ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| セマ4G |
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| 識別子 |
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| エイリアス | SEMA4G、セマフォリン4G |
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| 外部ID | MGI : 1347047; HomoloGene : 22682; GeneCards : SEMA4G; OMA :SEMA4G - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 19番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 19|19 C3 | 始める | 44,989,101 bp [2] |
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| 終わり | 45,003,397 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 横行結腸粘膜
- 直腸
- 肝臓の右葉
- 回腸粘膜
- 小脳の右半球
- 膵臓の体
- 右卵巣
- 左卵巣
- 甲状腺の右葉
- 脚の皮膚
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| | トップの表現 | - 肝臓の左葉
- 小腸のリーベルキューン陰窩
- 小腸上皮
- 結腸
- 左結腸
- 十二指腸
- 肝臓の右葉
- 小腸
- 小脳皮質
- 回腸
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- タンパク質結合
- ニューロピリン結合
- セマフォリン受容体結合
- 化学忌避活性
| | 細胞成分 |
- 膜の不可欠な構成要素
- 細胞膜
- 膜
- 細胞外空間
- 細胞膜の不可欠な構成要素
| | 生物学的プロセス |
- 多細胞生物の発達
- 細胞分化
- 神経系の発達
- 負の走化性
- 神経堤細胞の移動
- 細胞移動の正の調節
- 軸索誘導に関与する軸索伸長の負の調節
- セマフォリン-プレキシンシグナル伝達経路
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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セマフォリン4GはヒトではSEMA4G遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5]
セマフォリンは、N末端細胞外部分にセマフォリング(Sema)ドメインとPSIドメイン(プレキシン、セマフォリン、インテグリンに存在)を持つ、保存された分泌型膜関連タンパク質の大きなファミリーです。セマフォリンは、軸索誘導、免疫細胞の維持、血管の成長、腫瘍の移動において、細胞の運動性と接着性を維持します。[6]
配列と構造の類似性に基づき、セマフォリンは8つのクラスに分類されます。無脊椎動物にはクラス1と2、ウイルスにはクラスV、脊椎動物にはクラス3~7が含まれます。セマフォリンは、多量体受容体複合体を介して軸索誘導リガンドとして機能し、一部(すべてではない)にはプレキシンタンパク質が含まれています。この遺伝子はクラス4のセマフォリンをコードしています。この遺伝子とミトコンドリアリボソームタンパク質L43の遺伝子は、マップ位置10q24.31で重複しており、反対方向に転写されます。[5]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000095539 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000025207 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ab "Entrez Gene: SEMA4G セマドメイン、免疫グロブリンドメイン (Ig)、膜貫通ドメイン (TM) および短い細胞質ドメイン (セマフォリン) 4G"。
- ^ Kruger, Robert P.; Aurandt, Jennifer; Guan, Kun-Liang (2005年10月). 「セマフォリンが細胞に動きを指令する」Nature Reviews Molecular Cell Biology 6 ( 10): 789–800. doi :10.1038/nrm1740. ISSN 1471-0080.
さらに読む
- Pasterkamp RJ、Kolodkin AL (2003)。「セマフォリンジャンクション:神経接続への道筋」。Curr . Opin. Neurobiol . 13 (1): 79–89. doi :10.1016/S0959-4388(03)00003-5. PMID 12593985. S2CID 40661992.
- Dickson BJ (2003). 「軸索誘導の分子メカニズム」. Science . 298 (5600): 1959–64. doi :10.1126/science.1072165. PMID 12471249. S2CID 28328792.
- Holtmaat AJ、De Winter F、De Wit J、他 (2002)。「セマフォリン: 海馬ネットワークの構造的安定性に寄与するか?」成人脳の可塑性: 遺伝子から神経療法まで。脳研究の進歩。第 138 巻。pp. 17–38。doi : 10.1016/S0079-6123(02) 38068-3。ISBN 978-0-444-50981-9. PMID 12432760。
- Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173–8。Bibcode :2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038 /nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Deloukas P、Earthrowl ME、 Grafham DV、他 (2004)。「ヒト染色体 10 の DNA 配列と比較分析」。Nature . 429 ( 6990 ): 375–81。Bibcode :2004Natur.429..375D。doi : 10.1038/nature02462。PMID 15164054。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- 永瀬 孝、菊野 亮、中山 正之、他 (2001)。「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。XVIII. 試験管内で巨大タンパク質をコードする脳由来の 100 個の新しい cDNA クローンの完全配列」。DNA Res . 7 (4): 273–81. doi : 10.1093/dnares/7.4.271 . PMID 10997877。