FLRT3

FLRT3
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	5CMN、5CMP
識別子
エイリアス	FLRT3、HH21、フィブロネクチンロイシンリッチ膜タンパク質3
外部ID	オミム：604808; MGI : 1918686;ホモロジーン: 8322;ジーンカード：FLRT3; OMA :FLRT3 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体20（ヒト）
終わり	14,337,614 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	染色体2（マウス）
終わり	140,513,389 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	内皮細胞; ; 肺の下葉; ; 心膜; ; ブロードマン領域23; ; 中側頭回; ; 腎髄質; ; 臓側胸膜; ; 胚上皮; ; 小腸粘膜; ; 毛包;
	トップの表現
	性器結節; ; 手; ; 腹壁; ; 胎児の尾; ; 毛包; ; 下顎突出; ; 耳石器官; ; 神経節隆起; ; 上顎突出; ; 嗅結節;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	タンパク質高分子アダプター活性; タンパク質ホモ二量体化活性; 線維芽細胞増殖因子受容体結合; タンパク質キナーゼ阻害活性; タンパク質結合; 化学忌避活性;
細胞成分	細胞質; 軸索末端; 膜の不可欠な構成要素; シナプス膜; 細胞投影; 小胞体膜; 膜; 細胞間結合; 焦点接着; 軸索成長円錐; 細胞膜の不可欠な構成要素; 細胞外領域; 軸索; 小胞体; 細胞外空間; 細胞質; 細胞膜; 細胞接合; 細胞外マトリックス; グルタミン酸シナプス; シナプス後膜の不可欠な構成要素;
生物学的プロセス	負の走化性; タンパク質キナーゼ活性の負の調節; サイトカインを介したシグナル伝達経路; 頭部の発達; ニューロン投影拡張; 軸索誘導; 多細胞生物の発達; 心臓の発達; 細胞接着; 軸索損傷に対する反応; 胚の形態形成; 心膜の形態形成に関与する心外膜前細胞の移動; シナプスの組み立て; ニューロン投射の発達; JAK-STATを介した受容体シグナル伝達経路の負の制御; シナプス形成の正の調節; 線維芽細胞増殖因子受容体シグナル伝達経路; 細胞膜接着分子を介した細胞間接着; シナプス膜接着;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	23767
	71436
	ENSG00000125848
	ENSMUSG00000051379
	翻訳:
	Q8BGT1
	NM_013281 ; NM_198391
	NM_001172160 ; NM_178382
	NP_037413 ; NP_938205
	NP_001165631 ; NP_848469
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

ロイシンリッチリピート膜貫通タンパク質FLRT3は、ヒトではFLRT3遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]

FLRT1、FLRT2 、FLRT3はフィブロネクチンロイシンリッチ膜タンパク質（FLRT）ファミリーのメンバーです。これらは細胞接着や受容体シグナル伝達に機能する可能性があります。これらのタンパク質構造は、細胞外マトリックスに見られる小さなロイシンリッチプロテオグリカンに似ています。FLRT3は、FLRT1と55％のアミノ酸配列同一性、FLRT2と44％の同一性を共有しています。FLRT3は、腎臓、脳、膵臓、骨格筋、肺、肝臓、胎盤、心臓で発現しています。この遺伝子には、同じタンパク質をコードする2つの選択的スプライシング転写バリアントが記載されています。^[6]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000125848 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000051379 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Lacy SE、Bonnemann CG、Buzney EA、Kunkel LM (2000 年 3 月)。「FLRT1、FLRT2、FLRT3 の同定: 膜貫通ロイシンリッチリピートタンパク質の新規ファミリー」。Genomics . 62 ( 3): 417– 26. doi :10.1006/geno.1999.6033. PMID 10644439。
^ ab 「Entrez Gene: FLRT3 フィブロネクチンロイシンリッチ膜貫通タンパク質 3」。

さらに読む

Otsuki T, Ota T, Nishikawa T, et al. (2007). 「オリゴキャップ cDNA ライブラリーから分泌タンパク質または膜タンパク質をコードする全長ヒト cDNA を選択するためのシリコでのシグナル配列とキーワードトラップ」。DNA Res . 12 (2): 117– 26. doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID 16303743。
Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
太田孝文、鈴木勇、西川孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
Clark HF、Gurney AL、Abaya E、他 (2003)。「分泌タンパク質発見イニシアチブ (SPDI)、新規ヒト分泌タンパク質および膜貫通タンパク質を同定するための大規模な取り組み: バイオインフォマティクス評価」。Genome Res . 13 (10): 2265–70 . doi :10.1101/gr.1293003. PMC 403697 . PMID 12975309。
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932.
Deloukas P、 Matthews LH、Ashurst J、他 (2002)。「ヒト染色体20のDNA配列と比較分析」。Nature . 414 ( 6866 ): 865– 71。Bibcode :2001Natur.414..865D。doi : 10.1038/414865a。PMID 11780052。
永瀬剛、菊野亮、石川健、他 (2000)。「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。XVII。in vitroで巨大タンパク質をコードする脳由来の100個の新しいcDNAクローンの完全配列」。DNA Res . 7 (2): 143– 50. doi : 10.1093/dnares/7.2.143 . PMID 10819331。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000125848 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000051379 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid10644439-5] Lacy SE、Bonnemann CG、Buzney EA、Kunkel LM (2000 年 3 月)。「FLRT1、FLRT2、FLRT3 の同定: 膜貫通ロイシンリッチリピートタンパク質の新規ファミリー」。Genomics . 62 ( 3): 417– 26. doi :10.1006/geno.1999.6033. PMID 10644439。

[entrez-6] 「Entrez Gene: FLRT3 フィブロネクチンロイシンリッチ膜貫通タンパク質 3」。