SLBP

SLBP
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	2KJM、4QOZ
識別子
エイリアス	SLBP、HBP、ステムループ結合タンパク質
外部ID	オミム：602422; MGI : 108402;ホモロジーン: 31389;ジーンカード：SLBP; OMA :SLBP - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体4（ヒト）
終わり	1,712,344 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	5番染色体（マウス）
終わり	33,809,918 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	卵母細胞; ; 二次卵母細胞; ; 右精巣; ; 左精巣; ; 骨髄; ; 耳下腺; ; 神経節隆起; ; 心室帯; ; 生殖腺; ; 網膜色素上皮;
	トップの表現
	受精卵; ; 精母細胞; ; 胎児の尾; ; 胚; ; 胚; ; 心室帯; ; 精子細胞; ; 桑実胚; ; 性器結節; ; 胚盤胞;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	ヒストンpremRNA DCP結合; ヒストンpremRNAステムループ結合; タンパク質結合; mRNA結合; RNA結合; 同一のタンパク質結合;
細胞成分	細胞質; ヒストンpre-mRNA 3'末端プロセシング複合体; 核質; 核; 核小体; 細胞質; リボ核タンパク質複合体;
生物学的プロセス	RNAポリメラーゼII転写の終結; mRNA輸送; ステムループ結合と切断によるmRNA 3'末端処理; mRNA処理; 核からのmRNAの輸出; 核DNA複製; ヒストン mRNA 代謝プロセス; 細胞周期の相転移;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	7884
	20492
	ENSG00000163950
	ENSMUSG00000004642
	Q14493 ; Q53XR2
	P97440
	NM_001306074 ; NM_001306075 ; NM_006527
	NM_001289724 ; NM_001289725 ; NM_009193
	NP_001293003 ; NP_001293004 ; NP_006518 ; NP_006518.1
	NP_001276653 ; NP_001276654 ; NP_033219
	ウィキデータ
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ヒストンRNAヘアピン結合タンパク質またはステムループ結合タンパク質（SLBP）は、ヒトではSLBP遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]^[7]

種の分布

SLBP は、ヒト、線虫、ショウジョウバエ、アフリカツメガエル、ウニからクローン化されています。ヒトの全長タンパク質は 270 個のアミノ酸 (31 kDa) から成り、中央に RNA 結合ドメイン (RBD) があります。75 個のアミノ酸からなる RBD は種を超えてよく保存されていますが、SLBP の残りの部分はほとんどの生物で大きく異なり、真核生物ゲノムの他のどのタンパク質とも相同性がありません。

関数

この遺伝子は、複製依存性ヒストン mRNAのヒストン 3' UTR ステムループ構造に結合するタンパク質をコードします。ヒストン mRNA にはイントロンやポリアデニル化シグナルが含まれず、ステムループの下流で単一のエンドヌクレアーゼ切断イベントによって処理されます。ステムループ構造はヒストン pre-mRNA の効率的な処理に不可欠ですが、この構造はヒストン mRNA の輸送、翻訳、安定性も制御します。SLBP の発現は細胞周期の S 期に制御され、 G1の後半に 10 倍以上増加します。

すべての SLBP タンパク質は、ヒストンステムループ RNA と非常に安定した複合体を形成できます。ヒストン mRNA ステムループとの複合体形成は、新しい 3 ヘリックスバンドルフォールドによって実現されます。SLBP タンパク質は、ヒストンヘアピンのテトラループ構造、ステムの基部、および 5' 隣接領域も認識します。ステムループ RNA およびエキソヌクレアーゼEri1と複合体を形成したヒト SLBP の結晶構造は、 SLBP の Arg181 残基が RNA ステムの 2 番目のグアニン塩基と特異的に相互作用することを示しています。^[8]タンパク質の残りの部分は、ショウジョウバエでもヒトでも本質的に無秩序です。SLBP RBD のユニークな特徴は、 RNA 結合ドメインの Thr171 残基がリン酸化されることです。SLBP RBD はこの配列の周りでプロリン異性化も起こし、プロリルイソメラーゼ Pin1 の基質となります。ヒトSLBPのN末端ドメインは、SLIP1との相互作用を介してヒストンmRNAの翻訳活性化に必要である。SLBPはまた、CBP80関連タンパク質CTIFと相互作用して、ヒストンmRNAの急速な分解を促進する。SLBPはリン酸化タンパク質であり、T171のほか、哺乳類細胞ではSer7、Ser20、Ser23、Thr60、Thr61でもリン酸化される。Thr60のリン酸化はCK2によって媒介され、Thr61はサイクリンA / Cdk1によって媒介される。^[7]

参考文献

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さらに読む

Choe J、Mi Kim K、Park S、Kyung Lee Y、Song OK、Kim MK、Lee BG、Song HK、Kim YK (2013)。「複製依存性ヒストン mRNA の急速な分解は、主に核キャップ結合タンパク質 80 および 20 に結合した mRNA で起こる」。核酸研究。41 ( 2 ): 1307– 1318。doi :10.1093/ nar /gks1196。PMC 3553978。PMID 23234701。
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[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

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