MTA1

MTA1
利用可能な構造 電子データ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 4BKX、4PBY、4PBZ、4PC0、5ICN、5FXY
識別子
エイリアス	MTA1、転移関連1
外部ID	オミム：603526; MGI : 2150037;ホモロジーン: 3442;ジーンカード：MTA1; OMA :MTA1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） クロ。 染色体14（ヒト）[1] バンド 14q32.33 始める 105,419,820 bp [1] 終わり 105,470,729 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） クロ。 12番染色体（マウス）[2] バンド 12|12 F1 始める 113,061,898 bp [2] 終わり 113,100,826 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） トップの表現 右子宮管 甲状腺の右葉 甲状腺の左葉 心の頂点 右卵巣 左卵巣 小脳の右半球 左子宮管 子宮頸管 下垂体前葉 トップの表現 体節 胎児の尾 心室帯 胚葉上層 性器結節 下顎突出 臼歯 上顎突出 卵黄嚢 手 参照表現データの詳細 バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合 配列特異的DNA結合 転写コリプレッサー活性 DNA結合転写因子活性 転写活性化因子活性 亜鉛イオン結合 クロマチン結合 金属イオン結合 コアプロモーター配列特異的DNA結合 タンパク質結合 ヒストン脱アセチル化酵素活性 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 ヒストン脱アセチル化酵素結合 細胞成分 細胞質 核膜 細胞内膜で囲まれた細胞小器官 核質 微小管 細胞骨格 核 細胞質 NuRD複合体 生物学的プロセス 電離放射線に対する反応 転写の調節、DNAテンプレート 遺伝子発現の調節、エピジェネティック リズミカルなプロセス 遺伝子発現の概日リズム調節 転写、DNAテンプレート タンパク質の自己ユビキチン化の正の制御 二本鎖切断修復 光周期による概日時計の同調 シグナル伝達 プロテアソームを介したユビキチン依存性タンパク質分解プロセス 運動リズム ヒストン脱アセチル化 核酸テンプレート転写の負の制御 RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 核酸テンプレート転写の正の制御 RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 9112 116870 アンサンブル ENSG00000182979 ENSMUSG00000021144 ユニプロット Q13330 Q8K4B0 RefSeq (mRNA) NM_001203258 NM_004689 NM_054081 NM_001346696 NM_001364620 NM_001364621 NM_001364622 NM_001364623 RefSeq (タンパク質) NP_001190187 NP_004680 NP_001333625 NP_473422 NP_001351549 NP_001351550 NP_001351551 NP_001351552 場所 (UCSC) 14 章: 105.42 – 105.47 Mb 12 章: 113.06 – 113.1 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
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転移関連タンパク質 MTA1は、ヒトではMTA1遺伝子によってコードされるタンパク質です。MTA1 は MTA 遺伝子ファミリーの創設メンバーです。^{[5] [6]} MTA1 は主に核内に局在しますが、核外区画にも分布していることがわかっています。^{[7] MTA1 は、ヌクレオソームリモデリングおよび脱アセチル化複合体 (} NuRD )を含むいくつかのクロマチンリモデリング複合体の構成要素です。^{[8] [9]} MTA1 は、DNA 相互作用因子を遺伝子活性に統合する共調節因子として機能することで、遺伝子発現を制御します。^[10] MTA1 は、正常細胞と癌細胞の生理機能に関与しています。^{[11] [12]} MTA1 は、ヒト癌で最もアップレギュレーションされるタンパク質の 1 つであり、癌の進行、攻撃的な表現型、および癌患者の予後不良に関連しています。^{[9] [13]}

MTA1 は、1994 年に Toh、Pencil、Nicholson によって、転移性の高いラット乳がん細胞株で発現が異なる遺伝子として初めてクローン化されました。^{[5] [6]} MTA1 のクロマチンリモデリングにおける役割は、NuRD 複合体に MTA1 ポリペプチドが存在することから推測されました。^[8] MTA1-NuRD 複合体の最初の直接の標的は ERα でした。^[14] MTA2 は、当初、MTA1-L1 と名付けられた MTA1 様 1 遺伝子として認識され、Takashi Tokino 研究室による大規模なヒト cDNA の配列解析作業からランダムに選択されたクローンでした。MTA2 のクロマチンリモデリングにおける役割は、プロテオーム研究における NuRD 複合体での MTA2 ポリペプチドの普及から推測されました。^{[15] [16]}

MTA1は715/703アミノ酸長で、MTAファミリーの3つの遺伝子の1つによってコードされ、ヒトでは染色体14q32に、マウスでは染色体12Fに局在する。ヒトMTA1には、約51 kbの領域に21のエクソンがある。21のエクソンからの選択的スプライシングにより、416 bpから2.9 kbの長さに及ぶ20の転写産物が生成される。 ^[16]しかし、オープンリーディングフレームは、6つのタンパク質と2つのポリペプチドをコードする8つのスプライシングされた転写産物にのみ存在し、残りの転写産物は非コード長のRNAであり、その一部はイントロン配列を保持している。マウスMta1には、3つのタンパク質コード転写産物と3つの非コードRNA転写産物が含まれている。^[16]ヒトMTA1変異体のうち、スプライス変異体は2つのみ特徴付けられている。ZG29p変異体はC末端MTA1に由来し、251アミノ酸と29kDaの分子量を有する。 [ ^17] MTA1s変異体は中間エクソンの選択的スプライシングとそれに続くフレームシフトから生成され、430アミノ酸と47kDaの分子量を有する。^[18]

