ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| ＤＤＸ１０ |
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| 利用可能な構造 |
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| ＰＤＢ | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | DDX10、HRH-J8、DEADボックスヘリカーゼ10、Dbp4 |
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| 外部ID | オミム：601235; MGI : 1924841;ホモロジーン: 20922;ジーンカード：DDX10; OMA :DDX10 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置（マウス） |
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 | | クロ。 | 9番染色体（マウス）[2] |
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| | バンド | 9|9 A5.3 | 始める | 53,009,935 bp [2] |
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| 終わり | 53,159,353 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス（相同遺伝子） |
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| トップの表現 | - 腓骨神経
- 睾丸
- アキレス腱
- 右精巣
- 左精巣
- 生殖腺
- 神経節隆起
- 心室帯
- 腎臓尿細管
- 左子宮管
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| | トップの表現 | - 胎児の尾
- 耳板
- 球形嚢
- 性器結節
- 生殖腺隆起
- 胚葉上層
- 原始的な線
- 耳小胞
- 毛包
- 上顎突出
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- RNAヘリカーゼ活性
- ヌクレオチド結合
- 加水分解酵素活性
- ATP結合
- ヘリカーゼ活性
- 核酸結合
- RNA結合
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス | | | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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おそらくATP依存性RNAヘリカーゼDDX10は、ヒトではDDX10遺伝子によってコードされる酵素である。[5] [6]
DEAD ボックスタンパク質は、保存されたモチーフ Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD) を特徴とし、推定 RNA ヘリカーゼです。これらは、翻訳開始、核およびミトコンドリアのスプライシング、リボソームおよびスプライソソームの組み立てなど、RNA の二次構造の変化を伴う多くの細胞プロセスに関与しています。分布パターンに基づいて、このファミリーの一部のメンバーは、胚形成、精子形成、および細胞の成長と分裂に関与していると考えられています。この遺伝子は DEAD ボックスタンパク質をコードしており、リボソームの組み立てに関与している可能性があります。この遺伝子と核ポリン遺伝子NUP98の融合は、逆位 11 (p15q22)染色体転座によって、新規または治療関連の骨髄悪性腫瘍の患者に見られます。[6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000178105 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000053289 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Savitsky K、Ziv Y、Bar-Shira A、Gilad S、Tagle DA、Smith S、Uziel T、Sfez S、Nahmias J、Sartiel A、Eddy RL、Shows TB、Collins FS、Shiloh Y、Rotman G (1997 年 1 月)。「11q22-q23 で推定 DEAD ボックス RNA ヘリカーゼをコードするヒト遺伝子 (DDX10)」。Genomics。33 ( 2 ) : 199–206。doi :10.1006/geno.1996.0184。PMID 8660968 。
- ^ ab "Entrez Gene: DDX10 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) ボックスポリペプチド 10".
さらに読む
- Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、et al. (2006)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573。
- Andersen JS 、Lam YW、Leung AK 、他 (2005)。「核小体プロテオームダイナミクス」。Nature . 433 ( 7021 ): 77–83。Bibcode :2005Natur.433...77A。doi : 10.1038/nature03207。PMID 15635413。S2CID 4344740。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Wang SC、Lien HC、Xia W、et al. (2004)。「核チロシンキナーゼ受容体 ErbB-2 による COX-2 プロモーターへの結合とトランス活性化」。Cancer Cell . 6 (3): 251–61. doi : 10.1016/j.ccr.2004.07.012 . PMID 15380516。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Andersen JS、Lyon CE、Fox AH、et al. (2002)。「ヒト核小体の指向性プロテオーム解析」。Curr . Biol . 12 ( 1 ) : 1–11。Bibcode :2002CBio...12....1A。doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9。PMID 11790298。S2CID 14132033。
- Nakao K, Nishino M, Takeuchi K, et al. (2000). 「エトポシド関連骨髄異形成症候群患者における逆位 11 (p15q22) 染色体転座による核ポリン遺伝子 NUP98 と推定 RNA ヘリカーゼ遺伝子 DDX10 の融合」. Intern. Med . 39 (5): 412–5. doi : 10.2169/internalmedicine.39.412 . PMID 10830185.
- Zuber J、Tchernitsa OI、Hinzmann B、et al. (2000)。「RAS 形質転換ターゲットのゲノムワイド調査」。Nat . Genet . 24 (2): 144–52. doi :10.1038/72799. PMID 10655059. S2CID 21887748.
- 池田 孝文、池田 健、佐々木 健、他 (1999)。「NUP98-DDX10 および DDX10-NUP98 融合転写産物を伴う治療関連骨髄異形成症の inv(11)(p15q22) 染色体転座」。Int . J. Hematol . 69 (3): 160–4. PMID 10222653。
- Liang WQ、Clark JA、Fournier MJ (1997)。「酵母U14小核小体RNAのrRNA処理機能は、保存されたRNAヘリカーゼ様タンパク質によって回復できる」。Mol . Cell. Biol . 17 (7): 4124–32. doi :10.1128/mcb.17.7.4124. PMC 232266. PMID 9199348 。
- Arai Y, Hosoda F, Kobayashi H, et al. (1997). 「新規および治療関連骨髄悪性腫瘍のinv(11)(p15q22)染色体転座は、核ポリン遺伝子NUP98と推定RNAヘリカーゼ遺伝子DDX10の融合をもたらす」。Blood . 89 ( 11): 3936–44. doi : 10.1182/blood.V89.11.3936 . PMID 9166830。
