CRMP1

CRMP1
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	4B3Z
識別子
エイリアス	CRMP1、CRMP-1、DPYSL1、DRP-1、DRP1、ULIP-3、コラプシン応答メディエータータンパク質1
外部ID	オミム：602462; MGI : 107793;ホモロジーン: 20347;ジーンカード：CRMP1; OMA :CRMP1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体4（ヒト）
終わり	5,893,086 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	5番染色体（マウス）
終わり	37,449,477 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	神経節隆起; ; 心室帯; ; 視床の外側核群; ; 小脳の右半球; ; 中側頭回; ; 前頭前皮質; ; 背外側前頭前皮質; ; 右前頭葉; ; 小脳の傍小葉; ; 下垂体前葉;
	トップの表現
	神経節隆起; ; 上頸部神経節; ; バレル皮質; ; 嗅球; ; 嗅内皮質; ; CA3フィールド; ; 嗅周囲皮質; ; 海馬歯状回顆粒細胞; ; 内側神経節隆起; ; 神経管;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	タンパク質結合; 加水分解酵素活性; 加水分解酵素活性、炭素-窒素結合（ペプチド結合ではない）に作用する; フィラミン結合;
細胞成分	スピンドル; 細胞骨格; 微小管形成中心; 細胞質; 細胞質; 胴体; 中心体; 核;
生物学的プロセス	ニューロンの発達; 核酸塩基含有化合物の代謝プロセス; 微小管細胞骨格組織; 神経系の発達; 軸索誘導; アクチンフィラメント結合の負の調節; ニューロン投射発達の負の調節;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	1400
	12933
	ENSG00000072832
	ENSMUSG00000029121
	Q14194
	P97427
	NM_001313 ; NM_001014809 ; NM_001288661 ; NM_001288662
	NM_001136058 ; NM_007765
	NP_001014809 ; NP_001275590 ; NP_001275591 ; NP_001304
	NP_001129530 ; NP_031791
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

コラプシン応答メディエータータンパク質1はCRMP1遺伝子によってコードされ、 CRMPファミリーのヒトタンパク質である。^[5]

この遺伝子は、神経系でのみ発現する細胞質リン酸化タンパク質ファミリーのメンバーをコードしています。コードされているタンパク質は、神経発達中のセマフォリン誘導成長円錐崩壊に関与するセマフォリンシグナル伝達経路の一部であると考えられています。選択的スプライシングにより、複数の転写バリアントが生成されます。[ ^5]

CRMP1は皮質神経細胞の移動においてリーリンシグナル伝達を媒介する。^[6] CRMP1を欠損したマウスは長期増強障害と空間学習および記憶障害を示す。^[7]

CRMP1遺伝子はEVCと呼ばれる別の遺伝子と重複している。^[8]

