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統合DNAインデックスシステム（CODIS）は、連邦捜査局（FBI）が作成・維持管理する米国の国家DNAデータベースです。CODISは、DNAプロファイルの起源となるローカルDNAインデックスシステム（LDIS）、州内の研究所間で情報を共有できる州DNAインデックスシステム（SDIS）、そして州間でDNA情報を比較できる国家DNAインデックスシステム（NDIS）という3つのレベルの情報で構成されています。
CODISソフトウェアには、検索対象となる情報の種類に応じて複数のデータベースが含まれています。これらのデータベースの例としては、行方不明者、有罪判決を受けた犯罪者、犯罪現場から採取された法医学的サンプルなどが挙げられます。各州および連邦システムは、データベースに含まれる情報の収集、アップロード、分析に関してそれぞれ異なる法律を定めています。ただし、プライバシー保護のため、CODISデータベースには、DNAプロファイルに関連付けられた氏名などの個人識別情報は含まれていません。サンプルが一致した場合は、アップロード元の機関に通知され、その機関はそれぞれの法律に従って個人情報を開示する責任を負います。
米国における国家DNAデータベースの構築は、1989年にDNA分析方法に関する技術作業部会（TWGDAM）によって初めて言及された。[ 1 ] FBIの戦略目標は、州の自発的な参加を最大限に高め、数年前に8つの西部州が国家自動指紋識別システム（AFIS）ネットワークの構築プロセスに不満を抱き、独自の西部識別ネットワーク（WIN）を形成した事態を回避することであった。[ 2 ] FBIが州によるCODISと競合するシステムの構築を阻止するための戦略は、DNAデータベースソフトウェアを開発し、州および地方の犯罪研究所に無償で提供することであった。市場シェアを獲得する目的でソフトウェアを無償で提供するというこの戦略的決定は、当時としては革新的であり、ブラウザ戦争に先立つものであった。1990年、FBIは14の州および地方の研究所でDNAデータベースのパイロットプログラムを開始した。[ 3 ]
1994年、連邦議会はDNA識別法を可決し、FBIに有罪判決を受けた犯罪者の全国的なDNAデータベースと、行方不明者や犯罪現場から採取された法医学的サンプル用の個別のデータベースを作成する権限を与えた。（FBIの一部職員は、FBIの刑事司法情報サービス部門が既に同様の権限を使用して連邦、州、地方、部族の法執行機関にデータ共有ソリューションを提供しているため、全国的なDNAデータベースを確立するためにこの法律は必要ないと考えていた。）DNA識別法はまた、CODISプログラムに参加する研究所が、法医学分野に積極的に関与している独立した非営利団体から認定を維持すること、およびCODISに提出するDNAサンプルを処理する科学者が熟練度を維持し、データベースにアップロードされるプロファイルの品質を保証するために定期的にテストを受けることを義務付けた。[ 4 ] CODISの全国レベル（NDIS）は1998年10月に導入されました。現在、全50州、コロンビア特別区、連邦法執行機関、陸軍研究所、プエルトリコがDNAプロファイルの全国的な共有に参加しています。[ 5 ]
CODISデータベースには、DNAプロファイル情報を保存するためのさまざまなインデックスが含まれています。犯罪捜査を支援するために、3つのインデックスが存在します。犯罪で有罪判決を受けた者のDNAプロファイルを含む犯罪者インデックス、特定の州の法律に従って犯罪で逮捕された者のプロファイルを含む被逮捕者インデックス、および犯罪現場から収集されたプロファイルを含む法医学インデックスです。[ 6 ]行方不明者の特定を支援するために、身元不明遺体インデックス、行方不明者インデックス、行方不明者の生物学的親族インデックスなどの追加のインデックスが使用されます。[ 6 ]他のカテゴリに該当しない他の検体についても、特殊インデックスが存在します。これらのインデックスには、サンプルを扱う従業員のプロファイル用のスタッフインデックス、および2つ以上の遺伝子座で3つ以上の対立遺伝子を持つ単一ソースサンプル用の多対立遺伝子犯罪者インデックスが含まれます。[ 7 ]
