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| HLA-A1 | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| （MHCクラスI、細胞表面抗原） | ||||||||||
 1W72のレンダリング： α（A*01:01遺伝子産物）、β2-ミクログロブリン、およびMAGE-1ペプチド。 | ||||||||||
| について | ||||||||||
| タンパク質 | 膜貫通受容体/リガンド | |||||||||
| 構造 | αβヘテロダイマー | |||||||||
| サブユニット | HLA-A *01--、β 2 -ミクログロブリン | |||||||||
| 古い名前 | HL-A1 | |||||||||
| サブタイプ | ||||||||||
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| 希少対立遺伝子 | ||||||||||
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| EBIのIMGT/HLAデータベースへの対立遺伝子のリンク | ||||||||||
HLA-A1 (A1) は、HLA-A 「A」血清型グループ内のヒト白血球抗原 血清型です。血清型は、HLA-A α鎖のα1サブセットの抗体認識によって決定されます。A1の場合、α「A」鎖はHLA-A *01アレルグループによってコード化され、β鎖はB2M遺伝子座によってコード化されます。[1]このグループは現在、A*01:01が優勢です。A1とA *01は意味がほぼ同義です。A1は他の地域よりもヨーロッパで一般的であり、北西ヨーロッパの古代人によく見られていたと思われる長いハプロタイプの一部です。A1はAH8.1ハプロタイプの頻繁な構成要素です。A1血清型陽性は、免疫系が関与していると考えられる多数の炎症性疾患および状態に大まかに関連しています。 AH8.1 ハプロタイプ内での連鎖のため、多くの研究で A1 または A1,B8 との関連性が示されましたが、後にクラス II 領域遺伝子アレル、DR3 および DQ2.5 への関連性のドリフトが示されました。感染症における A1 の役割は明らかではありませんが、ハプロタイプの A1 領域内では HIV の感染率との何らかの連鎖が残っています。
血清型
これまでのすべての事例において、HLA-A1 は疾患と関連していることがわかっていますが、より大きなハプロタイプ上の A1 遺伝子付近の他の遺伝子対立遺伝子と比較して HLA-A1 が優勢な遺伝的リスクを持つことを定義しているものはほとんどありません。
A1と自己免疫疾患
「HL-A」抗原が初めて説明されたとき、 A1 血清型は多くの疾患と関連していました。HLA A1 と B8 は共通して関連していることが判明したため、その関連は急速に「HL-A8」 HLA-B8にまで拡大しました。DRw3 が特徴付けられるにつれて、自己免疫リスクはクラス II 領域へと移行しました。
A1-B58ハプロタイプ（B58が優勢なA1-B17）は、抗好中球細胞質抗体（ANCA）と関連している可能性がある[3]
糖尿病におけるA1
1型糖尿病を除いて、DR3およびDQ2遺伝子が特徴付けられるにつれて、A1と自己免疫疾患との直接的な関連性を示す証拠のほとんどは消滅しました。1型糖尿病はHLA A1-B8-DR3-DQ2ハプロタイプで広範な関連性を示していますが、関連性はHLA-B遺伝子座を超えて広がっていないようです。[4] DR3-DQ2/DR4-DQ8表現型に関する最近の研究では、A1-cw7-B8は実際には他のAB型と比較して予想よりも低いことがわかりました。これは、リスク関連遺伝子がB8とDR3の間にあることを示しています。しかし、別の研究では、A*01:01は1型糖尿病のリスクを変化させるようです。ただし、Cw7-B8は変化させないようです。[5] 1型糖尿病の例は、連鎖解析のみを使用してリスクを解読することの本質的な難しさを示しています。
A1とアレルギー疾患、過敏症
HLA の研究の初期段階で、アレルギー疾患における HL A1、B8 の関連性が見つかり、これらは拡張された HLA A1-B8 領域にリンクしていることがわかりました。