インタラクション

CRMP1はDPYSL2と相互作用することが示されている。^[9]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000072832 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000029121 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ ab 「Entrez Gene: CRMP1 コラプシン応答メディエータータンパク質 1」。
^ Yamashita N, Uchida Y, Ohshima T, Hirai S, Nakamura F, Taniguchi M, Mikoshiba K, Honnorat J, Kolattukudy P, Thomasset N, Takei K, Takahashi T, Goshima Y (2006 年 12 月). 「Collapsin response mediator protein 1 は皮質ニューロンの移動において reelin シグナル伝達を仲介する」. J. Neurosci. 26 (51): 13357–62. doi : 10.1523/JNEUROSCI.4276-06.2006 . PMC 6674993 . PMID 17182786.
^ Su KY、Chien WL、Fu WM、Yu IS、Huang HP、Huang PH、Lin SR、Shih JY、Lin YL、Hsueh YP、Yang PC、Lin SW (2007 年 3 月)。「コラプシン応答メディエータータンパク質 1 を欠損したマウスは長期増強が損なわれ、空間学習および記憶が損なわれる」。J . Neurosci . 27 (10): 2513–24。doi : 10.1523 / JNEUROSCI.4497-06.2007。PMC 6672508。PMID 17344389。
^ ルイス＝ペレス VL、イデ SE、シュトローム TM、ロレンツ B、ウィルソン D、ウッズ K、キング L、フランコマーノ C、フライジンガー P、スプランジャー S、マリノ B、ダラピッコーラ B、ライト M、マイティンガー T、ポリメロプロス MH、グッドシップ J (2000 年 3 月)。「エリス・ヴァン・クレベルト症候群およびウェアーズ先端歯異形成症における新しい遺伝子の変異」。ナット。ジュネット。 24 (3): 283–6。土井：10.1038/73508。PMID 10700184。S2CID 1391136 。
^ Leung, Thomas; Ng Yvonne; Cheong Albert; Ng Chong Han; Tan Ivan; Hall Christine; Lim Louis (2002 年 12 月). 「p80 ROKalpha 結合タンパク質は CRMP-1 の新しいスプライスバリアントであり、CRMP-2 と関連して RhoA 誘導性ニューロン形態を調節する」. FEBS Lett . 532 (3): 445–9. doi : 10.1016/S0014-5793(02)03736-5 . ISSN 0014-5793. PMID 12482610. S2CID 45499981.

外部リンク

UCSC ゲノムブラウザのヒト CRMP1 ゲノムの位置と CRMP1 遺伝子の詳細ページ。

さらに読む

Shih JY、Lee YC、Yang SC、他 (2003)。「コラプシン応答メディエータータンパク質-1：新規浸潤抑制遺伝子」。臨床研究転移。20 (1 ) : 69–76。doi : 10.1023 /A:1022598604565。PMID 12650609。S2CID 25005489 。
浜島暢、松田健、坂田聡、他 (1997)。「ヒトジヒドロピリミジナーゼと3つの関連タンパク質によって定義される新規遺伝子ファミリーは組織分布が異なる」。遺伝子180 ( 1–2 ): 157–63。doi :10.1016/S0378-1119(96)00445-3。PMID 8973361 。
Torres R、Polymeropoulos MH (1999)。「ヒト CRMP-1 遺伝子のゲノム構成と局在」。DNA Res . 5 (6): 393–5. doi : 10.1093/dnares/5.6.393 . PMID 10048489。
Shih JY、Yang SC、Hong TM、他 (2001)。「コラプシン応答メディエータータンパク質-1と癌細胞の浸潤および転移」。J . Natl. Cancer Inst . 93 (18): 1392–400. doi : 10.1093/jnci/93.18.1392 . PMID 11562390。
Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
Leung T、Ng Y、Cheong A、et al. (2003)。「p80 ROKalpha 結合タンパク質は CRMP-1 の新規スプライスバリアントであり、CRMP-2 と関連して RhoA 誘導性ニューロン形態を調節する」。FEBS Lett . 532 (3): 445–9. doi : 10.1016/S0014-5793(02)03736-5 . PMID 12482610. S2CID 45499981.
太田孝文、鈴木勇、西川孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
Chang CC、Shih JY、Jeng YM、他 (2004)。「結合組織増殖因子と肺腺癌の浸潤および転移におけるその役割」。J . Natl. Cancer Inst . 96 (5): 364–75. doi : 10.1093/jnci/djh059 . PMID 14996858。
Ballif BA、Villén J、Beausoleil SA、他 (2005)。「発達中のマウス脳のホスホプロテオミクス解析」。Mol . Cell. Proteomics . 3 (11): 1093–101. doi : 10.1074/mcp.M400085-MCP200 . PMID 15345747。
Goehler H、Lalowski M、Stelzl U、他 (2004)。「タンパク質相互作用ネットワークがハンチンチン凝集の促進因子である GIT1 とハンチントン病を結び付ける」。Mol . Cell . 15 (6): 853–65. doi : 10.1016/j.molcel.2004.09.016 . PMID 15383276。
Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
Sivakumaran TA、Lesperance MM (2005)。「CRMP1 および EVC 遺伝子のハプロタイプおよび連鎖不平衡解析」。Int . J. Mol. Med . 14 (5): 903–7. doi :10.3892/ijmm.14.5.903. PMID 15492864。
Stelzl U、Worm U、Lalowski M 、et al. (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワーク：プロテオーム注釈リソース」。Cell . 122 (6): 957–68. doi :10.1016/j.cell.2005.08.029. hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070. S2CID 8235923.
Cole AR、Causeret F、Yadirgi G、他 (2006)。「異なるプライミングキナーゼが、生体内でのグリコーゲン合成酵素キナーゼ-3によるコラプシン応答メディエータータンパク質の異なる調節に寄与する」。J . Biol. Chem . 281 (24): 16591–8. doi : 10.1074/jbc.M513344200 . PMC 1805471. PMID 16611631 。
Weidemann W、Stelzl U、Lisewski U、他 (2007)。「コラプシン応答メディエータータンパク質 1 (CRMP-1) と前骨髄球性白血病ジンクフィンガータンパク質 (PLZF) は、シアリン酸生合成の鍵酵素である UDP-N-アセチルグルコサミン 2-エピメラーゼ/N-アセチルマンノサミンキナーゼ (GNE) に結合する」。FEBS Lett . 580 (28–29): 6649–54. doi : 10.1016/j.febslet.2006.11.015 . PMID 17118363. S2CID 25369336.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000072832 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000029121 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[entrez-5] 「Entrez Gene: CRMP1 コラプシン応答メディエータータンパク質 1」。

