ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
真核生物の開始因子4A-III は、ヒトでは EIF4A3 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6] [7]
関数 この遺伝子は、 DEAD ボックス タンパク質ファミリーのメンバーをコードします 。DEAD ボックスタンパク質は、保存されたモチーフ Asp - Glu - Ala -Asp (DEAD) を特徴とし、推定上の RNA ヘリカーゼ です。これらは、 翻訳開始 、核およびミトコンドリアの スプライシング 、 リボソーム および スプライソソーム の組み立てなど、 RNA 二次構造 の変更を伴う多くの細胞プロセスに関与しています。分布パターンに基づいて、このファミリーの一部のメンバーは、 胚形成 、 精子形成 、および 細胞の成長 と分裂に関与していると考えられています。この遺伝子によってコードされるタンパク質は、 核マトリックスタンパク質です。そのアミノ酸配列は、DEAD ボックスタンパク質ファミリーの他の 2 つのメンバーである 翻訳開始因子 eIF4A-I および eIF4A-II のアミノ酸配列と非常に類似して います。 [7]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000141543 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000025580 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Holzmann K, Gerner C, Poltl A, Schafer R, Obrist P, Ensinger C, et al. (2000 年 2 月). 「真核生物翻訳開始因子 4A と相同性のあるヒト共通核マトリックスタンパク質」. Biochem Biophys Res Commun . 267 (1): 339–44. doi :10.1006/bbrc.1999.1973. PMID 10623621. ^ Chan CC、Dostie J、Diem MD、Feng W、Mann M、Rappsilber J、et al. (2004 年 1 月)。「eIF4A3 はエクソン接合複合体の新規構成要素です」。RNA . 10 ( 2): 200–9. doi :10.1261/rna.5230104. PMC 1370532 . PMID 14730019。 ^ ab "Entrez Gene: EIF4A3 真核生物翻訳開始因子 4A、アイソフォーム 3"。
さらに読む
Nagase T, Miyajima N, Tanaka A, Sazuka T, Seki N, Sato S, et al. (1995). 「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。III. ヒト細胞株 KG-1 からの cDNA クローンの解析により推定された 40 個の新しい遺伝子 (KIAA0081-KIAA0120) のコード配列」 。DNA Res . 2 (1): 37–43. doi : 10.1093/dnares/2.1.37 . PMID 7788527。 Li Q、Imataka H、Morino S、Rogers Jr GW、Richter-Cook NJ、Merrick WC、他（1999年）。 「真核生物の翻訳開始因子 4AIII (eIF4AIII) は、eIF4AI および eIF4AII とは機能的に異なります。」 モル。細胞。バイオル 。 19 (11): 7336–46。 土井 ：10.1128/mcb.19.11.7336。 PMC 84727 。 PMID 10523622。 Jurica MS、Licklider LJ、Gygi SR、Grigorieff N 、 Moore MJ (2002)。「3次元構造解析に適したネイティブスプライソソームの精製と特性評価」。RNA。8 ( 4 ) : 426–39。doi : 10.1017 /S1355838202021088。PMC 1370266。PMID 11991638 。 Lee S, Baek M, Yang H, Bang YJ, Kim WH, Ha JH, et al. (2002). 「cDNA マイクロアレイによる胃癌と正常胃粘膜間で差次的に発現する遺伝子の同定」 Cancer Lett . 184 (2): 197–206. doi :10.1016/S0304-3835(02)00197-0. PMID 12127692. Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、Derge JG、Klausner RD、Collins FS、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ...9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932 。 Palacios IM、Gatfield D 、St Johnston D、Izaurralde E (2004)。「mRNA の局在とナンセンス依存性 mRNA の分解に必要な eIF4AIII 含有複合体」。Nature . 427 ( 6976 ) : 753–7。Bibcode :2004Natur.427..753P。doi : 10.1038/nature02351。PMID 14973490。S2CID 4400243。 Ferraiuolo MA、Lee CS、Ler LW、Hsu JL、Costa-Mattioli M、Luo MJ、et al. (2004)。「核翻訳様因子 eIF4AIII はスプライシング中に mRNA にリクルートされ、ナンセンス変異を介した分解において機能する」。