RECQL4

RECQL4
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	2KMU
識別子
エイリアス	RECQL4、RECQ4、RecQ様ヘリカーゼ4
外部ID	オミム：603780; MGI : 1931028;ホモロジーン: 3144;ジーンカード：RECQL4; OMA :RECQL4 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体8（ヒト）
終わり	144,517,845 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	15番染色体（マウス）
終わり	76,594,748 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	心室帯; ; 横行結腸粘膜; ; 右精巣; ; 左精巣; ; 小脳の右半球; ; 神経節隆起; ; 生殖腺; ; 右前頭葉; ; 子宮内膜間質細胞; ; 被殻;
	トップの表現
	胎児肝臓造血前駆細胞; ; 胚葉上層; ; 胎児の尾; ; 原始的な線; ; パネートセル; ; 心室帯; ; 性器結節; ; 胚; ; 一次卵母細胞; ; 卵黄嚢;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	ATP依存性DNA/DNAアニーリング活性; ヌクレオチド結合; 3'-5' DNAヘリカーゼ活性; バブルDNA結合; タンパク質結合; 加水分解酵素活性; ATP結合; ヘリカーゼ活性; 核酸結合; 4方向接合ヘリカーゼ活性; 酸化プリンDNA結合; テロメアDループ結合; DNA結合; 一本鎖DNA結合;
細胞成分	膜; 細胞質; 核; テロメア; 染色体;
生物学的プロセス	多細胞生物の発達; DNA修復; 塩基除去修復; 相同組換えによる二本鎖切断の修復; DNA組み換え; DNA複製; DNA二重鎖の解離; テロメアDループの分解; テロメア維持; 細胞集団増殖の正の調節; 有糸分裂細胞周期のG2/M移行の正の調節; DNA複製の正の調節; DNA複製に関与するDNAの巻き戻し;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	9401
	79456
	ENSG00000160957
	ENSMUSG00000033762
	O94761
	Q75NR7
	NM_004260
	NM_058214
	NP_004251
	NP_478121
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

ATP依存性DNAヘリカーゼQ4は、ヒトではRECQL4遺伝子によってコードされる酵素である。^[5]^[6]^[7]

RECQL4の変異は、常染色体劣性疾患であるロスムンド・トムソン症候群と関連しており、この疾患は早期老化の特徴を示す。^[8]^[9] ロスムンド・トムソン症候群に加えて、RECQL4の変異はRAPADILINO症候群やBaller-Gerold症候群とも関連している。^[10] ロスムンド・トムソン症候群には2つのタイプがあり、RECQL4遺伝子の両方のコピーに有害な変異を持つ患者に発生するのはタイプ2である。この状態は、骨肉腫（骨の悪性腫瘍）を発症する高いリスクと関連している。 ^[11] RECQL4は、 RecQヘリカーゼファミリーの他のメンバーと相同性（配列を共有）であることからその名前が付けられている。他の2つの遺伝性疾患は、他のRECQヘリカーゼの変異が原因である。ブルーム症候群はBLM遺伝子の変異と関連しており、ウェルナー症候群はWRN遺伝子の変異と関連している。^[12]

DNA修復

DNAの二本鎖切断は細胞にとって潜在的に致命的であり、修復する必要がある。相同組み換え（HR）による二本鎖切断の修復は、この致死性を回避するための重要な細胞メカニズムである。RECQL4は、末端切除と呼ばれるHRの最初のステップで重要な役割を果たしている。^[13] RECQL4が欠損すると、末端切除、ひいてはHRが減少する。非相同末端結合、ヌクレオチド除去修復、塩基除去修復などの他の形態のDNA修復もRECQL4機能に依存していることを示唆する証拠がある。^{[9]ロスマンド・トムソン症候群において、RECQL4を介したDNA修復の欠損と早期老化との関連は}、老化のDNA損傷理論と一致している。

