| サムHD1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | SAMHD1、CHBL2、DCIP、HDDC1、MOP-5、SBBI88、SAMおよびHDドメイン含有デオキシヌクレオシド三リン酸トリホスホヒドロラーゼ1、hSAMHD1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム: 606754; MGI : 1927468;ホモロジーン:9160;ジーンカード:SAMHD1; OMA :SAMHD1 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SAMドメインおよびHDドメイン含有タンパク質1は、ヒトではSAMHD1遺伝子によってコードされるタンパク質である。SAMHD1は細胞酵素であり、樹状細胞[5]、マクロファージ[6]、単球[7]、および休止期CD4 + Tリンパ球[8]におけるHIVの複製を阻害する役割を担っている。これはホスホヒドロラーゼ活性を示す酵素であり、[ 9 ] [ 10 ]デオキシヌクレオシド三リン酸(dNTP)を無機リン酸(iPPP)および2'-デオキシヌクレオシド(すなわち、リン酸基のないデオキシヌクレオシド)に変換する。そうすることで、SAMHD1はウイルスc DNA合成のための逆転写酵素が利用できるdNTPのプールを枯渇させ、ウイルスの複製を防ぐ。[11] SAMHD1はヌクレアーゼ活性も示している。 [12] HIV-1の制限にはリボヌクレアーゼ活性が必要であると説明されていたが、[13]最近のデータでは、細胞内でのSAMHD1を介したHIV-1の制限にはリボヌクレアーゼ活性は関与しないことが確認された。[14]
命名法
SAMHD1 タンパク質は次のようにも知られています。
- AGS5: アイカルディ・グティエール症候群 5 型[15]
- DCIP: 樹状細胞由来IFNG誘導タンパク質2 [16]
- Mg21:インターフェロンγ誘導性タンパク質[16]
- HDDC1: 1を含むHDドメイン
- MOP-5: 単球タンパク質5
- SAMH1_ヒューマン
- SBBI88
- チャップリン2
遺伝子
ヒトSAMHD1をコードする遺伝子は、もともとヒト樹状細胞cDNAライブラリーで、マウス遺伝子IFN-γ誘導遺伝子Mg11の相同遺伝子として同定された。[16] SAMHD1遺伝子は染色体20に位置する。SAMHD1は16のエクソンで59,532 bpのゲノム配列(染色体20:34,954,059~35,013,590)に及び、分子量72.2 kDaの626アミノ酸(aa)タンパク質をコードする。[17] [18] SAMHD1は周期細胞と非周期細胞の両方で発現するが、SAMHD1の抗ウイルス活性は非周期細胞に限定される。[19]
構造
SAMHD1 は 626 アミノ酸 (aa) の長さで、2 つのドメインがあります。
a. 不稔性アルファモチーフ(SAM)ドメイン:残基45~110アミノ酸。[20] [21]一般に、SAMドメインは酵母からヒトまでの生物におけるタンパク質間およびタンパク質-核酸相互作用、キナーゼのドッキング部位、シグナル伝達、転写の調節として機能することが知られています。[22] [23]
b. ヒスチジン-アスパラギン酸(HD)ドメイン含有タンパク質1:残基164-319アミノ酸。[20] [21] HDドメインタンパク質は、ヒスチジンとアスパラギン酸の触媒残基の二重構造を特徴とし、ヌクレアーゼ、dGTPトリホスファターゼ、ホスファターゼ、またはホスホジエステラーゼ活性を有することが示されています。[22] [24]
触媒コアを含むSAMHD1断片の結晶構造は、タンパク質が二量体であることを明らかにしている。[10]また、研究ではSAMHD1がオリゴマー化して四量体を形成することが示されている。[25] SAMHD1は、細胞周期中の細胞では残基T592でリン酸化されるが、細胞が非細胞周期状態にあるときにはこのリン酸化は失われる。[26]
関数
SAMHD1の変異は、エカルディ・グティエール症候群(AGS)に見られる。AGSは「I型インターフェロン(IFN)の異常な産生と先天性ウイルス感染に似た症状を特徴とする遺伝性自己免疫脳症」である。[21] AGS患者から分離された単球は、HIV-1に対して非常に感受性が高い。[7]
SAMHD1はレンチウイルスタンパク質Vpxに結合して阻害される宿主タンパク質として同定された。VpxはSAMHD1を標的としてマクロファージと樹状細胞への感染を促進する。[27]
ヒトSAMHD1タンパク質はdNTPトリホスファターゼ活性、特にdGTP刺激dNTPトリホスホヒドロラーゼ活性と、HDドメインに関連する一本鎖DNAおよびRNAに対するヌクレアーゼ活性を有する。[12] [28]他の研究では、SAMHD1のサイレンシングが骨髄細胞のHIV-1およびSIV Δvpx感染を促進し、休止期CD4 + T細胞のHIV-1感染も促進することが実証されている。[19] [28]
