ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| オプティカル |
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| 識別子 |
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| エイリアス | OPTC、OPT、オプティシン |
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| 外部ID | オミム:605127; MGI : 2151113;ホモロジーン: 8652;ジーンカード:OPTC; OMA :OPTC - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体1(マウス)[2] |
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| | バンド | 1 E4|1 58.02 cM | 始める | 133,824,937 bp [2] |
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| 終わり | 133,835,737 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 前脛骨筋
- 回腸粘膜
- 三角筋
- 生殖腺
- 平滑筋組織
- 胎盤
- S状結腸の筋層
- 子宮体部
- 子宮筋層
- 左子宮管
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| | トップの表現 | - 上行大動脈
- 大動脈弁
- レンズ
- 毛様体上皮
- 胚
- 網膜の神経層
- 胚
- 膀胱
- 虹彩
- 大動脈領域の中膜
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | | NM_001160420 NM_001160421 NM_001160422 NM_054076 NM_001395557
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NM_001395558 |
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| RefSeq (タンパク質) | | NP_001153892 NP_001153893 NP_001153894 NP_473417 NP_001382486
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NP_001382487 |
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| 場所 (UCSC) | 1 章: 203.49 – 203.51 Mb | 1 章: 133.82 – 133.84 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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オプティシンはヒトではOPTC遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
オプチシンは、小ロイシンリッチリピートタンパク質(SLRP)ファミリーのクラスIIIに属します。このファミリーのメンバーは、通常、細胞外マトリックスと関連しています。オプチシンは、眼の硝子体に大量に存在し、角膜、虹彩、毛様体、視神経、脈絡膜、網膜、胎児肝臓にも局在しています。オプチシンは、コラーゲン原線維に非共有結合し、原線維の形態、間隔、組織を調節する可能性があります。オプチシン遺伝子は、遺伝性眼疾患である加齢黄斑変性(AMD)および網膜色素変性症後柱運動失調症(AXPC1)に関連する染色体1の領域にマッピングされています。[6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000188770 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000010311 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Reardon AJ、Le Goff M、Briggs MD、McLeod D、Sheehan JK、Thornton DJ、Bishop PN (2000 年 2 月)。「細胞外マトリックスのロイシンリッチリピートタンパク質ファミリーの新規メンバーであるオプティシンの硝子体での同定と分子クローニング」。J Biol Chem . 275 (3): 2123–9. doi : 10.1074/jbc.275.3.2123 . PMID 10636917。
- ^ ab 「Entrez Gene: OPTC オプチシン」。
さらに読む
- Hobby P、Wyatt MK、Gan W、他 (2000)。「ヒトの眼で発現する小さなロイシンリッチリピートプロテオグリカン (SLRP) ファミリーメンバーのクローニング、モデリング、染色体局在」。Mol . Vis . 6 : 72–8。PMID 10837509 。
- Friedman JS、Ducharme R、Raymond V、Walter MA (2000)。「差別的選択を用いた新しい虹彩特異的ロイシンリッチ反復タンパク質(オキュログリカン)の単離」。Invest . Ophthalmol. Vis. Sci . 41 (8): 2059–66. PMID 10892843。
- Armerding D、Fuhlbrigge RC、Kieffer JD、Kupper TS (2001)。「扁桃B細胞はPSGL-1を発現しないが、かなりの割合が皮膚リンパ球抗原を示し、効果的なE-およびP-セレクチンリガンド活性を示す」。Int . Arch. Allergy Immunol . 126 (1): 78–90. doi :10.1159/000049497. PMID 11641609. S2CID 45610233.
- Friedman JS、Faucher M、Hiscott P、他 (2002)。「ヒトの眼におけるタンパク質の局在とオプティシンの遺伝子スクリーニング」。Hum . Mol. Genet . 11 (11): 1333–42. doi : 10.1093/hmg/11.11.1333 . PMID 12019215。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Le Goff MM、Hindson VJ、Jowitt TA、他 (2003)。「オプティシンの特性評価と溶液中での安定した二量体化の証拠」。J . Biol. Chem . 278 (46): 45280–7. doi : 10.1074/jbc.M303117200 . PMID 12951322。
- Ramesh S、Bonshek RE 、Bishop PN (2004) 。「ヒトの眼におけるオプティシンの免疫局在」。英国眼科学誌。88 (5): 697–702。doi :10.1136/bjo.2003.031989。PMC 1772128。PMID 15090426。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Liu T、Qian WJ、Gritsenko MA、他 (2006)。「免疫親和性サブトラクション、ヒドラジド化学、質量分析によるヒト血漿 N-グリコプロテオーム分析」。J . Proteome Res . 4 (6): 2070–80. doi :10.1021/pr0502065. PMC 1850943. PMID 16335952 .
- Acharya M、Mookherjee S、Bhattacharjee A、他 (2007)。「原発性開放隅角緑内障における OPTC 遺伝子の評価: サイレント変化の機能的意義」。BMC Mol. Biol . 8:21 . doi : 10.1186/1471-2199-8-21 . PMC 1838427. PMID 17359525 。