ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
NHEJ1 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2QM4、2R9A、3Q4F、3RWR、3SR2、3W03
識別子 エイリアス NHEJ1 、XLF、非相同末端結合因子1 外部ID オミム ：611290; MGI : 1922820; ホモロジーン : 11714; ジーンカード ：NHEJ1; OMA :NHEJ1 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体1（マウス） [2] バンド 1|1 C4 始める 75,006,298 bp [2] 終わり 75,101,844 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 直腸 生殖腺 横行結腸粘膜 単球 腓腹筋 左精巣 平滑筋組織 右精巣 アキレス腱 睾丸
トップの表現 卵黄嚢 顆粒球 二次卵母細胞 受精卵 右腎臓 精母細胞 一次卵母細胞 精子細胞 近位尿細管 桑実胚
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能 細胞成分
非相同末端結合複合体 核 核質 原線維中心 DNAリガーゼIV複合体 生物学的プロセス
電離放射線に対する反応 B細胞の分化 中枢神経系の発達 リガーゼ活性の正の調節 T細胞の分化 非相同末端結合による二本鎖切断の修復 DNA損傷刺激に対する細胞反応 二本鎖切断修復 DNA修復 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) RefSeq (タンパク質) NP_079058 NP_001364427 NP_001364428
場所 (UCSC) 2 章: 219.08 – 219.16 Mb 1 章: 75.01 – 75.1 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
非相同末端結合因子 1 (NHEJ1) は、 Cernunnos または XRCC4 様因子 ( XLF )としても知られ 、ヒト では NHEJ1 遺伝子によってコードされる タンパク質 です。 [5] XLF はもともと、成長遅延、小頭症、免疫不全の 5 人の患者で変異したタンパク質として発見されました。 [6]このタンパク質は、 DNA 修復の 非相同末端結合 (NHEJ) 経路 に必要です。XLF 変異を持つ患者は 、V(D)J 組み換え の欠陥による免疫不全も患っています。V (D)J 組み換え は、NHEJ を使用して免疫系の抗体レパートリーの多様性を生み出します。XLF は DNA リガーゼ IV および XRCC4 と相互作用し、NHEJ の末端架橋またはライゲーション段階に関与していると考えられています。XLF の酵母 ( Saccharomyces cerevisiae ) ホモログは Nej1 です。 [7]
表現型 ヒトにおけるXLF欠失の重篤な免疫不全表現型とは対照的に、マウスではXLF単独の欠失では軽度の表現型となる。 [8] しかし、XLFの欠失と ATM キナーゼの欠失を組み合わせるとNHEJの合成欠陥を引き起こし、マウスではこれら2つのタンパク質の機能に部分的な冗長性があることを示唆している。 [9]
構造 XLFは構造的に XRCC4 に類似しており、N末端球状ヘッドドメイン、αヘリックス柄、および構造化されていないC末端領域（CTR）を持つ構成的二量体として存在する。 [10]
インタラクション XLFはXRCC4 と 相互作用する ことが示されており 、 [11] Ku タンパク質 と相互作用することが示されている [12]。 また、DNAとも弱く相互作用することができる。 [13] [14] XLFとXRCC4の共結晶構造は、2つのタンパク質がXLFとXRCC4サブユニットの交互の頭対頭相互作用を介してヘテロオリゴマーを形成できることを示唆している。 [15] [16] [17]これらのXRCC4-XLFフィラメントは、 NHEJ 中に末端ライゲーションの前にDNAを橋渡しすることが提案されている。XRCC4-XLFオリゴマーの形成は、 XRCC4 のC末端ドメインとDNAリガーゼIVのBRCTドメインとの相互作用によって阻害される可能性がある 。 [15]
造血幹細胞の老化 マウスにおけるNHEJ1の欠損は、長期にわたる再増殖が不完全で、時間の経過とともに悪化するという証拠を含むいくつかの証拠によって示されているように、造血幹細胞の早期老化につながります。 [18] NHEJ1欠損のヒト誘導多能性幹細胞モデルを使用して、NHEJ1が原始的な造血前駆細胞の生存を促進する上で重要な役割を果たすことが示されました。 [19] これらのNHEJ1欠損細胞は、生理学的ストレス、正常な代謝、および電離放射線によって引き起こされるDNA損傷に対処できないと思われる、NHEJ1を介した修復能力が弱いです。 [19]
参考文献
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さらに読む
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