病気における役割
エカルディ・グティエール症候群
エカルディ・グティエール症候群の患者では、SAMHD1遺伝子の16の変異が特定されています。変異により、SAMHD1の機能が低下したタンパク質が発生します。しかし、このタンパク質の機能不全が免疫系の異常、脳や皮膚の炎症性損傷、およびこの症候群の他の特徴にどのようにつながるかはわかっていません。[7] [21]
ウイルス感染の制限
SAMHD1 は、骨髄細胞および静止期 CD4 + T 細胞で観察される HIV-1 感染に対する逆転写阻害を担う細胞タンパク質として同定されました。SAMHD1 は、dNTP の細胞内プールを制限することによって骨髄細胞における HIV-1 感染を阻害します。[27] SAMHD1 の dNTP トリホスホヒドロラーゼ活性は、細胞内 dNTP レベルを低下させ、HIV-1 の複製を制限して免疫系の活性化を防ぎ、一本鎖 (ss)DNA および RNA だけでなく、DNA/RNA ハイブリッド中の RNA に対するヌクレアーゼ活性を持つことが提案されています。[22] [27] SAMHD1 のレトロウイルス制限能力はリン酸化によって制御され、この目的のために SAMHD1 は、トレオニン 592 でのリン酸化を媒介するサイクリン A2/CDK1 複合体と結合します。リン酸化 SAMHD1 は、逆に、非周期細胞中の非リン酸化SAMHD1は強力な制限活性を示す。[26]
癌細胞における発現調節と代謝拮抗物質の分解
SAMHD1 タンパク質の発現は、がん細胞において 4 つのレベルで影響を受ける可能性があります。第 1 に、SAMHD1 遺伝子の変異により、SAMHD1 mRNA の生成または翻訳後の機能的タンパク質が妨げられる可能性があります。[29] 第 2 に、プロモーターのメチル化により SAMHD1 mRNA の転写が妨げられる可能性があります。[30] [31]第 3 に、miRNA-155 および miRNA-181a は翻訳を妨げ、タンパク質の生成を妨げます。[32] [33]最後に、SAMHD1 の分解は細胞周期の S 期に発生します。[34] 非接着性腫瘍細胞株 (B 細胞、T 細胞、および骨髄細胞) は急速に分裂する細胞であり、接着細胞と比較して SAMHD1 タンパク質のレベルが低いか、まったく検出されません。がん細胞における SAMHD1 による dNTP 濃度の調節は、治療上の意味を持つ重要なメカニズムである可能性があります。[35] 代謝拮抗物質は、抗癌剤として使用され、いくつかの異なる作用機序によって細胞死を促進する抗癌ヌクレオシド、ヌクレオチド、および塩基類似体である。[36] これらの代謝拮抗物質の一部では、類似体の細胞内三リン酸形態が活性化合物である。 [36] SAMHD1は、アラビノース5'-三リン酸を加水分解できることが示されている。[37] SAMHD1はバイオマーカーであり、アラビノースC(ara-C;シタラビン)応答性に影響を与えることが示されている。[38]ウイルスタンパク質x(Vpx)は、造血悪性腫瘍に対するシタラビン療法を改善する可能性のある治療法として提案されている。[39]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000101347 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000027639 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Laguette N、Sobhian B、Casartelli N、Ringeard M、Chable-Bessia C、Ségéral E、Yatim A、Emiliani S、Schwartz O、Benkirane M (2011 年 5 月)。「SAMHD1 は樹状細胞および骨髄細胞特異的 HIV-1 制限因子であり、Vpx によって阻害される」。Nature . 474 ( 7353): 654– 7. doi :10.1038/nature10117. PMC 3595993. PMID 21613998 。
- ^ Hrecka K、Hao C、Gierszewska M、Swanson SK、Kesik-Brodacka M、Srivastava S、Florens L、Washburn MP、Skowronski J (2011 年 6 月)。「Vpx は SAMHD1 タンパク質を介したマクロファージの HIV-1 感染阻害を軽減する」。Nature . 474 ( 7353): 658– 61. doi :10.1038/nature10195. PMC 3179858 . PMID 21720370。
