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| ハプログループ M-P256 | |
|---|---|
 | |
| 起源の可能性のある時期 | 32,000-47,000年前[1] |
| 起源地の可能性 | ウォラセア(インドネシア東部) またはニューギニア [2] |
| 祖先 | K2b1 |
| 突然変異の定義 | P256 |
ハプログループM、別名M-P256、ハプログループK2b1b（以前はK2b1d）は、Y染色体DNAハプログループです。M-P256はハプログループK2b1の子孫ハプログループであり、32,000年から47,000年前に初めて出現したと考えられています。[1]
M-P256は西パプアとパプアニューギニア西部で最も頻繁に見られるY染色体ハプログループです。[3]さらに、M-P256はメラネシアの近隣地域、インドネシア、オーストラリア先住民にも見られます。
系統構造
このハプログループサブクレードの系統樹は、主にYCCが2008年に発表した系統樹[4]とISOGGが2016年に発表した系統樹に基づいています。[5]
- Ｍ*（P256）
- M1（M4、M5/P73、M106、M186、M189、M296、P35）
- M1a (P34_1、P34_2、P34_3、P34_4、P34_5)
- M1a1 (P51)
- M1a2 (P94)
- M1b （P87）
- M1b1 (M104_1/P22_1、M104_2/P22_2)
- M1b1a (M16)
- M1b1b (M83)
- M1b1 (M104_1/P22_1、M104_2/P22_2)
- M1a (P34_1、P34_2、P34_3、P34_4、P34_5)
- M2 (M353、M387)
- M2a (M177/SRY9138)
- M3（P117、P118）
- M1（M4、M5/P73、M106、M186、M189、M296、P35）
分布
M* (M-P256*)
パラグループM-P256*は、ニューギニア（6.3％）とフローレス（2.5％）で低頻度に発見されています。[2]
M1（M-M4）
| ハプログループM-M4 | |
|---|---|
| 起源の可能性のある時期 | 8,200 [3,800–20,600]年前[3] |
| 起源地の可能性 | 東南アジア-メラネシア[要出典] |
| 祖先 | M-P256 |
| 突然変異の定義 | M4、M5/P73、M106、M186、M189、M296、P35 [引用が必要] |
このグループはニューギニアとメラネシアに多く見られ、インドネシア、ミクロネシア、ポリネシアの近隣地域にも適度に分布しています。
- 100% [3]
- ケテンバン100% [3]
- アユ100% [3]
- シタック86% [3]
- アスマット75% [3]
- 西パプア
- 低地・海岸 77.5% [3]
- ハイランド地方 74.5% [3]
- コンバイ語/コロワイ語46% [3]
- パプアニューギニア
- 海岸 29% [3]
- ハイランド 35.5% [3]
- トライ（ニューブリテン） 31% [3]
- トロブリアンド諸島30% [3]
- マルク諸島（モルッカ諸島） 21% [3]
- トレス海峡諸島民（オーストラリア）：最大2.0％（つまりサンプルの0.9％）、全体の45％は「非先住民」とみなされた[6]
2012年の研究では、アフガニスタンのマザーリシャリーフ出身のハザラ人がM1（当該地域の男性60名のサンプル中）であることが報告され、極端な地理的外れ値が特定されたようです。[7]ハザラ人はSNP M186（M4に相当すると考えられている）を持っていました。
M1a（M-P34）
M1a（M-P34）は、西ニューギニアで最も頻繁に見られるY染色体DNAハプログループです。また、インドネシアの近隣地域（マルク、ヌサトゥンガラ）やパプアニューギニア全土（沖合の島々を含む）でも中程度の頻度で見られます。[3] [8]
M1b (M-P87)
M1b M-P87(xM104/P22)は、ニューアイルランドのサンプルプールの約18% (20/109) 、ニューハノーバーのラヴォンガイのサンプルの約12% (5/43) 、ニューブリテンのサンプルプールの約5% (19/395) (特に、東ニューブリテンのバイニングの約24% (15/63) )、さらにブーゲンビル北部のサポサの個体1体、パプアニューギニア北海岸の個体1体で発見されています。[1]
サブクレードM1b1（M104_1/P22_1、M104_2/P22_2）はビスマルク諸島とブーゲンビル島の個体群に頻繁に見られ、ニューギニア、フィジー、トンガ、東フツナ、サモアにも中程度に分布しています。[1] [9]
M2（M-M353）
