60Sリボソームタンパク質L29

RP29 ...
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	4UG0、4V6X、5AJ0、4UJD、4D67、4D5Y、4UJE、4UJC
識別子
エイリアス	RPL29、HIP、HUML29、RPL29P10、RPL29_3_370、リボソームタンパク質L29
外部ID	オミム：601832; MGI : 99687;ホモロジーン: 133570;ジーンカード：RPL29; OMA :RPL29 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体3（ヒト）
終わり	51,995,895 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	9番染色体（マウス）
終わり	106,308,767 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	子宮内膜間質細胞; ; 脚の皮膚; ; 左卵巣; ; 腹部の皮膚; ; 右卵巣; ; 神経節隆起; ; 右子宮管; ; 右副腎皮質; ; 太ももの筋肉; ; 皮下脂肪組織;
	トップの表現
	膀胱; ; 心室帯; ; リップ; ; 胎児の尾; ; 性器結節; ; 神経節隆起; ; 胸腺; ; レンズ; ; 副腎; ; 上皮層;
	参照表現データの詳細
	; ; ; ;
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	ヘパリン結合; RNA結合; リボソームの構造構成要素; カドヘリン結合;
細胞成分	細胞内解剖構造; 細胞質; 膜; 細胞質大リボソームサブユニット; リボソーム;
生物学的プロセス	翻訳開始; SRP依存性共翻訳タンパク質の膜への標的化; 核転写されたmRNAの分解過程、ナンセンス変異による分解; 細胞質翻訳; 胚移植; タンパク質生合成; ウイルス転写; rRNA処理;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	6159
	19944
	ENSG00000162244
	ENSMUSG00000048758
	P47914
	P47915
	NM_000992
	NM_009082 ; NM_001324533 ; NM_001324534
	NP_000983
	NP_001311462 ; NP_001311463 ; NP_033108
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

60Sリボソームタンパク質L29は、ヒトではRPL29遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]

関数

リボソームは、タンパク質合成を触媒する細胞小器官で、小さな40Sサブユニットと大きな60Sサブユニットから構成されています。これらのサブユニットは、4種類のRNAと約 80 種類の構造的に異なるタンパク質で構成されています。この遺伝子は、60S サブユニットの構成要素である細胞質リボソームタンパク質をコードしています。このタンパク質は、リボソームタンパク質の L29E ファミリーに属しています。このタンパク質は、細胞表面に発現し、ヘパリンと直接結合する末梢膜タンパク質でもあります。この遺伝子は、以前は 3q29-qter にマッピングされると報告されていましたが、3p21.3-p21.2 に位置すると考えられています。リボソームタンパク質をコードする遺伝子では一般的ですが、この遺伝子には、ゲノム全体に散在する複数の処理された擬似遺伝子があります。 ^[6]

インタラクション

RPL29はBLMHと相互作用することが示されている。^[7]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000162244 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000048758 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Law PT、Tsui SK、Lam WY、Luk SC、Hwang DM、Liew CC、Lee CY、Fung KP、Waye MM (1996 年 4 月)。「リボソームタンパク質 L29 のヒトホモログをコードする新規 cDNA」。Biochim Biophys Acta . 1305 (3): 105–8. doi :10.1016/0167-4781(95)00224-3. PMID 8597591。
^ ab 「Entrez Gene: RPL29 リボソームタンパク質 L29」。
^ Koldamova RP、Lefterov IM、DiSabella MT、Almonte C、Watkins SC、Lazo JS (1999 年 6 月)。「ヒトブレオマイシン加水分解酵素はリボソームタンパク質に結合する」。生化学。38 ( 22 ): 7111–7。doi :10.1021/bi990135l。PMID 10353821 。

