ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
IFNL3 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス IFNL3 、IL-28B、IL28B、IL28C、インターロイキン 28B、インターフェロン、ラムダ 3、インターフェロン ラムダ 3、IFN-ラムダ-3、IFN-ラムダ-4、IL-28C 外部ID オミム ：607402; MGI : 2450574; ホモロジーン : 77540; ジーンカード ：IFNL3; OMA :IFNL3 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 7番染色体（マウス） [2] バンド 7|7 A3 始める 28,222,261 bp [2] 終わり 28,223,747 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 睾丸 生殖腺 上前頭回 前頭前皮質 血 腹部の皮膚 胎盤 側頭葉 扁桃体 膀胱
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能 細胞成分 生物学的プロセス
JAK-STATを介した受容体シグナル伝達経路 ウイルスゲノム複製の負の制御 免疫反応の積極的な調節 先天性免疫反応 ウイルスに対する防御反応 T細胞活性化の調節 シグナル伝達受容体の活性の調節 サイトカインを介したシグナル伝達経路 出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
インターフェロンラムダ3（遺伝子記号： IFNL3） は、IFNL3タンパク質をコードしています。IFNL3 は 以前は IL28B と命名されていましたが、ヒトゲノム機構遺伝子命名委員会は、2013年に当時新しく発見された IFNL4 遺伝子 に名前を割り当てる際にこの遺伝子の名前を変更しました。 [5] IFNL1 （以前の IL29 ）および IFNL2 （以前の IL28A ）とともに 、これらの遺伝子は染色体領域19q13上のクラスター内にあります。IFNL3は、IFNL2と約96％、IFNL1と約80％、IFNL4と約30％のアミノ酸同一性を共有しています。
インターフェロンラムダ遺伝子は、 タイプIインターフェロン および IL-10ファミリー と遠縁である タイプIIIインターフェロン として分類される サイトカインをコードします。タイプIIIインターフェロンはウイルス感染によって誘導され、インターロイキン10受容体ベータ（IL10RB）とインターフェロンラムダ受容体1（IFNLR1）からなるヘテロ二量体クラスIIサイトカイン受容体と相互作用し、JAK-STAT抗ウイルス経路を介してシグナルを送ります。[ RefSeq 提供 、2008年7月]。
C型肝炎 2009年（すなわち、 IFNL4 の発見前 ）、 ゲノムワイド関連研究 （GWAS）の結果から、 IFNL3の 近くにある 一塩基多型 （SNP） （rs12979860、rs8099917など）が、慢性C型肝炎に対するペグインターフェロンαおよび リバビリン 治療への反応、 [6] [7] [8] [9] ならびに C型肝炎 （HCV）感染の自然消失と強く関連していることが示されました。 [10] [11] [12] [13]当時 IL28B （現在の IFNL3） として知られていた遺伝子 が、当時最も近い既知の遺伝子であったため、これらの遺伝子変異は「 IL28B 変異体」と呼ばれていました。観察された関連性は、その遺伝子の構造または調節の違いを反映していると考えられました。しかし、 IFNL4 の発見により、rs12979860 SNPは IFNL4 のイントロン1内に位置し、rs8099917は 遺伝子間領域 内にあるものの、 IFNL4に最も近いことが明らかになりました。 [5] rs12979860とrs8099917 SNPは、 IFNL4タンパク質の生成を制御する IFNL4 の変異体 （ IFNL4 -ΔG/TT; rs368234815）と高い 連鎖不平衡状態 にあります。 [5] IFNL4- ΔG/TTは、GWASによるHCVクリアランスと近傍SNPの関連性を説明する機能的多型であると考えられ、 IFNL4 -ΔG/TTはrs12979860よりもHCVクリアランスとの統計的関連性が強いことが示され、特にこれらの変異体間の連鎖不平衡が他の集団よりも弱いアフリカ系集団ではその傾向が顕著であった。 [5] [14]
IFNL3 の機能的変異体として考えられるものの1つは 、3'非翻訳調節領域にあるrs4803217 SNPである 。 この部位の祖先チミンをグアニンに置換すると 、mRNAの分解とHCV誘導性マイクロRNAの結合が減少し、 IFNL3 mRNAの発現が増加し [15] 、RNA構造が変化する。 [16] [11] rs4803217と IFNL4- ΔG/TT変異体 の間には高い連鎖不平衡が存在する。 [5] rs4803217はHCVの排除と関連することが示されているが [16] 、その関連性はrs4803217 SNP自体の直接的な機能的効果ではなく、
IFNL4 -ΔG/TTとの連鎖不平衡に起因していると思われる。
参考文献
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さらに読む
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