| サッカロミセス・パラドクス | |
|---|---|
| 科学的分類 | |
| ドメイン: | 真核生物 |
| 王国: | 菌類 |
| 分割: | 子嚢菌類 |
| クラス: | サッカロミセス |
| 注文: | サッカロミケス綱 |
| 家族: | サッカロミセス科 |
| 属: | サッカロミセス |
| 種: | S.パラドクス
|
| 二名法名 | |
| サッカロミセス・パラドクス バッハ=ライヒ、1914年
| |
サッカロミセス・パラドクサスは野生酵母であり、パン酵母サッカロミセス・セレビシエに最も近い既知の種である。集団ゲノム学や系統学の研究で、その野生特性を実験室酵母と比較するために使用されている。 [1]
エコロジー
サッカロミセス・パラドキサスは主に落葉樹(オーク、カエデ、カバノキ)から分離され、まれに昆虫や果物からも分離される。[2] [3] [4] [5]他のサッカロミセス属の種と共存していることが多い。[6] [7] [8]サッカロミセス・セレビシエと同様に世界中に分布しており、中温性であるため、自然分布は低緯度地域に限られている。しかし、サッカロミセス・パラドキサスは通常サッカロミセス・セレビシエよりも低温で生育するため、分布はイギリス諸島やカナダ東部などのより寒冷な地域へとわずかにシフトしている。[2] [8] [9]
生物地理学


他のほとんどのサッカロミセス種とは異なり、サッカロミセス・パラドキサスが人間によって栽培化されたという証拠はない。 [3] [11]したがって、その生物地理学は、限られた移動、[3]氷河避難所[12]および気候への適応[10]などの自然プロセスによって特徴付けられる。少なくとも 4 つの遺伝的および表現型の異なるサッカロミセス・パラドキサスの集団が特定されており、それぞれヨーロッパ (西シベリアを含む)、極東アジア (日本、東シベリア)、北米 (北米東海岸と西海岸、五大湖地域)、北東アメリカ (ガスペ半島、セントローレンス渓谷、アパラチア山脈) の主要な地理的区分に対応している。[3] [9] [10] [11]これらの集団の代表的な株は、部分的な接合後隔離を示す。[12] [13] 5 番目の集団は、ハワイからの単独の分離株によって代表される。[3] [11]ヨーロッパの集団からのいくつかの株は北アメリカとニュージーランドで発見されており、最近の植民地化イベントの結果である可能性が高い。[14] [15]南アメリカからの2つの分離株はSaccharomyces cariocanusとして記載されており、[16]遺伝的に区別がつかないが、染色体転座のために、アメリカの集団からの株と交配すると接合子後分離を示す。[13]
再生
サッカロミセス・パラドクサスは本来ホモタリックであり、環境中では主に二倍体として見つかる。生殖は主にクローンで、有性生殖の99%は同じ子嚢胞子の間で起こる。[17]これにより、クローン増殖中に蓄積された劣性有害変異が除去され、「ゲノム更新」と呼ばれるプロセスが行われる。 [18] [19] サッカロミセス・パラドクサスの株間では接合後の隔離がよく観察され、これは集団間の遺伝的相違または集団内の染色体変化によるものである可能性がある。[12] [13]
他のサッカロミセス種と同様に、標準的な遺伝子ツールを使用してヘテロタリズムを復元し、実験目的で 安定した半数体株を得ることができます。
参考文献
- ^ Dunham, MJ; Louis, ED (2011). 「酵母の進化と生態学がゲノミクスと出会う」. EMBO Reports . 12 (1): 8–10. doi :10.1038/embor.2010.204. PMC 3024138. PMID 21151040 .
- ^ ab Charron, G; Leducq, JB; Bertin, C (2014). 「北米におけるサッカロミセス・セレビシエとサッカロミセス・パラドクサスの分布北限の探査」FEMS酵母研究. 14 (2): 281–8. doi : 10.1111/1567-1364.12100 . PMID 24119009.
- ^ abcde Hyma, KE; Jay, JC (2013). 「北米のブドウ園におけるブドウ園型とオーク樹型のサッカロミセス・セレビシエの混合」分子生態学. 22 (11): 2917–30. doi :10.1111/mec.12155. PMC 3620907. PMID 23286354 .
- ^ Maganti, H; Bartfai, D; Xu, J (2012). 「カナダ、オンタリオ州ハミルトン周辺の樹木に関連する酵母の生態学的構造」FEMS酵母研究. 12 (1): 9–19. doi : 10.1111/j.1567-1364.2011.00756.x . PMID 22029478.
- ^ Sniegowski, PD; Dombrowski, PG; Fingerman, E (2002). 「Saccharomyces cerevisiae と Saccharomyces paradoxus は北米の自然林で共存し、ヨーロッパの同種とは異なるレベルの生殖隔離を示す」FEMS 酵母研究. 1 (4): 299–306. doi : 10.1111/j.1567-1364.2002.tb00048.x . PMID 12702333.
