ヒトのタンパク質コード遺伝子
ECHS1 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス ECHS1 、SCEH、ECHS1D、エノイルCoAヒドラターゼ、短鎖、1、ミトコンドリア、エノイルCoAヒドラターゼ、短鎖1、mECH、mECH1 外部ID オミム ：602292; MGI : 2136460; ホモロジーン : 3018; ジーンカード ：ECHS1; OMA :ECHS1 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体7（マウス） [2] バンド 7|7 F4 始める 139,685,623 bp [2] 終わり 139,696,389 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 肝臓の右葉 腎臓尿細管 耳下腺 人間の腎臓 横行結腸粘膜 小腸粘膜 腎髄質 糸球体 心の頂点 後腎糸球体
トップの表現 褐色脂肪組織 右心室 右腎臓 肝臓の左葉 心室の心筋 二腹筋 心室中隔 心筋 副腎 白色脂肪組織
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
タンパク質結合 触媒活性 リアーゼ活性 エノイルCoAヒドラターゼ活性 細胞成分 生物学的プロセス
代謝 脂肪酸代謝プロセス 脂質代謝 脂肪酸のベータ酸化 出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
エノイルコエンザイムAヒドラターゼ短鎖1ミトコンドリア遺伝子は ECHS1 としても知られ 、 ヒト 遺伝子 である。 [5]
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、ミトコンドリア脂肪酸β酸化経路の2番目のステップで機能します。2-トランス-エノイル-コエンザイムA（CoA）中間体のL-3-ヒドロキシアシル-CoAへの水和を触媒します。遺伝子産物は、ヒドラターゼ/イソメラーゼスーパーファミリーのメンバーです。ミトコンドリアマトリックスに局在します。代替転写開始部位を利用する転写バリアントが文献に記載されています。 [5]
構造 ECHS1遺伝子は長さが約11 kbで、8つの エクソン で構成され、エクソンIとVIIIにはそれぞれ5'-非翻訳領域と3'-非翻訳領域が含まれています。 2つの主要な転写開始部位があり、翻訳コドンの62および63 bp上流に位置し、プライマー伸長分析によってマッピングされました。 ECHS1遺伝子の5'フランキング領域はGCに富み、SP1結合モチーフのコピーがいくつか含まれていますが、典型的なTATAボックスやCAATボックスは見当たりません。 Alu繰り返し要素は、キャップ部位を基準とした領域-1052/-770内および イントロン 7で特定されています。 [6] 前駆体ポリ ペプチド には290個の アミノ酸 残基が含まれており、N末端ミトコンドリア標的化ドメイン（1-27、28、29）が不揃いな成熟N末端につながっています。 mRNAは21bpの5'非翻訳配列と391bpの3'非翻訳配列を有する。 [7]
関数 エノイルCoAヒドラターゼ（ECH）は、 脂肪酸代謝の β酸化経路の2番目のステップを触媒します。この酵素は、β-ヒドロキシアシルCoA チオエステルの形成に関与しています。2つの触媒グルタミン酸残基は協調して水分子を活性化すると考えられており、Gly-141は基質活性化に関与していると提案されています。ECHSには2つの強力な 阻害剤 があり 、共有結合付加物の形成を介して酵素を不可逆的に不活性化します。 [8]
臨床的意義 エノイルCoAヒドラターゼ短鎖はSTAT3 と相互作用することが確認されており 、ECHS1はSTAT3のリン酸化を阻害することでSTAT3の活性を特異的に抑制します。 [9] STAT3は、がん遺伝子としても腫瘍抑制因子としても作用します。ECHS1自体は、多くのがん、特に下垂体細胞がん（HCC）の発症に発生することが示されています。 [10] ECHS1の外因性および内因性の両方の形態がHBsに結合し、結果としてアポトーシスを誘導します。これは、ECHS1が将来、HBV関連 肝炎 またはHCC 患者の治療に使用される可能性があることを意味します。 [11]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000127884 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000025465 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ ab 「Entrez 遺伝子：ECHS1 エノイルコエンザイムAヒドラターゼ、短鎖、1、ミトコンドリア」。 ^ Janssen, U; Davis, EM; Le Beau, MM; Stoffel, W (1997). 「ヒトミトコンドリアエノイルCoAヒドラターゼ遺伝子（ECHS1）：構造構成および染色体10q26.2-q26.3への割り当て」。 Genomics . 40 (3): 470–5 . doi :10.1006/geno.1996.4597. PMID 9073515。 ^ 金沢 正之; 大竹 明; 阿部 秀; 山本 聡; 佐藤 勇; 高柳 正; 新見 秀; 森 正; 橋本 哲也 (1993). 「ヒトミトコンドリア短鎖エノイルCoAヒドラターゼcDNAの分子クローニングと配列解析」. 酵素とタンパク質 . 47 (1): 9– 13. doi :10.1159/000468650. PMID 8012501. ^ Agnihotri, G ; Liu, HW (2003). 「エノイルCoAヒドラターゼ。反応、 メカニズム 、阻害」。 バイオオーガニック＆メディシナルケミストリー 。11 (1): 9– 20. doi :10.1016/s0968-0896(02)00333-4。PMID 12467702。 ^ Chang, Y; Wang, SX; Wang, YB; Zhou, J; Li, WH; Wang, N; Fang, DF; Li, HY; Li, AL; Zhang, XM; Zhang, WN (2013). 「ECHS1 は STAT3 と相互作用し、STAT3 シグナル伝達を負に制御する」. FEBS Letters . 587 (6): 607– 13. Bibcode :2013FEBSL.587..607C. doi :10.1016/j.febslet.2013.02.005. PMID 23416296. S2CID 23233213. ^ Zhu, XS; Dai, YC; Chen, ZX; Xie, JP; Zeng, W; Lin, YY; Tan, QH (2013). 「ECHS1 タンパク質発現のノックダウンは Akt 活性の抑制を介して肝細胞癌細胞の増殖を阻害する」。 真 核生物遺伝子発現の批評的レビュー 。23 (3): 275– 82。doi :10.1615/ critreveukaryotgeneexpr.2013007531。PMID 23879543 。 ^ Xiao, CX; Yang, XN; Huang, QW; Zhang, YQ; Lin, BY; Liu, JJ; Liu, YP; Jazag, A; Guleng, B; Ren, JL (2013). 「ECHS1 は HepG2 細胞においてミトコンドリア経路を介してアポトーシスを促進する新規 HBs Ag結合タンパク質として機能する」。Cancer Letters . 330 (1): 67– 73. doi :10.1016/j.canlet.2012.11.030. PMID 23178449.
