ヒトのタンパク質コード遺伝子
| DDX11 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | DDX11、CHL1、CHLR1、KRG2、WABS、DEAD/Hボックスヘリカーゼ11 |
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| 外部ID | オミム:601150; MGI : 2443590;ホモロジーン: 68973;ジーンカード:DDX11; OMA :DDX11 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 17番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 17|17 E1.1 | 始める | 66,430,515 bp [2] |
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| 終わり | 66,459,169 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 横行結腸粘膜
- 膵臓の体
- 左卵巣
- 子宮体部
- 右卵巣
- 心の頂点
- リンパ節
- 左精巣
- 心室帯
- 脾臓
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| | トップの表現 | - 一次卵母細胞
- 手
- 精母細胞
- 二次卵母細胞
- パネートセル
- 受精卵
- 胚葉上層
- 心室帯
- 胎児の尾
- 腎小体
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- 4鉄、4硫黄クラスター結合
- ヌクレオチド結合
- ヘリカーゼ活性
- 鉄硫黄クラスター結合
- 金属イオン結合
- 一本鎖DNA結合
- リン酸無水物中の酸無水物に作用する加水分解酵素活性
- タンパク質結合
- RNA結合
- 核酸結合
- 二本鎖DNA結合
- 加水分解酵素活性
- ATP結合
- DNA結合
- クロマチン結合
- DNA複製起点結合
- 一本鎖RNA結合
- DNAヘリカーゼ活性
- ATP依存性活性、DNAに作用する
- ATP依存性活性、RNAに作用する
- 三重鎖DNA結合
- G四重鎖DNA結合
| | 細胞成分 |
- 核小体
- 細胞外エクソソーム
- 核
- スピンドルポール
- 原線維中心
- 核質
- 染色体
- 細胞質
- 中心体
- 微小管形成中心
- 細胞骨格
- 胴体
- 有糸分裂コヒーシン複合体
- Ctf18 RFC類似複合体
| | 生物学的プロセス |
- 姉妹染色分体凝集
- IRE1を介した未折り畳みタンパク質応答
- ウイルスプロセス
- 核酸塩基含有化合物の代謝プロセス
- DNA複製
- DNA修復
- 転写、DNAテンプレート
- 転写の調節、DNAテンプレート
- DNA損傷刺激に対する細胞反応
- 多細胞生物の発達
- レプリケーションフォーク処理
- エンドデオキシリボヌクレアーゼ活性の正の調節
- タンパク質結合の負の調節
- DNA二重鎖の解離
- クロマチン結合の正の制御
- G四重鎖DNAの巻き戻し
- 姉妹染色分体接着の正の調節
- ヒドロキシウレアに対する細胞反応
- シスプラチンに対する細胞反応
- RNAポリメラーゼIによる核小体の大きなrRNAの転写の正の制御
- ブレオマイシンに対する細胞反応
- 核小体クロマチン組織
- 二本鎖切断修復の正の制御
- 姉妹染色分体接着の確立
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | NM_001257144 NM_001257145 NM_004399 NM_030653 NM_030655
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NM_152438 |
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NM_001003919 NM_001348292 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001244073 NP_001244074 NP_004390 NP_085911 NP_689651 |
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NP_001003919 NP_001335221 |
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| 場所 (UCSC) | 12章: 31.07 – 31.1 Mb | 17章: 66.43 – 66.46 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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おそらくATP依存性RNAヘリカーゼDDX11は、ヒトではDDX11遺伝子によってコードされる酵素である。[5]
DEAD ボックスタンパク質は、保存されたモチーフ Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD) を特徴とし、推定上のRNA ヘリカーゼです。これらは、翻訳開始、核およびミトコンドリアのスプライシング、リボソームおよびスプライソソームの組み立てなど、 RNA の二次構造の変化を伴う多くの細胞プロセスに関与しています。分布パターンに基づいて、このファミリーの一部のメンバーは、胚形成、精子形成、および細胞の成長と分裂に関与していると考えられています。この遺伝子は、 ATPaseと DNA ヘリカーゼの両方の活性を持つ酵素である DEAD ボックスタンパク質をコードしています。この遺伝子は酵母CHL1遺伝子のホモログであり、染色体伝達の忠実性とゲノムの安定性を維持する機能を果たしている可能性があります。選択的スプライシングにより、異なるアイソフォームをコードする複数の転写バリアントが生成されます。[5]
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000013573 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000035842 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ab "Entrez Gene: DDX11 DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) ボックスポリペプチド 11 (CHL1 様ヘリカーゼホモログ、S. cerevisiae)"。
さらに読む
- Baens M、Aerssens J、van Zand K 他(1996年)。 「ヒト染色体 12p cDNA の単離と領域割り当て」。ゲノミクス。29 (1): 44–52。土井:10.1006/geno.1995.1213。PMID 8530100。
- Frank S、Werner S (1996)。「酵母CHL1遺伝子のヒト相同遺伝子は、新しいケラチノサイト増殖因子調節遺伝子である」。J . Biol. Chem . 271 (40): 24337–40. doi : 10.1074/jbc.271.40.24337 . PMID 8798685。
- Amann J、Valentine M、Kidd VJ、Lahti JM (1997)。「chi1関連ヘリカーゼ遺伝子のヒト染色体領域12p11および12p13への局在:これらの遺伝子の一部と保存されたヒトテロメア関連DNAとの類似性」。Genomics。32 (2): 260–5。doi :10.1006/geno.1996.0113。PMID 8833153 。
- Amann J、Kidd VJ、Lahti JM (1997)。「酵母染色体伝達忠実性遺伝子CHL1の推定ヒト相同遺伝子の特性」。J . Biol. Chem . 272 (6): 3823–32. doi : 10.1074/jbc.272.6.3823 . PMID 9013641。
- Hirota Y, Lahti JM (2000). 「新規ヒト DNA ヘリカーゼ hChlR1 の酵素活性の特性」Nucleic Acids Res . 28 (4): 917–24. doi :10.1093/nar/28.4.917. PMC 102573 . PMID 10648783.
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Vasa-Nicotera M、Brouilette S、Mangino M、他 (2005)。「ヒトのテロメア長を決定する主要遺伝子座のマッピング」。Am . J. Hum. Genet . 76 (1): 147–51. doi :10.1086/426734. PMC 1196417. PMID 15520935 .
- Parish JL、Rosa J、Wang X、et al. (2007)。「DNA ヘリカーゼ ChlR1 は哺乳類細胞における姉妹染色分体接着に必要である」。J . Cell Sci . 119 (Pt 23): 4857–65. doi :10.1242/jcs.03262. PMID 17105772. S2CID 26412273.
- Parish JL、Bean AM、Park RB、Androphy EJ (2007)。「ChlR1 はパピローマウイルス E2 を有糸分裂染色体にロードし、ウイルスゲノムを維持するために必要である」。Mol . Cell . 24 (6): 867–76. doi : 10.1016/j.molcel.2006.11.005 . PMID 17189189。