ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| スパルクル1 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | SPARCL1、MAST 9、MAST9、PIG33、SC1、SPARC 1 など |
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| 外部ID | オミム:606041; MGI : 108110;ホモロジーン: 3438;ジーンカード:SPARCL1; OMA :SPARCL1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 5番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 5 E5|5 50.55 cM | 始める | 104,226,977 bp [2] |
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| 終わり | 104,261,599 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 中側頭回
- 中心後回
- 上前頭回
- ブロードマン領域23
- 眼窩前頭皮質
- 外淡蒼球
- 海馬のI領域
- 後頭葉
- ブロードマン領域46
- 一次視覚野
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| | トップの表現 | - 深部小脳核
- 背側被蓋核
- 内側前庭核
- 小脳虫部
- 腹側被蓋野
- 淡蒼球
- 橋核
- 視床下部背内側核
- 小脳葉
- 視床下部室傍核
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- 金属イオン結合
- カルシウムイオン結合
- コラーゲン結合
- 細胞外マトリックス結合
- タンパク質結合
| | 細胞成分 |
- 細胞外エクソソーム
- 細胞外空間
- 小胞体腔
- 細胞外領域
- コラーゲン含有細胞外マトリックス
- グルタミン酸シナプス
| | 生物学的プロセス |
- シグナル伝達
- 解剖学的構造の発達
- 翻訳後タンパク質修飾
- シナプス膜接着
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_004684 NM_001128310 NM_001291976 NM_001291977 |
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NM_010097 NM_001359014 NM_001359016 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001121782 NP_001278905 NP_001278906 NP_004675 |
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NP_034227 NP_001345943 NP_001345945 |
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| 場所 (UCSC) | 4 章: 87.47 – 87.53 Mb | 5 章: 104.23 – 104.26 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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SPARC様タンパク質1(SPARCL1またはSC1 )は、ヘビン(高内皮細静脈タンパク質の略)としても知られ、 SPARCと高い構造類似性を持つ分泌タンパク質です。[5] [6]細胞外マトリックスと相互作用して、細胞接着の中間状態を作り出します。[7]癌の転移や炎症に関与する動的な細胞外役割のため、マトリックス細胞タンパク質と考えられています。[8] [9]ヒトでは、ヘビンはSPARCL1遺伝子によってコードされています。[10] [11]
インタラクション
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000152583 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000029309 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Girard JP 、 Springer TA(1995年1月)。「抗接着性細胞外マトリックスタンパク質SPARCの近縁種であるヘビンの精製高内皮細静脈細胞からのクローニング」。 免疫。2(1):113–23。doi :10.1016 /1074-7613(95)90083-7。PMID 7600298。
- ^ Hambrock HO、Nitsche DP、Hansen U、Bruckner P、Paulsson M、Maurer P、Hartmann U (2003 年 3 月)。「SC1/hevin。コラーゲン I に結合する細胞外カルシウム調節タンパク質」。The Journal of Biological Chemistry。278 ( 13): 11351–8。doi : 10.1074/ jbc.M212291200。PMID 12538579。
- ^ Sullivan MM、Barker TH、Funk SE、Karchin A、Seo NS、Höök M、他 (2006 年 9 月)。「Matricellular hevin はデコリン産生とコラーゲン形成を制御する」。The Journal of Biological Chemistry。281 ( 37): 27621–32。doi : 10.1074/ jbc.M510507200。PMID 16844696。
- ^ Morris AH、Kyriakides TR (2014年7 月)。「Matricellular タンパク質と生体材料」。Matrix Biology。37 : 183–91。doi : 10.1016/ j.matbio.2014.03.002。PMC 4167162。PMID 24657843。
- ^ Sullivan MM、Sage EH (2004 年 6 月)。「Hevin/SC1 は、SPARC/BM-40/オステオネクチン ファミリーのマトリ細胞糖タンパク質および潜在的な腫瘍抑制因子です」。国際生化学・細胞生物学ジャーナル。36 (6): 991–6。doi :10.1016/ j.biocel.2004.01.017。PMID 15094114 。
- ^ Schraml P、Shipman R、 Stulz P 、 Ludwig CU (1993 年 3 月)。「磁気補助サブトラクション技術 (MAST) を使用した cDNA サブトラクション ライブラリの構築」。Trends in Genetics。9 (3): 70–1。doi : 10.1016 /0168-9525(93)90216-5。PMID 8488563。
- ^ 「Entrez Gene: SPARCL1 SPARC-like 1 (mast9、hevin)」。
- ^ Kim JH、Jung HG、Kim A、Shim HS、Hyeon SJ、Lee YS、et al. (2021年3月)。「ヘビン-カルシオン相互作用は脳損傷後のシナプス再編成を促進する」。細胞死と分化 。28 ( 9 ): 2571–2588。doi : 10.1038 /s41418-021-00772-5。ISSN 1350-9047。PMC 8408247。PMID 33753902。
さらに読む
- Girard JP、Springer TA (1996 年 2 月)。「高内皮細静脈に関連する酸性タンパク質ヘビンによる内皮細胞接着の調節」。The Journal of Biological Chemistry。271 ( 8 ): 4511–7。doi : 10.1074 /jbc.271.8.4511。PMID 8626806 。
- Claeskens A、Ongenae N、Neefs JM、Cheyns P、Kaijen P、Cools M、Kutoh E (2000 年 3 月)。「Hevin は多くの癌でダウンレギュレーションされており、細胞の成長と増殖の負の調節因子である」。British Journal of Cancer。82 ( 6 ) : 1123–30。doi :10.1054/bjoc.1999.1051。PMC 2363342。PMID 10735494。
- Schmitt-Ulms G、Hansen K、Liu J、Cowdrey C、Yang J、DeArmond SJ、他 (2004 年 6 月)。「複合組織におけるタンパク質相互作用の研究のための時間制御経心臓灌流クロスリンク」。Nature Biotechnology。22 ( 6 ) : 724–31。doi : 10.1038/nbt969。PMID 15146195。S2CID 36630738。
- Colland F、Jacq X、Trouplin V、 Mougin C、Groizeleau C 、 Hamburger A、他 (2004 年 7 月)。「ヒトシグナル伝達経路の機能的プロテオミクスマッピング」。 ゲノム研究。14 ( 7): 1324–32。doi :10.1101/gr.2334104。PMC 442148。PMID 15231748。
- リー Y、アロカ=アギラール JD、ゴーシュ S、サンチェス=サンチェス F、エスクリバーノ J、コカ プラドス M (2006 年 1 月)。 「ミオシリンとヘビンのC末端領域との相互作用」。生化学および生物物理学研究コミュニケーション。339 (3): 797–804。土井:10.1016/j.bbrc.2005.11.082。PMID 16316624。
- Liu T、Qian WJ、Gritsenko MA、Camp DG、Monroe ME、Moore RJ、Smith RD (2006)。「免疫親和性サブトラクション、ヒドラジド化学、質量分析によるヒト血漿N-グリコプロテオーム分析」。Journal of Proteome Research。4 ( 6 ) : 2070–80。doi :10.1021/pr0502065。PMC 1850943。PMID 16335952。
- スカラブリーニ D、フェノーリオ C、スカルピーニ E、デリズ M、コミ C、ヴェントゥレッリ E 他(2007 年 10 月)。 「多発性硬化症患者におけるSPARCL1遺伝子の候補遺伝子解析」。神経科学の手紙。425 (3): 173-6。土井:10.1016/j.neulet.2007.08.020。PMID 17825989。S2CID 9381979 。