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| ハプログループE | |
|---|---|
| 起源の可能性のある時期 | 35,000 [1]から 8,000 [2] YBP |
| 起源地の可能性 | 東スンダランド[1]または福建沿岸[2] |
| 祖先 | M9 |
| 子孫 | E1、E2 |
| 突然変異の定義 | 3027、3705、7598、13626、16390 [3] |
ヒトミトコンドリア遺伝学において、ハプログループ Eはマレー諸島に典型的なヒトミトコンドリア DNA (mtDNA) ハプログループです。これはハプログループ M9のサブグループです。
起源
ハプログループEの起源の場所と時期については、対照的な2つの提案がなされている。1つの見解は、この系統群は3万年以上前、最終氷期極大期の頃、スンダランド北東海岸（現在のボルネオ島の近く）で形成されたというものである。このモデルでは、ハプログループは後期氷期の海面上昇によって分散した。[1] [4]
2014年、中国南東部の海岸沖にある馬祖諸島の1つである梁島で発見された8,000年前の骨格のミトコンドリアDNAは、ハプログループEに属し、E1サブグループの特徴である4つの変異のうち2つを持つことが判明しました。このことから、Koと同僚は、ハプログループEは8,000〜11,000年前に福建省北部の海岸近くで発生し、6,000年前に新石器時代の移住者とともに台湾に移動し、そこからオーストロネシア語族の拡散とともに東南アジアの海域に広がったと主張しています。[2] Soaresらは、単一のサンプルを重視しすぎることに対して警告し、一定の分子時計は、より早い時期（およびより南の起源）を示唆する可能性が高いことを示唆していると主張しています。[5]
分布
ハプログループEは東南アジア海洋部全域に見られる。[4] 東アジア本土ではほとんど見られず、東アジア本土では姉妹グループM9a（日本にも見られる）が一般的である。[4] [6] 特に、オーストロネシア語族の話者に見られ、東南アジアでも他の言語族の話者の間ではまれである。台湾、フィリピン、インドネシア、マレーシア（ボルネオ島のサバ州を含むが、マレー半島のオランアスリは含まない）、パプアニューギニア沿岸部、特にマリアナ諸島のチャモロ人の集団で検出されている。[4] [7] [8] [9] [10] [11]
4つの主要なサブクレードのうち、E1bとE2aは主に東南アジアの海域で発見され、E1aとE2bのみが台湾でも発見されています。[12] E2bは台湾内での多様性が低く、約5,000年前に到着したことが示唆されています。[12] 最も一般的なEサブクレードであるE1a1aは台湾で最も多様性が高く、フィリピンとスラウェシがそれに続きます。さらに、E1a1の他の分岐は主に台湾に限定されています。[13]
サブクラス
このハプログループEサブクレードの系統樹は、マンニス・ヴァン・オーブンとマンフレッド・カイザーによる論文「ヒトミトコンドリアDNA変異の包括的系統樹の更新」[3]とその後の発表された研究に基づいています。
- え
- E1
- E1a
- E1a1
- E1a1a
- E1a1a1
- E1a1a
- E1a2
- E1a1
- E1b
- E1b1
- E1a
- E2
- E2a
- E2b
- E2b1
- E2b2
- E1
参照
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参考文献
- ^ abc ソアレス他、2008、p. 1215。
- ^ abc Ko et al 2014.
- ^ヴァン・オーブン＆カイザー 2008より。
- ^ abcd Hillら2007年。
- ^ ソアレスら2016年。
- ^ Trejaut et al 2005.
- ^ Tabbada 他、2010 年、24、28 ページ。
- ^ ペンら 2010.
- ^ ヒルら2006年。
- ^ Vilar et al 2013.
- ^ ペンら2011年。
- ^ ab Soares 他、2008、p. 1213。
- ^ Tabbada et al 2010、29ページ。
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- Hill, Catherine; Soares, Pedro; Mormina, Maru; Macaulay, Vincent; Clarke, Dougie; Blumbach, Petya B.; Vizuete-Forster, Matthieu; Forster, Peter; Bulbeck, David; Oppenheimer, Stephen; Richards, Martin (2007). 「東南アジア島嶼部のミトコンドリア層序」. American Journal of Human Genetics . 80 (1): 29–43. doi :10.1086/510412. PMC 1876738. PMID 17160892 .
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外部リンク
- 一般的な
- マニス・ヴァン・オーヴェンのフィロツリー
- ハプログループE
- イアン・ローガンのハプログループ E
- イアン・ローガンのハプログループ E1
- イアン・ローガンのハプログループ E1a1b
- イアン・ローガンのハプログループ E1a2
- イアン・ローガンのハプログループ E2
- YFull MTree のハプログループ E
- MITOMAPのハプログループE
- FamilyTreeDNA の mtDNA ハプロツリー: ハプログループ E
- Ballinger, SW; Schurr, TG; Torroni, A.; Gan, YY; Hodge, JA; Hassan, K.; Chen, KH; Wallace, DC (1992). 「東南アジアのミトコンドリア DNA 分析により古代モンゴロイド移住の遺伝的連続性が明らかに」.遺伝学. 130 (1): 139–152. doi :10.1093/genetics/130.1.139. PMC 1204787. PMID 1346259 .
- Herrnstadt, C.; Elson, JL; Fahy, E.; et al. (2002). 「主要なアフリカ、アジア、ヨーロッパのハプログループの完全なミトコンドリア DNA コーディング領域配列の縮小中央値ネットワーク解析」。American Journal of Human Genetics。70 ( 5 ): 1152–1171。doi :10.1086/339933。PMC 447592。PMID 11938495。
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- Stoneking, M.; Jorde, LB; Bhatia, K.; Wilson, AC (1990). 「パプアニューギニアのヒトミトコンドリアDNAの地理的変異」.遺伝学. 124 (3): 717–733. doi :10.1093/genetics/124.3.717. PMC 1203963. PMID 1968873 .