人間の体内に存在するタンパク質
| COL6A1 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | COL6A1、OPLL、BTHLM1、UCHMD1、コラーゲンVI型アルファ1、コラーゲンVI型アルファ1鎖 |
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| 外部ID | オミム:120220; MGI : 88459;ホモロジーン: 1391;ジーンカード:COL6A1; OMA :COL6A1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体10(マウス)[2] |
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| | バンド | 10 C1|10 39.71 cM | 始める | 76,544,626 bp [2] |
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| 終わり | 76,562,002 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 子宮内膜間質細胞
- 上腕二頭筋の腱
- 子宮体部
- S状結腸の筋層
- 左子宮管
- 伏在静脈
- 右卵巣
- 子宮頸管
- ヒップの皮膚
- 左卵巣
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| | トップの表現 | - 輸出管
- 臍帯
- 頭蓋冠
- 内頸動脈
- 足首関節
- 子宮
- 足首
- 頸部
- 左肺葉
- 精管
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- 血小板由来成長因子結合
- 引張強度を与える細胞外マトリックス構造成分
| | 細胞成分 |
- 細胞外マトリックス
- 細胞外領域
- コラーゲンVI型三量体
- リソソーム膜
- 筋膜
- コラーゲン
- 小胞体腔
- 細胞外エクソソーム
- 膜
- 細胞外空間
- タンパク質含有複合体
- コラーゲン含有細胞外マトリックス
| | 生物学的プロセス |
- コラーゲン分解プロセス
- アミノ酸刺激に対する細胞反応
- タンパク質ヘテロ三量体化
- 細胞接着
- 細胞外マトリックスの組織化
- 内胚葉細胞の分化
- 骨芽細胞の分化
- 成長板軟骨軟骨細胞の形態形成
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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コラーゲンα-1(VI)鎖は、ヒトではCOL6A1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5]
関数
コラーゲンは、さまざまな組織の完全性を維持する役割を果たすタンパク質のスーパーファミリーです。コラーゲンは細胞外マトリックスタンパク質であり、共通の構造要素として三重らせんドメインを持っています。コラーゲンVIはミクロフィブリルの主要な構造成分です。コラーゲンVIの基本構造単位は、 α1(VI)、α2(VI)、α3(VI)鎖のヘテロ三量体です。α2(VI)鎖とα3(VI)鎖は、それぞれCOL6A2遺伝子とCOL6A3遺伝子によってコードされています。この遺伝子によってコードされているタンパク質は、VI型コラーゲンのα1サブユニット(α1(VI)鎖)です。コラーゲンVIサブユニットをコードする遺伝子の変異は、常染色体優性疾患であるベツレムミオパチーを引き起こします。[5]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000142156 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000001119 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ab 「Entrez 遺伝子: COL6A1 コラーゲン、VI 型、アルファ 1」。
さらに読む
- Bertini E、Pepe G (2002)。「コラーゲンタイプVIと関連疾患:ベスレムミオパチーとウルリッヒ硬化性筋ジストロフィー」。Eur . J. Paediatr. Neurol . 6 (4): 193– 8. doi :10.1053/ejpn.2002.0593. PMID 12374585。
- ランペ AK、ブッシュビー KM (2006)。 「VI型コラーゲン関連筋障害」。J.Med.ジュネット。42 (9): 673–85 .土井:10.1136/jmg.2002.002311。PMC 1736127。PMID 16141002。
- Bidanset DJ, Guidry C, Rosenberg LC, et al. (1992). 「プロテオグリカンデコリンのVI型コラーゲンへの結合」J. Biol. Chem . 267 (8): 5250–6 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)42759-7 . PMID 1544908.
- Saitta B、Wang YM、Renkart L、et al. (1992)。「ヒトα1(VI)およびα2(VI)コラーゲン遺伝子の三重らせんコーディング領域のエクソン構成は非常に類似している」。Genomics . 11 ( 1): 145– 53. doi :10.1016/0888-7543(91)90111-Q. PMID 1765372。
- Chu ML、Pan TC、Conway D、他 (1989)。「ヒト VI 型コラーゲンのアルファ 1(VI) およびアルファ 2(VI) 鎖の配列分析により、フォン ヴィレブランド因子の A ドメインに類似した球状ドメインの内部三重化と、カルボキシ末端が異なる 2 つのアルファ 2(VI) 鎖バリアントが明らかになった」。EMBO J. 8 ( 7): 1939– 46. doi :10.1002/j.1460-2075.1989.tb03598.x. PMC 401054. PMID 2551668 。
- Chu ML, Conway D, Pan TC, et al. (1989). 「ヒトコラーゲンVI型の三重らせんドメインのアミノ酸配列」J. Biol. Chem . 263 (35): 18601–6 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)37327-7 . PMID 3198591.
- Weil D、Mattei MG、Passage E、et al. (1988)。「VI型コラーゲンの3つの鎖をコードするヒト遺伝子のクローニングと染色体局在」。Am . J. Hum. Genet . 42 (3): 435– 45. PMC 1715162. PMID 3348212 。
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- Jobsis GJ、Bolhuis PA、Boers JM など。 (1996年)。 「ベスレムミオパチーの遺伝的局在」。神経内科。46 (3): 779–82 .土井:10.1212/wnl.46.3.779。PMID 8618682。S2CID 23010114 。
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- Lamandé SR、Bateman JF、Hutchison W、et al. (1998)。「コラーゲンVIの減少がベスレムミオパチーを引き起こす:ヘテロ接合性COL6A1ナンセンス変異がmRNAの崩壊と機能的ハプロ不全を引き起こす」。Hum . Mol. Genet . 7 (6): 981– 9. doi : 10.1093/hmg/7.6.981 . PMID 9580662。
- ペペ G、ジュスティ B、ベルティーニ E 他(1999年)。 「ベスレムミオパチーに罹患したイタリア人家族におけるα1(VI)コラーゲン鎖のインフレーム欠失を引き起こすCOL6A1のヘテロ接合性スプライス部位変異」。生化学。生物物理学。解像度共通。258 (3): 802– 7.土井:10.1006/bbrc.1999.0680。PMID 10329467。
- Merlini L、Villanova M、Sabatelli P、et al. (1999)。「染色体21連鎖ベスレムミオパチーにおけるラミニンβ1の発現低下」。Neuromuscul . Disord . 9 (5): 326– 9. doi :10.1016/S0960-8966(99)00022-X. PMID 10407855. S2CID 53256492.
外部リンク
- 先天性筋ジストロフィーの概要に関する GeneReviews/NCBI/NIH/UW のエントリ