ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| E2F3 |
|---|
|
| 識別子 |
|---|
| エイリアス | E2F3、E2F-3、E2F転写因子3 |
|---|
| 外部ID | オミム:600427; MGI : 1096340;ホモロジーン: 74413;ジーンカード:E2F3; OMA :E2F3 - オルソログ |
|---|
|
| 遺伝子の位置(マウス) |
|---|
 | | クロ。 | 13番染色体(マウス)[2] |
|---|
| | バンド | 13|13 A3.2 | 始める | 30,090,558 bp [2] |
|---|
| 終わり | 30,170,046 bp [2] |
|---|
|
| RNA発現パターン |
|---|
| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
|---|
| トップの表現 | - 頬粘膜細胞
- ブロードマン領域23
- 中側頭回
- 内皮細胞
- 上腕二頭筋の腱
- 歯肉上皮
- 脛骨
- 軟骨組織
- 臓側胸膜
- 骨髄
|
| | トップの表現 | - 原始的な線
- 下顎突出
- 上顎突出
- 積雲細胞
- 髄質集合管
- 腹壁
- アトリウム
- 胎児の尾
- 毛包
- 性器結節
|
| | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
|
| 遺伝子オントロジー |
|---|
| 分子機能 |
- DNA結合転写因子活性
- DNA結合
- タンパク質結合
- タンパク質二量体化活性
- RNAポリメラーゼII転写調節領域配列特異的DNA結合
- DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
- 配列特異的DNA結合
- DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
- シス調節領域配列特異的DNA結合
- DNA結合転写抑制活性、RNAポリメラーゼII特異的
- 転写因子結合
| | 細胞成分 |
- 核
- 転写制御因子複合体
- RNAポリメラーゼII転写調節因子複合体
- 核質
| | 生物学的プロセス |
- 転写の正の制御、DNAテンプレート
- 脂肪細胞増殖の抑制
- 細胞周期
- RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写開始
- 転写の調節、DNAテンプレート
- 転写、DNAテンプレート
- 細胞集団増殖の正の調節
- RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御
- 血管関連平滑筋細胞のアポトーシス過程の正の調節
- RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御
- 細胞周期の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
|
| オルソログ |
|---|
| 種 | 人間 | ねずみ |
|---|
| エントレズ | | |
|---|
| アンサンブル | | |
|---|
| ユニプロット | | |
|---|
| RefSeq (mRNA) | | |
|---|
NM_001289920 NM_010093 NM_001359994 |
|
|---|
| RefSeq (タンパク質) | | |
|---|
NP_001276849 NP_034223 NP_001346923 |
|
|---|
| 場所 (UCSC) | 6 章: 20.4 – 20.49 Mb | 13章: 30.09 – 30.17 Mb |
|---|
| PubMed検索 | [3] | [4] |
|---|
|
| ウィキデータ |
|
転写因子E2F3は、ヒトではE2F3遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5]
関数
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、転写因子の E2F ファミリーのメンバーです。E2F ファミリーは、細胞周期と腫瘍抑制タンパク質の作用の制御に重要な役割を果たし、小さな DNA 腫瘍ウイルスのトランスフォーミングタンパク質のターゲットでもあります。E2F タンパク質には、ファミリーのほとんどのメンバーに見られる進化的に保存されたいくつかのドメインが含まれています。これらのドメインには、DNA 結合ドメイン、分化制御転写因子タンパク質 (DP) との相互作用を決定する二量体化ドメイン、酸性アミノ酸に富むトランス活性化ドメイン、およびトランス活性化ドメイン内に埋め込まれた腫瘍抑制タンパク質関連ドメインが含まれます。このタンパク質と他の 2 つのメンバーである E2F1 と E2F2 には、追加のサイクリン結合ドメインがあります。このタンパク質は、細胞周期依存的に網膜芽細胞腫タンパク質 pRB に特異的に結合します。マウスの相同遺伝子には選択的遺伝子スプライシングが見られますが、ヒトではまだ報告されていません。[6]