奇妙なことに、A1はメトトレキサート誘発性肝硬変とも関連していることが判明しました。[6]一方、A1は炭鉱労働者塵肺症やハンセン病などの他の疾患とは負の関連があることが判明しました。[7] [8] [9]
A1と感染症
初期の研究では、A1はいくつかの感染症と関連しているか、または感染症から保護していることが判明しました。[10] [11] [12] A1と関連していることが判明したいくつかの疾患は、実際には拡張されたA1-B8ハプロタイプに関連しており、ウイルス誘発性肝炎やHIVの進行の加速などがその例です。
A1とB8の併用は麻疹感染リスクの増加を示したが[13]、有意性は一貫していなかった。[14]最近の論文では、A*01:01と麻疹ワクチンに対する平均より低い反応との関連が示された。[15]風疹の場合、A1-B8は母親からの感染の結果として感染した人々に多く見られた。[16] A1は口囲ヘルペス とも関連していることが判明した。[10] A1と口唇ヘルペスの関連も説明された。[17]その後、単純ヘルペスとの関連も示された。[18]
リンパ腫におけるA1
ホジキンリンパ腫ではHLA-A1 [19]が高いが、DR3は高くは見られなかった[20]。A1 -B8-DR3-DQ2ハプロタイプは腸管疾患関連T細胞リンパ腫との関連が知られており、患者の約70％は少なくとも1つのDR3-DQ2のコピーを持つDQ2のホモ接合体である。
対立遺伝子
| 研究対象集団 | 頻度 （％）[21] |
|---|---|
| アイルランド南部 | 25.0 |
| イングランド ランカスター | 21.5 |
| ウェールズ | 21.1 |
| アイルランド北部 | 20.2 |
| イングランド シェフィールド | 19.7 |
| イングランド リバプール | 19.4 |
| イングランド ニューカッスル | 19.3 |
| スペイン バスク アラティア ヴァッレ… | 19.2 |
| イングランド リーズ | 19.1 |
| イングランド マンチェスター | 18.9 |
| オーストラリア ニューサウスウェールズ州 | 18.7 |
| オーストラリア西部 | 18.5 |
| スコットランド オークニー | 17.0 |
| 南アフリカ ナタール タミル | 17.0 |
| ベルギー | 15.5 |
| イタリア北部 (1) | 15.4 |
| イスラエルのユダヤ人 | 15.2 |
| フランス南東部 | 15.0 |
| ドイツのエッセン | 14.4 |
| ロシア アルハンゲリスク ポモール | 14.0 |
| ナドル・メタルサ（ベルベル語） | 13.7 |
| スウェーデン ストックホルム | 13.6 |
| スペイン バスク ギプスコア プロ… | 13.5 |
| ブルキナファソ フラニ語 | 13.3 |
| パキスタン シンディー語 | 13.3 |
| セルビア | 13.2 |
| ポルトガルセンター | 13.0 |
| スウェーデン ウプサラ県 | 13.0 |
| チェコ共和国 | 12.7 |
| インド アーンドラ・プラデーシュ州 ゴル… | 12.5 |
| イスラエル ガザ パレスチナ人 | 12.4 |
| インド ムンバイ マラーター | 12.3 |
| チュニジア | 12.3 |
| アルジェリア1 | 12.3 |
| ルーマニア語 | 12.2 |
| イタリア | 12.1 |
| ロシア北西部 | 11.9 |
| ケニア・ナンディ | 11.8 |
| スペイン 東アンダルシア | 11.4 |
| マケドニア (4) | 11.3 |
| チュニジア | 11.2 |
| トルコ（I） | 10.9 |
| スペイン 北カンタブリア | 10.8 |
| ギリシャ北部 | 10.0 |
| クロアチア | 9.7 |
| イタリア 南カンパニア | 9.7 |
| ギリシャ (3) | 9.2 |
| ブラジル | 9.1 |
| フィンランド | 8.9 |
| サウジアラビア | 8.7 |
| スペイン カタルーニャ ジローナ | 8.6 |
| パキスタン カラチ パルシー | 8.3 |
| ウガンダ カンパラ | 8.3 |
| モンゴル ハルハ | 8.0 |
| ヨルダン アンマン | 7.9 |
| スペイン北部 カブエルニゴ | 7.6 |
| ケニア・ルオ | 7.4 |
| ブルガリア | 7.3 |
| ロシア チュヴァシ | 7.3 |
