ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| NDUFA2 |
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| 利用可能な構造 |
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| ＰＤＢ | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | NDUFA2、B8、CD14、CIB8、NADH:ユビキノン酸化還元酵素サブユニットA2、MC1DN13 |
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| 外部ID | オミム：602137; MGI : 1343103;ホモロジーン: 37628;ジーンカード：NDUFA2; OMA :NDUFA2 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置（マウス） |
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 | | クロ。 | 18番染色体（マウス）[2] |
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| | バンド | 18|18 B2 | 始める | 36,875,385 bp [2] |
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| 終わり | 36,877,610 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス（相同遺伝子） |
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| トップの表現 | - 上腕二頭筋
- 右心室
- 上腕二頭筋の骨格筋組織
- 心の頂点
- 上腕三頭筋
- 横行結腸粘膜
- 外側広筋
- 胸郭横隔膜
- 左心室
- 舌の体
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| | トップの表現 | - 大動脈弁
- 窩
- 顔面運動核
- 上行大動脈
- 髄質集合管
- 顆頭
- 腎小体
- 肋間筋
- 右腎臓
- パネートセル
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- ミトコンドリア内膜
- ミトコンドリア呼吸鎖複合体I
- レスピラソーム
- 膜
- ミトコンドリア
- ミトコンドリア膜
| | 生物学的プロセス |
- ミトコンドリア呼吸鎖複合体Iの組み立て
- ミトコンドリア電子伝達、NADHからユビキノン
- 胚盤胞の孵化
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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NADH 脱水素酵素 [ユビキノン] 1 アルファサブ複合体サブユニット 2は、ヒトではNDUFA2遺伝子によってコードされるタンパク質です。[5] [6] NDUFA2 タンパク質は、ミトコンドリア内膜に位置し、電子伝達系の 5 つの複合体の中で最大のNADH 脱水素酵素 (ユビキノン)のサブユニットです。[7] NDUFA2 遺伝子の変異は、リー症候群と関連しています。[6]
構造
NDUFA2遺伝子は、 5番染色体の長腕（q腕）の31.2番の位置にあり、2,422塩基対にまたがっています。[6] NDUFA2遺伝子は、99個のアミノ酸からなる11 kDaのタンパク質を生成します。[8] [9] NDUFA2は、呼吸複合体の中で最大の酵素であるNADH脱水素酵素（ユビキノン）のサブユニットです。構造はL字型で、長い疎水性膜 貫通ドメインと、すべての既知の酸化還元中心とNADH結合部位を含む末梢腕の親水性ドメインを持っています。 [7] NDUFA2は、複合体Iの膜貫通領域を形成する約31の疎水性サブユニットの1つです。N末端疎水性ドメインは、複合体Iの球状サブユニットと相互作用するC末端親水性ドメインとともに、ミトコンドリア内膜にまたがるαヘリックスに折り畳まれる可能性があることが指摘されています。高度に保存された2つのドメイン構造は、この特徴がタンパク質機能にとって重要であり、疎水性ドメインがミトコンドリア内膜でNADH：ユビキノン酸化還元酵素複合体のアンカーとして機能することを示唆しています。 [6]
関数
ヒトのNDUFA2遺伝子は、呼吸鎖の複合体Iのサブユニットをコードしており、電子をNADHからユビキノンに渡します。NDUFA2は複合体Iの補助サブユニットで、触媒には関与していないと考えられていますが、複合体Iの活性の制御や、酸化還元過程の補助によるその組み立てに関与している可能性があります。[6] [10]最初に、NADHは複合体Iに結合し、2つの電子をフラビンモノヌクレオチド（FMN）義手のイソアロキサジン環に渡してFMNH 2を形成します。電子は義手の一連の鉄硫黄（Fe-S）クラスターを介して移動し、最終的にコエンザイムQ10（CoQ）に渡され、ユビキノール（CoQH 2 ）に還元されます。電子の流れはタンパク質の酸化還元状態を変化させ、イオン化側鎖の構造変化とpKシフトをもたらし、ミトコンドリアマトリックスから4つの水素イオンを排出します。[7]
臨床的意義
NDUFA2遺伝子の変異は、通常生後1年以内に発症する重度の神経疾患であるリー症候群を引き起こす可能性があります。 [6]そのような変異の1つは、正常なスプライシングパターンを妨げ、エクソン2がスキップされる結果となります。これにより、複合体Iの活性が低下し、その組み立てが妨げられます。NDUFA2変異は、ミトコンドリアの脱分極にも関連しています。[11]
インタラクション
