ホモサピエンスで発見された哺乳類タンパク質
| DBT |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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1K8M、1K8O、1ZWV、2COO、3RNM |
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| 識別子 |
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| エイリアス | DBT、BCATE2、BCKAD-E2、BCKADE2、E2、E2B、BCOADC-E2、ジヒドロリポアミド分岐鎖トランスアシラーゼ E2、BCKDH-E2 |
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| 外部ID | オミム: 248610; MGI : 105386;ホモロジーン: 1444;ジーンカード:DBT; OMA :DBT - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体3(マウス)[2] |
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| | バンド | 3 G1|3 50.37 cM | 始める | 116,306,719 bp [2] |
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| 終わり | 116,343,630 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 頬粘膜細胞
- 腎髄質
- 内皮細胞
- 噴門
- 腹側被蓋野
- 乳首
- 幽門
- 三叉神経節
- 外淡蒼球
- 迷走神経下神経節
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| | トップの表現 | - 褐色脂肪組織
- 耳下腺
- 肋間筋
- 肝臓の左葉
- 涙腺
- 胃の上皮
- 網膜色素上皮
- 人間の腎臓
- 右腎臓
- 心室の心筋
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- アシルトランスフェラーゼ活性
- ユビキチンタンパク質リガーゼ結合
- トランスフェラーゼ活性
- ジヒドロリポイルリジン残基(2-メチルプロパノイル)トランスフェラーゼ活性
- アセチルトランスフェラーゼ活性
- リポ酸結合
| | 細胞成分 |
- ミトコンドリアマトリックス
- ミトコンドリアα-ケトグルタル酸脱水素酵素複合体
- ミトコンドリア核様体
- ミトコンドリア
- 細胞質
| | 生物学的プロセス | | | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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ミトコンドリアの分岐鎖α-ケト酸脱水素酵素複合体のリポアミドアシルトランスフェラーゼ成分は、ヒトではDBT遺伝子によってコードされる酵素である。[5] [6] [7]
分岐鎖α-ケト酸脱水素酵素複合体(BCKD)は、分岐鎖アミノ酸イソロイシン、ロイシン、バリン分解に関与するミトコンドリア内酵素複合体である。BCKD複合体は、24個のトランスアシラーゼ(E2)サブユニットのコアと、関連する脱炭酸酵素(E1)、脱水素酵素(E3)、および調節サブユニットで構成されていると考えられている。この遺伝子は、トランスアシラーゼ(E2)サブユニットをコードしている。この遺伝子の変異は、メープルシロップ尿症2型を引き起こす。選択的スプライシング転写変異体が記載されているが、その生物学的妥当性は決定されていない。[7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000137992 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000000340 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Lau KS、Chuang JL、Herring WJ、Danner DJ、Cox RP、Chuang DT (1992 年 12 月)。「ヒト分岐鎖アルファケト酸脱水素酵素複合体のジヒドロリポイルトランスアシラーゼ (E2) の完全な cDNA 配列」。Biochim Biophys Acta。1132 ( 3): 319–21。doi : 10.1016 /0167-4781(92)90169-z。PMID 1420314 。
- ^ Lau KS、Herring WJ、Chuang JL、McKean M、Danner DJ、Cox RP、Chuang DT (1992 年 12 月)。「ヒト分岐鎖アルファケト酸脱水素酵素複合体のジヒドロリポイルトランスアシラーゼ (E2) 成分をコードする遺伝子の構造と E2 擬似遺伝子の特性」。J Biol Chem . 267 (33): 24090–6。doi : 10.1016 / S0021-9258 (18)35950-7。PMID 1429740。
- ^ ab 「Entrez Gene: DBT ジヒドロリポアミド分岐鎖トランスアシラーゼ E2」。
さらに読む
- Patel MS、Harris RA (1995)。「哺乳類のα-ケト酸脱水素酵素複合体:遺伝子調節と遺伝的欠陥」。FASEB J. 9 (12): 1164–72. doi : 10.1096/fasebj.9.12.7672509 . PMID 7672509. S2CID 25326935。
- Popov KM、Zhao Y、Shimomura Y、et al. (1992)。「分岐鎖α-ケト酸脱水素酵素キナーゼ。分子クローニング、発現、およびヒスチジンタンパク質キナーゼとの配列類似性」。J. Biol. Chem . 267 (19): 13127–30. doi : 10.1016/S0021-9258(18)42179-5 . PMID 1377677。
