イスラム教はスーダンで最も一般的な宗教であり、1956年の独立以来、イスラム教徒が国家政府機関を支配してきた。UNDPスーダンによると、イスラム教徒の人口は97%で、多数のアラブ系および非アラブ系のグループが含まれる[ 1 ] 。残りの3%はキリスト教または伝統的なアニミズム宗教を信仰している。ヌバ山地地域を除くすべての地域でイスラム教徒が多数を占めている。スーダンのイスラム教徒の大多数は、スーフィズムの影響を強く受けたマリキ派のスンニ派イスラム教を信仰している[ 2 ]。首都ハルツームにはシーア派のコミュニティもいくつか存在する[ 3 ] 。最も大きな分裂はスーフィー教団の線に沿って生じている。アンサールとハトミアという2つの人気のある教団は、それぞれ野党のウンマ党と民主統一党と関連付けられている。ダルフール地域だけが、伝統的に国内の他の地域に見られるスーフィー教団が存在しない。[ 4 ]
シャリーア法は様々な軍事政権によって導入され、首都における非イスラム教徒への適用は交渉中の争点であったが、南北紛争の根底にある他の主要な問題とともに、合意によってほぼ解決された。シャリーア法は北部で適用される国家法制度の基礎として引き続き使用される。南部に適用される国家法は「国民の合意、価値観、慣習」に基づくものとする。多数派が法制度の基礎となる宗教的または慣習的信念とは異なる信念を持つ州または地域では、国家法はそのような信念によりよく適合するように改正される可能性がある。全国的に、非イスラム教徒へのシャリーア法の適用は制限され、裁判所は非イスラム教徒に対してシャリーア法のより厳しい身体的刑罰を課す裁量権を行使することはできない。スーダンでは1956年以降3つの民主政権が存在し、いずれもシャリーア法を廃止した。
2020年9月、スーダンの暫定政府が宗教と国家の分離に合意したことで、スーダンは憲法上世俗国家となり、北アフリカのこの国における30年間のイスラム支配とイスラム教の国教としての地位が終焉を迎えた。 [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]この新たな法律により、以前の背教法と公開鞭打ち刑も廃止された。[ 8 ]

イスラム教の勃興よりずっと以前から、ヌビア人とアラブ人の間には文化的な交流があった。イスラム教は、アムル・イブン・アル=アースの統治下でエジプトがイスラム教に征服された後、北からスーダンに広まった。ヌビアはすでにエジプトからキリスト教化されていたため、古いヌビア教会はコプト正教に従っていた。ヌビアのキリスト教王国であったノバティア、マクリア、アロディアは、それぞれ650年、1312年、1504年にイスラム教の侵略によって滅ぼされた。1504年以降、北スーダンはイスラム教徒のフンジ・スルタン国によって統治された。
南スーダン、すなわち南コルドファンと現在の南スーダンは、 19世紀までキリスト教化もイスラム化もされていませんでした。この地域はムハンマド・アリーの支配下に置かれ、それ以来、宗教的および民族的な紛争が続いています。マフディーヤの蜂起(1881~1899年)は政治的イスラム主義の起源とさえ見なすことができ、 1899年から1955年までのイギリスの支配につながりました。アラブ系イスラム教徒の北部と黒人アフリカ系キリスト教徒の南部との間の人種的および宗教的紛争は、第一次スーダン内戦(1955~1972年)、第二次スーダン内戦(1983~2005年)、ダルフール戦争(2003~2010年)、そして2011年以降の紛争で再び勃発しました。