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000160957 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000033762 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^北尾聡、大杉郁、市川健 、後藤正之、古市勇、嶋本明 (1999 年 2 月)。「RecQ ファミリーの 2 つの新しいヒトヘリカーゼ遺伝子のクローニング: 高等真核生物における複数の種の生物学的意義」。ゲノミクス。54 ( 3): 443–52。doi :10.1006/geno.1998.5595。PMID 9878247 。
^ Sangrithi MN、Bernal JA、Madine M、Philpott A、Lee J、Dunphy WG、Venkitaraman AR (2005 年 6 月)。「ロスマン・トムソン症候群では DNA 複製の開始に RECQL4 タンパク質の変異が必要」。Cell . 121 ( 6): 887–98. doi : 10.1016/j.cell.2005.05.015 . PMID 15960976. S2CID 15064074。
^ 「Entrez Gene: RECQL4 RecQ タンパク質様 4」。
^ Lu H、Fang EF、Sykora P、Kulikowicz T、Zhang Y、Becker KG、Croteau DL、Bohr VA (2014)。「RECQL4の機能不全によって誘発される老化は、マウスのロスムンド・トムソン症候群の特徴に寄与する」。Cell Death Dis。5 ( 5 ) : e1226。doi :10.1038/cddis.2014.168。PMC 4047874。PMID 24832598。
^ ab Lu L、Jin W、Wang LL (2017)。「ロスマンド・トムソン症候群および関連するRECQL4遺伝性疾患における老化」。Ageing Res. Rev. 33 : 30–35. doi :10.1016/j.arr.2016.06.002. PMID 27287744. S2CID 28321025.
^ Shamanna RA、Singh DK、Lu H、Mirey G、Keijzers G、Salles B、Croteau DL、Bohr VA (2014)。「RECQヘリカーゼRECQL4は非相同末端結合に関与し、Ku複合体と相互作用する」。発癌性。35 ( 11 ): 2415–24。doi :10.1093 / carcin/bgu137。PMC 4216052。PMID 24942867。
^ Wang LL、Gannavarapu A、Kozinetz CA、et al. (2003)。「ロスマンド・トムソン症候群における骨肉腫とRECQL4遺伝子の有害変異との関連性」。J. Natl. Cancer Inst . 95 (9): 669–74. doi : 10.1093/jnci/95.9.669 . PMID 12734318。
^ 北尾聡、リンドール NM、白鳥正之、他 (2000)。「ロスマンド・トムソン症候群の原因遺伝子 RECQL4: ゲノム構造と産物」。ゲノミクス61 ( 3): 268–76. doi :10.1006/geno.1999.5959. PMID 10552928。
^ Lu H、Shamanna RA、Keijzers G、Anand R、Rasmussen LJ、Cejka P、Croteau DL、Bohr VA (2016)。「RECQL4はDNA二本鎖切断の修復においてDNA末端切除を促進する」。セル担当者16 (1): 161-73。土井：10.1016/j.cellrep.2016.05.079。PMC 5576896。PMID 27320928。

さらに読む

Kellermayer R (2006). 「多用途のRECQL4」Genet. Med . 8 (4): 213–6. doi : 10.1097/01.gim.0000214457.58378.1a . PMID 16617241.
Soukup T (1976). 「ラット四肢筋紡錘の紡錘内繊維タイプ：形態学的および組織化学的特徴」。組織化学。47 ( 1 ): 43–57。doi : 10.1007 /BF00492992。PMID 133085。S2CID 23487130。
北尾聡、島本明、後藤正之、他 (1999)。「RECQL4 の変異がロスマン・トムソン症候群の症例の一部を引き起こす」。Nat . Genet . 22 (1): 82–4. doi :10.1038/8788. PMID 10319867. S2CID 195211275.
Yankiwski V, Marciniak RA, Guarente L, Neff NF (2000). 「正常細胞とブルーム症候群細胞の核構造」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (10): 5214–9. Bibcode :2000PNAS...97.5214Y. doi : 10.1073/pnas.090525897 . PMC 25808 . PMID 10779560.
Kawabe T, Tsuyama N, Kitao S, et al. (2000). 「細胞形質転換と細胞周期におけるヒトRecQファミリーヘリカーゼの異なる制御」。Oncogene . 19 ( 41): 4764–72. doi : 10.1038/sj.onc.1203841 . PMID 11032027。
Wang LL、Worley K、Gannavarapu A、et al. (2002)。「ロスマンド・トムソン症候群における突然変異メカニズムとしてのイントロンサイズ制約」。Am . J. Hum. Genet . 71 (1): 165–7. doi :10.1086/341234. PMC 384974. PMID 12016592 。
Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
Roversi G、Beghini A、Zambruno G、他 (2003)。「2つの新規RECQL4エクソンSNPの同定とIVS12ミニサテライトのゲノム特性」。J . Hum. Genet . 48 (2): 107–9. doi : 10.1007/s100380300016 . PMID 12601557. S2CID 9960752.
Wang LL、Gannavarapu A、Clericuzio CL、他 (2004)。「ナバホ族および非ナバホ族患者の好中球減少症を伴う多形皮膚萎縮症における RECQL4 変異の欠如」。Am . J. Med. Genet. A . 118 (3): 299–301. doi :10.1002/ajmg.a.10057. PMID 12673665. S2CID 36023058.
Beghini A、Castorina P、Roversi G、他 (2004)。「複合ヘテロ接合性 Rothmund-Thomson 患者におけるヘリカーゼ遺伝子 RECQL4 の RNA 処理欠陥」。Am . J. Med. Genet. A . 120 (3): 395–9. doi :10.1002/ajmg.a.20154. PMID 12838562. S2CID 25885145。
Siitonen HA、Kopra O、Kääriäinen H、他。 (2004)。「RAPADILINO症候群の分子欠損はRECQL疾患の表現型スペクトルを拡大する」。ハム。モル。ジュネット。12 (21): 2837–44。土井: 10.1093/hmg/ddg306。PMID 12952869。
Brandenberger R、Wei H、Zhang S、他 (2005)。「トランスクリプトーム特性評価により、ヒト ES 細胞の成長と分化を制御するシグナル伝達ネットワークが解明」Nat. Biotechnol . 22 (6): 707–16. doi :10.1038/nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
Nishijo K, Nakayama T, Aoyama T, et al. (2004). 「散発性骨肉腫におけるRECQL4遺伝子の変異解析」Int. J. Cancer . 111 (3): 367–72. doi : 10.1002/ijc.20269 . PMID 15221963. S2CID 20389854.
Yin J、Kwon YT、Varshavsky A、Wang W (2005)。「ロスマンド・トムソン症候群およびRAPADILINO症候群で変異したRECQL4は、N末端ルール経路のユビキチンリガーゼUBR1およびUBR2と相互作用する」。Hum . Mol. Genet . 13 (20): 2421–30. doi : 10.1093/hmg/ddh269 . PMID 15317757。
Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
Sengupta S、Shimamoto A、Koshiji M、et al. (2005)。「腫瘍抑制因子p53はRECQ4ヘリカーゼの転写を抑制する」。Oncogene . 24 ( 10): 1738–48. doi : 10.1038/sj.onc.1208380 . PMID 15674334。