- ^ Naumov, GI; Naumova, ES; Sniegowski, PD (1998). 「Saccharomyces paradoxus と Saccharomyces cerevisiae は北米のオークの滲出液と関連している」. Canadian Journal of Microbiology . 44 (11): 1045–50. doi :10.1139/w98-104. PMID 10029999.
- ^ Sampaio, JP; Goncalves, P (2008). 「ポルトガルの Saccharomyces kudriavzevii の自然集団はオークの樹皮と関連しており、S. cerevisiae および S. paradoxus と同所的である」(PDF) .応用環境微生物学. 74 (7): 2144–52. Bibcode :2008ApEnM..74.2144S. doi :10.1128/AEM.02396-07. PMC 2292605 . PMID 18281431.
- ^ ab Sweeney, JY; Kuehne, HA; Sniegowski, PD (2004). 「同所性天然Saccharomyces cerevisiaeとS. paradoxusの集団は異なる熱成長プロファイルを持つ」FEMS酵母研究. 4 (4–5): 521–5. doi : 10.1016/s1567-1356(03)00171-5 . PMID 14734033.
- ^ ab Johnson, LJ; Koufopanou, V; Goddard, MR (2004). 「野生酵母Saccharomyces paradoxusの集団遺伝学」.遺伝学. 166 (1): 43–52. doi :10.1534/genetics.166.1.43. PMC 1470673. PMID 15020405 .
- ^ abc Leducq, JB; Charron, G; Samani, P (2014). 「広範囲に分布する微生物の局所気候適応」Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences . 281 (1777): 20132472. doi :10.1098/rspb.2013.2472. PMC 3896012 . PMID 24403328.
- ^ abc Liti, G; Carter, DM; Moses, AM (2009). 「家畜酵母と野生酵母の集団ゲノミクス」. Nature . 458 (7236): 337–41. Bibcode :2009Natur.458..337L. doi :10.1038/nature07743. PMC 2659681. PMID 19212322 .
- ^ abc Charron, G; Leducq, JB; Landry, CR (2014). 「染色体変異は初期の種内で分離し、生殖隔離と相関する」.分子生態学. 23 (17): 4362–4372. doi :10.1111/mec.12864. PMID 25039979. S2CID 43071397.
- ^ abc Liti, G; Barton, DB; Louis, EJ (2006). 「サッカロミセスにおける配列多様性、生殖隔離、種概念」.遺伝学. 174 (2): 839–850. doi :10.1534/genetics.106.062166. PMC 1602076. PMID 16951060 .
- ^ Kuehne, HA; Murphy, HA; Francis, CA (2007). 「野生酵母集団における異所的分岐、二次接触、遺伝的隔離」Current Biology . 17 (5): 407–11. doi : 10.1016/j.cub.2006.12.047 . PMID 17306538. S2CID 18301950.
- ^ Zhang, HA; Skelton, A; Gardner, RC (2010). 「ニュージーランドのオークの木に生息するサッカロミセス・パラドクサスとサッカロミセス・セレビシエ:ヨーロッパからの移住と種間雑種の証拠」FEMS酵母研究. 10 (7): 941–7. doi : 10.1111/j.1567-1364.2010.00681.x . PMID 20868381.
- ^ Naumov, GI ; James, SA; Naumova, ES (2000). 「Saccharomyces sensu stricto 複合体における 3 つの新種: Saccharomyces cariocanus、Saccharomyces kudriavzevii、および Saccharomyces mikatae」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology。50 ( 5): 1931–42。doi : 10.1099 /00207713-50-5-1931。PMID 11034507。
- ^ Tsai, IJ; Bensasson, D; Burt, A (2008). 「野生酵母 Saccharomyces paradoxus の集団ゲノミクス: ライフサイクルの定量化」米国科学アカデミー紀要. 105 (12): 4957–62. Bibcode :2008PNAS..105.4957T. doi : 10.1073/pnas.0707314105 . PMC 2290798. PMID 18344325.
- ^ Mortimer, Robert K.; Romano, Patrizia; Suzzi, Giovanna; Polsinelli, Mario (1994 年 12 月)。「ゲノム更新: ブドウ果汁の自然発酵から得られる 43 株の Saccharomyces cerevisiae の遺伝学的研究から明らかになった新しい現象」。 酵母。10 ( 12 ) : 1543–1552。doi :10.1002/yea.320101203。PMID 7725789。S2CID 11989104 。
- ^ Masel, Joanna ; Lyttle, David N. (2011年12月). 「クローン的に繁殖する種における自殖による稀な有性生殖の結果」.理論集団生物学. 80 (4): 317–322. doi :10.1016/j.tpb.2011.08.004. PMC 3218209. PMID 21888925 .