CODISは一般的に犯罪と他の犯罪、そして場合によっては容疑者を関連付けるために使用されますが、行方不明者索引など、犯罪以外の部分もデータベースに含まれています。 CODIS(mp)としても知られる統合DNA索引システムは、FBIによってCODISのNDISレベルで維持されており、すべての州が情報を共有できるようになっています。 2000年に既存のCODISインフラストラクチャを使用して作成されたこのデータベースのセクションは、行方不明者または行方不明者の親族のDNA情報を収集して保存することにより、人間の遺体を特定するのに役立つように設計されています。[ 8 ] [ 9 ]身元不明の遺体は、国立司法研究所の資金提供を受けているノーステキサス大学人間識別センターによってDNA処理されます。[ 10 ]遺体を特定できる可能性を最大化するために、身元不明の遺体と既知の親族の両方に対して、核、Y-STR（男性のみ）、およびミトコンドリア分析を実行できます。[ 8 ]
2020年9月現在 NDISには、1400万件以上の犯罪者プロファイル、400万件以上の被逮捕者プロファイル、100万件以上の法医学プロファイルが含まれていました。[ 11 ] [ 12 ] CODISの有効性は、データベースヒットによって支援された捜査の数によって測定されます。2020年9月現在、 CODISは52万件以上の調査を支援し、53万件以上のヒットを生み出した。[ 11 ] [ 12 ]各州は独自のSDISデータベースを持っており、各州は国レベルよりも緩やかな独自の包含基準を設定できる。このため、州レベルのデータベースに存在するプロファイルのいくつかは、国のデータベースには存在せず、州境を越えて日常的に検索されることはない。[ 13 ]
CODIS を使用した識別の大部分は、ヒトゲノム全体に散在する短いタンデムリピート ( STR ) と、その特定のプロファイルが集団内でどれくらいまれであるかを計算するために使用される統計に依存しています。 [ 14 ] STR はコピー数多型の一種で、何度も繰り返されるヌクレオチド塩基対の配列で構成されています。DNA 分析中にテストされる各位置 (遺伝子座 (複数形は loci) とも呼ばれる) では、人は父親から 1 つ、母親から 1 つの 2 つの繰り返しセットを持っています。各セットが測定され、繰り返しコピーの数が記録されます。[ 15 ]両親から受け継いだ両方の鎖がその遺伝子座で同じ数の繰り返しを含んでいる場合、その人はその遺伝子座でホモ接合体であると言われます。繰り返し数が異なる場合、ヘテロ接合体であると言われます。遺伝子座での考えられるすべての違いは対立遺伝子です。[ 16 ]この反復判定は複数の遺伝子座にわたって行われ、反復値がCODISにアップロードされるDNAプロファイルとなります。 2017年1月1日現在、既知の犯罪者プロファイルを国家レベルにアップロードするための要件は20遺伝子座です。[ 5 ]
あるいは、CODISでは、ミトコンドリアDNA （mtDNA）情報を行方不明者索引にアップロードすることができます。mtDNAは母親から子に受け継がれるため、同じmtDNAを持つ生存している親族と遺体を結びつけるために使用できます。[ 5 ]
2017 年 1 月 1 日以前は、CODIS の全国レベルでは、既知の犯罪者プロファイルには「CODIS コア」と呼ばれる 13 個の遺伝子座のセットが必要であるとされていました。それ以降、この要件は 7 つの遺伝子座を追加するように拡大されました。部分的なプロファイルも別のインデックスで CODIS で許可されており、劣化している、または複数の個人の混合物である犯罪現場のサンプルでは一般的です。これらのプロファイルを CODIS の全国レベルにアップロードするには、少なくとも 8 つのコア遺伝子座が存在することと、プロファイルの希少性が 1000 万分の 1 (人口統計を使用して計算) である必要があります。[ 5 ]
遺伝子内に含まれる遺伝子座は、その遺伝子にちなんで命名されます。たとえば、TPOX はヒト甲状腺ペルオキシダーゼ遺伝子にちなんで命名されています。[ 17 ]遺伝子内に含まれない遺伝子座には、統一性を保つために標準的な命名規則が適用されます。これらの遺伝子座は、D + 遺伝子座が存在する染色体 + S + その染色体上の位置が記述された順序で命名されます。たとえば、D3S1358 は第 3 染色体上にあり、1358 番目の記述位置です。[ 18 ] CODIS コアは以下にリストされています。アスタリスクが付いている遺伝子座は新しいコアであり、2017 年 1 月にリストに追加されました。[ 19 ]