Proc . Natl . Acad. Sci. USA . 101 (12): 4118–23。Bibcode :2004PNAS..101.4118F。doi : 10.1073/pnas.0400933101 . PMC 384704 . PMID 15024115。 渋谷 孝文、丹下 俊一、Sonenberg N、Moore MJ (2004)。「eIF4AIII はエクソンジャンクション複合体でスプライスされた mRNA に結合し、ナンセンス変異を介した分解に必須である」。Nat . Struct. Mol. Biol . 11 (4): 346–51. doi :10.1038/nsmb750. PMID 15034551. S2CID 30171314. Jin J、Smith FD、Stark C、Wells CD、Fawcett JP、Kulkarni S、et al. (2004)。「細胞骨格調節と細胞組織化に関与する生体内14-3-3結合タンパク質のプロテオーム、機能、およびドメインベースの分析」。Curr . Biol . 14 ( 16 ): 1436–50。Bibcode : 2004CBio ...14.1436J。doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051。PMID 15324660。S2CID 2371325 。 Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、Shenmen CM、Grouse LH、Schuler G、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。 Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。 Andersen JS、Lam YW 、Leung AK、Ong SE、Lyon CE、Lamond AI、et al. (2005)。「核小体プロテオームダイナミクス」。Nature . 433 ( 7021 ): 77–83。Bibcode :2005Natur.433 ... 77A。doi : 10.1038/nature03207。PMID 15635413。S2CID 4344740。 Xia Q、Kong XT、Zhang GA、Hou XJ、Qiang H、Zhong RQ (2005)。 「膵臓癌の有望な血清マーカーである新規自己抗原としてのDEADボックスタンパク質48のプロテオミクスに基づく同定」。 生化学。生物物理学。解像度共通 。 330 (2): 526-32。 土井 ：10.1016/j.bbrc.2005.02.181。 PMID 15796914。 Ballut L、Marchadier B、Baguet A、Tomasetto C、Séraphin B、Le Hir H (2005)。「エクソンジャンクションコア複合体は、eIF4AIII ATPase活性の阻害によりRNAに固定される」。Nat . Struct. Mol. Biol . 12 (10): 861–9. doi :10.1038/nsmb990. PMID 16170325. S2CID 1359792. Rual JF、Venkatesan K、Hao T、Hirozane-Kishikawa T、Dricot A、Li N、et al. (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature。437 ( 7062 ) : 1173–8。Bibcode : 2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038 /nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。 Gehring NH、Kunz JB、Neu-Yilik G、Breit S、Viegas MH、Hentze MW、他 (2005)。「エクソンジャンクション複合体の構成要素は、異なる補因子要件を伴うナンセンス媒介 mRNA 分解の異なる経路を指定します」。Mol . Cell . 20 (1): 65–75. doi : 10.1016/j.molcel.2005.08.012 . PMID 16209946。 Andersen CB、Ballut L、Johansen JS、Chamieh H 、 Nielsen KH、 Oliveira CL、他 (2006)。「RNA に結合した捕捉 DEAD ボックス ATPase を持つエクソン ジャンクション コア複合体の構造」。Science。313 ( 5795 ): 1968–72。Bibcode : 2006Sci ...313.1968A。doi : 10.1126/science.1131981。PMID 16931718。S2CID 26409491 。 You KT、Li LS、Kim NG、Kang HJ、Koh KH、Chwae YJ、et al. (2007)。「腫瘍におけるフレームシフト変異由来のmRNAからの切断タンパク質の選択的翻訳抑制」。PLOS Biol . 5 (5): e109. doi : 10.1371/journal.pbio.0050109 . PMC 1854916. PMID 17456004 。 Zhang Z、Krainer AR (2007)。「スプライシングは、eIF4A3 依存性および非依存性のエクソン接合複合体成分のリクルートメントを介してメッセンジャーリボ核タンパク質構造を再構築する」。Proc . Natl. Acad. Sci . USA . 104 (28): 11574–9。Bibcode : 2007PNAS..10411574Z。doi : 10.1073 / pnas.0704946104。PMC 1913901。PMID 17606899 。