- ^ abc Berger A, Sommer AF, Zwarg J, Hamdorf M, Welzel K, Esly N, Panitz S, Reuter A, Ramos I, Jatiani A, Mulder LC, Fernandez-Sesma A, Rutsch F, Simon V, König R, Flory E (2011年12月). 「エカルディ・グティエール症候群患者のSAMHD1欠損CD14+細胞はHIV-1感染に対して非常に感受性が高い」. PLOS Pathogens . 7 (12): e1002425. doi : 10.1371/journal.ppat.1002425 . PMC 3234228. PMID 22174685 .
- ^ Pan X、Baldauf HM、Keppler OT、Fackler OT(2013年6月)。「休止期CD4+ Tリンパ球におけるHIV-1複製の制限」。細胞研究。23 (7):876–885。doi :10.1038/cr.2013.74。PMC 3698640。PMID 23732522。
- ^ Powell RD、Holland PJ、Hollis T、Perrino FW(2011年12月)。「Aicardi-Goutieres症候群遺伝子およびHIV-1制限因子SAMHD1はdGTP制御デオキシヌクレオチドトリホスホヒドロラーゼである」。The Journal of Biological Chemistry。286 ( 51 ):43596– 600。doi :10.1074/ jbc.C111.317628。PMC 3243528。PMID 22069334。
- ^ ab Goldstone DC、Ennis-Adeniran V、Hedden JJ、Groom HC、Rice GI、Christodoulou E、Walker PA、Kelly G、Haire LF、Yap MW、de Carvalho LP、Stoye JP、Crow YJ、Taylor IA、Webb M (2011 年 11 月)。「HIV-1 制限因子 SAMHD1 はデオキシヌクレオシド三リン酸三リン酸加水分解酵素である」。Nature。480 ( 7377 ) : 379– 82。Bibcode : 2011Natur.480..379G。doi : 10.1038 / nature10623。PMID 22056990。S2CID 205226940。
- ^ Lahouassa H、Daddacha W、Hofmann H、Ayinde D、Logue EC、Dragin L、Bloch N、Maudet C、Bertrand M、Gramberg T、Pancino G、Priet S、Canard B、Laguette N、 Benkirane M、Transy C、Landau NR、キム B、マルゴッティン・ゴーゲ F (2012 年 2 月)。 「SAMHD1は、デオキシヌクレオシド三リン酸の細胞内プールを枯渇させることによって、ヒト免疫不全ウイルス1型の複製を制限します。」自然免疫学。13 (3): 223–8 .土井:10.1038/ni.2236。PMC 3771401。PMID 22327569。
- ^ ab Beloglazova N, Flick R, Tchigvintsev A, Brown G, Popovic A, Nocek B, Yakunin AF. 「Aicardi-Goutieres症候群およびHIV-1制限に関与するヒトSAMHD1タンパク質のヌクレアーゼ活性」。Beloglazova N, Flick R, Tchigvintsev A, Brown G, Popovic A, Nocek B, Yakunin AF (2013年3月)。 「Aicardi-Goutieres症候群およびHIV-1制限に関与するヒトSAMHD1タンパク質のヌクレアーゼ活性」。The Journal of Biological Chemistry . 288 (12): 8101– 10. doi : 10.1074/jbc.M112.431148 . PMC 3605629 . PMID 23364794。
- ^ Ryoo J, Choi J, Oh C, Kim S, Seo M, Kim SY, Seo D, Kim J, White TE, Brandariz-Nuñez A, Diaz-Griffero F, Yun CH, Hollenbaugh JA, Kim B, Baek D, Ahn K (2014年8月). 「SAMHD1のリボヌクレアーゼ活性はHIV-1制限に必要」. Nature Medicine . 20 (8): 936– 41. doi :10.1038/nm.3626. PMC 4318684. PMID 25038827 .
