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| FA114A1 型番 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | FAM114A1、Noxp20、配列類似性114のメンバーA1を持つファミリー | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | MGI : 1915553; HomoloGene : 12259; GeneCards : FAM114A1; OMA :FAM114A1 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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タンパク質FAM114A1は神経系過剰発現タンパク質20（NOXP20）としても知られ、ヒトではFAM114A1遺伝子によってコードされるタンパク質です。[4] FAM114A1の相同遺伝子は、ショウジョウバエのよう にホモサピエンスから分類学的に遠い生物に見られます。しかし、予想どおり、ヒトのFAM114A1は他の相同遺伝子よりも霊長類のFAM114A1に似ています。FAM114A1には1つの相同遺伝子FAM114A2があり、これも機能が不明なタンパク質をコードしています。
遺伝子
FAM114A1はヒトの第4染色体短腕（4.p14）の順方向鎖に位置し、塩基対38869354から始まり、38947365で終わる。 [4] mRNAは4138 bpである。この遺伝子は同じ染色体上に以下の隣接遺伝子を持つ。
- TLR1：Toll様受容体（TLR）1は、病原体の認識と自然免疫の活性化に役割を果たします。
- TLR6：Toll様受容体（TLR）6は、病原体の認識と自然免疫の活性化に役割を果たします。
- TMEM156: この遺伝子は膜貫通タンパク質をコードします。
- KLHL5：ケルチ様5、そのタンパク質はリンパ球の活性化に役割を果たすと考えられている。[5]
相同性
表現
NOXP20は脳で過剰発現しており、[6] Allen Brain Atlasを使用したマイクロアレイデータ[7]がその発現の証拠を示しています。NCBI GEO Profile [8]のデータによると、FAM114A1は脳で発現していますが、その発現は神経組織を超えて人体のほとんどの組織タイプに及んでいます。GEO Profilesはまた、FAM114A1が未分化幹細胞よりも間葉系幹細胞でより多く発現していることも示しています。さらなる実験[8]により、FAM114A1の発現に影響を与える特定の要因があることが示されています。一例は、CLDN-1の過剰発現とFAM114A1の過剰発現との直接的な関係です。
タンパク質
NOXP20 は 563 個のアミノ酸から構成され、重量は 60742 Da、等電点は 4.415999 です。このタンパク質の詳細についてはほとんどわかっていませんが、タンパク質の構造と機能については多くの科学的予測があります。他のタンパク質と同様に、このタンパク質は翻訳後修飾を受けます。実際に起こっていることが証明されている修飾は、タンパク質のアミノ酸 196 と 199 の 2 つの リン酸化です。
構造
タンパク質の二次構造を予測するツールはいくつかあります。それらのツールの結果を組み合わせたツールの1つが、SDSC Biology WorkBenchのPELEです。[9]このツールによると、タンパク質の二次構造は主にアルファヘリックスとコイルで構成され、その周囲にいくつかのベータストランドがあります。
インタラクション
FAM114A1タンパク質が人体の他のタンパク質と相互作用するという証拠はありません。しかし、マウスではFAM114A1とCDGSH鉄硫黄ドメイン2の相互作用が検出されました。[10] 2つの種（ホモサピエンスとマウス）のNOXP20のアミノ酸 には77％の同一性と83％の類似性があります。2つの種が密接な関係にあるため、NOXP20はヒトでも同じ相互作用を持つと推測できます。
関数
NOXP20の正確な機能はまだよくわかっていません。しかし、このタンパク質にはカスパーゼリクルートドメインがあるという証拠があります。 [6]カスパーゼがアポトーシスに関与していることがわかっているため、この情報からNOXP20はアポトーシスと細胞増殖の調節に役割を果たしている可能性があると考えられます。
参考文献
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000029185 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ab 「配列類似性114を持つFAM114A1ファミリー、メンバーA1 [ホモサピエンス]」。NCBI 。 2012年4月22日閲覧。
- ^ 「GeneCards」. Genecards . 2012年4月28日閲覧。
- ^ ab Boucquey M、De Plaen E、Locker M、Poliard A、Mouillet-Richard S、Boon T、Kellermann O (2006 年 10 月)。「Noxp20 と Noxp70、初期神経分化の 2 つの新しいマーカーが、奇形癌由来の神経外胚葉前駆細胞で検出された」。Journal of Neurochemistry。99 ( 2 ): 657–69。doi : 10.1111/ j.1471-4159.2006.04093.x。PMID 17029606。
- ^ 「マイクロアレイデータ」。アレン脳科学研究所。 2012年4月28日閲覧。
- ^ ab 「Geo Profiles」。NCBI 。 2012年4月28日閲覧。
- ^ 「Biology Workbench」。SDSC Biology WorkBench 。 2012年4月28日閲覧。
- ^ “String”. STRING9.0 . 2012年4月28日閲覧。