[pmid17182786-6] Yamashita N, Uchida Y, Ohshima T, Hirai S, Nakamura F, Taniguchi M, Mikoshiba K, Honnorat J, Kolattukudy P, Thomasset N, Takei K, Takahashi T, Goshima Y (2006 年 12 月). 「Collapsin response mediator protein 1 は皮質ニューロンの移動において reelin シグナル伝達を仲介する」. J. Neurosci. 26 (51): 13357–62. doi : 10.1523/JNEUROSCI.4276-06.2006 . PMC 6674993 . PMID 17182786.

[pmid17344389-7] Su KY、Chien WL、Fu WM、Yu IS、Huang HP、Huang PH、Lin SR、Shih JY、Lin YL、Hsueh YP、Yang PC、Lin SW (2007 年 3 月)。「コラプシン応答メディエータータンパク質 1 を欠損したマウスは長期増強が損なわれ、空間学習および記憶が損なわれる」。J . Neurosci . 27 (10): 2513–24。doi : 10.1523 / JNEUROSCI.4497-06.2007。PMC 6672508。PMID 17344389。

[pmid10700184-8] ルイス＝ペレス VL、イデ SE、シュトローム TM、ロレンツ B、ウィルソン D、ウッズ K、キング L、フランコマーノ C、フライジンガー P、スプランジャー S、マリノ B、ダラピッコーラ B、ライト M、マイティンガー T、ポリメロプロス MH、グッドシップ J (2000 年 3 月)。「エリス・ヴァン・クレベルト症候群およびウェアーズ先端歯異形成症における新しい遺伝子の変異」。ナット。ジュネット。 24 (3): 283–6。土井：10.1038/73508。PMID 10700184。S2CID 1391136 。

[pmid12482610-9] Leung, Thomas; Ng Yvonne; Cheong Albert; Ng Chong Han; Tan Ivan; Hall Christine; Lim Louis (2002 年 12 月). 「p80 ROKalpha 結合タンパク質は CRMP-1 の新しいスプライスバリアントであり、CRMP-2 と関連して RhoA 誘導性ニューロン形態を調節する」. FEBS Lett . 532 (3): 445–9. doi : 10.1016/S0014-5793(02)03736-5 . ISSN 0014-5793. PMID 12482610. S2CID 45499981.