- ^ Antonucci JM、St Gelais C、de Silva S、Yount JS、Tang C、Ji X、Shepard C、Xiong Y、Kim B、Wu L(2016年10月)。「細胞内でのSAMHD1を介したHIV-1の制限にはリボヌクレアーゼ活性は関与しない」。Nature Medicine。22 ( 10 ): 1072–1074。doi : 10.1038 / nm.4163。PMC 5069697。PMID 27711056。
- ^ Chahwan C, Chahwan R (2012年5月). 「Aicardi-Goutieres症候群:患者から遺伝子まで、そしてその先へ」.臨床遺伝学. 81 (5): 413– 20. doi : 10.1111/j.1399-0004.2011.01825.x . PMID 22149989. S2CID 28902344.
- ^ abc Li N, Zhang W, Cao X (2000年11月). 「ヒト樹状細胞からのマウスIFN-γ誘導タンパク質のヒトホモログの同定」.免疫学レター. 74 (3): 221–4 . doi :10.1016/S0165-2478(00)00276-5. PMID 11064105.
- ^ Rice GI、Bond J、Asipu A、Brunette RL、Manfield IW、Carr IM、他 (2009 年 7 月)。「Aicardi-Goutières 症候群に関与する変異は、SAMHD1 が自然免疫応答の調節因子であることを示唆している」。Nature Genetics。41 ( 7 ) : 829– 32。doi : 10.1038 /ng.373。PMC 4154505。PMID 19525956。
- ^ Welbourn S、Miyagi E、White TE 、Diaz-Griffero F 、Strebel K (2012年10月)。「SAMHD1の自然発生スプライスバリアントの同定と特徴付け 」。Retrovirology。9 : 86。doi : 10.1186 / 1742-4690-9-86。PMC 3503569。PMID 23092512。
- ^ ab バルダウフ HM、パン X、エリクソン E、シュミット S、ダッダーチャ W、ブルクグラフ M、シェンコヴァ K、アンビエル I、ワブニッツ G、グラムベルク T、パニッツ S、フローリー E、ランダウ NR、セルテル S、ルッチ F、ラシチュカ F、キム B、ケーニッヒ R、ファクラー OT、ケプラー OT (2012 年 11 月)。 「SAMHD1 は、休止状態の CD4(+) T 細胞における HIV-1 感染を制限します。」自然医学。18 (11): 1682 – 7.土井:10.1038/nm.2964。PMC 3828732。PMID 22972397。
- ^ ab White TE、Brandariz-Nuñez A、Valle-Casuso JC、Amie S、Nguyen L、Kim B、Brojatsch J、Diaz-Griffero F (2013 年 2 月)。「ヒト SAMHD1 を介したレトロウイルス制限に対する SAM および HD ドメインの寄与」。Virology . 436 ( 1): 81– 90. doi :10.1016/j.virol.2012.10.029. PMC 3767443 . PMID 23158101。
- ^ abcd Crow YJ、Rehwinkel J (2009 年 10 月)。「Aicardi-Goutieres 症候群および関連表現型: 核酸代謝と自己免疫との関連」。Human Molecular Genetics . 18 (R2): R130-6. doi :10.1093/hmg/ddp293. PMC 2758706 . PMID 19808788.