さらに読む

Wool IG、Chan YL、Glück A (1996)。「哺乳類リボソームタンパク質の構造と進化」。Biochem . Cell Biol . 73 (11–12): 933–47. doi :10.1139/o95-101. PMID 8722009。
Nika H、Hultin T (1984)。「哺乳類リボソームの隣接タンパク質 L6 と L29 間のジスルフィド相互作用に関与するスルフィドリル基の位置。ドデシル硫酸ゲル電気泳動による分離後のポリアクリルアミドゲルにおけるシアニル化タンパク質の S 切断」。Eur . J. Biochem . 142 (3): 521–6. doi : 10.1111/j.1432-1033.1984.tb08316.x . PMID 6468376。
Liu S、Smith SE、Julian J、Rohde LH、Karin NJ、Carson DD (1996)。「ヒト子宮上皮細胞および細胞株の新規細胞表面ヘパラン硫酸/ヘパリン結合タンパク質、HIP の cDNA クローニングおよび発現」。J. Biol. Chem . 271 (20): 11817–23. doi : 10.1074/jbc.271.20.11817 . PMID 8662616。
Rohde LH、Julian J、Babaknia A、Carson DD (1996)。「ヒト子宮上皮細胞および細胞株における、新規ヘパリン/ヘパラン硫酸結合タンパク質 HIP の細胞表面発現」。J . Biol. Chem . 271 (20): 11824–30。doi : 10.1074/ jbc.271.20.11824。PMID 8662617 。
Jacobs AL、Julian J、Sahin AA、Carson DD (1997)。「ヒト乳がん細胞および正常乳房上皮におけるヘパリン/ヘパラン硫酸相互作用タンパク質の発現と機能」。Cancer Res . 57 (22): 5148–54. PMID 9371517。
Garcia-Barcelo M、Law PT、Tsui SK、Fung KP、Lee CY、Waye MM (1998)。「ヒトリボソーム大サブユニットタンパク質遺伝子 RPL29 のヒト染色体 3q29-qter へのマッピング」。Genomics . 46 ( 1): 148–51. doi :10.1006/geno.1997.4990. PMID 9403071。
Koldamova RP、Lefterov IM、DiSabella MT、Almonte C、Watkins SC、Lazo JS (1999)。「ヒトブレオマイシン加水分解酵素はリボソームタンパク質に結合する」。生化学。38 ( 22 ): 7111–7。doi :10.1021/bi990135l。PMID 10353821 。
Kudo H, Senju S, Mitsuya H, Nishimura Y (2000). 「マウスとヒトの GTPBP2、GTPase の GP-1 ファミリーの新しく同定されたメンバー」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 272 (2): 456–65. doi :10.1006/bbrc.2000.2763. PMID 10833435。
Uechi T, Tanaka T, Kenmochi N (2001). 「ヒトリボソームタンパク質遺伝子の完全な地図: 80 個の遺伝子の細胞遺伝学的地図への割り当てとヒト疾患への影響」. Genomics . 72 (3): 223–30. doi :10.1006/geno.2000.6470. PMID 11401437.
Kirn-Safran CB、Julian J、Fongemie JE、Hoke DE、Czymmek KJ、Carson DD (2002)。「in vivo および in vitro マウス乳腺上皮細胞の発現および分化中のヘパリン/ヘパラン硫酸相互作用タンパク質/リボソームタンパク質 L29 (HIP/RPL29) の細胞学的分布の変化」。Dev . Dyn . 223 (1): 70–84. doi : 10.1002/dvdy.1226 . PMID 11803571. S2CID 13577595。
Hoke DE、Carson DD、Höök M (2006)。「ヒト HIP/RPL29 由来のヘパリン結合合成ペプチドは、抗凝固活性ヘパリン種と不活性ヘパリン種を具体的に区別できない」。Journal of Negative Results in Biomedicine。2 : 1。doi : 10.1186 / 1477-5751-2-1。PMC 152653。PMID 12659638。
Odintsova TI、Müller EC、Ivanov AV、Egorov TA、Bienert R、Vladimirov SN、Kostka S、Otto A、Wittmann-Liebold B、Karpova GG (2004)。「質量分析法とエドマン配列決定法によるヒト大細胞質リボソームサブユニットタンパク質の翻訳後修飾の特性評価と分析」。J . Protein Chem . 22 (3): 249–58. doi :10.1023/A:1025068419698. PMID 12962325. S2CID 10710245.
Andersen JS、Lam YW 、 Leung AK、Ong SE、Lyon CE、Lamond AI、Mann M (2005)。「核小体プロテオームダイナミクス」。Nature . 433 ( 7021): 77–83。Bibcode : 2005Natur.433 ... 77A。doi :10.1038/nature03207。PMID 15635413。S2CID 4344740。
Nakanishi K, Komatsu Y, Kogawa N, Matsushita H (2005). 「1 型糖尿病感受性 HLA クラス II 分子から溶出されたペプチドの分析により、新規膵島タンパク質、ヘパリン/ヘパラン硫酸相互作用タンパク質が同定されました」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 329 (1): 356–61. doi :10.1016/j.bbrc.2005.01.144. PMID 15721314。
シュテルツル U、ヴォルム U、ラロウスキー M、ヘニヒ C、ブレンベック FH、ゲーラー H、ストロイッケ M、ツェンクナー M、シェーンヘル A、ケッペン S、ティム J、ミンツラフ S、エイブラハム C、ボック N、キーツマン S、ゲーデ A、トクセシュ E 、ドローゲ A、クロビッチ S、コーン B、バーヒマイヤー W、レーラッハ H、ワンカー EE (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワーク: プロテオームに注釈を付けるためのリソース」。セル。122 (6): 957–68。土井：10.1016/j.cell.2005.08.029。hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0。PMID 16169070。S2CID 8235923 。
Liu JJ、Huang BH、Zhang J、Carson DD、Hooi SC (2006)。「HIP/RPL29 発現の抑制は結腸癌細胞の分化を誘導する」。J . Cell. Physiol . 207 (2): 287–92. doi :10.1002/jcp.20589. PMID 16475173. S2CID 6610010.

外部リンク

PDBe-KBの UniProt : P47914 (60S リボソームタンパク質 L29)のPDBで入手可能なすべての構造情報の概要。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000162244 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000048758 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid8597591-5] Law PT、Tsui SK、Lam WY、Luk SC、Hwang DM、Liew CC、Lee CY、Fung KP、Waye MM (1996 年 4 月)。「リボソームタンパク質 L29 のヒトホモログをコードする新規 cDNA」。Biochim Biophys Acta . 1305 (3): 105–8. doi :10.1016/0167-4781(95)00224-3. PMID 8597591。

[entrez-6] 「Entrez Gene: RPL29 リボソームタンパク質 L29」。

[pmid10353821-7] Koldamova RP、Lefterov IM、DiSabella MT、Almonte C、Watkins SC、Lazo JS (1999 年 6 月)。「ヒトブレオマイシン加水分解酵素はリボソームタンパク質に結合する」。生化学。38 ( 22 ): 7111–7。doi :10.1021/bi990135l。PMID 10353821 。