| オマーン | 7.2 |
| シンガポール ジャワ インドネシア… | 7.0 |
| ジョージア トビリシ クルド人 | 6.7 |
| フランス コルシカ島 | 6.5 |
| ジョージア トビリシ ジョージア… | 5.7 |
| ジョージア スヴァネティ スヴァンス | 5.6 |
| 中国 青海 恵 | 5.5 |
| オーストラリアのアボリジニ ケープ… | 5.3 |
| スーダン人 | 5.0 |
| イタリア サルデーニャ島(3) | 4.5 |
| ロシア ムルマンスク サオミ | 4.0 |
| スペイン パスバレー | 3.8 |
| ザンビア ルサカ | 3.5 |
| ブルキナファソ リマイベ | 3.2 |
| シンガポール リアウ マレー語 | 3.2 |
| ケニア | 3.1 |
| ロシア ネネツ | 3.1 |
| カメルーン バコラ ピグミー | 3.0 |
| タイ | 2.8 |
| オーストラリアのアボリジニグルー… | 2.7 |
| セネガル ニオホロ・マンデンカ | 2.7 |
| カメルーン バミレケ | 2.6 |
| インド ジャルパイグリ トト | 2.5 |
| 中国 上海 | 2.4 |
| タイ北東部 | 2.4 |
| 対立遺伝子頻度のみ提示 | |
| 研究対象集団 | 頻度 （％）[21] |
|---|---|
| インド 北デリー | 3.3 |
| ケニア・ナンディ | 2.7 |
| カーボベルデ南東部I… | 1.6 |
| セネガル ニオホロ・マンデンカ | 1.6 |
| マリ バンディアガラ | 1.1 |
| チュニジア | 1.0 |
| ギニアビサウ | 0.8 |
| マデイラ | 0.8 |
| アメリカ合衆国アフリカ系アメリカ人 (3) | 0.7 |
| アルゼンチン トバ・ロサリオ | 0.6 |
| アメリカ ヒスパニック | 0.6 |
| ケニア・ルオ | 0.4 |
| カメルーン ベティ | 0.3 |
| ロシア トゥヴァ (2) | 0.3 |
| ウガンダ カンパラ | 0.3 |
| 対立遺伝子頻度のみ提示 | |
| 研究対象集団 | 頻度 （％）[21] |
|---|---|
| イスラエル・アシュケナージと非… | 2.1 |
| ケニア・ナンディ | 1.7 |
| スーダン人 | 1.5 |
| ケニア | 0.7 |
| サウジアラビア グライアットと… | 0.7 |
| イラン・バローチ | 0.6 |
| 広東省梅州漢 | 0.5 |
| 中国 北京 石家荘… | 0.2 |
| 対立遺伝子頻度のみ提示 | |
A*01:01 によってもたらされる疾患リスクのほとんどは、A1 血清型リスクまたは A1-B8 血清型リスクのいずれかによって表されます (ヨーロッパでは、A1-B8 はほとんどの場合 A*01:01 と B*08:01 で構成されています)。他のアレルである A*01:02 と A*01:03 は、特定のリスクをもたらす可能性があります。たとえば、A*01:02 は、鎌状赤血球貧血の子供によく見られるタイプの脳卒中と関連していることがわかりました。[22]
米国内のソマリア人コミュニティでは、A1 保有者の 2/3 が A*01:03 アイソフォームを持っているという報告があります。
A1-Bハプロタイプ
- A1-B8西アイルランド、北アイルランド、スコットランド、ウェールズ、北西イングランド、スカンジナビア、ユーゴスラビア、ロシア、....
- A1-B7 アルメニア、オーストリア、北西ヨーロッパ（A1-B8 と A2/A3-B7 の地域的組み換え）
- A1-B13 ウラ語
- A1-B35 (アルバニア、ベルギー、イタリア、ギリシャ、フランス - 東地中海起源)
- A1-B37 ヤクート人、部族インド人、アイヤーズインド人、モンゴル人、インド人、オロチョン人、ルーマニア人、ユーゴスラビア人、韓国人、アルバニア人、フランス人、ドイツ人、満州人
- A1-B51 ユーゴスラビア、ドイツ、イベリア、イタリア
- A1-B52 バルガヴァス インド、部族インド、イタリア、イベリア半島、フランス
- A1-B57 (ディスカッションページの表を参照)
- A1-B58 (ディスカッションページの表を参照)
参考文献
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