DPF2

DPF2
利用可能な構造
電子データ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	3IUF
識別子
エイリアス	DPF2、REQ、UBID4、ubi-d4、ダブル PHD フィンガー 2、CSS7、SMARCG2
外部ID	オミム：601671; MGI : 109529;ホモロジーン: 21265;ジーンカード：DPF2; OMA :DPF2 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体11（ヒト）
終わり	65,354,262 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	19番染色体（マウス）
終わり	5,963,038 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	卵母細胞; ; 二次卵母細胞; ; アキレス腱; ; 心室帯; ; 子宮体部; ; 右卵巣; ; 左卵巣; ; 神経節隆起; ; 子宮頸管; ; S状結腸の筋層;
	トップの表現
	胎児の尾; ; 性器結節; ; 網膜の神経層; ; 心室帯; ; 耳小胞; ; 内頸動脈; ; 外頸動脈; ; 原始的な線; ; 胚葉上層; ; レンズ;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	金属イオン結合; RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合; タンパク質結合; 核酸結合; DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的; 転写コリプレッサー活性; ヒストンアセチルトランスフェラーゼ活性; ヒストン結合; H3K9me3 修飾ヒストン結合; リジンアセチル化ヒストン結合;
細胞成分	核; 核質; 細胞内膜で囲まれた細胞小器官; 中心体; 細胞質; 細胞質; ヒストンアセチルトランスフェラーゼ複合体; nBAF複合体;
生物学的プロセス	転写の調節、DNAテンプレート; 転写、DNAテンプレート; アポトーシスシグナル伝達経路; アポトーシスの過程; RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御; クロマチン組織; 神経系の発達; ヒストンのアセチル化; 転写の負の調節、DNAテンプレート; RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御; 骨髄前駆細胞の分化の抑制;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	5977
	19708
	ENSG00000133884
	ENSMUSG00000024826
	Q92785
	Q61103
	NM_006268 ; NM_001330308
	NM_001291078 ; NM_011262
	NP_001317237 ; NP_006259 ; NP_006259.1
	NP_001278007 ; NP_035392
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

ジンクフィンガータンパク質ubi-d4は、ヒトではDPF2遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]

この遺伝子によってコードされるタンパク質は、ジンクフィンガーのような構造モチーフを特徴とするd4ドメインファミリーのメンバーです。このタンパク質は、生存因子の欠乏後のアポトーシス反応に必要な転写因子として機能します。これは、急速な造血細胞の増殖とターンオーバーを制御する役割を果たしていると考えられます。この遺伝子は、多発性内分泌腫瘍形成I型の候補遺伝子と考えられています。これは、多発性副甲状腺、腸膵臓、および下垂体の腫瘍を伴う遺伝性癌症候群です。^[6]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000133884 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000024826 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ ニンキナ NN、メルサロフ IB、クリコバ DA、アリモバコスト MV、シモノバ OB、コロチキン LI、キセレフ SL、ブッフマン VL (2002 年 2 月)。「d4 遺伝子ファミリーの 3 番目のメンバーである Cerd4: ゲノム遺伝子座の発現と構成」。マムゲノム。12 (11): 862–6。土井：10.1007/s00335-001-3039-1。PMID 11845289。S2CID 2149578 。
^ ab 「Entrez Gene: DPF2 D4、亜鉛、およびダブル PHD フィンガーファミリー 2」。

さらに読む

Gabig TG、Mantel PL、Rosli R、Crean CD (1994)。「Requiem: 骨髄細胞のアポトーシスに必須な新規ジンクフィンガー遺伝子」。J . Biol. Chem . 269 (47): 29515–9. doi : 10.1016/S0021-9258(18)43910-5 . PMID 7961935。
Chestkov AV、Baka ID 、 Kost MV、et al . (1997)。「ヒトゲノムのd4遺伝子ファミリー」。ゲノミクス。36 (1): 174–7。doi :10.1006/geno.1996.0440。PMID 8812431 。
Guru SC、Agarwal SK、Manickam P、et al. (1997)。「多発性内分泌腫瘍症タイプ 1 遺伝子座を含む 2.8 Mb 領域の転写マップ」。Genome Res . 7 (7): 725–35. doi :10.1101/gr.7.7.725. PMC 310681. PMID 9253601 。
Gabig TG、Crean CD、Klenk A、et al. (1998)。「Requiem 遺伝子の発現と染色体局在」。Mamm . Genome . 9 (8): 660–5. doi :10.1007/s003359900840. PMID 9680388. S2CID 22559464.
Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
太田孝文、鈴木勇、西川孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
Bouwmeester T、Bauch A、Ruffner H、et al. (2004)。「ヒトTNF-α/NF-κBシグナル伝達経路の物理的および機能的マップ」。Nat . Cell Biol . 6 (2): 97–105. doi :10.1038/ncb1086. PMID 14743216. S2CID 11683986.
Beausoleil SA、Jedrychowski M、 Schwartz D、他 (2004)。「HeLa 細胞核リン酸化タンパク質の大規模特性評価」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 101 ( 33 ) : 12130–5。Bibcode :2004PNAS..10112130B。doi : 10.1073/ pnas.0404720101。PMC 514446。PMID 15302935。
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外部リンク

米国国立医学図書館の医学主題標目表(MeSH)における DPF2+タンパク質、+ヒト

この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000133884 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000024826 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid11845289-5] ニンキナ NN、メルサロフ IB、クリコバ DA、アリモバコスト MV、シモノバ OB、コロチキン LI、キセレフ SL、ブッフマン VL (2002 年 2 月)。「d4 遺伝子ファミリーの 3 番目のメンバーである Cerd4: ゲノム遺伝子座の発現と構成」。マムゲノム。12 (11): 862–6。土井：10.1007/s00335-001-3039-1。PMID 11845289。S2CID 2149578 。

[entrez-6] 「Entrez Gene: DPF2 D4、亜鉛、およびダブル PHD フィンガーファミリー 2」。