薬理学ガイド

IUPHAR/BPS 薬理学ガイド

コンテンツ
説明	処方薬のヒトに対するすべての標的に関する薬理学的情報へのオンラインのオープンアクセスポータル
キャプチャされたデータの種類	ターゲットの命名法、薬理学的データ、リガンド構造
生物	ヒト、マウス、ラット
接触
研究センター	エディンバラ大学（英国）
主な引用	2020年のIUPHAR/BPS薬理学ガイド：免疫薬理学の内容を拡張し、IUPHAR/MMVマラリア薬理学ガイドを導入[1]
アクセス
Webサイト	詳しくはこちら
ウェブサービスURL	www.guidetopharmacology.org/webServices.jsp
Sparqlエンドポイント	rdf.guidetopharmacology.org/sparql
その他
バージョン管理	コンテンツは約四半期ごとに更新されます（例：2020.2 は [年].[リリース番号] を示します）
キュレーションポリシー	マニュアル、社内

IUPHAR /BPS 薬理学ガイドはオープンアクセスのウェブサイトで、認可された医薬品やその他の小分子の生物学的ターゲットに関する情報へのポータルとして機能します。薬理学ガイド (標準略語は GtoPdb) は、国際基礎・臨床薬理学連合(IUPHAR) と英国薬理学会(BPS) の共同事業として開発されました。これは、2009 年のオリジナルの IUPHAR データベース (標準略語 IUPHAR-DB) に代わるものであり、これを拡張したものです。薬理学ガイドは、科学界と臨床界のすべてのメンバーと関心のある一般の人々がアクセス可能な、すべての薬理学的ターゲットの簡潔な概要と、選択されたターゲット セットの詳細へのリンクを提供することを目指しています。掲載されている情報には、薬理学的データ、ターゲット、遺伝子命名法、およびリガンドの厳選された化学情報が含まれます。各ターゲット ファミリーの概要と解説が、主要な参考文献へのリンクとともに含まれています。

薬理学ガイドは、2011年12月にオンラインで最初に公開され、2012年7月に追加資料が公開されました。エディンバラ大学を拠点とするキュレーターチームによって管理されている薬理学ガイドは、簡潔な薬理学ガイドの編集者を含む国際的な寄稿者のネットワークによって開発されています。オリジナルのIUPHAR-DBと同様に、国際基礎・臨床薬理学連合（IUPHAR）の受容体命名法および薬物分類委員会（NC-IUPHAR）が、データベースの科学諮問委員会および編集委員会として機能します。500人を超える専門家アドバイザーのネットワーク（約90の小委員会に編成）が専門知識とデータを提供します。GtoPdbプロジェクトの現在のPIおよび助成金受領者は、Jamie A. Davies教授です。 2012年のGtoPdbの最初のバージョンの開発とリリースは、British Journal of Pharmacologyに掲載された「Guide to Pharmacology.org- an update」と題された論説で説明されました。^[2] IUPHAR-DBは現在開発されておらず、このサイトに含まれるすべての情報は現在Guide to PHARMACOLOGYを通じて入手できます（IUPHAR-DBリンクはリダイレクトされるはずです）。

現在、「薬理学ガイド」に含まれている対象グループは次のとおりです。

• 触媒受容体
• 酵素
• Gタンパク質共役受容体
• イオンチャネル
• キナーゼ
• 核受容体
• トランスポーター
• 脂肪酸結合タンパク質、シグマ受容体、アディポネクチン受容体などの他のタンパク質標的