- ^ abc Ayinde D、Casartelli N、Schwartz O (2012年10月)。「SAMHD1に よるHIVの抑制:ヌクレオチド飢餓による」。Nature Reviews。微生物学。10 ( 10): 675– 80。doi :10.1038/nrmicro2862。PMID 22926205。S2CID 24799736。
- ^ Kim CA、Bowie JU (2003 年 12 月)。「SAM ドメイン: 均一な構造、機能の多様性」。生化学科学の動向。28 ( 12): 625–8。doi :10.1016/ j.tibs.2003.11.001。PMID 14659692 。
- ^ Aravind L、Koonin EV (1998年12月)。「HDドメインは金属依存性ホスホヒドロラーゼの新しいスーパーファミリーを定義する」。生化学科学の動向。23(12):469–72。doi : 10.1016 / s0968-0004 ( 98 )01293-6。PMID 9868367。
- ^ Yan J、Kaur S、DeLucia M、Hao C、Mehrens J、Wang C、Golczak M、Palczewski K、Gronenborn AM、Ahn J、Skowronski J (2013年4月)。「SAMHD1の四量体化は生物学的活性とHIV感染の抑制に必要である」。The Journal of Biological Chemistry。288 ( 15): 10406– 17。doi : 10.1074 / jbc.M112.443796。PMC 3624423。PMID 23426366。
- ^ ab White TE、Brandariz-Nuñez A、Valle-Casuso JC、Amie S、Nguyen LA、Kim B、Tuzova M、Diaz-Griffero F (2013 年 4 月)。「SAMHD1 のレトロウイルス制限能力はリン酸化によって制御されるが、デオキシヌクレオチドトリホスホヒドロラーゼ活性はリン酸化によって制御されない」。Cell Host & Microbe。13 ( 4 ): 441– 51。doi :10.1016/ j.chom.2013.03.005。PMC 3864637。PMID 23601106。
- ^ abc Mashiba M, Collins KL (2013年1月). 「骨髄細胞における自然免疫応答のHIV免疫回避の分子メカニズム」.ウイルス. 5 (1): 1– 14. doi : 10.3390/v5010001 . PMC 3564108. PMID 23344558 .
- ^ ab Descours B、Cribier A、Chable-Bessia C、Ayinde D、Rice G、Crow Y、Yatim A、Schwartz O、Laguette N、Benkirane M (2012年10月)。「SAMHD1は静止CD4(+)T細胞におけるHIV-1逆転写を制限する 」Retrovirology。9 : 87。doi : 10.1186 / 1742-4690-9-87。PMC 3494655。PMID 23092122。
- ^ Clifford R, Louis T, Robbe P, Ackroyd S, Burns A, Timbs AT, et al. (2014年2月). 「SAMHD1は慢性リンパ性白血病で繰り返し変異し、DNA損傷への反応に関与している」Blood . 123 (7): 1021– 31. doi :10.1182/blood-2013-04-490847. PMC 3924925. PMID 24335234 .