- Fisher CW、Lau KS、Fisher CR、他 (1991)。「チアミン反応性メープルシロップ尿症患者 WG-34 のジヒドロリポイルトランスアシラーゼ (E2) mRNA における 17 bp の挿入と Phe215----Cys ミスセンス変異」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 174 (2): 804–9. doi :10.1016/0006-291X(91)91489-Y. PMID 1847055。
- Zneimer SM、Lau KS、Eddy RL、他 (1991)。「ヒト分岐鎖α-ケト酸脱水素酵素複合体の2つの遺伝子の領域割り当て:E1β遺伝子(BCKDHB)は染色体6p21-22、E2遺伝子(DBT)は染色体1p31」。Genomics。10 (3 ):740–7。doi :10.1016/0888-7543(91)90458-Q。PMID 1889817 。
- Chuang DT、Fisher CW、Lau KS、他 (1991)。「メープルシロップ尿症:分岐鎖α-ケト酸脱水素酵素複合体のジヒドロリポイルトランスアシラーゼ(E2)成分のドメイン構造、変異、エクソンスキッピング」。Mol . Biol. Med . 8 (1): 49–63. PMID 1943690。
- Herring WJ、Litwer S、Weber JL、Danner DJ (1991)。「分岐鎖アシルトランスフェラーゼの2つの欠陥対立遺伝子を持つ家族におけるメープルシロップ尿症の分子遺伝学的根拠とヒト染色体1への遺伝子の局在」。Am . J. Hum. Genet . 48 (2): 342–50. PMC 1683011. PMID 1990841 。
- Lau KS、Lee J、Fisher CW、et al. (1991)。「分岐鎖α-ケト酸脱水素酵素複合体のヒトトランスアシラーゼ(E2)遺伝子における転写の早期終結と選択的スプライシング」。FEBS Lett . 279 ( 2 ): 229–32。Bibcode :1991FEBSL.279..229L。doi : 10.1016/0014-5793(91)80155- V。PMID 2001734 。
- Mitsubuchi H, Nobukuni Y, Akaboshi I, et al. (1991). 「メープルシロップ尿症は、分岐鎖α-ケト酸脱水素酵素複合体の内部E2コアドメインにおける異常スプライシングによる部分的欠失によって引き起こされる。E2遺伝子のイントロンの5'スプライスドナー部位における1塩基欠失は、この領域のコンセンサス配列を破壊する」。J . Clin. Invest . 87 (4): 1207–11. doi :10.1172/JCI115120. PMC 295137. PMID 2010537 .
- Danner DJ、Litwer S、Herring WJ、Pruckler J (1989)。「ヒト分岐鎖アシルトランスフェラーゼの全長プレタンパク質をコードするcDNAの構築とヌクレオチド配列」。J . Biol. Chem . 264 (13): 7742–6. doi : 10.1016/S0021-9258(18)83297-5 . PMID 2708389。
- Nobukuni Y, Mitsubuchi H, Endo F, Matsuda I (1989). 「ヒト分岐鎖α-ケト酸脱水素酵素複合体のトランスアシラーゼ(E2b)サブユニットの完全な一次構造」. Biochem. Biophys. Res. Commun . 161 (3): 1035–41. doi :10.1016/0006-291X(89)91347-8. PMID 2742576.
- Lau KS、Griffin TA、Hu CW、Chuang DT (1988)。「哺乳類分岐鎖α-ケト酸脱水素酵素複合体のリポイル含有およびジヒドロリポイル脱水素酵素結合ドメインにおける一次構造の保存:ヒトおよびウシのトランスアシラーゼ(E2)cDNAの分子クローニング」。生化学。27 (6):1972–81。doi :10.1021/bi00406a025。PMID 2837277 。
- Litwer S、Danner DJ (1985)。「分岐鎖ケト酸脱水素酵素のトランスアシラーゼ成分のラムダgt11におけるcDNAクローンの同定」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 131 (2): 961–7. doi :10.1016/0006-291X(85)91333-6. PMID 2932110。
- Litwer S、Danner DJ (1988)。「in vitro で合成されたヒト前分岐鎖アシルトランスフェラーゼフラグメントのミトコンドリアへの輸入と処理」。Am . J. Hum. Genet . 43 (5): 764–9. PMC 1715554. PMID 3189339 。
- Hummel KB、Litwer S、Bradford AP、et al. (1988)。「分岐鎖アシルトランスフェラーゼのcDNAのヌクレオチド配列と推定タンパク質構造の解析」。J . Biol. Chem . 263 (13): 6165–8. doi : 10.1016/S0021-9258(18)68766-6 . PMID 3245861。
- Chuang DT、Niu WL、Cox RP (1982)。「正常および古典的なメープルシロップ尿症患者の皮膚線維芽細胞における分岐鎖 2-オキソ酸脱水素酵素とその成分の活性」。Biochem . J. 200 (1): 59–67. doi :10.1042/bj2000059. PMC 1163502. PMID 6895847 。
- Wynn RM、Kochi H、Cox RP、Chuang DT (1994)。「ラット配列のN末端プロリンによって引き起こされる分岐鎖α-ケト酸脱水素酵素複合体のヒトおよびラットE1α前駆体の異なる処理」。Biochim . Biophys. Acta . 1201 (1): 125–8. doi :10.1016/0304-4165(94)90161-9. PMID 7918575。
- Fisher CW、Fisher CR、Chuang JL、他 (1993)。「メープルシロップ尿症患者 6 名の E2 (DBT) 遺伝子座における 2 bp (AT) 欠失アレルおよびナンセンス (G から T) 変異アレルの発生: 変異の二次的影響としての複数エクソン スキッピング」。Am . J. Hum. Genet . 52 (2): 414–24. PMC 1682180. PMID 8430702 。