インタラクション
E2F3はTFE3 [7]およびRYBP [8]と相互作用することが示されている。
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000112242 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000016477 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Lees JA、Saito M、Vidal M、Valentine M、Look T、Harlow E、Dyson N、Helin K (1993 年 12 月)。「網膜芽細胞腫タンパク質は E2F 転写因子ファミリーに結合する」。分子細胞生物学。13 ( 12): 7813–25。doi :10.1128/mcb.13.12.7813。PMC 364853。PMID 8246996 。
- ^ 「Entrez Gene: E2F3 E2F転写因子3」。
- ^ Giangrande PH、Hallstrom TC、Tunyaplin C、Calame K、Nevins JR (2003 年 6 月)。「E2F3 転写因子の機能パートナーとしての E ボックス因子 TFE3 の同定」。分子細胞生物学。23 (11): 3707–20。doi : 10.1128 / MCB.23.11.3707-3720.2003。PMC 155231。PMID 12748276。
- ^ Schlisio S、Halperin T、Vidal M 、 Nevins JR ( 2002 年 11 月)。「RYBP を介した YY1 と E2F の相互作用により、E2F 機能の特異性に関するメカニズムが提供される」。EMBO Journal。21 ( 21): 5775–86。doi : 10.1093 / emboj/cdf577。PMC 131074。PMID 12411495。
さらに読む
- 野村直人、長瀬哲也、宮島直人、佐塚哲也、田中亜人、佐藤真治、関直也、瓦林裕治、石川和人、田畑真司 (1995)。 「未確認のヒト遺伝子のコード配列の予測。II. ヒト細胞株 KG-1 の cDNA クローンの分析によって推定された 40 個の新しい遺伝子 (KIAA0041 ~ KIAA0080) のコード配列」。DNA 研究。1 (5): 223–9。土井:10.1093/dnares/1.5.223。PMID 7584044。
- Wu CL、Zukerberg LR、Ngwu C、Harlow E、Lees JA (1995 年 5 月)。「E2F と DP ファミリータンパク質の生体内関連」。分子細胞生物学。15 ( 5): 2536–46。doi :10.1128/mcb.15.5.2536。PMC 230484。PMID 7739537 。
- Karlseder J 、 Rotheneder H、Wintersberger E (1996 年 4 月)。「Sp1 と成長および細胞周期によって制御される転写因子 E2F との相互作用」。分子細胞 生物学。16 (4): 1659–67。doi :10.1128/mcb.16.4.1659。PMC 231152。PMID 8657141。
- Rogers KT、Higgins PD、Milla MM、Phillips RS、Horowitz JM (1996 年 7 月)。「E2F のヘテロ二量体パートナーである DP-2: 生体内で発現した DP-2 タンパク質の同定と特性」。米国 科学アカデミー紀要。93 (15): 7594–9。Bibcode : 1996PNAS ...93.7594R。doi : 10.1073 / pnas.93.15.7594。PMC 38791。PMID 8755520。
- Magae J、Wu CL、Illenye S、Harlow E、Heintz NH (1996 年 7 月)。「ヘテロ二量体パートナーおよび網膜芽細胞腫タンパク質ファミリーメンバーによる DP および E2F 転写因子の核局在」。Journal of Cell Science。109 ( 7): 1717–26。doi :10.1242/ jcs.109.7.1717。PMID 8832394 。
- Hofmann F、Livingston DM (1996 年 4 月)。「G1 終了時の pRbおよびE2F 機能の制御に対する cdk2 および cdk3 の異なる効果」。遺伝子と発達。10 (7): 851–61。doi : 10.1101/ gad.10.7.851。PMID 8846921 。
- Lindeman GJ、Gaubatz S、Livingston DM、Ginsberg D (1997 年 5 月)。「E2F-4 の細胞内局在は細胞周期に依存する」。米国科学アカデミー紀要。94 (10): 5095–100。Bibcode :1997PNAS... 94.5095L。doi : 10.1073 / pnas.94.10.5095。PMC 24637。PMID 9144196 。