外部リンク

GeneReviews/NCBI/NIH/UW の Rothmund-Thomson 症候群に関するエントリ

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000160957 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000033762 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid9878247-5] ^北尾聡、大杉郁、市川健 、後藤正之、古市勇、嶋本明 (1999 年 2 月)。「RecQ ファミリーの 2 つの新しいヒトヘリカーゼ遺伝子のクローニング: 高等真核生物における複数の種の生物学的意義」。ゲノミクス。54 ( 3): 443–52。doi :10.1006/geno.1998.5595。PMID 9878247 。

[pmid15960976-6] Sangrithi MN、Bernal JA、Madine M、Philpott A、Lee J、Dunphy WG、Venkitaraman AR (2005 年 6 月)。「ロスマン・トムソン症候群では DNA 複製の開始に RECQL4 タンパク質の変異が必要」。Cell . 121 ( 6): 887–98. doi : 10.1016/j.cell.2005.05.015 . PMID 15960976. S2CID 15064074。

[entrez-7] 「Entrez Gene: RECQL4 RecQ タンパク質様 4」。

[pmid24832598-8] Lu H、Fang EF、Sykora P、Kulikowicz T、Zhang Y、Becker KG、Croteau DL、Bohr VA (2014)。「RECQL4の機能不全によって誘発される老化は、マウスのロスムンド・トムソン症候群の特徴に寄与する」。Cell Death Dis。5 ( 5 ) : e1226。doi :10.1038/cddis.2014.168。PMC 4047874。PMID 24832598。

[pmid27287744-9] Lu L、Jin W、Wang LL (2017)。「ロスマンド・トムソン症候群および関連するRECQL4遺伝性疾患における老化」。Ageing Res. Rev. 33 : 30–35. doi :10.1016/j.arr.2016.06.002. PMID 27287744. S2CID 28321025.

[pmid24942867-10] Shamanna RA、Singh DK、Lu H、Mirey G、Keijzers G、Salles B、Croteau DL、Bohr VA (2014)。「RECQヘリカーゼRECQL4は非相同末端結合に関与し、Ku複合体と相互作用する」。発癌性。35 ( 11 ): 2415–24。doi :10.1093 / carcin/bgu137。PMC 4216052。PMID 24942867。

[11] Wang LL、Gannavarapu A、Kozinetz CA、et al. (2003)。「ロスマンド・トムソン症候群における骨肉腫とRECQL4遺伝子の有害変異との関連性」。J. Natl. Cancer Inst . 95 (9): 669–74. doi : 10.1093/jnci/95.9.669 . PMID 12734318。

[12] 北尾聡、リンドール NM、白鳥正之、他 (2000)。「ロスマンド・トムソン症候群の原因遺伝子 RECQL4: ゲノム構造と産物」。ゲノミクス61 ( 3): 268–76. doi :10.1006/geno.1999.5959. PMID 10552928。

[pmid27320928-13] Lu H、Shamanna RA、Keijzers G、Anand R、Rasmussen LJ、Cejka P、Croteau DL、Bohr VA (2016)。「RECQL4はDNA二本鎖切断の修復においてDNA末端切除を促進する」。セル担当者16 (1): 161-73。土井：10.1016/j.cellrep.2016.05.079。PMC 5576896。PMID 27320928。