CODISで使用される遺伝子座は、タンパク質をコードしない非コードDNA領域にあるため選択されました。これらの領域からは、髪の色や目の色、人種など、その人に関する追加情報は得られないはずです。 [ 20 ]しかし、遺伝子マーカーと祖先に関する理解の新たな進歩により、CODIS遺伝子座には表現型情報が含まれている可能性があることが示されています。[ 21 ] [ 22 ]
米国のデータベースは他の国と直接接続されていませんが、基盤となるCODISソフトウェアは世界中の他の機関で使用されています。2016年4月現在 CODISソフトウェアは50か国の90の国際研究所で使用されています。[ 3 ] [ 21 ]米国のデータベースを検索したい国際警察機関は、FBIに審査依頼を提出できます。依頼が妥当であり、検索対象のプロファイルが、遺伝子座の数など、米国のプロファイルの包含基準を満たす場合、依頼は国家レベルで検索されるか、データベースのそのレベルに存在する可能性があるという合理的な疑いがある州に転送されます。[ 5 ]
有罪判決時のみ徴収一部の重罪逮捕時のみ徴収すべての重罪逮捕時から徴収
CODISデータベースの当初の目的は、有罪判決を受けた性犯罪者のDNAを収集することによって、性犯罪者登録簿を拡充することであった。 [ 23 ]時が経つにつれて、それは拡大した。現在、50州すべてが重罪で有罪判決を受けた者からDNAを収集している。多くの州では、未成年者や、犯罪で逮捕されたもののまだ有罪判決を受けていない者からもサンプルを収集している。[ 12 ] [ 24 ]州のデータベースに保管されるDNAの収集を犯罪で有罪判決を受けた者のみに限定している州であっても、ニューヨーク市の主任検視官事務所が運営する法医学研究所などの地方データベースでは、有罪判決を受けていない被逮捕者のDNAサンプルを収集する可能性があることに注意が必要である。被逮捕者のサンプルの収集は、憲法上の問題、特に不当な捜索と押収を禁止する合衆国憲法修正第4条の問題を引き起こした。犯罪で有罪判決を受けていない者から、明確な採取命令なしにDNAを採取することは、令状なしの捜索とみなされ、したがって違法であると主張された。[ 25 ] 2013年、米国最高裁判所はメリーランド州対キング事件で、犯罪で逮捕されたもののまだ有罪判決を受けていない者からDNAを採取することは、警察の逮捕手続きの一部であり、その採取が身元確認目的で使用される場合は合理的であるとの判決を下した。[ 26 ]
2020 年以降、米国国土安全保障省(DHS) は、税関・国境警備局 (CBP) などの機関を通じて、CODIS への DNA プロファイルの提出を大幅に増やしました。この拡大は、移民拘留者の大規模な DNA サンプリングを可能にする長年の免除を撤回した 2020 年 4 月の司法省の規則に続くものです。これらの新規エントリの大部分、2020 年以降約 260 万のプロファイルは、民事 (刑事ではない) 権限の下で収集され、CODIS の「拘留者」インデックスの大幅な増加に貢献しました。2020 年 10 月から 2024 年 12 月までのデータによると、CBP は国境検問所で未成年者を含む約 2,000 人の米国市民から DNA サンプルを収集しました。[ 27 ] [ 28 ] [ 29 ]
一部のDNAの遺伝パターンは、近親者が社会の他のランダムなメンバーよりも高い割合のアレルを共有することを意味します。[ 30 ]これにより、完全一致が見つからない場合にCODIS内で近親者を検索することができます。近親者に焦点を当てることで、捜査官はCODISにプロファイルがある近親者を見つけ、検索範囲を特定の家族に絞り込むことができます。家族検索は、他のすべての手がかりが尽きた後、グリムスリーパー連続殺人犯を含むいくつかの有罪判決につながりました。[ 31 ]この方法は、最終的に犯罪で起訴された人物が、CODISデータベースに他人のDNAがあったために関与したとみなされたため、合衆国憲法修正第4条の問題も引き起こしました。[ 32 ] 2018年4月現在 12州がCODISでの家族検索の使用を承認している。[ 33 ]