各ターゲット グループの情報は、分類に基づいてファミリーに細分化され、ファミリーごとに個別のデータ ページが用意されています。各ページでは、ターゲットが表のリストにまとめられ、各表には、ターゲットのタンパク質と遺伝子の命名法と遺伝子命名法データベースへのリンク、およびターゲットで活性を持つ選択されたリガンド (アゴニスト、アンタゴニスト、阻害剤、放射性リガンドなど) のリストが含まれています。薬理学的データと参考文献が提供され、各リガンドは、命名法と化学構造またはペプチド配列、同義語、および関連データベース リンクを表示するリガンド ページにハイパーリンクされています。薬理学ガイドには、サイトに含まれるすべてのリガンド分子のリストも含まれており、小有機分子 (哺乳類の代謝物、ホルモン、神経伝達物質を含む)、合成有機分子、天然物、ペプチド、無機分子、抗体などのカテゴリに細分化されています。Web サイトに含まれるすべての承認済み医薬品の完全なリストも、リガンド リストから入手できます。薬理学ガイドは、教育リソースに加えて、標的とリガンドに関する臨床情報も含むように拡張されています。Web サイトの検索機能には、クイック検索オプションと詳細検索オプション、受容体とリガンドの検索 (化学構造を使用したリガンド構造のサポートを含む) が含まれます。その他の機能には、「ホット トピック」ニュース項目と最近の受容体とリガンドのペアリング リストが含まれます。

2015 年 11 月から 2018 年 10 月まで、ウェルカム トラストは、 GtoPdb スキーマに基づいて IUPHAR 免疫薬理学ガイド (GtoImmuPdb) を開発するプロジェクトを支援しました。GtoImmuPdb は、既存の IUPHAR/BPS 薬理学ガイドにある高品質で専門家がキュレーションした薬理学データに免疫学的視点を取り入れたオープン アクセス リソースです。免疫薬理学に関連するタンパク質ターゲットとリガンドはタグ付けされ、GtoImmuPdb にキュレーションされています。これらは、免疫学的プロセス、細胞タイプ、疾患などの新しい免疫学的データ タイプにも関連付けられています。GtoImmuPdb は、免疫学と薬理学を結び付ける知識ベースを提供し、付加価値をもたらし、疾患の免疫、炎症、感染成分の調節を目的とした薬剤の研究開発を支援します。^[3]

薬理学ガイドには、以前は「受容体とチャネルのガイド」^[4]であった薬理学簡潔ガイドのオンラインオープンアクセスデータベースバージョンが含まれており、HTML、PDF、印刷形式で利用できます。オンラインデータベースのハードコピーの要約は、薬理学簡潔ガイド2017/2018 ^{[5]として、} British Journal of Pharmacologyの半年ごとの補足として一連の論文として出版されています。

薬理学ガイドには、簡潔なページと詳細なページの両方で、ターゲット ページとリガンド ページを介して他の関連リソースへのリンクが含まれています。これらのリソースの多くは、関連する薬理学ガイド ページと相互リンクを維持しています。

• HUGO遺伝子命名委員会
• マウスゲノムインフォマティクス
• ラットゲノムデータベース
• アンサンブル
• ユニプロット
• エントレズ
• パブケム
• ケムスパイダー
• チェムBL
• チェビ
• ケッグ
• オンラインメンデル遺伝学（OMIM）
• ドラッグバンク
• タンパク質データバンク

ウェルカムトラストからの資金提供を受けて、2012年から2015年にかけて、Guide to PHARMACOLOGYは、すべての処方薬の生物学的ターゲットと、将来の低分子薬の可能性のある他のターゲットを含むように拡張されました。幅広いターゲットの主な特徴の概要は、概要ビューページで提供され、詳細ビューページでは、選択されたターゲットのサブセットの特性に関するより詳細な情報を提供します。2018年1月現在、Medicines for Malaria Ventureは、Guide to Malaria Pharmacologyを開発するための新しい拡張機能をサポートしています。コアGtoPdbは、引き続き英国薬理学会によってサポートされています。

• 国際基礎・臨床薬理学連合
• 英国薬理学会
• 生物学的標的
• 英国薬理学ジャーナル

• IUPHAR/BPS 薬理学ガイド
  • 2021年版IUPHAR/BPS薬理学ガイド（BJPに掲載）
  • 2024年版IUPHAR/BPS 薬理学簡潔ガイド（BJP 発行）
• 国際基礎・臨床薬理学連合 (IUPHAR)
• 英国薬理学会（BPS）
• 英国薬理学ジャーナル
• 薬理学の簡潔ガイド
• ウェルカムトラスト
• マラリア治療薬ベンチャー