MTA1 の保存ドメインには、BAH (Bromo-Adjacent Homology)、ELM2 (egl-27 と MTA1 の相同性)、SANT (SWI、ADA2、N-CoR、TFIIIB-B)、および GATA のようなジンク フィンガーが含まれます。MTA1 の C 末端分岐領域には、Src 相同性 3 結合ドメイン、酸性領域、および核局在化シグナルがあります。これらのドメインの存在により、MTA1 が修飾または非修飾ヒストンおよび非ヒストン タンパク質との相互作用、クロマチン リモデリング、および遺伝子転写の調整に関与していることが明らかになりました。^{[9] [19] [20] [21]} MTA1は、リジン626のアセチル化、リジン182とリジン626のユビキチン化、リジン509のSUMO化、リジン532のメチル化など、複数の翻訳後修飾を受ける。^{[22] [23] [24]} MTA1ドメインの構造的洞察は、NuRD複合体のHDAC1またはRbAp48サブユニットとの複合体に関する研究から推定されている。^{[19] [20]} MTA1sバリアントは、核局在配列のないMTA1のN末端部分であるが、そのC末端領域に33アミノ酸の新しい配列を含む。新しい配列には、MTA1にエストロゲン受容体αまたは他のI型核受容体と相互作用する能力を与える核受容体結合モチーフLXXLLが含まれている。^[18] ZG29p変異体は、2つのプロリンに富むSH3結合部位を持つC末端MTA1を表す。^{[17] [25]}

MTA1の発現は転写および非転写機構の影響を受ける。MTA1の発現は成長因子、成長因子受容体、がん遺伝子、環境ストレス、電離放射線、炎症、低酸素症によって制御される。^{[9] [12]} MTA1の転写はc-Myc、^[26] SP1、^[27] CUTL1ホメオドメイン、^[28] NF-ḵB、^[29] HSF1、^[30] HIF-1a、^[31] Clock/BMAL1複合体、^[32]などの転写因子によって刺激され、p53によって阻害される。^[33] MTA1発現の非ゲノム的メカニズムには、RINGフィンガーユビキチンタンパク質リガーゼCOP1によるユビキチン化^[34]や腫瘍抑制因子ARFとの相互作用[24]、またはmiR-30c、miR-661、miR-125a-3pなどのマイクロRNAなどの転写後制御が含まれる。^{[35] [36] [37] [38]}

MTA1の機能は翻訳後修飾によって制御され、エフェクター分子の役割を調節し、他の調節タンパク質やクロマチンリモデリング機構と相互作用し、HDACを含むNuRD複合体の構成要素と相互作用して標的遺伝子の発現を調節する。^{[9] [19] [20]}

MTA1は、乳がん1型感受性遺伝子^[39] 、 PTEN、^{[40]、p21WAF}、[ ^41]、グアニンヌクレオチド結合タンパク質G(i)サブユニットα-2、^[22]、 SMADファミリーメンバー7、^[42] 、核受容体サブファミリー4グループAメンバー1、^[43]、ホメオボックスタンパク質SIX3、^[44]の転写を抑制し、BCL11B ^[45] およびE-カドヘリンの発現を抑制します。^{[46] [47]}

MTA1は、Stat3、^[48]乳がん増幅配列3、^[49] FosB、^[28]ペアボックス遺伝子5、^[50]トランスグルタミナーゼ2、^[51]骨髄分化一次応答88、^[52]腫瘍抑制因子p14/p19ARF、^{[27] [53]}チロシン水酸化酵素、^[54]時計遺伝子CRY1、^[32] SUMO2、^[23]およびWnt1とロドプシンの転写を刺激するため、二重共調節因子であり、ホメオドメインタンパク質Six3による転写阻害の解除によるものである^{[44] [55]}

MTA1はERαやMAT1、^[56] MICoA、^{[57] [58]} LMO4 ^[59]などの共調節因子と相互作用し、 ERの転写活性化活性を阻害する。^[14] MTA1はまた、p53やHIFなどの標的タンパク質を脱アセチル化し、それらの転写活性化機能を調節する。^{[60] [61]}さらに、MTA1ノックダウンによりmiR-210、miR-125b、miR-194、miR-103、miR-500の調節が起こるため、MTA1はマイクロRNAネットワークを介して標的遺伝子の発現を調節する可能性がある。^{[62] [63]}

MTA1 はコリプレッサーまたはコアクチベーターとして作用する能力により、標的遺伝子の発現を調節する。MTA1 の標的および/またはエフェクター経路は、正常細胞と癌細胞の両方で細胞機能の経路を制御する。^{[11] [12] MTA1 の生理学的機能には、} DJ1 ^[53]およびエンドフィリン-3との MTA1 の相互作用による脳での役割、 ^[64]マウスの眼におけるロドプシン発現の調節、 CLOCK-BMAL1 複合体との MTA1 の相互作用および Cry 転写の刺激による概日リズムの修正因子、MTA1-FOG2 相互作用による心臓の発達、MTA1 の枯渇が乳管低分岐につながることによる乳腺の発達、精子形成、休止期および活性化マクロファージにおけるサイトカインの発現に対する異なる影響による免疫調節、肝障害後の肝再生などがある。間葉系幹細胞の骨形成軸への分化、およびDNA損傷応答の構成要素である。^[11]癌細胞では、MTA1とその下流エフェクターは、形質転換、浸潤、生存、血管新生、上皮間葉転換、転移、DNA損傷応答、および乳癌のホルモン非依存性に役割を果たす遺伝子および/または経路を制御する。^{[9] [12]}

• 米国国立医学図書館の医学主題標目表(MeSH)における MTA1+タンパク質、+ヒト
• PDBe-KBのUniProt : Q13330 (転移関連タンパク質 MTA1)のPDBで入手可能なすべての構造情報の概要。

この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。