さらに読む
Hochstrasser DF 、Frutiger S、 Paquet N、他 (1993)。「ヒト肝臓タンパク質マップ：マイクロシークエンシングとゲル比較により確立された参照データベース」。 電気 泳動 。13 ( 12): 992– 1001。doi :10.1002/elps.11501301201。PMID 1286669。S2CID 23518983。 Dawson SJ、White LA (1992)。「シプロフロキサシンによるヘモフィルス・アフロフィルス心内膜炎の治療」。J . Infect . 24 (3): 317– 20. doi :10.1016/S0163-4453(05)80037-4. PMID 1602151。 Li J, Norwood DL, Mao LF, Schulz H (1991). 「バルプロ酸のミトコンドリア代謝」. 生化学 . 30 (2): 388– 94. doi :10.1021/bi00216a012. PMID 1988037. Jackson S、Schaefer J、Middleton B、Turnbull DM (1995)。「ヒト脂肪酸ベータ酸化の新規酵素の特性評価：マトリックス関連ミトコンドリア 2-エノイル-CoA ヒドラターゼ」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 214 (1): 247– 53. doi :10.1006/bbrc.1995.2281. PMID 7669045。 金沢 正之、大竹 明、阿部 秀、他 (1994)。「ヒトミトコンドリア短鎖エノイルCoAヒドラターゼcDNAの分子クローニングと配列解析」 酵素 とタンパク質 。47 (1): 9– 13. doi :10.1159/000468650. PMID 8012501。 Janssen U、Davis EM、Le Beau MM、Stoffel W (1997)。「ヒトミトコンドリアエノイルCoAヒドラターゼ遺伝子（ECHS1）：構造構成と染色体10q26.2-q26.3への割り当て」。ゲノミクス。40 （ 3 ） ： 470–5。doi ： 10.1006 /geno.1996.4597。PMID 9073515 。 Hubbard MJ、McHugh NJ (2001)。「ヒトERp29：単離、一次構造特性評価および2次元ゲルマッピング」。 電気泳動 。21 (17): 3785– 96。doi : 10.1002/1522-2683(200011)21:17<3785::AID- ELPS3785 > 3.0.CO;2-2。PMID 11271497。S2CID 42538820 。 Jiang LQ、Wen SJ、Wang HY、Chen LY (2003)。「酵母ツーハイブリッドシステムを用いたヒト心臓cDNAライブラリー中のカルパインと相互作用するタンパク質のスクリーニング」。 高血圧。Res . 25 (4): 647– 52. doi : 10.1291/hypres.25.647 . PMID 12358155。 Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932. Deloukas P、Earthrowl ME、 Grafham DV 、他 (2004)。「ヒト染色体10のDNA配列と比較分析」。Nature . 429 ( 6990 ): 375– 81。Bibcode :2004Natur.429..375D。doi : 10.1038/nature02462。PMID 15164054 。 Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。 Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。 Bruneel A、Labas V、 Mailloux A、 et al. (2006)。「エトポシド誘導性アポトーシスに適用したヒト臍静脈内皮細胞のプロテオミクス」。 プロテオミクス 。5 ( 15 ): 3876– 84。doi :10.1002/pmic.200401239。PMID 16130169。S2CID 26007149。 Ewing RM、Chu P、Elisma F、他 (2007)。「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」。Mol . Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931 。 Takahashi M, Watari E, Shinya E, et al. (2007). 「ヒト神経膠芽腫細胞におけるミトコンドリア短鎖エノイルCoAヒドラターゼのダウンモジュレーションによるウイルス複製の抑制」 Antiviral Res . 75 (2): 152– 8. doi :10.1016/j.antiviral.2007.02.002. PMID 17395278.