- ^ Wang JL、Lu FZ、Shen XY、Wu Y、Zhao LT(2014年12月)。「SAMHD1はメチル化によって肺癌でダウンレギュレーションされ、腫瘍細胞の増殖を阻害する」。生化学および生物物理学的研究通信。455 (3〜4):229〜33。doi:10.1016/ j.bbrc.2014.10.153。PMID 25449277 。
- ^ de Silva S、Wang F、Hake TS、Porcu P、Wong HK、Wu L (2014 年 2 月)。「セザリー症候群患者における SAMHD1 発現のダウンレギュレーションはプロモーター DNA メチル化と相関する」。The Journal of Investigative Dermatology。134 ( 2): 562– 5。doi : 10.1038 / jid.2013.311。PMC 3844041。PMID 23884314。
- ^ Kohnken R、Kodigepalli KM、Mishra A、Porcu P、Wu L(2017年1月)。「MicroRNA-181は、セザリー症候群患者由来のCD4 + T細胞におけるSAMHD1発現のダウンレギュレーションに寄与する」。白血病研究。52 :58〜66。doi:10.1016 / j.leukres.2016.11.010。PMC 5195900。PMID 27889686。
- ^ Pilakka-Kanthikeel S、Raymond A、Atluri VS、Sagar V、Saxena SK、Diaz P、Chevelon S、Concepcion M、Nair M (2015 年 4 月)。「アストロサイトにおける不稔性アルファモチーフおよびヒスチジン/アスパラギン酸ドメイン含有タンパク質 1 (SAMHD1) による HIV 制限は miRNA-181a によって制御される」 。Journal of Neuroinflammation。12 : 66。doi : 10.1186 / s12974-015-0285-9。PMC 4410490。PMID 25890101。
- ^ Kretschmer S、Wolf C、König N、Staroske W、Guck J、Häusler M、Luksch H、Nguyen LA、Kim B、Alexopoulou D、Dahl A、Rapp A、Cardoso MC、Shevchenko A、Lee-Kirsch MA (2015 年 3 月)。「SAMHD1 はゲノム安定性を維持することで自己免疫を防ぐ」。Annals of the Rheumatic Diseases . 74 (3): e17. doi :10.1136/annrheumdis-2013-204845. PMC 4345975 . PMID 24445253。
- ^ Kohnken R、Kodigepalli KM、Wu L(2015年9月) 。「がんにおけるデオキシヌクレオチド代謝の調節:新たなメカニズムと治療への影響」。 分子がん。14 :176。doi :10.1186 / s12943-015-0446-6。PMC 4587406。PMID 26416562。
- ^ ab Shelton J, Lu X, Hollenbaugh JA, Cho JH, Amblard F, Schinazi RF (2016年12月). 「抗癌ヌクレオシド、ヌクレオチド、塩基類似体の代謝、生化学的作用、化学合成」. Chemical Reviews . 116 (23): 14379– 14455. doi :10.1021/acs.chemrev.6b00209. PMC 7717319. PMID 27960273 .
- ^ Hollenbaugh JA、Shelton J、Tao S、Amiralaei S、Liu P、Lu X、Goetze RW、Zhou L、Nettles JH、Schinazi RF、Kim B (2017年1月)。「SAMHD1の基質と阻害剤」。PLOS ONE。12 ( 1 ) : e0169052。Bibcode : 2017PLoSO..1269052H。doi : 10.1371 / journal.pone.0169052。PMC 5207538。PMID 28046007。
- ^ Schneider C, Oellerich T, Baldauf HM, Schwarz SM, Thomas D, Flick R, et al. (2017年2月). 「SAMHD1はシタラビン反応のバイオマーカーであり、急性骨髄性白血病の治療標的である」(PDF) . Nature Medicine . 23 (2): 250– 255. doi :10.1038/nm.4255. PMID 27991919. S2CID 205398095.
- ^ Herold N, Rudd SG, Ljungblad L, Sanjiv K, Myrberg IH, Paulin CB, et al. (2017年2月). 「Vpxタンパク質によるSAMHD1の標的化による血液悪性腫瘍に対するシタラビン療法の改善」Nature Medicine . 23 (2): 256– 263. doi :10.1038/nm.4265. PMID 28067901. S2CID 22800252.
さらに読む
- Laguette N、 Benkirane M (2012 年 1 月)。「 SAMHD1がウイルス制限に対する見方をどのように変えるか」。Trends in Immunology。33 ( 1 ): 26– 33。doi :10.1016/j.it.2011.11.002。PMC 3595995。PMID 22177690。
- Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、Macek B、Kumar C、Mortensen P、Mann M (2006 年 11 月)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 (3): 635– 48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573。
