ヒトのタンパク質コード遺伝子
CPEB1 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2M13、2MKH、2MKK、2N1O
識別子 エイリアス CPEB1 、CEBP、CPE-BP1、CPEB、CPEB-1、hCPEB-1、h-CPEB、細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質 1 外部ID オミム ：607342; MGI : 108442; ホモロジーン : 7278; ジーンカード ：CPEB1; OMA :CPEB1 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体7（マウス） [2] バンド 7|7 D3 始める 80,996,774 bp [2] 終わり 81,105,213 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 睾丸 C1セグメント 下垂体 下垂体前葉 ブロードマン領域9 右精巣 脳梁 上前頭回 左精巣 黒質
トップの表現 一次卵母細胞 上前頭回 太ももの筋肉 海馬歯状回顆粒細胞 一次視覚野 二次卵母細胞 腰椎神経節 脊髄前角 上腕三頭筋 受精卵
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
金属イオン結合 mRNA 3'-UTR AUリッチ領域結合 翻訳因子活性、RNA結合 RNA結合 核酸結合 リボソーム結合 翻訳抑制活性、mRNA調節要素結合 mRNA 3'-UTR結合 翻訳調節活動 タンパク質結合 細胞成分
シナプス 細胞投影 細胞接合 ニューロン投影 メッセンジャーリボ核タンパク質複合体 シナプス後密度 シナプス後膜 膜 Pボディ 樹状突起 細胞膜 細胞質 核 核質 細胞質 生物学的プロセス
インスリン刺激に対する細胞反応 翻訳の規制 細胞質翻訳の負の調節 mRNA処理 アミノ酸刺激に対する細胞反応 低酸素に対する細胞反応 タンパク質生合成 mRNAポリアデニル化の正の制御 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ENSG00000277445 ENSG00000214575
ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_030594 NM_001079533 NM_001079534 NM_001079535 NM_001288819 NM_001288820
NM_001252525 NM_001252526 NM_007755 NM_001357107
RefSeq (タンパク質) NP_001073001 NP_001073002 NP_001073003 NP_001275748 NP_001275749 NP_085097 NP_001352169 NP_001352170 NP_001352171 NP_001352172 NP_001352173 NP_001352174 NP_001352175 NP_001352176 NP_001352177 NP_001352178 NP_001352179
NP_001239454 NP_001239455 NP_031781 NP_001344036
場所 (UCSC) 15 章: 82.54 – 82.65 Mb 7章: 81 – 81.11 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質1は 、ヒト では CPEB1 遺伝子 によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6]
この遺伝子は、細胞質ポリアデニル化要素 （CPE）結合 タンパク質ファミリー のメンバーをコードしています 。この高度に保存されたタンパク質は、いくつかの mRNA の 3' UTR にあるCPEと呼ばれる特定の RNA 配列に結合します。 アフリカツメガエル と マウスの同様のタンパク質は、短い ポリAテール を持つ休眠mRNAの 細胞質 ポリアデニル化を 誘導し、 翻訳を 引き起こすように機能します。このタンパク質ファミリーのメンバーは、 胚 細胞分裂 中に サイクリンB1 の翻訳を制御します。この遺伝子には、 異なる アイソフォーム をコードする複数の 転写 バリアントが 見つかっています。 [6]
参考文献
^ abc ENSG00000214575 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000277445, ENSG00000214575 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000025586 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Welk JF、Charlesworth A、Smith GD 、MacNicol AM (2001年3月)。「ヒト細胞質ポリアデニル化エレメント結合タンパク質をコードする遺伝子の同定と特徴付け」。Gene . 263 (1–2): 113–20. doi :10.1016/S0378-1119(00)00588-6. PMID 11223249。 ^ ab 「Entrez Gene: CPEB1 細胞質ポリアデニル化要素結合タンパク質 1」。
さらに読む
Mendez R, Richter JD (2001). 「CPEB による翻訳制御: 目的を達成するための手段」 Nat. Rev. Mol. Cell Biol . 2 (7): 521–9. doi : 10.1038/35080081 . PMID 11433366. S2CID 815958. サンガー センター、ワシントン大学ゲノムシークエンシングセンター (1999)。「完全なヒトゲノム配列に向けて」。 ゲノム 研究 8 ( 11): 1097–108。doi : 10.1101/gr.8.11.1097。PMID 9847074 。 Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932 。 Huang YS、Carson JH、Barbarese E、Richter JD (2003)。「CPEBによる樹状突起mRNA輸送の促進」。Genes Dev . 17 (5): 638–53. doi :10.1101/gad.1053003. PMC 196011. PMID 12629046 。 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。 Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。 Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。 Wilczynska A、Aigueperse C、 Kress M、et al. (2005)。「翻訳調節因子 CPEB1 は dcp1 体とストレス顆粒を結び付ける」。J . Cell Sci . 118 (Pt 5): 981–92。doi : 10.1242/ jcs.01692。PMID 15731006 。 Sasayama T, Marumoto T, Kunitoku N, et al. (2005). 「Aurora-A の過剰発現は細胞質ポリアデニル化エレメント結合タンパク質を標的とし、Cdk1 およびサイクリン B1 の mRNA ポリアデニル化を促進する」。Genes Cells . 10 (7): 627–38. doi : 10.1111/j.1365-2443.2005.00870.x . hdl : 20.500.14094/D2002840 . PMID 15966895. S2CID 24879593. Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). 「転写調節の多様化: ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模な同定と特性評価」 Genome Res . 16 (1): 55–65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560 .
外部リンク
