ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
TFAM 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 3FGH、3TMM、3TQ6、4NNU、4NOD
識別子 エイリアス TFAM 、MTTF1、MTTFA、TCF6、TCF6L1、TCF6L2、TCF6L3、転写因子A、ミトコンドリア、MTDPS15 外部ID オミム ：600438; MGI : 107810; ホモロジーン : 31139; ジーンカード ：TFAM; OMA :TFAM - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体10（マウス） [2] バンド 10 B5.3|10 36.83 cM 始める 71,061,294 bp [2] 終わり 71,074,110 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 右精巣 左精巣 二次卵母細胞 アキレス腱 心室帯 単球 胚上皮 神経節隆起 S状結腸粘膜 生殖腺
トップの表現 心室帯 心内膜クッション 房室弁 腹壁 胚 体節 移動性腸管神経堤細胞 胚葉上層 太ももの筋肉 上腕三頭筋
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
DNA結合 ミトコンドリアプロモーター配列特異的DNA結合 熱ショックタンパク質結合 DNA結合転写因子活性 DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 クロマチン結合 RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 タンパク質結合 転写コアクチベーター結合 DNAの結合、曲げ RNA結合 配列特異的DNA結合 細胞成分
細胞質 ミトコンドリアマトリックス ミトコンドリア ミトコンドリア核様体 核 タンパク質含有複合体 生物学的プロセス
DNA依存性DNA複製 転写の調節、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIによる転写の調節 ミトコンドリアプロモーターからの転写開始 ミトコンドリア組織 転写、DNAテンプレート 転写の正の制御、DNAテンプレート ミトコンドリア呼吸鎖複合体の組み立て RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 RNAポリメラーゼIIによる転写 ミトコンドリア転写 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001270782 NM_003201 NM_012251
RefSeq (タンパク質) 場所 (UCSC) 10 章: 58.39 – 58.4 Mb 10 章: 71.06 – 71.07 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
ミトコンドリア転写因子A （TFAM または mtTFA と略される）は 、ヒトでは TFAM 遺伝子 によってコードされる タンパク質 である。 [5] [6]
関数 この遺伝子は、ミトコンドリア転写の重要な活性化因子であり、ミトコンドリアゲノム複製の参加者でもあるミトコンドリア転写因子をコードしています 。TFAM は ミトコンドリアプロモーター DNA に結合して、ミトコンドリアゲノムの転写を助けます。マウスの研究では、この遺伝子産物はミトコンドリアゲノムのコピー数を調節するために必要であり、 胚の発達 に不可欠であることが実証されています。心臓細胞と筋肉細胞を標的としてこの遺伝子の発現を阻害することで、 カーンズ・セイヤー症候群 のマウスモデルが作成されました。 [6]
TFAMは、二重ボックス型の 高移動度 DNA結合タンパク質および曲げタンパク質である。 [7] この曲げ作用は、哺乳類のミトコンドリア転写開始に重要であるが、相同遺伝子Abf2を持つ酵母では重要ではない。TFAMは、その結合活性が配列特異的ではないため、ミトコンドリアゲノムのパッケージングにも関与している可能性がある。 [8]
インタラクション TFAMはTFB1M および [9] TFB2M と 相互作用する ことが示されている 。 [10]
参考文献
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さらに読む
富永 功、秋山 聡、香川 勇、太田 聡 (1992)。「ヒトミトコンドリア転写因子1のゲノム遺伝子の上流領域」。Biochim . Biophys. Acta . 1131 (2): 217–9. doi :10.1016/0167-4781(92)90082-b. PMID 1610904。 Fisher RP、Lisowsky T、Parisi MA、Clayton DA (1992)。「ミトコンドリア高移動度グループ様転写活性化タンパク質によるDNAのラッピングと曲げ」。J . Biol. Chem . 267 (5): 3358–67. doi : 10.1016/S0021-9258(19)50739-6 . PMID 1737790。 Parisi MA、 Clayton DA (1991)。「ヒトミトコンドリア転写因子1と高 移動 度群タンパク質の類似性」。Science。252 ( 5008): 965–9。Bibcode : 1991Sci ...252..965P。doi :10.1126/science.2035027。PMID 2035027 。 富永 健、林 淳、香川 勇、太田 誠 (1993)。「ヒトミトコンドリア転写因子1の小型アイソフォーム：その広範な分布と選択的スプライシングによる生成」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 194 (1): 544–51. doi :10.1006/bbrc.1993.1854. PMID 8333869。 