NDUFA2は、NADH脱水素酵素[ユビキノン]1アルファサブ複合体の他のメンバー、複合体Iの他のサブユニット、および酸化還元タンパク質との相互作用を含む多くのタンパク質相互作用を持っています。これは、複合体Iの組み立てと酸化還元プロセスの補助における潜在的な役割によるものと考えられます。[6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000131495 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000014294 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Emahazion T、Brookes AJ (1998 年 11 月)。「イントロンベースの放射線ハイブリッドマッピングによる NDUFA2、NDUFA6、NDUFA7、NDUFB8、および NDUFS8 電子伝達鎖遺伝子のマッピング」。細胞 遺伝学および細胞遺伝学。82 (1–2): 114。doi :10.1159/ 000015081。PMID 9763676。S2CID 46861680 。
- ^ abcdefg 「Entrez Gene: NDUFA2 NADH 脱水素酵素 (ユビキノン) 1 アルファ サブ複合体、2、8kDa」。
- ^ abc プラット、ドナルド・ヴォート、ジュディス・G・ヴォート、シャーロット・W. (2013). 「18」。生化学の基礎: 分子レベルでの生命(第 4 版)。ニュージャージー州ホーボーケン：ワイリー。 581–620ページ。ISBN 9780470547847。
{{cite book}}: CS1 maint: 複数の名前: 著者リスト (リンク)
- ^ Zong NC、Li H、Li H、Lam MP、Jimenez RC、Kim CS、Deng N、Kim AK、Choi JH、Zelaya I、Liem D、Meyer D、Odeberg J、Fang C、Lu HJ、Xu T、Weiss J、Duan H、Uhlen M、Yates JR、Apweiler R、Ge J、Hermjakob H、Ping P (2013 年 10 月)。「専門的な知識ベースによる心臓プロテオーム生物学と医学の統合」。Circulation Research。113 ( 9 ) : 1043–53。doi : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151。PMC 4076475。PMID 23965338。
- ^ 「NADHデヒドロゲナーゼ[ユビキノン]1アルファサブ複合体サブユニット2」。心臓オルガネラタンパク質アトラスナレッジベース（COPaKB）。
- ^ 「NDUFA2 - NADH 脱水素酵素 [ユビキノン] 1 アルファ サブ複合体 サブユニット 2」。UniProt : タンパク質情報のハブ。UniProt コンソーシアム。2015年3 月 24 日閲覧。
- ^ Hoefs SJ、Dieteren CE、Distelmaier F、Janssen RJ、Epplen A、Swarts HG、Forkink M、Rodenburg RJ、Nijtmans LG、Willems PH、Smeitink JA、van den Heuvel LP (2008 年 6 月)。 「NDUFA2 複合体 I 変異はリー病を引き起こす」。アメリカ人類遺伝学ジャーナル。82 (6): 1306–1315。土井：10.1016/j.ajhg.2008.05.007。PMC 2427319。PMID 18513682。
さらに読む
- Walker JE、Arizmendi JM、Dupuis A、Fearnley IM、Finel M、Medd SM、Pilkington SJ、Runswick MJ、Skehel JM (1992 年 8 月)。「ウシ心臓ミトコンドリアの NADH:ユビキノン酸化還元酵素の 20 サブユニットの配列。ポリメラーゼ連鎖反応を使用したタンパク質の配列決定のための新しい戦略の適用」。Journal of Molecular Biology。226 ( 4): 1051–72。doi : 10.1016 /0022-2836(92)91052-Q。PMID 1518044 。
- Dunbar DR、Shibasaki Y、Dobbie L、Andersson B、Brookes AJ (1997)。「5つのヒト呼吸鎖複合体I遺伝子のゲノムクローンのin situハイブリダイゼーションマッピング」。細胞遺伝学と細胞遺伝学。78 (1): 21–4。doi : 10.1159 /000134618。PMID 9345899 。
- ローフェン JL、トライペルス RH、ファン デン フーベル LP、シュエルケ M、ブスケンス CA、スミーツ RJ、トライベルス JM、スメイティンク JA (1998 年 12 月)。 「NADH の 8 つの核コード サブユニットの cDNA: ユビキノン酸化還元酵素: ヒト複合体 I cDNA の特徴付けが完了しました。」生化学および生物物理学研究コミュニケーション。253 (2): 415-22。土井：10.1006/bbrc.1998.9786。PMID 9878551。
- Zhang QH、Ye M、Wu XY、Ren SX、Zhao M、Zhao CJ、Fu G、Shen Y、Fan HY、Lu G、Zhong M、Xu XR、Han ZG、Zhang JW、Tao J、Huang QH、Zhou J、Hu GX、Gu J、Chen SJ、Chen Z (2000 年 10 月)。「CD34+ 造血幹細胞/前駆細胞で発現する 300 個の未定義遺伝子のオープン リーディング フレームを持つ cDNA のクローニングと機能解析」。ゲノム研究。10 ( 10 ) : 1546–60。doi :10.1101/gr.140200。PMC 310934。PMID 11042152。
- ブロックマン C、ディール A、レーバイン K、シュトラウス H、シュミーダー P、コーン B、キューネ R、オシュキナート H (2004 年 9 月)。 「ヒト複合体Iの酸化サブユニットB8はチオレドキシンフォールドを採用しています。」構造。12 (9): 1645 ～ 1654 年。土井：10.1016/j.str.2004.06.021。PMID 15341729。
- Vogel RO、Dieteren CE、van den Heuvel LP、Willems PH、Smeitink JA、Koopman WJ、Nijtmans LG (2007 年 3 月)。「タグ付き NDUFS3 をトレースしてミトコンドリア複合体 I アセンブリ中間体を識別し、ミトコンドリアサブユニットのエントリポイントを実証」。The Journal of Biological Chemistry。282 ( 10): 7582–90。doi : 10.1074/ jbc.M609410200。hdl : 2066 / 52607。PMID 17209039。
