (2002 年 12 月)。「ヒト LSm1-7 タンパク質は、mRNA 分解酵素 Dcp1/2 および Xrnl と、異なる細胞質フォーカスで共存します」。RNA。8 ( 12): 1489–501。doi : 10.1017 /S1355838202021726。hdl : 11858/ 00-001M -0000-0012-F270-9。PMC 1370355。PMID 12515382。
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Li Y、Yamane D 、 Lemon SM (2015 年 5 月)。「C 型肝炎ウイルスの複製を制限する 5' エキソリボヌクレアーゼ Xrn1 および Xrn2 の役割の解明」。Journal of Virology。89 ( 9 ): 4857–65。doi : 10.1128 /JVI.03692-14。PMC 4403451。PMID 25673723。
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Ding M、Lin B、Li T、Liu Y、Li Y、Zhou X、Miao M、Gu J、Pan H、Yang F、Li T、Liu XY、Li R (2015 年 4 月)。「前立腺腺癌細胞および神経内分泌様前立腺癌細胞における miR-204 とその標的 XRN1 の二重かつ相反する成長制御機能」。Oncotarget。6 ( 10 ) : 7686–700。doi : 10.18632 /oncotarget.3480。PMC 4480709。PMID 25797256。
ブラスコ＝モレノ B、デカンポス＝マタ L、ベッチャー R、ガルシア＝マルティネス J、ユングフライシュ J、ネディアルコバ DD、チャットパディヤ S、ガス ME、オリバ B、ペレス＝オルティン JE、ライデル SA、チョーデル M、ディエス J (2019 年 3 月) ）。「エキソヌクレアーゼ Xrn1 は、膜タンパク質をコードする mRNA の転写と翻訳を活性化します。」ネイチャーコミュニケーションズ。21 (10): 1298。ビブコード:2019NatCo..10.1298B。土井：10.1038/s41467-019-09199-6。PMC 6428865。PMID 30899024。

この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000114127 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000032410 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[5] Mullen TE、Marzluff WF (2008年1月)。「ヒストンmRNAの分解にはオリゴウリジル化とそれに続く脱キャップ化、および5'から3'および3'から5'へのmRNAの同時分解が必要」。遺伝子と発達。22 ( 1): 50–65。doi : 10.1101/gad.1622708。PMC 2151014。PMID 18172165。

[entrez-6] 「Entrez 遺伝子: 5'-3' エキソリボヌクレアーゼ 1」。