Lezza AM、Pesce V、Cormio A、Fracasso F、Vecchiet J、Felzani G、Cantatore P、Gadaleta MN (2001)。「高齢ヒト被験者の骨格筋におけるミトコンドリア転写因子Aおよび核呼吸因子-1の発現増加」。FEBS Lett。501 ( 1 ) : 74–8。doi : 10.1016 /S0014-5793(01)02628- X。PMID 11457459。S2CID 45160010 。 高松 千恵子、梅田 聡、大里 孝文、大野 剛志、阿部 勇、福尾 明、品川 秀、浜崎 暢、康 大 (2002)。「転写因子 A と一本鎖 DNA 結合タンパク質によるミトコンドリア D ループの制御」。EMBO Rep . 3 (5): 451–6. doi :10.1093/embo-reports/kvf099. PMC 1084112. PMID 11964388 。 Falkenberg M 、 Gaspari M、 Rantanen A、 Trifunovic A、 Larsson NG、 Gustafsson CM (2002)。「ミトコンドリア転写因子 B1 および B2 はヒト mtDNA の転写を活性化する」。Nat . Genet . 31 (3): 289–94. doi :10.1038/ng909. PMID 12068295. S2CID 11164308. Reyes A、Mezzina M、Gadaleta G (2002)。「ヒトミトコンドリア転写因子A（mtTFA）：遺伝子構造と関連擬似遺伝子の特徴」。Gene . 291 (1–2): 223–32. doi :10.1016/S0378-1119(02)00600-5. PMID 12095695。 Yoshida Y, Izumi H, Ise T, Uramoto H, Torigoe T, Ishiguchi H, Murakami T, Tanabe M, Nakayama Y, Itoh H, Kasai H, Kohno K (2002). 「ヒトミトコンドリア転写因子Aは酸化ダメージを受けたDNAに優先的に結合する」 Biochem. Biophys. Res. Commun . 295 (4): 945–51. doi :10.1016/S0006-291X(02)00757-X. PMID 12127986. ガリード N、グリパリク L、ジョキタロ E、ワルティオヴァーラ J、ファン デル ブリーク AM、スペルブリンク JN (2003)。 「ヒトミトコンドリア核様体の組成と動態」。 モル。バイオル。セル 。 14 (4): 1583–96。 土井 ：10.1091/mbc.E02-07-0399。 PMC 153124 。 PMID 12686611。 Yoshida Y, Izumi H, Torigoe T, Ishiguchi H, Itoh H, Kang D, Kohno K (2003). 「P53 はミトコンドリア転写因子 A と物理的に相互作用し、損傷 DNA への結合を差別的に制御する」。Cancer Res . 63 (13): 3729–34. PMID 12839966。 McCulloch V、Shadel GS (2003)。「ヒトミトコンドリア転写因子 B1 は h-mtTFA の C 末端活性化領域と相互作用し、RNA メチルトランスフェラーゼ活性とは独立して転写を刺激する」。Mol . Cell. Biol . 23 (16): 5816–24. doi :10.1128/MCB.23.16.5816-5824.2003. PMC 166325. PMID 12897151 。 Deschauer M、Kiefer R、Blakely EL、He L、Zierz S、Turnbull DM、Taylor RW (2003)。「常染色体優性進行性外眼筋麻痺における新たなTwinkle遺伝子変異」。Neuromuscul . Disord . 13 (7–8): 568–72. doi :10.1016/S0960-8966(03)00071-3. PMID 12921794. S2CID 23020569. Günther C、von Hadeln K、Müller-Thomsen T、Alberici A、Binetti G、Hock C、Nitsch RM、Stoppe G、Reiss J、Gal A、Finckh U (2005)。「ミトコンドリア転写因子 A (TFAM) 遺伝子型と散発性アルツハイマー病との関連性の可能性」。Neurosci . Lett . 369 (3): 219–23. doi :10.1016/j.neulet.2004.07.070. PMID 15464268. S2CID 25710306。 Kanki T, Ohgaki K, Gaspari M, Gustafsson CM, Fukuoh A, Sasaki N, Hamasaki N, Kang D (2004). 「ヒトミトコンドリアDNAの維持におけるミトコンドリア転写因子Aの構造的役割」 Mol. Cell. Biol . 24 (22): 9823–34. doi :10.1128/MCB.24.22.9823-9834.2004. PMC 525493. PMID 15509786 . カム H、バルシウナイト E、ブレイス A、スペクター A、スカルプーラ RC、ヤング R、クルーガー Y、ディンラハト BD (2004)。 「遺伝子調節ネットワークの共通のセットが代謝と成長阻害を結びつけている。」 モル。セル 。 16 (3): 399–411。 土井 ： 10.1016/j.molcel.2004.09.037 。 PMID 15525513。
外部リンク 