- Dynlacht BD、Moberg K、Lees JA、 Harlow E 、 Zhu L (1997 年 7 月)。「サイクリン依存性キナーゼによる E2F ファミリーメンバーの特異的制御」。分子細胞生物学。17 (7): 3867–75。doi : 10.1128/mcb.17.7.3867。PMC 232239。PMID 9199321。
- Pierce AM、Schneider - Broussard R、Philhower JL、Johnson DG (1998 年 7 月)。「E2F ファミリー メンバーの異なる活動: 転写制御における独自の機能」。分子発癌。22 (3): 190–8。doi : 10.1002 /(SICI)1098-2744(199807)22:3<190::AID-MC7>3.0.CO;2- P。PMID 9688145。S2CID 42749241 。
- Humbert PO、Verona R、Trimarchi JM、Rogers C、Dandapani S、 Lees JA (2000 年 3 月)。「E2f3 は正常な細胞増殖に不可欠」。遺伝子 と発達。14 ( 6): 690–703。doi :10.1101/gad.14.6.690。PMC 316459。PMID 10733529。
- Takahashi Y, Rayman JB, Dynlacht BD (2000 年 4 月)。「E2F および pRB ファミリーによるプロモーター結合の in vivo での解析: 異なる E2F タンパク質が活性化と抑制を媒介する」。遺伝子と 発達。14 ( 7): 804–16。doi :10.1101/gad.14.7.804。PMC 316494。PMID 10766737。
- Leone G、Nuckolls F、Ishida S、Adams M、Sears R、Jakoi L、Miron A、Nevins JR (2000 年 5 月)。「新規 E2F3 産物の同定は、Rb タンパク質による抑制の特異性を決定するメカニズムを示唆している」。分子細胞生物 学。20 ( 10): 3626–32。doi :10.1128/MCB.20.10.3626-3632.2000。PMC 85655。PMID 10779352。
- He Y、Armanious MK、Thomas MJ、Cress WD (2000 年 7 月)。「保存された N 末端領域を欠く E2F-3 の代替形態である E2F-3B の同定」。Oncogene . 19 ( 30): 3422–33. doi : 10.1038/sj.onc.1203682 . PMID 10918599。
- Yamochi T, Semba K, Tsuji K, Mizumoto K, Sato H, Matsuura Y, Nishimoto I, Matsuoka M (2001 年 12 月). 「ik3-1/Cables はサイクリン依存性キナーゼ 3 (cdk 3) の基質である」. European Journal of Biochemistry . 268 (23): 6076–82. doi :10.1046/j.0014-2956.2001.02555.x. PMID 11733001.
- Weinmann AS、Yan PS、 Oberley MJ、Huang TH、Farnham PJ (2002 年 1 月)。「クロマチン免疫沈降法と CpG アイランドマイクロアレイ解析を組み合わせたヒト転写因子ターゲットの分離」。 遺伝子と発達。16 ( 2): 235–44。doi :10.1101/gad.943102。PMC 155318。PMID 11799066。
- Ren B、Cam H、Takahashi Y、Volkert T、Terragni J、Young RA、Dynlacht BD (2002 年 1 月)。「E2F は細胞周期の進行を DNA 修復、複製、および G(2)/M チェックポイントと統合します」。 遺伝子と発達。16 ( 2 ): 245–56。doi :10.1101/gad.949802。PMC 155321。PMID 11799067。
- He Y、 Cress WD (2002 年 6 月)。「 E2F -3B はサイクリン A の生理学的標的である」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 26): 23493–9。doi : 10.1074/jbc.M202629200。PMID 11980909。
- Schlisio S、Halperin T、Vidal M 、 Nevins JR (2002 年 11 月)。「 RYBPを介した YY1 と E2F の相互作用は、E2F 機能の特異性に関するメカニズムを提供します」。EMBO ジャーナル。21 ( 21): 5775–86。doi :10.1093 / emboj/cdf577。PMC 131074。PMID 12411495。
外部リンク
- 米国国立医学図書館の医学主題標目表(MeSH)における E2F3+タンパク質、+ヒト
この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。