サブクレードM2a（M-M177、M-SRY9138とも呼ばれる）は、ブーゲンビル島東海岸のナシオイ個体1体とソロモン諸島マライタ州の個体1体で発見されている。[11]
査読済み文献内で以前に使用された M2a サブクレードの別名を以下に示します。
M3（M-P117）
M3（P117、P118）はニューブリテン島の個体群で頻繁に見られ、ブーゲンビル島北部、フィジー、東フツナでも時折観察される。[9] [1]
これまでの系統発生の歴史
2002 年以前は、学術文献では少なくとも 7 つの異なる Y 染色体系統樹の命名システムが使用されており、かなりの混乱を招いていました。この問題を解決するために、2002 年に主要な研究グループが協力して Y 染色体コンソーシアム (YCC) を結成しました。その結果、科学界が使用する標準として 1 つの新しい系統樹を含む共同論文が発表されました。その後、集団遺伝学と遺伝系譜学に関心を持つ別の科学者グループが、命名システムを継続的に改善するために取り組みました。
以下の表は、画期的な 2002 年の YCC ツリー以前のハプログループ M 研究で使用された命名法をまとめたものであり、古い文献をレビューする研究者が、使用されていたさまざまな命名法をすばやく変換できるようにしています。
- 出典
YCC ツリーの作成には、以下の研究チームがそれぞれの出版物ごとに参加しました。
- α Jobling と Tyler-Smith 2000 および Kaladjieva 2001
- βアンダーヒル2000
- γハマー 2001
- δカラフェット 2001
- εセミノ 2000
- ζス 1999
- ηカペリ 2001
カラフェットの2008年の論文では、以前の2006年のISOGGツリーと比較して、いくつかの変更が導入されました。[4] P256マーカーの発見以前は、現在のサブグループM-M4（M4マーカーによって定義）は、ハプログループM-P256全体を表していました。また、サブグループM2とM3は、親ハプログループKのサブグループK1とK7として分類されていました。[引用が必要]
参考文献
- ^ abcde Scheinfeldt, Laura; Friedlaender, Françoise; Friedlaender, Jonathan; Latham, Krista; Koki, George; Karafet, Tatyana; Hammer, Michael; Lorenz, Joseph (2006-06-05). 「メラネシア北部島嶼における予期せぬ NRY 染色体変異」. Molecular Biology and Evolution . 23 (8): 1628– 1641. doi :10.1093/molbev/msl028. ISSN 1537-1719. PMID 16754639.
- ^ ab Tatiana M. Karafet、Brian Hallmark、Murray P. Cox、Herawati Sudoyo 、Sean Downey、J. Stephen Lansing、Michael F. Hammer、「Major East–West Division Underlies Y Chromosome Stratification across Indonesia」、 Molecular Biological Evolution、(2010)、第27巻第8号、pp. 1833-1844。
- ^ abcdefghijklmnop Kayser, Manfred; Brauer, Silke; Weiss, Gunter; Schiefenhövel, Wulf; Underhill, Peter; Shen, Peidong; Oefner, Peter; Tommaseo-Ponzetta, Mila; Stoneking, Mark (2003). 「西ニューギニアのヒト集団におけるY染色体の減少、しかしミトコンドリアDNAの減少、多様性」アメリカ人類遺伝学ジャーナル72 (2): 281– 302. doi : 10.1086/346065. ISSN 0002-9297. PMC 379223 . PMID 12532283.
- ^ ab Karafet, Tatiana M.; Mendez, Fernando L.; Meilerman, Monica B.; Underhill, Peter A.; Zegura, Stephen L.; Hammer, Michael F. (2008-05-01). 「新しいバイナリ多型によりヒトY染色体ハプログループツリーの形状が変わり、解像度が向上」. Genome Research . 18 (5): 830– 838. doi :10.1101/gr.7172008. ISSN 1088-9051. PMC 2336805. PMID 18385274 .
- ^ 「ISOGG 2018 Y-DNAハプログループM」isogg.org . 2024年9月18日閲覧。
- ^ Nagle, Nano; Ballantyne, Kaye N.; van Oven, Mannis; Tyler-Smith, Chris; Xue, Yali; Taylor, Duncan; Wilcox, Stephen; Wilcox, Leah; Turkalov, Rust; van Oorschot, Roland AH; McAllister, Peter; Williams, Lesley; Kayser, Manfred; Mitchell, Robert J.; The Genographic Consortium (2016). 「オーストラリア先住民のY染色体の古さと多様性」. American Journal of Physical Anthropology . 159 (3): 367– 381. doi :10.1002/ajpa.22886. ISSN 0002-9483. PMID 26515539.
- ^ マーク・ハーバー;プラット、ダニエル E.ボナブ、マジアル・アシュラフィアン。ユハンナ、ソニア C.ソリア＝ヘルナンツ、デイビッド F.マルティネス・クルス、ベゴーニャ。ドゥアイヒ、ブシュラ。ガッシベ・サバグ、ミシェル。ラファトパナ、ホシャン。ガンバリ、モーセン。クジラ、ジョン。バラノフスキー、オレグ。ウェルズ、R. スペンサー。コマス、デイビッド。タイラー・スミス、クリス (2012-03-28)。 「アフガニスタンの民族グループは、歴史的出来事によって構造化されたY染色体遺産を共有している」。プロスワン。7 (3): e34288。ビブコード:2012PLoSO...734288H。doi : 10.1371/journal.pone.0034288 . ISSN 1932-6203. PMC 3314501 . PMID 22470552.
- ^ Karafet, Tatiana M; Lansing, J. S; Redd, Alan J; Watkins, Joseph C; Surata, SP K; Arthawiguna, W. A; Mayer, Laura; Bamshad, Michael; Jorde, Lynn B; Hammer, Michael F (2005). 「バリ島のY染色体から見たインドネシアの開拓：新石器時代以前の狩猟採集民、オーストロネシアの農民、インド人商人の遺伝的寄与」『ヒューマンバイオロジー』77 (1): 93– 114. doi :10.1353/hub.2005.0030. hdl : 1808/13586 . ISSN 1534-6617. PMID 16114819.
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- ^ Kayser, Manfred; Brauer, Silke; Cordaux, Richard; Casto, Amanda; Lao, Oscar; Zhivotovsky, Lev A.; Moyse-Faurie, Claire; Rutledge, Robb B.; Schiefenhoevel, Wulf; Gil, David; Lin, Alice A.; Underhill, Peter A.; Oefner, Peter J.; Trent, Ronald J.; Stoneking, Mark (2006). 「ポリネシア人のメラネシアおよびアジア起源: 太平洋を横断する mtDNA と Y 染色体の勾配」. Molecular Biology and Evolution . 23 (11): 2234– 2244. doi :10.1093/molbev/msl093. hdl : 11858/00-001M-0000-0010-0145-0 . ISSN 1537-1719. PMID 16923821.
- ^ Cox, Murray P.; Mirazón Lahr , Marta (2006). 「ソロモン諸島のオーストロネシア語族とパプア語族のペアコミュニティにおけるY染色体の多様性は言語所属と逆相関している」。American Journal of Human Biology。18 ( 1): 35– 50。doi :10.1002/ajhb.20459。ISSN 1042-0533。PMID 16378340 。
変換表のソース
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- Hammer, Michael F.; Karafet, Tatiana M.; Redd , Alan J.; Jarjanazi, Hamdi; et al. (2001 年 7 月 1 日)。「ヒト Y 染色体のグローバル多様性の階層的パターン」。分子生物学 と進化。18 (7): 1189– 1203。doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003906。PMID 11420360。
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- Semino, O.; Passarino, G; Oefner, PJ; Lin, AA; et al. (2000)、「現存するヨーロッパ人における旧石器時代のホモ・サピエンス・サピエンスの遺伝的遺産：AY染色体の観点」、Science、290 (5494): 1155– 9、Bibcode :2000Sci...290.1155S、doi :10.1126/science.290.5494.1155、PMID 11073453
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- Underhill, Peter A.; Shen, Peidong; Lin, Alice A.; Jin, Li; et al. (2000 年 11 月)。「Y 染色体配列の変異と人類集団の歴史」。Nature Genetics . 26 (3): 358– 361. doi :10.1038/81685. PMID 11062480。
外部リンク
- ハプログループMの広がり、ナショナルジオグラフィックより
参照
ウィキメディア・コモンズには、Y-DNA のハプログループ Mに関連するメディアがあります。